Paramecium tetraurelia: GSPATT00005259001
Help
Entry
GSPATT00005259001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20178
vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
GSPATT00005259001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00005259001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
GSPATT00005259001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_Vps8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5013691
NCBI-ProteinID:
XP_001427907
Genoscope:
GSPATT00005259001
UniProt:
A0BPP2
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1234 aa
AA seq
DB search
MFKFVEYKNFEQFHQFLNSHPQVTYQEIIKHPLQEFQFENEFVNPIIVKQSVKLPFQEYI
NIMHCSNRFVYLGSQKRVQVFDIRTGIKLIQKLEIQNSLIIQETEDCLFILQLEYILLIE
ISKDFSIIGTYKLEQVQVPFSFLRVINESQKQLDWYEVVIADLKGNSSKIKCNIFKLFNK
RNVQFSTQELTQSGSIIDSKQKKFNDSGFSILYELLVLQGSNENYAFLLYQMHNRISIIR
VSKTNKETPVQLYNLQNDQIDSGWACLSTCLDNSSQIRYSFCCSYGNVIHLFMYEIFGGS
ITVDEIGVKQLENERKINGLECCDSDIFVVLFDDGFALVHTTEFKMCENKLNYLNQSLKI
KKFNGHFMLGLTEDSFEFMMLQDCRTLLQNQADQLEFRKAMQNAVRIMNGDLLMIKIAPS
DQLSELLQKLAFTECLFLGKQKNLTVQSLSEIIKFLIKTKQEHYLFTIISDVTSDLGYKD
VFVNTIESLLRQHQIPYIPDQQLYELCKMYQNQQNVEMIHHLVCSTDFHRISSAILITCC
EQMKMYNEMIYVCQMSQDFVTPLVKLFGGDQLLEECQKYILSILEGKSFEGKNLTDEQFT
IALRSLIQFLFVSENLFKFINKDPKGAIDIIYQFYIGKAQTCIENSGAEIVLKFQVDETE
SSLFDFDQNNVRSSTHRLMYLSVRKLEFPKSDIWISYLTAKLLIQKFSFSSQVAYETIYT
LCRNYEFLLQLNNDILLVNQFIIRVMMSKKLTEQQLSDLEFSASIVKKFSLALVFIYSQQ
QQYKKAFEAFKIVNPQIRELIFPWIQQLVELRPMILNSQNDEFILEILKYLITIDEQQTY
KLIEKCFHQKHFQILSCFQKDFEDQKYFANFISYLFQSQKVFLINDQTKILYLKRLCETQ
PKQVLQAIKSMNFPLDEALRLAKEFKINQAAAYIHQISGAIKQALDIYINSFLKKIKKSI
ALLMKKQTLDNNCTDKLKCKLETIIQMILEDLKQNQSNNDDDQTLWMHFVNLYINQNKIR
TFIMPNIPQSVKDLLSLYLSEYLARISDKVQVSQIFDQLNLNYPQLPVSVFRQTIYRVVS
KFHDDLRTLKETSLIQSNEKYQIIQQLKEINQSAWICNHICQRCQNHIIDSELAIAFTCS
HVFHDYCVLKGIYKIPFCDTCQTETSYKIQKERVLKQYAVTQQISESKFLQQMSVNKISV
ISNQQQQLQTRKDKKQLIKRFDFELQQKYDYSWA
NT seq
3705 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaatttgtagagtacaaaaactttgaataatttcattagttcttgaattctcat
ccttaagtcacatatcaagaaattattaaacatcctctataagaatttcaatttgaaaat
gaatttgttaatcctattattgtcaagcaatctgttaagttaccctttcaagaatatata
aacattatgcattgttcaaatagattcgtatacctaggcagtcaaaaaagagtccaggtt
tttgatattagaactggaattaaattgattcagaaactagaaatataaaattcccttata
atctaagaaactgaggattgcttgttcattttacaactagaatacatattattaattgaa
atctcaaaggatttttcaattattggtacctataaattagaataagtttaggttcctttt
tcatttctaagagtgattaatgaatcctaaaaacaattagattggtatgaagttgtgatt
gctgatctcaagggtaactcttccaaaatcaaatgcaacatttttaagctctttaataag
aggaatgtataattttcaacctaggagctaacataaagtggatcaattatagattcaaaa
caaaaaaagtttaatgattcaggatttagcatcctttacgagttattagtcttacaagga
agcaatgaaaattatgcattcttattatatcaaatgcacaatcgaatttcaattattaga
gtaagcaaaactaataaagaaacaccagttcaattgtataatttatagaacgatcaaata
gattctggttgggcatgtctatcaacttgcttagataatagtagttaaattagatattca
ttttgctgtagttatggcaatgtcattcatttgtttatgtatgaaatttttggaggctca
attacagttgatgaaattggagtcaagcaattagaaaatgaaagaaaaataaatggtctg
gaatgttgtgattctgatatatttgtagttttatttgatgatggctttgcacttgtgcat
acaacagaattcaagatgtgtgagaacaaattaaactatctcaatcaatctttgaaaatc
aaaaaatttaatggtcactttatgttaggcttaactgaagactcttttgaattcatgatg
ctataagattgtagaactttgttatagaaccaagcagattagttggagtttagaaaagct
atgtaaaatgcagttagaattatgaatggtgatttattaatgattaaaattgccccttct
gattaattatcagaattactctaaaaattagcctttactgaatgcttatttttgggcaaa
taaaaaaatctaactgtctaatccttatccgagattattaagtttttaataaaaactaaa
caagagcattatttatttactattatcagtgatgtcacatctgatttgggatacaaagat
gtctttgttaatacaattgaaagcctacttagacagcattagattccttacatacctgat
taataattatacgaattatgtaaaatgtattaaaattaataaaatgttgagatgatacat
catttagtttgttcgactgattttcataggatatcaagtgctatattaattacttgctgt
gaacaaatgaaaatgtataatgagatgatctatgtttgtcaaatgtctcaagactttgta
actccgcttgtaaaattgtttggaggagattagttattagaggaatgccaaaaatatatt
ttgagcattttagagggtaaatcatttgaaggaaagaatctaactgacgaataatttact
attgctttacggagtttaatttagtttctatttgtaagtgaaaatctatttaaatttatt
aataaagatccaaagggagctatagatataatatattaattttatattggtaaagcataa
acttgcattgagaatagtggagcagagattgtattaaaattttaagtcgatgagactgaa
agctctctatttgattttgactaaaataatgtgcgaagttcaacccatagactaatgtat
ttatcagttagaaaattagagtttccaaaatcagatatttggatatcatacttaactgca
aaattgttaatataaaagttttctttttcatcccaagtagcctatgaaacaatttacaca
ctatgtagaaactacgaatttctattataactcaacaatgatatactattagttaatcaa
tttatcatccgtgtgatgatgtcgaaaaaacttacagaacaataattgtctgatttagag
ttttcagcttcaattgttaaaaagttttctttagctttagtcttcatatattctcaataa
caacaatataaaaaggcttttgaagcatttaaaatagtaaatccttagattagagaacta
atttttccgtggatttagtaattggttgaattaaggccaatgattttgaattctcaaaat
gatgaatttatattagaaattttgaaatacctaattacaatagatgaataataaacgtat
aaattaattgaaaaatgttttcatcagaaacacttttagatattgagttgtttttaaaaa
gattttgaagattagaaatactttgctaatttcatatcctacttgttttaatcttaaaaa
gtgtttttaattaatgattaaaccaaaatactctatctcaaaagattatgtgaaactcag
cctaaataagtattataggctattaaaagcatgaattttccattggatgaagcattaaga
ttggcaaaggaatttaagatcaattaggcagctgcctatattcattaaattagtggagct
ataaaataagcattggatatatatatcaattcgttcttaaagaaaatcaaaaagtctata
gctttgctaatgaaaaagtagactctggataataattgcactgataaattaaagtgtaaa
ttagaaaccattatttaaatgattttagaggatttaaagtaaaattaatctaataatgat
gatgattagacgttatggatgcattttgtcaatctatatataaatcaaaataaaataaga
acattcattatgccaaatatcccttaaagtgtgaaagatttattgagtctttatttaagt
gaatatttagcaagaatcagtgataaagtctaagtctcataaatatttgatcaattaaat
cttaactatccttaattaccagtatctgtatttagatagactatttatagagttgtgagt
aagtttcatgatgatctaagaacattaaaagaaacttcattaatctagagtaatgagaaa
tatcagatcatacaataattaaaagaaattaattaaagtgcatggatttgcaatcatatt
tgttaaagatgttaaaatcatataattgattctgaacttgctattgcttttacatgttct
cacgttttccatgattattgtgtcttaaaaggcatctataaaattccattttgtgacaca
tgctaaacagaaacttcatataagatttaaaaggagagagttttgaaataatatgctgtc
acataataaatttctgagtctaagttcctttagtagatgtctgtgaataaaattagtgtg
atatcaaatcaacaataatagttgtaaacaaggaaggataaaaaataattgattaagaga
tttgattttgaattatagtaaaagtatgattattcttgggcttga
DBGET
integrated database retrieval system