KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00012230001
Entry
GSPATT00012230001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K15075  DNA repair/transcription protein MET18/MMS19
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
    GSPATT00012230001
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ptm03400]
    GSPATT00012230001
Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Spindle formation proteins
    GSPATT00012230001
DNA repair and recombination proteins [BR:ptm03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    Other NER factors
     GSPATT00012230001
SSDB
Motif
Pfam: MMS19_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 5029859
NCBI-ProteinID: XP_001444075
Genoscope: GSPATT00012230001
UniProt: A0D0W1
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 761 aa
MTSKDDSVRAKATHKFREELEQLTVNQEESEFLIEFFLHKLSDPQSLLDTTYILLKLSKS
SKSIHPSFIKMIQNKQIIIPTFSREARINFYQIFLAFPITFELAAIILQSIIGEKDPRNI
LVAFQLCDAILEVKNIGTQYKREIFEFLDCYYPIEFNEKADPRFQIKKVEIEHILNKCLF
SEVLLNDSILLLQDKIVSAYDRAQGSALKSVMWIIKNQNKITALQIEEIYESIQKLAEQV
IMDDDVIEQIPITLIEICNNERFQKVKTKIKTISLKTLEEIPATQQGFIYFNFLKLLVQN
HGETIFRDIVQIFNKKFDTKNINVTQKRLENVISAIAEYKKYNREFVSELDNNQKSLLYD
KLQQGITHKMQNVFILTLKCLADIMKYYQDYQKDLELYLYNQINNRELIEQQCILDYFAK
NGIVDIKQYQQLLAFWSENNQLLYDYSLTCSLYNIQDYFSQFTLGLINNQNYQIKSEQIS
ALKGYLDNNSISNSIRQDQAQLVINHIYNPLNKNRKNKLIKQLIQFILKQFALNQNIIKQ
ITLDYVLHLEDDQIYYYIPLMEQELNENLIQSILEIIYKQDFKQRDVQITNRKYAYKFIY
TCLSKYQKELNLDFPQLSTMETQFNDHQLNQLQLYIVLLRQQMLFNNEIALEKLKEISQS
HPQLLSQIIKHKDLENKPSLQKSIGEMIKQLNHKQTLNYLINQVDEEFITGLANPELLQL
IIEHFNDTKIDKLKSLALIVNWCPILKKQTISRFCTLQLIL
NT seq 2286 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacttcaaaggatgattcagtgagagcaaaagccactcacaaatttagagaagaattg
gaataactcactgttaatcaagaagaatcagaatttttaatcgagtttttcctccacaaa
ttaagtgatcctcaatccttacttgatacaacctatattctactcaaattgagtaaatct
tcaaaaagcattcatccatcatttattaaaatgatatagaacaaatagataattattcct
acattttctagagaagcaagaattaatttttattaaatttttctcgcttttccaattaca
tttgaactagccgcaataatactctagagtattataggagaaaaagatcctagaaatatt
ttagttgctttttaattatgtgatgctattttagaagtaaaaaatataggaacataatat
aagagagaaatttttgaattcttagattgttattatcctatagaatttaacgagaaagca
gatccaaggtttcaaatcaaaaaggtagaaattgaacatattcttaataaatgtcttttt
agtgaagtattgcttaatgattctatattattgttacaagataaaattgtatcagcttat
gatcgagcttaaggttcggcactcaaaagtgttatgtggataattaaaaactaaaataaa
atcactgcattataaattgaagagatttatgaatctatctaaaaacttgcagaataggta
attatggatgacgatgtaattgaataaattccaattactttaatagaaatttgtaataat
gaaagattttaaaaagttaagactaaaattaaaacaatttctttgaaaactttagaagaa
atacctgctacttaataaggatttatttattttaatttcttaaaacttttggtttaaaat
catggagaaacaatttttagagacatcgttcaaatatttaataaaaaatttgataccaaa
aatattaatgtgacttaaaaaaggttagagaatgtaatatcagcaattgcagaatataaa
aaatataatagagaattcgtttcagaattagacaataatcaaaaatccctactctatgat
aaattataataagggattactcataagatgtaaaatgtttttattcttactcttaaatgt
ttagctgacattatgaaatattactaagattactagaaagatttagaattatatttatat
aactaaataaataatagggagcttattgaataataatgcattttggattactttgccaaa
aatggaattgtggatatcaaacaatattaatagctgctcgctttttggtcagaaaataat
tagttgctatatgattacagtttaacatgctctttatataatatctaagattatttctcc
taatttactttaggtttaataaataattagaattattaaataaagtcagaataaatatct
gctctaaaaggctatttggataataactcaatatcaaattcaataagacaagattaggct
taattagtcataaatcatatttataatcctttaaataagaatagaaaaaataagctaata
aaacagttaatttagttcatattaaagcaatttgctctaaattaaaatatcattaaataa
attacccttgattacgtactacatctcgaagatgattaaatatactattacattcctttg
atggaataggagttaaatgaaaatctcatccagtctatactagaaattatatacaaataa
gattttaaacaaagagatgtgcaaataacaaatagaaaatatgcatataaatttatttac
acatgcttatcaaaatatcaaaaagaattaaatttggatttcccctaattatcaacgatg
gaaacataattcaatgatcatcaattaaattagttgcaattgtatatagtattgctcaga
taatagatgttgttcaataatgagatagcgcttgaaaaattaaaggaaatatcttagagt
cacccacaattactgagtcaaataattaagcataaagatttagaaaataaaccatctcta
taaaaatcaataggtgaaatgattaaacaattaaatcataaacaaacccttaattatcta
atcaattaagtagatgaagagttcattactggtttagcaaatcctgaattgctgtaatta
ataattgaacatttcaatgatacaaaaattgataaactaaaatcacttgctttaattgtg
aattggtgtccaatactgaagaaacaaacgatatcaaggttttgtacactttaattaata
ttgtga

DBGET integrated database retrieval system