Paramecium tetraurelia: GSPATT00005652001
Help
Entry
GSPATT00005652001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K17263
cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
GSPATT00005652001
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
ptm04147
]
GSPATT00005652001
Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
Multi subunit type E3 associated proteins
GSPATT00005652001
Exosome [BR:
ptm04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of haemopoietic cells (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
GSPATT00005652001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5015588
NCBI-ProteinID:
XP_001429804
Genoscope:
GSPATT00005652001
UniProt:
A0BV39
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1175 aa
AA seq
DB search
MDQKKIDPLILEALTNPDPDIQYMRAEELTNELTTYYGKPEQGMEDEKNQKLINNCYRVF
YQHLSSQYREIQGIGIELFIIGNAIRQFQRLAPLMRSREVSYISLELLKSSIEGMSDVRE
NYHICLQEIVEKISSQVISLEEVQETIIQKLDELKVNVKKLQVSNQIVHQEIQKNVEIQA
ELLKILSLIMSRWPKLYYKDFGDLLLDNITNSNELSIRKNSCVCLGHLGACLNQESLNHL
IQQKILPFTKELKFDQQNFTKILYLNQSLNYLAKSSGKYFDKTLVEQIFYRYIQTQNEHS
KIDLDNINQYAEILEIQLLTINYLLSNYYARSFDLQLIEQITPLIDFDPLGVATIEEENA
YEDDYYADETSDSTWRVRRCALYTFQELLKIQPQLYKLILSALFGPNQIIMKRMNEKNPE
IKLSIIQFLIGLVQASAIIKEDINIMEVEQLSLIKQRSIPASISLIELVEQLLEQIQSIF
KDSQEQQSLKSETTKLLLAIGQYFHSQIQTSHSCFSKIVEIINESITGSSMHYSNEQKLA
SILTMKTILKITESAEFQVQILQQMVLILLEAVNQKYIRIQVEGYNTLEKIIEVFKLNFE
EVTFSQSLAQIKQNLITKILIDNLDQEIKQSLFSLAATLFKNFGSIFSKAEVEQLAQISL
VRLQIEALTNNIINLVQYFKNLNDPKVLISNIANQLQRNDKAQTYNTLIQLIQNNKVDQQ
LAVDILNRFKQITIENYDLQIQTLQVLIKVTGIKLPEQLIRESVKIGLYQTKIKSEIEDY
FHLINQPQIIEQEVSRQLGKEELYPAGQIYCQILKNVPGSLSSLYSSIGTNRQLKLSTLR
FLHKYQKDQKAIEILCKLIKDNQDSDLAAIVIGSAISDIQQIQNLIEQNPNQYQFYQALK
EFTEINTISNPANIASYILNQVNGKDKTISTICGDILGGLVKQNYKSLEQILFESLKSPS
QNVRFSCIQSLKYSNQWASKSQILFEMLQNEKDIQILTAIIKALTQNIQHIKLINLTQYL
TFTLRRYEEKELNFGNFVEKRDDAKDLRSLSFDLLELFIDKYNLEMKPILVEVFDKFVED
KYDETRIPRLRIIQKIVKKDPVILGQYYEILIKTFEPILKTLIQNLQKQDQNLDKEKEKI
RLIVQILQGLRQNSKEVDEIYRKYVTKQIQDFVCQ
NT seq
3528 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattagaagaaaattgatcctctgattttggaagccttgaccaatccagaccctgac
attcaatatatgagagctgaagaactcacaaatgagttgacaacatattatggaaaacca
gaataagggatggaagatgaaaagaatcaaaagttaattaataattgctatagagtattt
tattagcatttatcatctcaatatagagaaattcaaggtattggaatcgaattatttata
ataggaaatgcaattagataattttaaagattggctcctttgatgagatcaagggaagta
tcatatatttctctagaattattgaagtcgtctatagaaggaatgagtgatgtaagagaa
aattatcacatttgccttcaagaaatagtagaaaagatttcaagtcaagttatcagctta
gaagaagtttaagaaacaattatataaaaattggatgaattgaaagtaaatgttaagaag
ttgtaggtgtcaaattaaatagtccatcaagaaatctagaaaaatgttgaaatataggct
gaactccttaagattttaagtttaataatgtctagatggcccaaattatactataaagac
tttggagatttattattggataatatcacaaactcaaatgaattgtcaataagaaaaaat
tcatgcgtatgtctcggtcatttgggagcatgcctaaatcaagaaagtctaaatcattta
atccaataaaaaatacttccatttacaaaggaattaaaatttgattaacaaaatttcact
aaaattctttacttaaattagagtttgaattatttagcaaagagttctggaaaatatttt
gataaaaccttagtggaatagattttttatagatacatttagacacaaaatgaacatagt
aaaatagatttagacaatattaattaatatgctgagatattagaaatttaattgcttaca
ataaattacttactatcaaattattatgcacgttcatttgacctctaattaattgagtaa
ataacacctttgattgattttgatcccttaggagtagcaacaatcgaagaagaaaatgca
tatgaagatgattattatgctgatgaaacctctgattcaacatggagagtaagaagatgt
gcattatatacattctaagagttattgaagattcaaccataactctataaactaattctg
tcggctctgtttggaccaaatcagatcattatgaaaaggatgaatgaaaaaaatccagaa
attaaattatctattatttaatttttgattggtttggtttaagcatctgctattataaag
gaggatataaatataatggaagttgaataattatctttgatcaagcaaagatctatccca
gcctctatctcacttattgaattggtagaatagttattggaataaatttaatctatcttt
aaagactcttaggaacaatagtctttaaaatcagaaaccacaaaattattattagcaatt
gggcaatatttccactcccaaatttagacatcacattcatgtttttcaaaaattgttgaa
atcatcaatgaatcaattactggttcttctatgcattattctaatgaataaaaacttgct
tctattttaacaatgaaaactatacttaaaattacagagtcagcagaattttaagtgtaa
attttgcagcaaatggttttgatacttcttgaagcagtcaattaaaagtatatcagaatt
caggttgaaggttataataccttagaaaagataattgaagtgtttaaattgaactttgaa
gaggtaacattctcatagtctttggcataaatcaaataaaatctgatcacaaaaatattg
atcgataatttagatcaagagatcaagtaaagcttattttcacttgcagctacactcttc
aaaaactttggatcaatattttcaaaagcagaagttgaataattagcttaaatctctttg
gtcagattataaattgaagccctaactaacaatatcatcaatcttgtctaatatttcaaa
aatctaaatgaccctaaagtgttaatttcaaatattgctaattaactttagagaaatgat
aaggcttaaacatataatactttaattcagttaatccaaaacaataaagttgatcaatag
ttagcagttgatatcctaaacaggttcaaatagatcacaatagaaaactatgatttgtaa
atttagactttacaagtattgattaaagttacaggcatcaaattacctgaataacttata
agggagtcagttaaaattggattgtatcaaacaaaaataaagagtgaaattgaagattac
ttccatttaataaattaaccttagataattgaataggaagtttccagacaactaggaaag
gaagaattatatcctgctggataaatatattgctagatattaaaaaacgttccaggctca
ctcagttctttatattcttcaataggcactaacagatagttaaaattatcaactttaaga
ttcttgcataaatattaaaaagactaaaaagcaatagagattttatgcaaattaatcaag
gataattaggactctgatttagctgctattgtaataggatcagctatttctgatattcaa
taaatataaaatttgattgaataaaatcctaattaatactagttttatcaagcattaaag
gaattcacagaaattaatactatttctaatcctgcaaatattgctagttatattttgaat
taggttaatggaaaagataaaacaatatccaccatatgtggtgacattttgggtggttta
gtaaagtagaattataaatctttagaacaaattttgtttgagagtcttaaaagtccttct
tagaatgtcagattttcttgcattcaaagtctaaaatattccaatcaatgggccagcaaa
tcttaaatcctatttgagatgttgtaaaatgaaaaggacattcaaatactaactgcaatc
atcaaagcactcacctaaaacatataacatattaaattaatcaatttaacttaatattta
acatttactttaaggagatatgaggaaaaagaattaaattttggtaattttgttgagaaa
agggatgatgctaaggatctaagatctctgtcctttgatttattagaattattcatagat
aaatacaatcttgaaatgaaaccaattttagtagaagtctttgataaatttgttgaggat
aaatatgacgaaactagaatacccagattaagaattatctagaagatcgttaaaaaggat
cctgtgatattgggtcaatattatgaaattttaatcaaaactttcgaacctattcttaag
acattgatttaaaatttacaaaaataagattaaaatttagataaagaaaaagaaaaaatc
agattaatagtctagatactataaggactaaggtaaaattccaaagaagtagatgaaatt
tacagaaaatacgtaactaaataaatttaggattttgtatgctaatga
DBGET
integrated database retrieval system