Paramecium tetraurelia: GSPATT00005905001
Help
Entry
GSPATT00005905001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K11840
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9/24 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ptm01002
]
GSPATT00005905001
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
GSPATT00005905001
Enzymes [BR:
ptm01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
GSPATT00005905001
Peptidases and inhibitors [BR:
ptm01002
]
Cysteine peptidases
Family C19: ubiquitin-specific protease family
GSPATT00005905001
Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
UBP/USP
GSPATT00005905001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UCH
ARM_UBP24_USP9X-Y
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5017235
NCBI-ProteinID:
XP_001431451
Genoscope:
GSPATT00005905001
UniProt:
A0BZT6
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
2377 aa
AA seq
DB search
MDVKKSKKKPELNEQLFVGNYIDVFHQGSKQHKLAYILQKNEKEIEITYDGLSKKDNEII
KLSQNKINFARRFTQNYTGEDFRQSKTSRDYLKYSREDCEKNIKELNSIMQNNFQGLSPI
EICLSVRVRQFIWLDMVLSSEFPSKELPVALEYIKTYYNFIKWYFEQFPKYFADYMRFQN
NQELYILDERVSIAACLQEVCEAFCMLFGSIWRVLKQENSFFYLNCDNLQQQFDKFFPPS
SQQGFVVNPNIDDWKLYQGASDIVKCIKKTWPFYLRTMSFFKSIGGLQAWEGLLKPQENG
EYNYIPLKAMNRIVITQQYLSSYFQLSDQAQMAKKTFEWLQNRVNNLTVQDIKDTDIDQV
KELTSDYQYYFLKGFTEDQLNKLTDEIQLQLALKFLKSSFLEKRVKGISEIKDFTERSKY
EQQTSLKFRSSISKDDLIRWISQNRILDYTLLGDSVHPELIKRSSDVAVFLCRNQAFQID
YIDKIWKNNHDKHETTQLALYEFFKIVSPYLSFQGIEKLYNHISTIPYSKYNENIVSMIK
TFTESALSQKFHEQQLQLKPEKRFMTFNQLWELLQDRDDQLTNSVIQEQCFSAARMIISQ
IQQTKQFISQYFGKCFELIGAHQSVYQAISLVHYFLDKQFKDDIIGKRELIQSTDDKYNI
IELFVKDIEVYMEKVRQYFKNDIPQDIVINGVQKFSQNVFFRLQMLNYLLSQTHLKITYE
QTVRLWDALSAKTKGGIQKKELNKILITNYQIDVNSFRICPIYFDKEGEQKFFKQVLCNP
DRNDYENYTIEDFELFQVFFRSYNQSHQTLKYFNNSSRFLVNDHNFEGKSAIWNIFAKVK
DQQLLEQISYFIINLYTQLNSNLDQQCDKIYQEMMDKCLDLIQQQCPSLTTRSINLLLQL
FNYFQSGPPSKKSTKPINYTQFKVQIQYPNNLVKSVEQKEGDTTTINQWKQKLAEELQVA
YLQLDITIENKPIEQQYDIVETFVCQAFYQLATVKVKINNKNHPKNYLSQEQRTFEILFK
LLDKQESIEFLSQVWDLINRLPINIIKKRQVETCKDWKQYLDHQFFDMFYVLQIILKLLD
NEQWSEQFNNFDGVDLITQKFLGQQLQFQQRPLEIKCCLTYLEILSHPQIKMKESQLVDQ
IKSKIIEVIQQLCQYIKTKKKLESGQRKSPQQKEMNEIESRLLRKCFLQLDDDGCRQYIK
NSELNQQLYAFFVEHENQELKREYSLQLLNMKNTPESQLLIKIILEDVLKNVISNNKQKC
DHFFEFCCNLIYQEKNLNIRNLNFEELLVYIRQNLEQLPCNENTVKDQDKILIGLLKLLN
ALIDRIQSLSTHQGLFEQILSYLFENEGETRCKCKSQQSRTAGFHCFFTLLKSTKNMQKF
LDVVSPLHYTHTWRTKNFNDWNIQSKFHEKSSTGYVGLYNLGCICYMNSLLQQLYMVPAF
REKLLQIEDKSTGALEENLLHQLKCLFLALKHSQKQYHNPKKLCHAFKDLDGHPTNIFEQ
MDVDEFCNLLMDRIELSIKSTSDEDLVKRNFGGVISNEIIGKTCPHYSEREEPFFAISLP
VANKKNLEECLQTLVHGDLLEGENAYSCEQCNKKVSALKRTCIKKLPDHLILVLKRFNFD
FDLMAKAKINERIEFPFELDLLPYSQQGLRQQENRVNPENGQDNPSEYYQYRLTGVVIHI
GSADCGHYYSFIQDRVDFNKWYEFNDINVSPADIKDVKNDGFGGVDRMLKTKYPGQFKDK
SKSAYMLFYERVKPLNNKEELMDIELDQKTSQFLDEIRDENRKFQIQRFIFSPEYFIFIQ
NLIKFELQQNQVSEQIVKTLVFFYLTCAVRENDKTFISNNIQDIQELLRRAPSTCEWLLK
CFNQYQYIREFQFDCSKKMVRKYVISLIVTAIETVQKLEGYNVLQEYTDDKPKSLVASLI
NSWIRMIPDLKKSLKNSIEYYDLFYRFAKLSQQNSQYLISKKIVGKFLDLFMDALQINVS
KIQIPNKEIARKLDDLKVIQFTEDQNNFLGQQNIQNVDVASNYYDELLEKKFEKSMNSGP
STSRVYMWRLIAFLLKTEGKNALSTEEQNLLQFDNSTLMAILEEGDCKLAIRMISDILSV
LSQDNQKQTEMIITAIIKQIMDKEYKEYRKYVVVLKRLFMLKDSQQQMRIHQGMSRLLEV
MQKQSQYFFETDVCQQYILRMVFRNHAVYQWMVKNHRTWQWIIETNNTQSNPNEKLISNN
SNSQKCNHRLHNIYLPITTQAYAKLLSWKKQQFLNLVKEPFKQNEDFDTDDDLTEKVVKV
DDKIDYYDQNQWLTATVGRVMGDYVHLTFSGKMTPQNIDIELDNERLAPFNTLSSNNKIP
GYTNNNQEMAFEHQSDPDNDTEEGNNNSINQTDSDDE
NT seq
7134 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgtgaagaagagtaaaaagaaaccagaattgaatgaacagttatttgttggcaat
tacattgatgttttccatcaaggaagcaagtaacataagttggcgtacattttgtaaaaa
aatgaaaaagaaatcgaaatcacatatgatgggttatctaagaaggataatgagataatc
aaattatcgcaaaacaagatcaactttgctcgtagattcacccaaaactacactggagag
gatttccgataaagcaagacttcacgggattacctgaaatactcgagagaggattgcgag
aagaatatcaaggaattgaattcaataatgtaaaataatttccaaggtctctctccaatt
gaaatatgtttatctgtgcgtgtgagacaattcatatggttggacatggtgctctctagc
gaattcccatcaaaagaattgcctgtagcattggaatacattaaaacctactacaacttc
attaagtggtatttcgagtagttcccaaagtactttgcagattatatgagattccaaaac
aactaagaattgtacatcctagacgaacgagtctcaatagcagcttgtctttaggaagtc
tgtgaagccttctgcatgctatttggttccatatggcgagtcctgaaataagaaaactct
tttttctacctaaactgcgacaatttgtaacagcaattcgataaattctttcccccttcc
agttaataaggcttcgttgtgaatccgaatatcgatgactggaaactatattaaggcgca
tcagatatcgtcaaatgcatcaagaagacatggccattttatttgagaactatgtctttc
ttcaagtcaataggtggacttcaagcttgggaaggattattgaaaccctaagaaaacgga
gaatataattacatccctcttaaggccatgaacaggatagtaataacacaacaatacttg
tcctcctacttccaattgtctgattaggctcaaatggccaagaaaacattcgagtggtta
taaaatagagttaacaatttgacagtctaagatatcaaggacactgacattgattaagtc
aaagaacttacgtcagattatcaatattactttctgaaaggattcacagaagatcaacta
aataaattgactgatgaaatctaattacaattagcattgaaattcttgaagtcttccttt
ttggaaaagagagtgaaaggcataagtgagattaaagatttcactgagagatccaaatat
gaacaatagacaagtcttaaattcaggagttccatttccaaagatgatttgattagatgg
atatcacaaaatagaattctagactacactttacttggagattcagttcatccggaatta
atcaaaagatcaagtgatgtagcagtgtttttatgtcggaatcaagcattccaaattgat
tacatagacaaaatatggaaaaacaatcatgataaacatgagactactcaattagctttg
tatgaattcttcaagattgtgtctccctatttaagtttccaaggaatcgaaaaactgtat
aatcatatctccactattccatactctaaatacaatgaaaatattgtaagcatgattaaa
acattcactgagtcagcattgtcttagaaattccacgaataacaattgcaattgaaacca
gaaaagaggttcatgacttttaattagttgtgggaattgttgtaagatagggacgatcaa
ttaactaatagtgtcattcaagaatagtgtttttcagctgccagaatgatcatctcctag
attcaataaaccaaataattcatctcataatattttggtaagtgcttcgaattgattggt
gctcatcaatctgtctactaagctattagtcttgtccattatttcctcgataaataattc
aaagatgatatcattggtaaaagggaattgattcaatccacagatgacaaatataatatc
attgaactctttgttaaagatattgaagtctatatggaaaaggtcagacaatattttaag
aatgacatcccccaagacatcgtcatcaatggagtctaaaagtttagttagaatgtattc
ttcagattataaatgttgaattatctcctttcataaacacatcttaagatcacttatgaa
taaactgtcagattgtgggatgcactctctgccaaaaccaaagggggcatccaaaagaaa
gaattgaataagatcctaataaccaattactaaatagatgtcaactcctttagaatttgc
cccatctatttcgataaagaaggcgaataaaagttcttcaagtaggtcttatgtaatcca
gacagaaatgactatgaaaattacaccattgaggattttgaattgttccaagtcttcttt
agatcatataatcaatctcatcaaactttgaaatattttaacaactcttccagattctta
gttaatgatcacaatttcgaagggaaatctgccatttggaacatctttgctaaagtcaag
gatcaataattattagaataaatctcctactttattattaacttgtacacgtaactaaat
tctaatcttgatcaataatgcgataagatctattaagaaatgatggacaaatgcttagat
ttgatttaacagcaatgtccaagcctaaccactagatcaatcaatctcttattgcaattg
ttcaactacttctaaagtggtcctccttctaagaaatcaactaaaccaattaattatact
caattcaaagtgtagatatagtaccccaataatttggttaagtctgttgaataaaaagaa
ggtgataccaccacaatcaatcaatggaaataaaaattggctgaagaattacaggtagca
tacttacaattggacatcactatagaaaataaacccattgaataataatacgatattgtt
gaaaccttcgtctgctaagccttttatcaattagccactgtgaaggtgaagattaacaac
aagaatcaccctaaaaactacctttcttaagaataaaggacatttgagattctatttaaa
ttactagacaaataagaaagcattgaatttttgagttaagtctgggatctaataaataga
ttacccatcaatattatcaaaaaaaggtaagtagaaacttgtaaagattggaaataatac
ttagatcatcaattttttgatatgttttatgtcttacaaatcatattaaaattattggat
aatgaataatggagtgaataatttaacaattttgatggtgtagatttaattacttaaaaa
ttcctaggataacaactataattttaataacgtcctcttgaaatcaaatgttgtttgact
tatttggaaatattgagtcatccataaattaagatgaaagaatctcaattagttgattaa
attaaatcaaaaattattgaagttatccaacaattatgtcaatacatcaagaccaaaaaa
aaactagaatctggataaaggaaatccccttaacaaaaggaaatgaatgaaattgaatct
cgtcttctcaggaaatgctttttgtaattggatgatgatggctgcagataatacattaag
aattctgaattaaattaataactttatgccttctttgtcgaacatgaaaattaagaactg
aagagagaatatagtttataattactaaacatgaagaacactccagaaagttagctatta
attaaaataatattggaggatgttttaaagaatgtaatatcaaataacaaataaaagtgt
gatcatttctttgaattctgttgtaatttaatatatcaagagaaaaacttgaatattcga
aatctgaattttgaagaattattagtctacataaggtaaaacttggaataattaccatgc
aatgaaaacactgttaaggattaggataaaattttgattggcctacttaaattgttaaat
gcattaatcgatagaattcagtcactctcaactcaccaagggttattcgaataaatactt
agttatttgtttgaaaatgaaggagaaaccagatgcaaatgcaagtcacaataatctaga
acagccgggttccattgcttctttactctattgaaatctactaaaaatatgcaaaaattc
ttagatgtagtgtcccctctacattatactcatacttggagaacaaagaatttcaatgat
tggaatattcaaagcaaatttcatgagaaatcgtcaactggatatgttggtctctataat
ttaggatgtatttgttatatgaattccttacttcaatagttatatatggttcctgctttt
cgtgaaaaattgttataaatagaagacaaaagcacaggagcattagaagagaatttattg
cattaattaaagtgcttatttttggctcttaagcattcatagaaataatatcacaatcct
aagaaattatgtcatgccttcaaagatttggatggacatccaacaaatatatttgaataa
atggatgttgatgaattttgcaatttgttgatggatagaatagagttaagcatcaaatca
acttctgatgaagatttagttaaaagaaattttggaggagtgatatctaatgaaattata
ggaaagacatgtccacattactcagaaagagaggaacccttctttgctatttcattacca
gtggctaataagaagaatctagaagaatgtctatagactttggttcatggggatttactt
gaaggagaaaatgcttatagttgtgaatagtgcaacaaaaaggttagtgctttaaagaga
acttgtattaaaaagttacctgatcatctgattttagttttgaaaagattcaatttcgat
tttgacttgatggcaaaggctaagataaatgaaagaatagaatttccatttgaattagat
cttttgccttattcataataaggactcagacagtaggagaatagagttaatcctgagaat
ggataggataatccatcagaatattaccaatatagattaactggagttgttattcacata
ggttcagctgattgcggacattattactcattcatttaagatagagttgatttcaacaaa
tggtatgaatttaatgatataaatgtttcacctgcagatatcaaggatgtcaagaatgat
ggtttcggaggagtggatagaatgctgaaaaccaaatatccaggttagtttaaggataag
tcaaaaagtgcctatatgttattttatgagagggttaaaccattaaataataaagaggaa
ttgatggacatcgaattagattagaagacatcccaatttttagatgaaataagagatgaa
aatcgaaagttctagatttagagatttattttcagtcctgaatatttcatctttattcag
aatttaataaaatttgaattgcaataaaaccaagtttcagaacagattgttaaaacctta
gttttcttttatctcacttgtgcagtaagagaaaacgacaaaaccttcatttccaataat
atttaggatatttaagagttattaagaagagctcctagtacatgtgaatggctattgaaa
tgttttaattaataccaatacataagagaattctagtttgattgttcaaagaaaatggtg
agaaagtatgtcatttcattgatagtgacagcaatagagactgtgtaaaaattggaaggg
tacaacgtcttataagaatatacagatgataaacctaaatctttggttgcctctttaatt
aattcttggattaggatgattccagatctaaagaagagtctcaaaaattcaatagaatat
tatgatctattttatagattcgccaaattaagttagtagaattcctagtatttgatttcc
aagaaaatagtggggaaattcttggatctgtttatggatgcattataaatcaatgtaagc
aaaatacaaataccaaataaagaaattgctaggaaattggatgatctaaaagtaatttaa
tttacagaagatcaaaacaatttcttaggataacaaaacatttaaaatgtagatgtggcc
tctaattattatgatgaacttcttgaaaagaaattcgaaaagtctatgaattctggtcca
tctacaagtagagtttatatgtggagactaattgccttcttactcaaaactgaaggtaag
aacgctttgagcactgaagaataaaatctcttgtaatttgacaattctaccttaatggcc
attttggaggaaggcgattgtaaattagcaattaggatgatatctgacattctttcagtt
ctatcctaagataattaaaaataaactgaaatgattattacagcgattattaaataaatt
atggataaagaatacaaagaatacagaaaatatgtggttgttttgaagagactattcatg
ttgaaggattctcaacaataaatgagaattcactaaggaatgagtagattattggaagta
atgtaaaagcaatctcaatatttctttgaaacagatgtgtgttaataatatattctcaga
atggtctttaggaaccatgctgtctatcaatggatggttaagaatcataggacatggcaa
tggattattgagacaaacaatactcaatcaaatccaaatgagaaacttatatcaaataac
tctaattcataaaaatgtaatcacagattgcataacatatacctgccaattacaacctaa
gcttatgctaaattgttgagttggaagaaataacaattcttgaatctggtcaaggaacca
ttcaaacaaaacgaagattttgatactgatgatgatctgacagaaaaggttgtcaaagta
gatgataaaatagattactatgattaaaattaatggcttactgcaactgtcggtagagtt
atgggtgactatgtacatttgaccttcagtggcaaaatgactccttaaaatatcgacata
gaattagacaatgaaagactcgccccctttaatacattgtcatccaacaataaaattcca
ggatacacgaataataattaagaaatggcatttgaacactaatcagatcctgataatgat
actgaagagggtaacaataattctattaattaaactgattcagatgatgagtga
DBGET
integrated database retrieval system
