KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00011868001
Entry
GSPATT00011868001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K15436  transportin-3
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03013  Nucleocytoplasmic transport
ptm03250  Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    GSPATT00011868001
  09125 Information processing in viruses
   03250 Viral life cycle - HIV-1
    GSPATT00011868001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:ptm03016]
    GSPATT00011868001
Transfer RNA biogenesis [BR:ptm03016]
 Eukaryotic type
  tRNA transport factors
   tRNA import factors
    GSPATT00011868001
SSDB
Motif
Pfam: TPR_TNPO3_IPO13_3rd
Other DBs
NCBI-GeneID: 5029477
NCBI-ProteinID: XP_001443692
Genoscope: GSPATT00011868001
UniProt: A0CZS8
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 900 aa
MFSTEEFILQYQKLANPDKTISHQANQYILKLQQSKEALRIAKQLLDQPNIQQEYQFIAC
QMIYRRLKEECNIQIQQYLLEIIGQTFTKCCHELGMFFFSCDRCWKQIIMGRELIQLMKS
RMAIGIEILTQIAIQGKEWYKKSEQLRLQQEFISQENTLSEIFISLLQVQDLSIFNQTVK
CIECWTQNQLEKYQTQYIKHDKLFALLNEGVIYSQYNRQQNVNQIDSQVLQNLNFILEFI
ISIYNPLSSKGYVSFTTKFLCDFYVLVLNSKYEKDVFNLMGNIISNPSRNIAFQTFEFWN
QMREYNNLQGFGLNILQTMIDKCRMKTIKLTKEFIQGEREEEEENDYNLKYCNETEEHQI
STSDFREHSKDIFYSIYKSAEINMESDQYLQVVLNNLIIPNSFAHNQILQSESALFSLYS
IIEQADISVNNQLILQIIQVILSLPVHSNFDIIVKTSLQLFSEFTNQLQLHNDVLLQLTQ
YFFKYMLHPLLGPLAGVAFEQICNLSSMDNVELISESVKFLELHFYEFINQSQVSNYIEG
IIKLCFRLFEEGKPDCLIQLFKFANHQFQQVCNPQVTEKQFHYNNSLVVAIFQWVNLNAK
ENDQIKQLLELLCQSIFEPLLIVLKGQYTFSFFDDTFKLIQIILKVSNFSNQQQVIHLLQ
ISYQIFHSDPIQKHHWLQLITQVISRSIDHQFIVQWAMVNDHQIHLFCIESFNRWKDPDL
MKVYVEYIKECIRCCPQVLFESPYLQKIIDVICDAFINLCSFEMHREILHFFKFLFQSLE
NSKEYFNPLVVRVVSTIFMSISDINPAIVFQVIQILLLILKKQVNSNELEELIFQTLQKS
WGKDKPAQKVKLVSQAIISYILKSEQGEVNKDLKILLENLRPQSEEEINYVQLEIVIKRK
NT seq 2703 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttagtacagaagaattcattctacagtattagaagcttgctaatccagacaaaaca
attagccattaagcaaattaatacattcttaaattataataaagcaaggaagccttgagg
attgcaaaataattattagactaaccaaatatttaataggaatattaattcatagcttgt
tagatgatatacagaagattgaaagaagagtgcaatatttaaatttaataatatcttcta
gaaattattggctagacctttaccaaatgttgccatgaattaggtatgttcttctttagc
tgtgatcgttgttggaaatagatcattatggggagggaactgatttagttaatgaaatcg
aggatggcaattgggatagaaattttaacataaattgcaatacaaggaaaggaatggtat
aaaaaaagtgaataattaagattgcaataagaatttatttctcaggaaaatactttatca
gaaatattcattagtttactttaggtttaagacttgagtatatttaattaaacagtgaaa
tgtattgaatgttggacttaaaattaactagagaaatattaaacttagtatattaaacat
gacaaattatttgcattgttaaatgaaggtgttatttactcataatacaatagacaataa
aatgtaaactagattgattcttaagtgttatagaatttaaactttattcttgagtttatc
atatcaatatacaatcctctgtcttcaaagggatatgtttcattcaccaccaaattttta
tgtgatttctatgtacttgtgttgaattcgaaatatgaaaaggatgtttttaatttgatg
ggtaatattattagtaatccatcaaggaatattgcattttaaacttttgaattttggaat
cagatgagagaatataataacttataagggttcggtttaaatatattataaactatgatt
gataaatgtagaatgaaaacaataaaattaacaaaggaatttatttaaggagaacgtgaa
gaggaagaggagaatgattataatcttaaatattgtaatgaaacagaagaacattaaatt
tcaacatctgattttagagagcattccaaagatatcttttatagtatttataagagtgcc
gaaattaatatggaatcagatcaatatttgtaagttgtattaaacaatttgatcataccc
aattcttttgctcacaatcagatacttcaaagtgaatctgcattattttcattgtattca
atcatcgaacaggctgatatttcagtcaataaccaattaatattgcaaataatttaagtt
attttatcattacctgttcattctaactttgatatcattgttaaaacatctttataacta
tttagtgagtttactaatcaattacaattacataatgacgttttgctttaattaacttaa
tattttttcaaatacatgcttcatccattgctaggacctttggcaggagtagcattcgaa
cagatctgcaacttaagcagtatggataatgttgaactaatatctgaaagtgtcaaattc
ttagagttgcatttctatgagttcatcaatcaatcccaagtaagtaactatattgaggga
ataataaagctgtgttttcggttatttgaagaaggtaagccggattgtttaatttagtta
tttaaatttgcaaatcatcagttttaataagtttgtaatccccaagtgactgagaagtag
tttcattataataattctttggtggtcgcaatattctaatgggtgaacttgaatgcgaaa
gagaatgattagatcaagtaactcttggaactgttatgtcaatcaatttttgaacccttg
ttaattgttttaaaagggtaatatactttctcattttttgatgatactttcaaattaatt
caaattatactcaaagtgtcaaacttttcaaattaataataggtaattcatctcttgtaa
atatcttattaaatatttcattctgatccaattcagaagcatcattggctataattaatt
acctaagtaatcagtagatctatcgatcactaatttattgtttagtgggcaatggttaat
gatcattaaattcatttgttttgcatagaatcctttaatcgttggaaagatcccgatcta
atgaaagtttatgttgaatacatcaaagagtgcattagatgttgtccataggttctcttt
gaatcaccttacttgtaaaaaattatcgatgtaatctgcgatgcctttattaatttatgc
tcttttgaaatgcatagagagatcttacacttttttaaatttttgttttagtctttagag
aatagtaaagagtatttcaatcccttggtggtaagggttgtctctaccatatttatgtca
attagcgatataaatcctgcaatagtattttaagtaatttaaattttactgttaatattg
aaaaaataagtgaattcaaatgaattggaagaattaattttttaaacattacaaaaaagt
tggggaaaagataaaccagcacagaaagttaaattagtcagttaagccataatttcatac
atattgaaatctgagtaaggagaagtcaataaggatttgaaaatactacttgagaacttg
cgaccttaaagtgaagaagaaatcaattatgttcaattagaaatagtaattaaacgaaag
tga

DBGET integrated database retrieval system