KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00005259001
Entry
GSPATT00005259001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20178  vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04148  Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04148 Efferocytosis
    GSPATT00005259001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00005259001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Endosome - Lysosome transport
  Tethering complex
   CORVET complex
    GSPATT00005259001
SSDB
Motif
Pfam: TPR_Vps8
Other DBs
NCBI-GeneID: 5013691
NCBI-ProteinID: XP_001427907
Genoscope: GSPATT00005259001
UniProt: A0BPP2
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1234 aa
MFKFVEYKNFEQFHQFLNSHPQVTYQEIIKHPLQEFQFENEFVNPIIVKQSVKLPFQEYI
NIMHCSNRFVYLGSQKRVQVFDIRTGIKLIQKLEIQNSLIIQETEDCLFILQLEYILLIE
ISKDFSIIGTYKLEQVQVPFSFLRVINESQKQLDWYEVVIADLKGNSSKIKCNIFKLFNK
RNVQFSTQELTQSGSIIDSKQKKFNDSGFSILYELLVLQGSNENYAFLLYQMHNRISIIR
VSKTNKETPVQLYNLQNDQIDSGWACLSTCLDNSSQIRYSFCCSYGNVIHLFMYEIFGGS
ITVDEIGVKQLENERKINGLECCDSDIFVVLFDDGFALVHTTEFKMCENKLNYLNQSLKI
KKFNGHFMLGLTEDSFEFMMLQDCRTLLQNQADQLEFRKAMQNAVRIMNGDLLMIKIAPS
DQLSELLQKLAFTECLFLGKQKNLTVQSLSEIIKFLIKTKQEHYLFTIISDVTSDLGYKD
VFVNTIESLLRQHQIPYIPDQQLYELCKMYQNQQNVEMIHHLVCSTDFHRISSAILITCC
EQMKMYNEMIYVCQMSQDFVTPLVKLFGGDQLLEECQKYILSILEGKSFEGKNLTDEQFT
IALRSLIQFLFVSENLFKFINKDPKGAIDIIYQFYIGKAQTCIENSGAEIVLKFQVDETE
SSLFDFDQNNVRSSTHRLMYLSVRKLEFPKSDIWISYLTAKLLIQKFSFSSQVAYETIYT
LCRNYEFLLQLNNDILLVNQFIIRVMMSKKLTEQQLSDLEFSASIVKKFSLALVFIYSQQ
QQYKKAFEAFKIVNPQIRELIFPWIQQLVELRPMILNSQNDEFILEILKYLITIDEQQTY
KLIEKCFHQKHFQILSCFQKDFEDQKYFANFISYLFQSQKVFLINDQTKILYLKRLCETQ
PKQVLQAIKSMNFPLDEALRLAKEFKINQAAAYIHQISGAIKQALDIYINSFLKKIKKSI
ALLMKKQTLDNNCTDKLKCKLETIIQMILEDLKQNQSNNDDDQTLWMHFVNLYINQNKIR
TFIMPNIPQSVKDLLSLYLSEYLARISDKVQVSQIFDQLNLNYPQLPVSVFRQTIYRVVS
KFHDDLRTLKETSLIQSNEKYQIIQQLKEINQSAWICNHICQRCQNHIIDSELAIAFTCS
HVFHDYCVLKGIYKIPFCDTCQTETSYKIQKERVLKQYAVTQQISESKFLQQMSVNKISV
ISNQQQQLQTRKDKKQLIKRFDFELQQKYDYSWA
NT seq 3705 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaaatttgtagagtacaaaaactttgaataatttcattagttcttgaattctcat
ccttaagtcacatatcaagaaattattaaacatcctctataagaatttcaatttgaaaat
gaatttgttaatcctattattgtcaagcaatctgttaagttaccctttcaagaatatata
aacattatgcattgttcaaatagattcgtatacctaggcagtcaaaaaagagtccaggtt
tttgatattagaactggaattaaattgattcagaaactagaaatataaaattcccttata
atctaagaaactgaggattgcttgttcattttacaactagaatacatattattaattgaa
atctcaaaggatttttcaattattggtacctataaattagaataagtttaggttcctttt
tcatttctaagagtgattaatgaatcctaaaaacaattagattggtatgaagttgtgatt
gctgatctcaagggtaactcttccaaaatcaaatgcaacatttttaagctctttaataag
aggaatgtataattttcaacctaggagctaacataaagtggatcaattatagattcaaaa
caaaaaaagtttaatgattcaggatttagcatcctttacgagttattagtcttacaagga
agcaatgaaaattatgcattcttattatatcaaatgcacaatcgaatttcaattattaga
gtaagcaaaactaataaagaaacaccagttcaattgtataatttatagaacgatcaaata
gattctggttgggcatgtctatcaacttgcttagataatagtagttaaattagatattca
ttttgctgtagttatggcaatgtcattcatttgtttatgtatgaaatttttggaggctca
attacagttgatgaaattggagtcaagcaattagaaaatgaaagaaaaataaatggtctg
gaatgttgtgattctgatatatttgtagttttatttgatgatggctttgcacttgtgcat
acaacagaattcaagatgtgtgagaacaaattaaactatctcaatcaatctttgaaaatc
aaaaaatttaatggtcactttatgttaggcttaactgaagactcttttgaattcatgatg
ctataagattgtagaactttgttatagaaccaagcagattagttggagtttagaaaagct
atgtaaaatgcagttagaattatgaatggtgatttattaatgattaaaattgccccttct
gattaattatcagaattactctaaaaattagcctttactgaatgcttatttttgggcaaa
taaaaaaatctaactgtctaatccttatccgagattattaagtttttaataaaaactaaa
caagagcattatttatttactattatcagtgatgtcacatctgatttgggatacaaagat
gtctttgttaatacaattgaaagcctacttagacagcattagattccttacatacctgat
taataattatacgaattatgtaaaatgtattaaaattaataaaatgttgagatgatacat
catttagtttgttcgactgattttcataggatatcaagtgctatattaattacttgctgt
gaacaaatgaaaatgtataatgagatgatctatgtttgtcaaatgtctcaagactttgta
actccgcttgtaaaattgtttggaggagattagttattagaggaatgccaaaaatatatt
ttgagcattttagagggtaaatcatttgaaggaaagaatctaactgacgaataatttact
attgctttacggagtttaatttagtttctatttgtaagtgaaaatctatttaaatttatt
aataaagatccaaagggagctatagatataatatattaattttatattggtaaagcataa
acttgcattgagaatagtggagcagagattgtattaaaattttaagtcgatgagactgaa
agctctctatttgattttgactaaaataatgtgcgaagttcaacccatagactaatgtat
ttatcagttagaaaattagagtttccaaaatcagatatttggatatcatacttaactgca
aaattgttaatataaaagttttctttttcatcccaagtagcctatgaaacaatttacaca
ctatgtagaaactacgaatttctattataactcaacaatgatatactattagttaatcaa
tttatcatccgtgtgatgatgtcgaaaaaacttacagaacaataattgtctgatttagag
ttttcagcttcaattgttaaaaagttttctttagctttagtcttcatatattctcaataa
caacaatataaaaaggcttttgaagcatttaaaatagtaaatccttagattagagaacta
atttttccgtggatttagtaattggttgaattaaggccaatgattttgaattctcaaaat
gatgaatttatattagaaattttgaaatacctaattacaatagatgaataataaacgtat
aaattaattgaaaaatgttttcatcagaaacacttttagatattgagttgtttttaaaaa
gattttgaagattagaaatactttgctaatttcatatcctacttgttttaatcttaaaaa
gtgtttttaattaatgattaaaccaaaatactctatctcaaaagattatgtgaaactcag
cctaaataagtattataggctattaaaagcatgaattttccattggatgaagcattaaga
ttggcaaaggaatttaagatcaattaggcagctgcctatattcattaaattagtggagct
ataaaataagcattggatatatatatcaattcgttcttaaagaaaatcaaaaagtctata
gctttgctaatgaaaaagtagactctggataataattgcactgataaattaaagtgtaaa
ttagaaaccattatttaaatgattttagaggatttaaagtaaaattaatctaataatgat
gatgattagacgttatggatgcattttgtcaatctatatataaatcaaaataaaataaga
acattcattatgccaaatatcccttaaagtgtgaaagatttattgagtctttatttaagt
gaatatttagcaagaatcagtgataaagtctaagtctcataaatatttgatcaattaaat
cttaactatccttaattaccagtatctgtatttagatagactatttatagagttgtgagt
aagtttcatgatgatctaagaacattaaaagaaacttcattaatctagagtaatgagaaa
tatcagatcatacaataattaaaagaaattaattaaagtgcatggatttgcaatcatatt
tgttaaagatgttaaaatcatataattgattctgaacttgctattgcttttacatgttct
cacgttttccatgattattgtgtcttaaaaggcatctataaaattccattttgtgacaca
tgctaaacagaaacttcatataagatttaaaaggagagagttttgaaataatatgctgtc
acataataaatttctgagtctaagttcctttagtagatgtctgtgaataaaattagtgtg
atatcaaatcaacaataatagttgtaaacaaggaaggataaaaaataattgattaagaga
tttgattttgaattatagtaaaagtatgattattcttgggcttga

DBGET integrated database retrieval system