Paramecium tetraurelia: GSPATT00006168001
Help
Entry
GSPATT00006168001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K11969
ariadne-2 [EC:
2.3.2.31
]
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
GSPATT00006168001
Enzymes [BR:
ptm01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.31 RBR-type E3 ubiquitin transferase
GSPATT00006168001
Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
RBR proteins
GSPATT00006168001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
IBR
IBR_1
zf-C3HC4_2
Prok-RING_4
Pik1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5017497
NCBI-ProteinID:
XP_001431713
Genoscope:
GSPATT00006168001
UniProt:
A0C0J8
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
492 aa
AA seq
DB search
MGQICMKRAREMDCLDSERNEVSQYGLSFKIDEKCCLKQSVQYMQGRQEQNIKLMQPDLY
QELQQQIEKYQNSNKESLQIVMNVKLLNQSKIFLYCNFKDDDVKRCFNLLKTNSDYKEEL
KLIGIYRESSLKYHKKEFCSLCSQENMECYSLRCQHIFCKDCWHQMIDIQLSDSIPIVKC
LEYQCLERLPHQFLELNQLYKEILVKRMLDNDSNYTWCPGLNCQNIYKLEGLALNFKCHC
GVRFCSKCKVDTHYPIPCETLKEITQYKESNQSWTVLDISVCPFCSRNIQRIQGCIQMSC
VCGNDFCNKCSQPWNKEHGQDYVNCSFASYNKNPSQILNQMRQNESALTKDIFQLENYQQ
QLNKQNQDYQRHRLQMSLRNLIKFKKFQKMQQFIKLLSVLYFTYYLNEKFNDNSLDQYYD
KFQLEINNYQRNLLNQLQGVLFNEQEVKNNDKINFNEFVNLVYQMDQKLKVQRHCFKKQI
IELLQEKQQQIQ
NT seq
1479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttaaatttgtatgaaaagggctcgtgaaatggattgtttggacagcgaaagaaac
gaagtgagttaatatggtctatcatttaagattgatgagaaatgttgtttgaaataatct
gtttagtatatgtaaggcagataagaatagaatataaaattgatgtaacctgatttatat
caagagcttcaataacagattgagaaatactaaaatagtaataaagaaagcttataaatc
gtgatgaatgtaaaattacttaattaatcgaagatttttctatattgtaattttaaagat
gatgatgttaaaagatgctttaatcttctaaaaactaatagtgattacaaagaagaactg
aaattaattggaatttacagggagtcctctttaaaatatcataaaaaagagttttgttca
ttatgttcttaagaaaatatggaatgttatagcttaagatgttaacatattttttgtaag
gattgctggcattaaatgatagatattcaattatctgattctatacctatagtaaaatgt
ttagaatattaatgcttagaaagattacctcattaatttcttgaacttaattaattatac
aaggaaatattggttaagagaatgttggacaacgatagcaattatacttggtgtccagga
cttaattgttaaaacatatataaattagagggacttgcattaaatttcaagtgtcattgt
ggtgtaaggttttgttctaagtgtaaagtagatacacattatccaatcccctgtgaaact
ttgaaggaaataacataatacaaggaatcaaattaatcttggacagtattggatatttct
gtgtgtcctttttgtagtaggaatatccagagaatttaaggctgtatttagatgtcatgc
gtttgtggaaatgacttttgtaataagtgttcatagccttggaataaagaacatggataa
gactatgttaattgttcttttgcatcctataacaaaaacccatcttaaatattgaactaa
atgagacaaaatgaatcagctttaacaaaggatatcttccaattagagaattactaataa
taactcaataaatagaattaggattattagagacatcgactttaaatgagcctgcgtaat
ttaataaaatttaagaagttctagaaaatgtaataatttattaaactattaagtgtttta
tattttacatattatttgaatgaaaaatttaatgataatagtttagatcaatattatgat
aaattttaattagaaataaataactattaaagaaatttgttaaatcaattataaggggta
ctttttaatgagcaagaagtcaaaaacaatgataagattaatttcaacgaatttgtaaat
ttagtttatcagatggattagaagttgaaagtctaaagacattgttttaaaaaatagatc
attgaattattgcaagagaaacaatagcaaatataatga
DBGET
integrated database retrieval system