Paramecium tetraurelia: GSPATT00005057001
Help
Entry
GSPATT00005057001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14833
nucleolar complex protein 2
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
GSPATT00005057001
Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
GSPATT00005057001
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Noc2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5013490
NCBI-ProteinID:
XP_001427706
Genoscope:
GSPATT00005057001
UniProt:
A0BP41
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MNLALVWILILSISAFEVRINFEKATSETRRKNHFSSSTFESNKLKATEDDSKKYLDDYI
LTIPLTLGQTQLKQTIDTTSYISWVYTKQTETNLCTNCPNDAEIFKCEGSCQYSKTADDQ
KKIPLTTENTYGGRVVVTGSYATQDSLELMGLKANQVGLGLIDNLNAKEDPKYDFKAKNG
VIGFAYGSDYIEYKNKKNAMVGEVKNEPPLEQTHSLLQQFHSQLNNVQASTFAIKLEDNL
SLLIIGEQSNYFAESKFTQFTNVGKKAWALKVKKIAYGLEGNFASTGTAIFDSTTRFIWA
DNSVIQSFLKEIKNFQIECTQEDGLYKCPCNDEQFEKYKDIYFSFNLQDKIAYPLSKQDY
IHREQNQCYLIHQQLNKRNLMSLFHIHSLKKILCCSIQDTNQISISHSYQVNPDEIHSPK
IQFFTQQLSEYCCFCCHYSFWQIVCIKLLMIRIICIKLTLVRVDNQDLLLIISNHNNNNN
NNNNNKCLNSINNINNPNQPCLELLKHINNSLKELNLLNIKVVSIILAHKELTKSEQTLR
DNICQGNIDDENVINKIIQNNSIRFFILSLFKVQLFHYQLSLQDKATYSLNQVNMIYLYL
QTKQYSYKKYNIVASYNEIINQLQNQYYIYSLFKDLYKSRIQVIIIIFYIKNRLIDRFYN
STLCLASFRNLRSLFWTKRAQLLEIFNSLFILGLILIATCNRQLLKYINVIKQHIQLMII
NQLFEKLTESPNFKSISLLIKLFRLASKGDQDEDQPDQAIAKYCQEPEDYSKIIQFSLLQ
LPNILRDFYQVDYAETFKREHIESHIHQVIIRGFFIKAMNFLEHTIETQEAQEGTILFVI
RALGNLNIVLTAFESLQKKALKLLIQIWGDHLSLQIKLQAFVQVRKVFQSMADHQQQDIL
KKFYEKYLESAKHVLWRNYEAINFMINCITELCNLNMNQAYQVVYLSLQRLVKKIRDASV
SKNQQNVLSIYNQQTLNVLKLWAQVICTHKRENQLADLMPPFIQITQSVLDFYPCIENYT
FQLQLIDILIKVSQVYKVNQNLLSYILRMLNCAELKRRKLKSSVKPYDFLINISIKPKYK
QSGTFWADFCQQIVNKIVIYLSIFSTEKWFYEYTLFLEKQLKRISEDFGFVGNKIKVKDL
IRLIEQHNKGEKGESNLQSEAQRLVYEQEELIKQKVMSEKQRQQAGEELEESEQEIDDEK
EQEYVLDEIRKYKEDKKKDAVAEEDYEGLSEYEGDPENYQEEPDGQDDLDDDSDN
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatctagcattagtttggattttaattctgagcatttcagcatttgaagttagaatt
aattttgagaaagcaacttctgaaacacgaaggaagaatcattttagcagttcaacattt
gagagcaataaattgaaggcaactgaagatgactctaaaaaatatttggatgattacatt
ttaacaattccattgactttggggcagacttaactcaaataaacaatagatactacttct
tatatctcttgggtttataccaaataaactgagactaacttatgtactaattgcccaaat
gatgcagaaatattcaaatgtgaaggaagttgctaatattcaaaaactgcagatgatcaa
aaaaaaatcccgttaaccactgaaaatacttacggaggacgtgtagtagttacaggctca
tatgcaactcaagattctttagaattgatgggattgaaggcaaactaagttggtcttgga
cttattgataatttaaatgcaaaggaggatcccaagtatgattttaaagcaaagaatggt
gtgataggttttgcttatggttcagattatattgaatacaaaaacaagaaaaatgctatg
gttggggaagttaagaatgaaccacctttggagtagacccacagtttactttaataattc
cattctcaattgaataatgtgtaagcatcaacatttgcaataaaattggaagataattta
tctttattgattattggagaataatcgaactattttgcagaatcaaaattcacttaattt
actaatgtaggaaaaaaggcgtgggctttgaaagtaaaaaagattgcatatggtcttgaa
ggaaactttgcatctactggaactgccattttcgatagcaccactagatttatttgggct
gataattcagtaatccaaagcttcctaaaggagattaagaatttccaaattgaatgcact
taagaagatggcctatataaatgcccttgtaatgatgagcaatttgaaaaatataaagac
atttacttctcatttaatctccaggataaaatagcatatccattatccaagtaggattac
attcacagagaacaaaactaatgttatctaatacattagcaactcaataagagaaaccta
atgtcattattccatatacattctttaaaaaaaattttgtgttgttcaatccaagataca
aaccaaatttcaatttctcattcatatcaagtcaatcctgatgaaattcactcccctaaa
atacaattctttacacagcaattgtcggagtattgttgcttttgttgtcattattccttc
tggtaaattgtatgcataaagctccttatgatcaggattatttgcattaagttgactctg
gtaagggtggataatcaagacctgttgttaattattagtaaccataataataataataat
aataataataataataagtgcctcaattcaattaacaatattaataatcctaaccagcca
tgtttggagctcctcaaacatattaataacagccttaaagagcttaacctcctcaatatt
aaggtggtctctataattctagcccataaagagctaaccaaatcggaataaactcttagg
gataatatatgccagggcaatatagatgatgagaatgttataaataagataatataaaat
aattcaattagattctttattttgagtctctttaaagtataattatttcattattaatta
tccttataggataaagcaacatattcacttaattaagtaaatatgatttatttgtatcta
tagacaaaataatactcttataaaaaatataatatagtcgcgtcttataacgagataatt
aattagttatagaatcaatactatatctatagtttatttaaagacctttataaatctaga
atttaagttattattataatattctatattaaaaaccgattaattgacaggttttataac
tctactttatgccttgcttcctttagaaatttgaggtctcttttctggactaagagagca
taactattagagatcttcaattctttattcatacttggtctaatactaattgcaacttgt
aatagacaattattaaaatacattaatgttatcaagtaacatatttaattaatgattatt
aatcaactctttgagaaactcacagagtcaccgaatttcaagagcatatctctattgatt
aagctttttagacttgcatcgaaaggagattaagatgaggattaaccagaccaagccatc
gcaaagtactgctaagaacctgaagattactcgaagattattcaattctcattactacaa
cttccaaatattttaagggatttttattaagtggattatgcagaaacatttaagagagag
catattgaatcacatattcattaggttatcataagagggttcttcatcaaagcaatgaat
ttcttggaacatactatagagacacaagaggcgtaggagggaacaatcctatttgttata
cgcgctcttggaaatttgaatatcgtgttgacagcctttgaaagtttgtaaaagaaggca
ttgaagttattgatacaaatatggggtgatcatttatcattgtaaatcaaattgcaagca
tttgtgtaggttagaaaggtgttttaatcaatggctgatcattagcaataagacattttg
aaaaaattttatgagaagtatttggagtcagcaaagcacgttctatggaggaattatgaa
gcaatcaatttcatgatcaattgtatcactgaattgtgcaatctcaacatgaatcaagct
tattaagtagtgtatttgagtttacagagattggtgaaaaagatcagagatgctagtgtt
tctaagaatcaataaaatgttttatccatttacaattaacaaaccttgaatgtactcaag
ttatgggctcaagtaatttgtactcacaagagagagaattaattggctgacttgatgcct
cctttcattcaaatcactcaatcagtgttagacttttatccttgcattgaaaattacacc
ttctaattatagttgattgatatcttaatcaaagtgtcttaggtgtacaaggtcaactaa
aatctgttgagttatatacttagaatgttgaattgtgctgagttgaagaggagaaagtta
aagagcagtgttaagccatatgactttttgatcaatatatcgattaaaccgaaatacaaa
taatcgggaacattttgggctgatttttgttaatagatagtcaataagatagtgatttac
ttatccatattctccactgaaaagtggttctatgaatacaccttatttttggagaaataa
ttgaaaagaatctcagaagattttggtttcgtgggcaataaaattaaggtgaaggatttg
attcggttaattgaacaacataataaaggagaaaagggggagagcaatttgtagagtgaa
gcttagagattggtttatgagtaggaggaattgattaaatagaaggttatgtctgagaaa
tagagacaataagcaggggaagaacttgaggaatctgaataggaaattgatgatgagaag
gaataagaatatgtgttggatgagattcgaaagtataaggaggacaagaagaaggatgct
gttgctgaagaggattatgaagggttaagtgaatatgagggagatcctgagaattattag
gaggagcctgatggataggatgacttagatgatgattctgataattga
DBGET
integrated database retrieval system
