Paramecium tetraurelia: GSPATT00006903001 Help Entry GSPATT00006903001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K19525   vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C Organism ptm  Paramecium tetraurelia Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]     GSPATT00006903001 Membrane trafficking [BR:ptm04131]  Endosome - Golgi transport   Rab GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     GSPATT00006903001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  VPS13_VAB VPS13_N VPS13_C LupA PH-GRAM_MTMR6-like Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5020778 NCBI-ProteinID:  XP_001434993 Genoscope:  GSPATT00006903001 UniProt:  A0C9X9 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 3381 aa AA seqDB search MFESLLEKVLNSVLGQFIEGFDAQNLHIGIWSGEVIISNVSLKADIIKMLELPIRLCFSH IGKLKLNVPWKSLTSSPVEVMLTDLYLILSADHPDLWQYMNYAGFKKKMEILDKLKDSII QNINDKSKSKDDKEDGYVKKLVLKIIDNLQLSISNIHIRFEDTIKNEFAWGFSIKAIETF TCNSEWKKQYFDRTKEENKKVPLQKLLTLVNIGAYWNQHEKRFLNSQDKEVILREMDEMI ISTQDPKSHPKYGQFVLLLNAQGRLFQNTSGKFDSPEFSLSIELSGIDVALENLQLQQII RMAELFSLYQNRLNKQKKQRLQLSNQQIEDQKLLFIGLYEKILRSPDQSIKALSKDENEL FEQSVSNLSIEILCETAKEMIKVVQKELAIKEAEEKKKKSGGWFSWGKKKESDLLDQKEK DELTSFIDQLADFQDIKDIRRPPDYVWLSVIFSLKTGSVHILKQFDTKREGIQLTYSGFD GSFEMKDSGMLMKMGLQFIGIDIVTEPIQQGIVFYSEQKRIAFLEQINNQKFIDFTFETN PSHHKGVDKYIKLETGALKLIFNPIVMVRIQQFTDFQVRDETLKNAAWDQMEIAQDLAAQ QMAQSQLSPSILFIDMKIKSTIVLVPLPNTQENWLLNIGDVSIITPRIDELHYDNFEISL QDFTFKHYNQIDQCHRSIQQGIFLENVDGSYSIIQNIRVVIRAQILRGSSKPPKELPSII IDGELPQLDVFINPSIYTRILKIGECFVEPIRETEEVIRKQTKLSIENVQTERTALMESA TKVGKIWKRGQLLTWSQYTGVLSGGYIYLFAKPKDQLPEFHFWIRNSDFIDVSEQEVGMN NAFYIKNKYGDTLVAFDKPKMANDWKEAIELLRTMPRVEKEKENDEVAKVQSEKTQESRP MNFKFVLKGFGAHLQDEKQQDWFNVVISGLNAGANLFDGSINLDLKLRDLYVTDSVQKYM NPLLKYIVKSDPDPESNELININVQQISNKDKRYNKKNLIIGVTFGSLSVIAKPLVVAKL LVFITPTDNQAEDMQTYQGKDVEKQQQDQAKKELENNSQHQNVNFDNMQDIILMDVSVKI RSINAILVHRFTTLPLAEAKIENTEIGLIKYVDEMQLNGSLGNLQLFDLTNYPNTLSKES EYTLINPKQMIGVKHQQQSLLKVKLNLFSEGSKKIINNVNIIINVDMSQLIIHVMMQPVL RLLDYTLQQLLFALSNPKQTINPIVKQKEVELDQEIDQYHQTRAQTKKAQTILLSEDETA YLNKQLQNPPAMQLNVVINNPQVILKPNQESNAAMVIDLGTILVSNQRRKVTNRIVTKDQ QFPVWVDVFILNMKDIQLYQQNGQNKREFSLPFDFNISVEIFGMLQQYQLFYPKIKFDEK LIINCFIAPMILQMTHSDYMFLMKCLFHNIAYDDGFDNMIRNNHPQYFQAFFEQQKQQEI KLKEMLLTKNSDAQLSFQLDLENFSIFLLKDIQPKPTPFLRMMLIMMRVSFQKCNNGSAI VDLKIRDLEGSNFVLEKTGLFNELPFIGSMNIQQTYSYEQVTNLNGLVRGRQGTLSNANQ ILNMASRGLLSQGQQRQLIFKFEDAYQQIEDKPQYKLEFNLQMKITGDKVIEIELSDFKL QLHAGPLFEVLALIAMDDPELTPSPGKYVVAQQQIQQGIQQQQDQIQPAQEPQQGSLQIT VNLKNVITCIPTQIEQNVLTIRGIFEIKMKMAPQRSLKDIEKEIKQNDIPENRWHELNET MRIEANLKRLEIFLCKSYDLSKKDDFKQVKKREILNPIDLEVILSKSSVILQNFQGFAEL TDLRGSITPINLKVSFQDLYTIKEGLNYQLSQMPKQPEQQQQLQQQGINQEKKNEEISQL DASHLNKMQLSAVKIDLDIEKTKIIVLNDMGNCYSPLFDYEMDTIKVTLDKNNLFLKISI TLPFKLSNFNPLCSKWEPIIENTGFQIEIFQSYIQGLGGDISNLITIEQMKDFDKFNLTL STVCIQTVLRALKIMEKIFNKQQQEVHQSFVKSFGGGTDDDSSHSEDNIIQVSPYSIKNL TGYPIVVEFIDNLRLPSLNLHINQQQNLIFDDEIERASSGQRRVNVTIKADKVPFPIKLI DLDKISAKLFEQDNLQAFASVKLDQLTNQKILSLYAPVVIVNKTSKSIIISISDDKHQQT MKLSQQKIDQELSHMAPIPLGFVNPKIAIRFSECQDYTEDILVDSLIKQQDKNIEIETRD GQYILVKVSKDNDNQGKFELELQTPFRITNSLPLDIFIQMMNHNKETTFTKKICQQQTIE DYQHGHYKCSYLRVYIEGYYWSDEFKLQAAEELQQKNDDCISKLSLNDSNNNPTTLLIFE SQKQQDYAKLTREYVIHCSGYIINKSGIPLKYFTNNNKNDLTPLGGMESINTGDPLNRQI VLLGTESGNILSLSHTSTNQKISQFPIQISTIGEPEIDVIISNEEDTNQLLQTFLGAKLE LGRCNKKYTLFNKIITLEPRFIIINNCNQDIVIASDEDLFSQSVPSNQRIIFQSHYNSKT KIRNPCQFISMNLSNNDYQSSSRLNISAIGILYYQLRRKDQPKERLYFSCDIRQEGCSLY IIFNQLPQDQAPYKIELPVENLELEIPELDVILNSNNQVTYFAWDDPQRLQKALNVELRI RDDPNGDYKPLKYTLYPDHIGLFQVYTFRPPKGSKAALISVALSILPKGCQKQIQITTAT QEQVKMSKLKPKQDFLRQLKQQNSLDNEDEDESRAQSVSLQSRQSSSENSDKIENRINLK LNSFSLSIVHNSDVKRRPAEFFHFTCTNIEFVTISTVLNTVVQLRVQYINFDHNAEFFVQ YPVVITPQKYALYHVAPKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQSDKYFFNVMIIKDNRVSDIKLFQ NITFEVDPFEIRVEQLFISNLLEFIWAITSFQGQIYELDKNQSGSFVMEKQYQVLKQEEE KEIEYNNQKNMQSFVQFDEEWRTKKLPDPQLPTYISEIVISPIKLNLTVQMSGKGDLNMG KLAIFASVAQAVGVVLSDISEAPIFFQGWKIENCFDTGSGITNKMIQFYKQEGIKQIGSV IGSLSIIGNPIGLLNNISTGFKDLVDKPAAGLTQGPLEAGLGLAQGATSLVSHTIAGAFS SVNKITGSVGSGLANLTMDEDYLRKREKQKMHKPKHIGDGLGQGAKSIMTGITDGITGVF LKPIKGAKEQGIKGVFTGTAQGLAGLIIKPITGVLDGMSQAAAGIQNTVSYFDDKPNNNR SRNIRPVYGLEGYIQDFNSIDAEGFTMIHFLKGGILQNDRFVAAYLIVPDVKEPENKFML VITFEHFIYMSFKTKKKVWILETNEVTHLEIVPSGIKIQVNKPQKQLKNKYVTQIQLLKE EQLEVFKTMQGVREAQGAIQK NT seq 10146 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtttgaatcattacttgaaaaagtattgaattccgtattgggataattcatagaagga tttgatgcctaaaatctccacatcggtatttggagtggagaggtgatcatatccaacgtt tcgctaaaagcagacatcatcaaaatgctggaattgccaatcagactttgttttagtcac atcggaaaattgaaactaaatgtgccatggaagtcattaaccagttcacctgtggaagtg atgttaacagatttatacctgatcttatcagcagatcatcctgatttatggtaatatatg aattatgctggctttaaaaagaagatggagatcctagataaactcaaggattccatcatt caaaatattaatgataaatctaaatcaaaagatgacaaagaggatggatatgtgaaaaaa cttgtcttgaagattatcgataacttataactgagcatatcaaatatccatattagattt gaagatacaatcaagaatgaatttgcatggggattttcaatcaaagctattgaaaccttc acttgcaattctgaatggaaaaaataatatttcgatcgaaccaaagaagaaaacaaaaaa gttcctctgcaaaaactattaacgttggtcaatattggagcctattggaattaacatgag aaaaggtttttgaattcataggataaagaagtaattcttagagaaatggatgagatgatc atatctacccaagatcccaagtctcatccaaaatacggttaatttgtcttactgttaaat gcctaagggagattattttagaatacttctggaaagttcgattctccagagttttcctta tctattgaattgagtggcatcgatgtagccttagaaaatttataactccaataaataata agaatggctgaactcttttcgttgtatcaaaatagattgaacaaataaaagaagtagaga ttataactatcaaactaataaattgaagattaaaagttattatttattggtttatatgaa aaaatactcaggtctcctgattagagtattaaagccttgagtaaagacgaaaacgaactg tttgaataatcagtaagtaatttaagcatagaaatattatgtgagaccgccaaggaaatg attaaggtggttcagaaagaattagctattaaagaagctgaggagaagaaaaagaaatca ggaggatggtttagttggggcaagaaaaaggaatcggatttgttggatcaaaaggagaag gatgaattaacttcctttattgatcaattggcagacttctaggacattaaagatataaga agaccacccgattatgtttggctgtctgtcatattttctttgaaaacaggatctgtgcat attctcaaacagtttgatactaagagggaaggtatctaattgacatattctggatttgat ggaagttttgaaatgaaggatagtggaatgcttatgaaaatgggattataatttattgga atcgatatagtgacagaaccaatttaatagggaattgtgttttacagtgaataaaagaga atagcatttttagaataaataaacaactagaagtttatagatttcacatttgagacaaat ccatctcatcataaaggagttgataaatacatcaagttggaaacaggagcattgaaattg atattcaacccaatagtgatggtcagaatacagtaatttacagatttctaggtgagagat gaaactctgaaaaatgctgcttgggatcaaatggaaatagcctaagatttggctgcctaa tagatggcataatcataattgtctccatctattttatttattgatatgaaaatcaaatcc acaattgttttggtgccacttccaaatactcaagaaaattggttactcaatatcggtgat gtttccattattacaccaagaatagatgaattacattatgataattttgagatttcattg caagatttcacattcaaacattacaattagattgattaatgtcatcgatccatttaataa ggaatttttctggagaatgtggacggatcatacagcatcatttagaacataagagtagta ataagagcttaaattttgagaggtagttctaagcctccaaaagaattgccttcaattatt attgatggagaattaccttaattagatgtttttataaatccaagtatctatactagaatc ttaaaaattggagaatgctttgttgaaccaataagggaaaccgaagaagtcataagaaaa taaactaaattatcaatagaaaatgtttagacggaaagaactgcattgatggaatcagca actaaagtaggaaagatttggaaaagaggttaattattaacatggagttaatatacagga gtgttgagtggtggatacatttatttatttgctaaacctaaagatcagttgcctgaattt catttctggattagaaatagtgatttcattgatgttagtgaataggaagtaggaatgaat aatgctttctacattaagaataagtatggggatacccttgttgcatttgataaaccaaag atggccaatgattggaaggaggcaattgaactcttaaggactatgcctagagttgagaaa gaaaaagagaatgatgaagtagcaaaagtataaagtgagaaaacctaagaaagtagacca atgaattttaaatttgtattaaagggttttggggcacacttgcaagatgagaaataataa gattggtttaatgttgtgatcagtggattgaatgctggtgctaatctatttgatggatcc ataaatcttgatttgaaattaagagacttgtatgtcactgatagtgtgtagaagtacatg aacccattgcttaagtacatagttaaatctgatcctgatccagaatctaacgaattaatt aacattaatgtgcaatagattagtaataaggacaaacgatataataagaagaacctgatt ataggtgtaacatttggatcattgtcagttattgccaaacctctagttgtagctaagtta ttagtctttataactcctactgataattaggcagaggatatgcagacttattaaggaaaa gacgttgagaaatagtaataggactaagctaaaaaagaattggaaaataattcacaacat tagaatgtgaatttcgataacatgcaggatattatcctcatggatgtcagtgtaaaaatt aggagtattaatgctatcttggttcatagattcacaactctaccattggcagaggctaaa attgaaaatactgaaattgggttaatcaagtatgtagatgaaatgtaattgaatggatct cttggtaatctgcaattgtttgatcttacaaattatccaaatactttaagcaaagagtct gaatacactctgattaatccgaaataaatgattggagttaagcatcaacaacagtcctta ttgaaggttaaattaaatttatttagtgaaggatccaaaaagattatcaacaatgttaat ataataatcaatgtagatatgagttaattaatcattcacgtaatgatgtaacccgtatta agattgctcgattacactttataacaactattgtttgccttatccaatccaaagtaaacc ataaatccaattgtaaaacagaaggaagtagaacttgatcaagaaattgattaatatcat taaactagagcttaaacaaaaaaagcatagacaattttattgtcagaagatgaaacggct tatttgaataagcaattgtaaaatccacctgcaatgcaactaaatgtagtcattaataat cctcaagttattttaaaaccaaatcaggaaagtaatgctgcaatggtaatcgatcttggc acaatacttgtatcaaattaaagaaggaaggtcacaaacagaattgtaacaaaagactaa caatttcctgtatgggttgatgtgtttatattgaatatgaaagacatataattatatcaa tagaatggataaaataaaagggaatttagtttgccttttgatttcaatattagtgttgag atttttggaatgttataacaatattaactattctatccaaaaataaaatttgatgagaaa ttaattatcaattgcttcattgccccaatgattttgtaaatgacacattcagattatatg tttttgatgaaatgtttatttcacaacatcgcttatgatgatggatttgataatatgatc agaaacaatcacccctaatatttccaagctttctttgaataacagaagcagtaagagatt aaactcaaggagatgctcctaactaaaaatagtgatgcctaactatcattctaattggat ttagagaattttagcatatttctattaaaggatatccaacctaaacccacgccctttctg agaatgatgctcataatgatgagggtttcattttagaagtgtaataatggatctgccata gtggaccttaagataagagatttggaaggctccaattttgttttggagaaaactggatta tttaatgagttgccttttattggtagtatgaatattcaatagacatattcttatgaacaa gttactaatttaaatggattggtaagaggtagataagggaccttgagtaatgcaaattag attttgaatatggcatcacgcggattgttaagttaaggacaataaagacaattgatattc aagttcgaagatgcctatcaacagattgaagataaaccacaatataaattagaatttaac ctttaaatgaaaataactggtgataaagtgatcgaaattgaattatcagatttcaagtta taattacatgctggcccactttttgaagtcttggcactgatagctatggatgatcctgaa ttgacaccaagtcctggaaaatatgtagttgcttaataataaatataataaggtatttaa caatagcaggattaaatataaccggcttaggagccataataaggtagtttgtagatcact gtcaacttaaaaaatgtaattacttgcataccaacttaaatagaatagaatgtgttgact ataagaggaatttttgaaataaaaatgaagatggctcctcaaagatcacttaaagatata gaaaaggaaatcaaataaaatgatattcctgaaaatcgttggcatgagttaaatgaaact atgagaattgaagctaatttaaaaagattggagatctttctttgtaagagctatgattta agtaagaaggatgactttaagtaggtgaagaagagagaaatcttaaatccaattgattta gaagttattttgagcaaatcatcagtgatattataaaacttttaaggttttgctgaattg actgatttgaggggaagtataactccaataaatttaaaggtttccttctaagatctttat actatcaaggaaggcttaaattactaattgagtcaaatgcctaaataacctgaataataa taacaattgtaacaataaggtataaattaagaaaagaaaaacgaggaaatttcttaattg gatgcttctcacttaaataaaatgtaattgagtgcagtcaaaattgacttggatatagaa aaaacaaaaataattgtcttgaatgatatgggtaattgctattcaccattatttgattat gagatggatacaattaaagtgacactagacaaaaataatctatttctcaaaatttcaatt acattgccatttaaattgagtaatttcaatcctttgtgttcaaaatgggagcctatcatt gaaaacactggattttaaatagaaatattttaaagttatatctaaggtttgggaggagat ataagcaacttgatcaccattgagtaaatgaaagattttgataaatttaatttgactcta tctacagtttgcatctaaacagtattaagagctttgaaaataatggaaaaaatatttaat aaatagcaacaagaagtacatcagagttttgtaaaatcattcggagggggtacagatgac gattcatctcattcagaagataatataatttaggtatcaccttattccataaaaaatcta acaggttatcctatagttgttgaatttattgacaatttgagattaccctctctcaattta catatcaatcaacaataaaatctcatttttgatgatgaaatagagagggctagctctgga caaagaagagtaaatgtaactataaaagcagataaagtgccttttccaattaaattaatt gatttggataaaatatcggctaaattatttgaataagacaatcttcaagcctttgccagt gtaaaattggattagttgacaaaccaaaagattttgagtttgtatgctccagttgtaata gtgaataaaaccagcaaatctatcataatatcaattagtgatgacaaacattagcagact atgaaactaagttaataaaaaatagatcaagaattgagtcatatggctccaattcctttg ggatttgtgaatcctaaaatagcaataagatttagtgaatgctaagactacactgaagat attcttgtggattctttgataaaataacaggataagaacattgaaatagagactagagat ggacaatatatattggttaaggtgagtaaggacaatgacaactaaggaaagtttgagtta gaactacaaactccattcagaataactaattcattacctttagatatttttatctaaatg atgaaccacaataaagaaacaacatttacaaaaaagatttgtcaataataaacgatagag gactattaacatggtcattataaatgcagctatcttagagtatatatagagggatattat tggtctgatgagtttaagttgtaagctgcagaagaattatagtaaaaaaatgatgattgt atttccaaattaagtttgaatgattcaaataataatccaactacattattaatatttgag tcttaaaaataataggattatgctaaattgacaagagaatatgtaattcattgttctggc tacattatcaataaatcaggaatcccattgaaatattttactaataataataaaaatgat ttgactccattaggaggcatggaatcaataaatactggagatcctttgaatagataaata gtacttttgggaacagaatctggtaacatcttatcattgagtcatacttcaaccaactaa aaaatatcttaattccctatatagatttcaacaataggtgaacctgaaatagatgtaatc atcagtaatgaggaagatacaaattaattactataaacctttttgggtgctaaattggaa ttaggaagatgcaacaaaaaatacactttattcaacaaaataattacacttgaacccaga ttcatcattatcaataattgtaattaggatatagttattgcttcagatgaggatctcttt tcttaaagtgttccctccaattaaagaataatattctaatctcattataattcaaaaact aaaattagaaatccctgttagttcatcagtatgaatttaagcaataatgattattaaagc agcagtagattaaatatcagtgctattggcattctttattattaacttagaagaaaagat taacctaaagaaagattatactttagttgtgatattcgctaagaaggatgcagtctttat attatattcaattaattgcctcaagatcaagcaccatacaaaattgaattgccagttgaa aatctagaattggaaatcccagagttagatgtgatactcaactcaaacaattaagttact tattttgcatgggatgatccataaagactataaaaagcattgaatgttgagttgagaatt agggatgatcctaatggagattacaagcctctcaaatataccttatatccagatcatatt ggactatttcaagtgtatacctttaggcctccaaaaggatcgaaagcagcattaatctca gttgcattatcaattctccctaaaggttgttaaaagtaaattcaaattactacagccact taagaacaagtcaaaatgtctaaacttaaaccaaaacaagatttcttaagacagttaaaa taacagaatagtttagataatgaagatgaggatgaatcaagagctcaatcggtctcttta caatcaagatagtctagctctgagaatagtgacaaaattgaaaatagaatcaatcttaaa ctcaattcattttctttatccatagttcataattcagatgttaaaagaagacctgctgaa tttttccatttcacttgtactaatatagagtttgtaactatttcaaccgttttgaataca gtagtctaattaagagtgtaatatatcaattttgatcacaatgctgaattctttgtacaa tacccagttgtaattacaccataaaaatatgccttatatcatgttgcacccaaacaataa caacaataataacaataataatagtaataataatagcaatagtaataatagagtgataag tatttctttaatgtcatgattattaaagataatagagtgtctgacattaaattattctaa aatatcactttcgaagtagatccttttgaaattagggttgaatagttgtttataagtaac ctcctagaattcatttgggccattacatcattctaaggttaaatctatgaattagataag aattaatctggaagctttgtcatggagaaataatatcaagtattgaaataagaagaagaa aaggaaatagaatataacaattaaaaaaatatgcaatctttcgtttaatttgatgaagag tggagaacaaagaaattacctgatccataattgccgacttacattagtgaaattgtcata tcacctattaaattgaacttaacagtttagatgtctggcaaaggtgatttaaatatgggt aaacttgctatctttgcttcagttgctcaagctgttggagtagttctatcagatattagt gaagccccaatcttcttttaaggatggaaaatagagaattgctttgatactggctcaggt ataacgaataaaatgattcaattttataaataggaaggaatcaaacaaatcggatctgtt attggaagtttgtcaatcataggtaatccaattggtttattgaataatatctccactgga ttcaaagacttagttgataaaccagcagctggtttgactcaaggacccttagaggctgga ttaggattagcctagggagctacttcattagtatcacatacaattgcaggagcattcagt tcagttaataagattacaggtagtgttggaagtggtctcgctaacttgacaatggatgaa gattatttaagaaagagagagaagtaaaaaatgcacaaaccaaaacatattggcgatgga cttggataaggagctaaatcaattatgactggaattactgatggaatcacaggagtattc ttaaagccaattaaaggagcaaaggaataaggcattaaaggagtattcactggaactgct taaggacttgctggtttaatcataaaaccaataacaggagtactagatggtatgtctcaa gcagctgctggaatataaaatactgtttcatatttcgatgataaaccaaataataacaga tcaagaaatattagacctgtctatggattagaaggttatatttaagactttaattcaatt gatgcagaaggatttacaatgatccactttttgaaggggggaattttgtaaaatgaccga tttgtagcagcttacctaattgttcctgatgtcaaagaaccagaaaataaattcatgttg gttattacatttgaacattttatttatatgtcattcaagaccaagaaaaaagtttggatt cttgagaccaatgaagtgactcatttagaaatagttccatctggaataaagatttaagtc aacaagcctcaaaaataattaaagaataaatatgtgacccaaattcaattattaaaggag gaataattagaagtcttcaaaacaatgtaaggtgttagggaagcttaaggagcaatttaa aaatga

DBGET integrated database retrieval system