Paramecium tetraurelia: GSPATT00011309001
Help
Entry
GSPATT00011309001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K04646
clathrin heavy chain
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04142
Lysosome biogenesis
ptm04144
Endocytosis
ptm05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
GSPATT00011309001
04142 Lysosome biogenesis
GSPATT00011309001
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
GSPATT00011309001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00011309001
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
ptm04147
]
GSPATT00011309001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Clathrin
GSPATT00011309001
Exosome [BR:
ptm04147
]
Exosomal proteins
Proteins found in most exosomes
GSPATT00011309001
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Clathrin
Clathrin_H_link
TPR_1
TPR_8
TPR_2
TPR_COPA_B
CFAP70_TPR_C
TPR_17
Bac_DnaA_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5028859
NCBI-ProteinID:
XP_001443074
Genoscope:
GSPATT00011309001
UniProt:
A0CY10
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1701 aa
AA seq
DB search
MNPLRPIRVQEAYRFSQLGVSQTNFKFGQIFFESDKYITIRETAPNGDTQLLQFNFETKQ
LISQKNIIALRAAGEQPNSTVIQIFNLDEKQRIKNVELNETIVFWRWVNPQKLAYVTPTA
VYHINITNPNEQQVKVMDRYPLSSENPVQIIGYGLEGNEKWCALYGISTPDGGRTINGHI
QLFLIEQARQQILEGHCCCFGDALIHTDDYKSSLFCFVERKSGETTSRLHISEIGVPPNG
FQKYKRQVEVQTDPNYPTDFPVLMHINQRYGLIYVISKYSFLTVYELSTASLIFRERICN
ENVFVGAPNINQGQYHIIGKEGIVYTISVNDDQLVSYLINTCRHIPEVIQLGFRLASRYK
LPGADNMFVDQFNKAILSGDALSAAKIAASAPGTVLRNPESIAKFKQMQQQPGQPQPLIV
YFQTLLEKGTLNKFEAIELCGPILQQGRKQFVEQWIAQNKLEPSDELGDLLKKYDVNLAI
QIYKLSKSYQKLAQCYMETGQIELAMQLQQQFGVSTDYMAMLRNMMMQSPEQALAMAKSL
YQRDQSINVHQIAELFEQFQRLPEMTAFLVECMKNNRAEDGPLQTKVLCLNLQAAAQVAD
AILSMNIWTQFDRIRVAQLCEQKGLYQRALENYSDPKDVKRVILNTHALPPEFLINFLSR
VDPALTLQCLSDLLRHNRQNLQVVVNVAVQNNQRLTIPACIKVFESVSAFEGVYLFLGSL
INTTSDKDIYYKYIEAAAKCNQIKELERVITEKGDCYDADKVKNYLKEQKLSDPRPLIFL
CDMNGFVDELTRYLYKNGFTRYIEIYIFKVNPNAAPGVFGTLIDLECDEVYLKQLLYNIR
GMCPIEPTVDEFEKRNKLRVLEQWLEARVTEGNQIPAIHNALAKIKIDTSQDPDGFLINN
QFYDAKAVGKFCEERDPQLAVLAYKRAWGQCDQELINLTNKNEMYRVQAKYLVERQDVDL
WAGVLQETNPHRKNLIDYVIQALQDSKNVDEVQAAVKAFVLAKIPYELLGLLEKLVLHNP
EFMQYKQLQNLLIITAIQSDTSKVLDYINRLDKFDPQIIAQHCLNEEYNLFEEAYAVFKK
FNLHIDAVNVLLRNLGSIPRAHEYAQYASSPEVWSLLAEAYLNQGQTNESIDCYIKANDS
SAFLNIINVAEQEEKYELLVKYLLMCRQTVKDVNIDNSLIYCYAKLDKNLDIESLIQSSN
SADVIKVGERCYDQQLYEAAKILFTALKNNARIASCLVRLKQFNKAIEAAQKANTSKTWK
ELCFACVEASEFKYASIAAQNIIIVPDMLESLIKQYEEYNAQEEMMILLENALGMQRAHV
GIFTELAVLYCHYKQKKVMEHCRQYFQKMNILKVLRTCEKMCLWSEAVYLHQHYDQPDNA
INIMIEHSPTAFSHDVLVMLLQKITNTDLYYKCILFYLEEQPEQINDLLRSIQSKIDLSK
FVKLMKNTGYLALTLPFLQQIQNANNKDVNDALNQLYLDIEDYENLRESVKNYENFDQLA
LAQKTQSHELVEFRRIAAYLYRKIQKYDLSMNLSKQDQMYRDSVETAQESQNVKLVYELL
EFFIQNKESEFFTVCLYTCYDLLKPDQVMELTWRSGLMEFAMPYFIQITWELTHKIEYVQ
KKHEDREKKEIQTAQQQQSQALPIAQDFLLNQGQLMLGPPSQMNNSNISFGQPSGFTNSQ
MNQAPMGYGGQQFGSYQPPGF
NT seq
5106 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccattaagaccaataagagtttaagaggcataccgattttcttaattgggtgtt
agtcaaaccaatttcaagtttggttaaatattcttcgaatcagataaatatatcacaatc
agagagacagccccgaatggagatactcaattattgcaattcaattttgagacaaagcaa
ttgatttctcaaaagaatatcatcgctcttagagctgcaggtgaatagccaaattcaact
gtgatctaaatcttcaatttggatgagaaatagagaataaagaatgtcgaattgaatgag
actatagtgttttggagatgggtcaacccataaaaattagcatatgttactccaacagca
gtatatcacatcaatatcacaaatcctaatgagcaacaagttaaagtgatggacaggtat
ccattgtcatcagagaatccagtgtaaatcataggatatggattggaaggaaatgaaaaa
tggtgtgcattatatggtatttcaacaccagatggaggtagaacaattaatggtcacatt
caattatttttgattgaataggcaaggtaataaatcttagaaggacattgttgctgtttt
ggagatgccttgattcacacagatgactacaaaagcagtttattctgttttgtggagaga
aagtctggtgaaacaacaagcagattacatatctcagaaattggagtaccccccaatgga
ttctaaaaatacaaaagataagttgaagtttaaactgatccaaattatccaacagatttc
ccagtcttaatgcacattaatcaaagatatggattgatctatgtaataagcaaatattca
tttttgactgtctatgaattaagcactgccagtttgatattcagagagagaatctgcaac
gagaatgtctttgtaggtgccccaaacattaatcaaggataatatcatattattggtaag
gaaggtattgtctacacaatatctgtcaatgatgactaattggtgtcttacttaattaac
acttgcagacatattccagaggttattcaattgggattccgtttggccagtagatataag
cttcctggagcagataatatgtttgttgattaattcaataaggctatcttatctggagat
gctttgagtgctgctaaaattgctgccagtgctcctggaacagttcttagaaacccagaa
agtattgctaaattcaaataaatgcaacaacaaccaggataaccataaccactcatcgtc
tatttccaaacattattagaaaagggaacattaaataaatttgaagctattgaattgtgt
ggaccaattttataacaaggaagaaaacaattcgttgaataatggattgcataaaataaa
ttagaaccatcagatgaattaggagatctcttaaaaaaatatgatgtcaatttagctatt
caaatctataaattatccaaatcatattagaaattagcataatgctatatggaaactgga
tagatcgaattggctatgcaattataataacaatttggagtatcgacagattacatggct
atgttgagaaatatgatgatgtaatctccagaacaagccttggctatggccaaatcttta
tatcaaagagaccaaagcatcaatgttcatcaaattgctgaattatttgaataattctag
agattaccagaaatgacagcctttttggttgaatgcatgaaaaacaatagagcagaagat
ggaccactctaaactaaggtcttgtgcttgaacttataggctgctgcataagttgctgat
gccatcttatcaatgaacatttggacccaatttgatagaattagagttgcccaattatgt
gaataaaaaggactttatcaaagagcacttgaaaattattctgatcccaaggatgttaaa
agagttattcttaatactcatgctctccctcctgaattccttatcaatttcttatccaga
gttgaccctgcattgacattataatgcctttcagatttattaagacacaatagatagaat
ttataagttgttgtcaatgtcgcagtttaaaataattaaagattaacaatcccagcttgc
attaaggtctttgaatctgttagtgcatttgaaggagtctacctatttttgggatctttg
attaacacaacatctgataaggatatctattataaatatatcgaagctgctgctaaatgc
aattaaatcaaagaattagaaagagttattacagaaaaaggagattgttatgatgctgat
aaagtcaaaaattacttaaaggaataaaagttatctgatccaagaccattgatattctta
tgtgatatgaatggatttgttgatgaattgaccagatatctttataaaaatggattcact
agatatattgaaatctatatcttcaaagttaatcctaatgctgctcctggtgtatttggt
acattaattgatttggaatgcgatgaagtttacttgaaataattgttgtataacattcgt
ggaatgtgtccaattgagccaactgttgatgaattcgaaaaaagaaataaacttagagtc
ttggaataatggcttgaagctagagttacagaaggtaaccaaattccagctattcacaat
gcattagctaaaatcaagattgatacatcataagatcctgatggtttcttgatcaataat
caattctatgatgccaaggctgttggtaaattctgtgaggaaagagatccttaattagca
gttctagcttataagagagcttggggacaatgcgattaagaattaattaatttaacaaac
aaaaatgaaatgtacagagtctaagccaaatatctcgtagaaagataggatgttgattta
tgggctggagtattataagagacaaatccacacagaaaaaatttaattgactatgtcatt
taagcattataggactcaaagaatgttgatgaagtttaagcagctgtcaaagcatttgtg
ttggccaagattccttatgaattattgggtttgttagagaaattggttttacataaccct
gaatttatgtaatacaaataattatagaatttattaatcatcacagccattcaaagtgac
acaagcaaagtgttggattacatcaatagattggataaattcgatccatagattattgct
taacattgtttgaatgaagaatataacttgtttgaagaggcttatgctgtctttaagaaa
tttaatttacacattgatgctgttaatgtgttactcagaaatttgggcagcattccaaga
gctcatgaatatgcttagtatgctagttccccagaagtatggtcattattggctgaagct
tatttgaattaaggataaacaaatgaatccattgattgctacatcaaggctaatgattca
agtgcattcttgaatattattaatgttgctgaataagaagagaaatatgaattattagtc
aaatatctcttaatgtgcagataaacagtcaaggatgtcaacattgacaattcattaatc
tattgttatgccaaattagacaagaacttagatattgaatctttgatttaatcaagcaac
tcagcagatgtaattaaggtaggagagagatgctatgatcaataattatatgaagcagct
aagatcttattcactgcccttaaaaataatgcaagaatagcatcttgtttggttagatta
aaataatttaacaaagctattgaagcagcttaaaaggccaatacttccaagacatggaaa
gaattatgctttgcttgtgttgaggcatcagaattcaagtatgcttccattgctgcttag
aatattatcattgtaccagatatgttggagtcattgatcaaataatatgaagaatacaat
gcataagaggaaatgatgatattattggagaatgccttaggtatgtaaagagcacatgtt
ggtatcttcacagaattagcagttctttattgccattacaaatagaagaaagtcatggaa
cactgcagataatacttctaaaagatgaacattttgaaagtcttaagaacttgtgaaaag
atgtgtctctggagtgaagctgtctacttacatcaacactatgattaaccagataatgct
atcaacattatgatcgagcattcaccaactgccttctcacatgatgttctagttatgtta
ctctaaaagataaccaatacagatttgtattacaaatgtattctcttttaccttgaagaa
taaccagaataaattaatgatttattaagaagcattcaatctaagattgatttaagcaaa
tttgttaaattgatgaagaacactggctatttggctttgacattaccatttttataacaa
attcaaaatgccaataacaaagatgttaacgatgccttgaatcaactctatttagatatt
gaggactatgaaaatcttagagaatcagtcaagaactatgaaaactttgactaattggct
ttggcttaaaagacctaatctcacgaattggttgaattcagaagaatcgctgcttattta
tatagaaagatttagaaatatgatttatctatgaacctgagtaaataggactaaatgtac
agagattcagtcgaaacagcttaggaatcttagaatgttaagttagtttatgaattattg
gaattcttcatataaaacaaggaaagtgaattctttacagtgtgtctttacacatgctat
gatttattgaaaccagactaagttatggaattgacttggagatcaggccttatggaattt
gctatgccatacttcatctaaatcacttgggaattgactcacaaaattgagtatgtataa
aagaagcacgaagacagagaaaagaaggaaattcaaacagcacaataacaataatcataa
gctctaccaatagcttaagatttcttattgaactaaggctaattaatgttgggtccacca
agccaaatgaataacagcaatataagctttggatagccttccggtttcacaaattcctaa
atgaattaagctcctatgggttatggaggttaacaatttggatcatattagccacctggt
ttttga
DBGET
integrated database retrieval system