KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00001699001
Entry
GSPATT00001699001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14556  U3 small nucleolar RNA-associated protein 12
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    GSPATT00001699001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
    GSPATT00001699001
Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    GSPATT00001699001
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_WDR3_2nd Beta-prop_WDR3_1st Beta-prop_WDR5 Beta-prop_THOC3 WD40_Prp19 WD40_CDC20-Fz Beta-prop_IFT122_1st WDR55 WD40 WD40_WDHD1_1st Beta-prop_EML_2 Beta-prop_WDR36-Utp21_1st WD40_Gbeta EIF3I Beta-prop_TEP1_2nd Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd WD40_MABP1-WDR62_2nd Beta-prop_WDR90_POC16_2nd Beta-prop_EML Beta-prop_TEP1_C Beta-prop_WDR41 DSE1_N ANAPC4_WD40 Beta-prop_IFT140_1st Beta-prop_DCAF4 Beta-prop_WDR19_1st Beta-prop_SCAP Beta-prop_Aladin Beta-prop_DCAF12 Beta-prop_SPT8 Beta-prop_ACSF4 Beta-prop_CAF1B_HIR1 KNTC1_N CFAP251_N WDR90_beta-prop_4th Beta-prop_IP5PC_F WD40_2 WDR54 TRM82_WD P_gingi_FimA
Other DBs
NCBI-GeneID: 5031840
NCBI-ProteinID: XP_001446055
Genoscope: GSPATT00001699001
UniProt: A0D6J1
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 828 aa
MVKAYFGYKFETLFGSIGNNGGVIINDIAYTIVDQYLLLLNIKTQEIIQQIVIEGKNIKI
TKIAIKDNTLAIGYHDGEIIIYNLIDNEVQCRFFNHQSEITQLVFLSEAVLISGSCDTSI
IVWDLADQQLQFRLIGHSNQITALDIISLEDQSLAITQQFIVSGSKDGLVKIWDLNLECS
IATLSSMHSEVTCLCVYENYLLICTNSDEVLIKSCQLISGKCQIDNDGIIKRQSFIRAVQ
CQFVQQKLLILNNEKKIEVYKSKQGKKLQKAENFSQSLIYSTVISQLNKIVYFQAMVFKN
LLKIYIFTSDNQIVIKELNNDNVDENNNVAIQQITGQVKQIKLTQNDHKLVVIASNKCYQ
FDNETAQQVNCLTNTSNLTSLCILPKNKYFMVGDEQGTLYLVDMNQNEIVFEQKIHNSNI
NSIECHENCKAFNGLVIMTTEIDKKVNFVELFFNKTQKCLEFQVVNTIYLKENIRSAQFS
YDGNYYAFAQMNNIVSIYYCDSHKLYLELYGHSLPVLTFAYTSDDTIVISAGADKSIKLW
ATDFGNCKKTLKAHTAEVIQIKTVNETHYFFSGCKDNIIKYWDGDTYQLILQFNEALAGV
QSMAVGCIGDLFYSATKNGVIRKYVQTKEQIFVSEEEEKRLQETLMQELQNKNKQQTGFD
QGLDQVKKDLTLVQIGQQKLLETEQLMDILEKIKQYRETIDQGEVPNEDLFYNKNVTEYL
FDNLQNSDLSSLMKFLHHQHLVTLIDEMNQDLALKQYPIIINKLITYIFNKVDGFGFNSH
EIMMKVINIRTQLQIYFKKEKKIAGYNLDILNLMIQDISKNQDDFIFE
NT seq 2487 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtaaaagcctattttggatataaatttgagactctttttggtagtattggcaacaat
ggaggagtaataataaacgatatcgcatatacaatagtagattaatatttgcttttgcta
aatataaagacacaagagattatttaataaatagtaattgaaggtaagaacataaaaatt
acaaaaattgctataaaagacaacactttggcaataggatatcatgatggtgaaataata
atatataatctgattgataatgaagtttaatgcagattttttaaccatcagagtgaaata
acctaattggtatttttgagtgaggcagttttaataagtggaagttgtgacacttctatt
attgtttgggatctagcagattaataattgtaatttagattgataggacattcaaattaa
ataactgccttggatatcattagccttgaagattaaagtcttgctataacctaataattc
attgtatcaggtagtaaagatggactcgtcaaaatatgggatttgaatctagaatgttct
atagccactctatcaagtatgcatagtgaagtcacatgtttatgtgtctacgaaaattat
ttgcttatctgcaccaattctgatgaagttcttattaaatcatgttaattgatttcaggc
aagtgtcagattgataatgatggaattattaaaagataatcctttattagagcagtccaa
tgccaattcgtttaataaaaattgttgattttaaataatgaaaagaaaattgaagtttat
aagtcaaaataaggaaagaagctacaaaaagctgaaaactttagtcaatccctaatttat
agcactgtcatatcttaattgaataagattgtatatttttaagcaatggtatttaaaaac
ctattgaaaatctatatattcacatctgacaattaaatagtaatcaaagaattaaataat
gataatgtggatgaaaataataatgtagcaatttaatagattacaggtcaggtcaaataa
attaaattaacttaaaatgatcacaaattggtagtaatcgcatcaaacaaatgttattaa
tttgataacgaaacggcttagtaggtcaactgtctcactaatacaagtaatttaacttct
ttatgcattttgccaaaaaataaatattttatggtaggggatgaataaggaaccttatat
ttggttgatatgaatcaaaatgaaattgtttttgaatagaaaattcataattcaaatatt
aacagtattgaatgccatgagaattgtaaggcatttaatggtttagtaataatgacaact
gaaatagataagaaagtgaattttgtcgagttattttttaataaaacttaaaaatgcttg
gaattctaagtggttaatacaatctatttaaaggaaaatattagaagtgcttaattttca
tatgatggaaattactatgcatttgcccaaatgaataatattgtatcaatctattactgt
gactctcataaattgtatcttgaattatatgggcattcattacccgttttaacttttgct
tatacttcagatgatacaatagtaatttcagcaggtgcagataagagcattaaattatgg
gcaactgattttggaaattgtaagaaaacccttaaagctcatacagcagaagttatttaa
ataaaaacagtaaatgaaactcactatttctttagtggatgcaaagacaatatcattaaa
tattgggatggagatacatattaattaatattgcaatttaatgaagcattagctggagta
taatcaatggctgttgggtgtattggagatttgttttattcagcaacaaaaaatggagtc
attagaaaatatgttcaaaccaaagaataaatttttgtttcggaagaggaggaaaagaga
ttgcaagaaactttgatgtaagaattataaaataagaataaataataaactggatttgat
taaggcttagattaagtcaaaaaagatttaactttagtgtagattggataataaaaacta
ttagaaactgaataattaatggacattctggaaaagattaaacagtatagagaaactatt
gattaaggtgaggttccaaatgaagatctattttataataaaaatgtcactgagtattta
tttgataatctctaaaattcagacttgagttcccttatgaaatttttgcatcatcaacat
ttggtaactttgatagacgaaatgaattaagatttagcattaaaatagtatcccatcatc
attaataagttaataacttatatctttaataaggttgatggatttggattcaattcacat
gaaattatgatgaaagtgataaatatcagaacttaattacaaatctattttaagaaagag
aagaaaattgctggatacaatcttgacattctcaatttaatgatttaagatataagtaaa
aattaagatgattttatttttgaatga

DBGET integrated database retrieval system