Paramecium tetraurelia: GSPATT00013596001 Help Entry GSPATT00013596001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K24155   rabconnectin-3a Organism ptm  Paramecium tetraurelia Pathway ptm04142   Lysosome Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09140 Cellular Processes   09141 Transport and catabolism    04142 Lysosome     GSPATT00013596001  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]     GSPATT00013596001 Membrane trafficking [BR:ptm04131]  Exocytosis   Small GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     GSPATT00013596001  Endosome - Lysosome transport   Acidification regulators    Rabconnectin-3 complex     GSPATT00013596001    RAVE complex     GSPATT00013596001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Rav1p_C Beta-prop_THOC3 WDR55 Beta-prop_WDR3_2nd WD40_Prp19 Beta-prop_EML_2 Beta-prop_WDR3_1st EIF3I Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5031331 NCBI-ProteinID:  XP_001445546 Genoscope:  GSPATT00013596001 UniProt:  A0D532 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 2039 aa AA seqDB search MYQILKSVSHFQNECILTYSKEKLIIYTKEILLHMQTFRNYISDIVAVATSSKGVFVVFC ERELIAYKPLLNGWEQGYSKNCTNPIRDAFFSFDDEHIIGCSQNKLHIWKATHKQNRLLG QLDQYELIDLTEIYTLELEYQIANVKFSPDVRYFTTLHLNTVIVWDFHSIKEVQEGALSQ QQRVSLDHQDEVISYKFRGTLRIAPSPFPTPNTIVTLTKSNQLTIWQEMIQCKNFCKLHT LHFDQISSFCFIYLKGLTPYPWKNTYLESDQFGVQDTEQSSVDYLLLHQESELSVVKLDF LRNYSLEESVKVIKKTKSNIFNQIKKILLVDQIEGQKIEMIGFDRLWNLIKICVNLKDDS QQMFQCEKFIFQNIVHFSTCKSQVAIINDWNYLCLQQLKLNSVISQEYHIVEGQQKIWKI NSDLSKYQLMFIAKDKIKENDVIVLTSSNAQQCQAFIIQQNQLVEVHLKLYNHLSNEYRD KITDLRKINYEIDDLQLLVIAASKIALIQIQFEIYGHGQMDLQILELKTWKLDFTYERLQ VLQSIELSFISISGKTLKGYNEQMKQIVQISKNYNIKDVGQLKGIQPIYYVMSHQNEIDF HSSSGEFLVRFNLQSFLVRVDKALYDVSKVIVQVVPLNNFAFILQTDNYLTAFAIQFDKS DQNYKLTSIKQKYLNNREAIYCKRLSKYSMPQNYRFFTIKDCLIVKTGRKVKVLGNSLIR CLADKFWMPSTLSYKLINQQNNVQLQDYDFLSELIQLGKIQLVQFILKLICLKFKHHGTL GNHFMVPYKYLLELYHLNSEPEPLWVDAIKTYVTKKLQDKDSYDYTLHPVDVLKKICQEY PLKITIILDYLRYYEDNSRSLDFYAAMFMFHVQIFRNQPTHKRNRVLSSKEVVWALHSLQ KETLWQECIGNSDDLSWNLVKRYAAVLWMDLSFIKQRLEEIALQIYKQSKDPFQSLLYFI VLGKKSVITTLFKKEVNSGKEYKSTYEFLQQDFTQPRWKSAASKNAYALVSKKRYQDAAA FFLIGGHLNDAVNVMARYMEDIQLAYLTTKIHEPQGGPVGEQLIQDYFIKSGEEMNDIWL LHIGFYLLGRYVDSVNVLLREPEHHILEYDNSGKAVCISWPSTFTPQLSYYHPSAILLVE KLKENINVKREIQQSIDANKKKSKKAEDDIFSQFYESEESEEEEVVEQVPIKKINDNQEF IKQQAVEYYYNIQMPQLGMIFAQELNQQTEQSEQLIELQIEMYIVQAIEDQEHFTNYVQL MQKLDDLANFTNHNKTKLYDIALKKLRQLKSPSRFLTFAIHYDQTGLDEFISFCQETQSL LYRICFDYPLSEKSQEYYLTFVQSLYEIDVGLKLFQQSQYYQKKFDNKLKLNIIKLLALF MTLILALELHLWENAFEQLRKLETFCNTVYKQHVQDCGYENLRDDFCELVKSAIKNKRLY ANKGFKAYRNLDVLQDAYPEDLYNVSEQDYLQKHKPAAPEQEQQKSDSLEDLQQSDLSQE KTTEEENIQNSFIYFTLQSLIVKYFLSISKSYFKLEIFNIAITSYSNIFTMAEQYVTTRN DMVITLLKNLSDFSQEQNFIEDLRMVLKETSFAKSQYFKQLERIFNLNHFFQICQKVGLD QYLEEISINRTKQAFKYPISNFDEQSIITFKNKIFKQGVEVFKIKSDQIKSICINNTNPI EGFVLYGKFLKHMKFYNTLQHKNRSLDGYNLVEEETIDEAIRTEASQTNKPYIVKLCSSA LGIQVGLDKEKKSYLKSRAHPYEEYKDFTEKDFMEKFQNCSSKLIPEEDLQCLASHPHLP LFLQGGKGMINVMTFKSSTQVVAEFNSQQRDSIDFLKFNNSGELFIGHDINNSAYIWKLN RVNKLNTPLFQLNSKVRPTTDLTFINEGTVFASIYSSTNKPHFGLYDMLLPSNRNIVAQE NFNGTDILFSTPLNSILIGNQKKGTVNFLDIRKNQIYKTLELPFTEIKFMKLNQYQTSLI CACNDGQIKIINLETLSTIVDYKPFRQDKKQQIMALTQTENATYAASSDGVISLVYLNA NT seq 6120 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtatcaaatactgaaaagtgtctcacatttttagaacgagtgcattctaacctattcg aaagagaagctcattatttacaccaaagaaatattgctacatatgcaaacttttaggaat tatataagtgatatcgtggctgtggcaacgtcaagcaaaggagtatttgtcgtgttctgt gagagagaattgatagcgtataagccccttttgaatggctgggaataagggtacagtaaa aattgcacaaatcccataagagatgcatttttctcatttgatgatgaacatatcatagga tgttcataaaataagcttcacatttggaaggcaactcataagcaaaatagattacttgga caattagattaatatgaattaattgatctgacagaaatctacacattagaattagaatac taaatagcaaatgtgaaattctctccagatgttcgttattttacaacccttcatttaaat acagttattgtgtgggatttccattcaatcaaggaagtctaagaaggagctctgtcacaa caataaagagtgagtttggatcattaagacgaagtaatttcttacaaatttcgaggtaca cttagaatagctccatctccatttcccactcctaataccattgttacactcaccaaatcc aaccaattaacaatatggtaagaaatgattcaatgcaaaaatttctgtaaattacacaca ttgcatttcgatcaaatctcatcattttgtttcatttacctcaagggattaacaccttac ccttggaaaaatacatatttagaatctgattaatttggagtataggacacagagtaatct agtgtggattaccttctcttacactaggaatctgaattaagtgttgtcaaattagatttc ctaaggaattattcattagaagaatctgttaaagtaattaagaagactaaaagtaacatc ttcaatcaaattaaaaagattcttctagttgattaaatagaaggacaaaaaattgaaatg atcggattcgatagattgtggaatctaatcaaaatatgtgtgaatttgaaggatgattcc taatagatgtttcaatgtgaaaaattcatattttagaatatcgtacatttctccacatgt aaaagtcaagtggcaataataaatgattggaattatttgtgtttgcaataattaaaattg aatagtgttattagttaggaatatcatattgttgagggacaataaaagatatggaaaatt aattcagatctatccaaatattagctaatgtttattgctaaggataaaattaaagaaaat gatgttattgtactaacatcatctaatgcttaacaatgttaggcttttattatctagtaa aatcaactagtagaagtgcatctcaaattatacaaccatctatcaaatgagtatcgagat aaaattactgacttgagaaaaatcaattatgaaatagatgacttacaattattagtaata gcagcctcgaaaattgcattaatttaaatatagtttgagatctatggacatggacagatg gatttataaatattagaattgaagacatggaaattagatttcacttatgaaagactctaa gtcttacaatcgatagaactatcttttatttccatttctgggaaaacattgaagggatac aatgaatagatgaagcaaatcgtttaaatttctaaaaactacaatatcaaagatgttgga tagttaaagggaatccagcctatttattatgtgatgagtcatcaaaatgaaattgatttt cattcttcatcaggagaatttttggttagattcaatctccaatcatttcttgtgagagta gacaaggctctttatgatgtttccaaagttatagtgtaggttgtaccattaaataacttt gcattcattttataaaccgataattacttgacggcatttgcgatacaatttgataagagt gattaaaattataaattgacatcgattaaataaaagtacttaaataatagagaagcaatc tattgtaaacgattatcgaaatattctatgccttaaaattatagatttttcacaataaag gactgtctaatagtaaaaactggccgaaaagtgaaagtattgggaaattcattaatccgt tgtttagcagacaagttttggatgcctagtacattaagctacaaattaataaattaataa aacaacgtttaattgtaagattatgatttcctgagtgaattaatacaacttggtaaaata caattggtataattcatattgaagctaatatgtctcaaatttaaacatcatggtactttg ggaaatcattttatggttccatataagtatttattagaattatatcatttgaattctgag ccagaacccttatgggttgatgcaattaagacatatgtaacaaagaaactgtaagacaag gattcatatgattatactttacatccagttgatgtacttaaaaagatttgttaagaatat ccattaaagattactataattctagattacttaagatattatgaagataattcacgttca ttagacttttatgctgcaatgtttatgttccatgtgtaaatcttcagaaatcaacctact cacaaaagaaatcgagtgttaagttctaaagaagttgtttgggcattacattcattgtaa aaagaaactctttggtaagaatgcattggcaattcagatgatttatcttggaatttagtt aaaagatatgcagcagtattatggatggatttgtcattcattaaataaagattggaagaa attgcattgtagatttataaataatctaaagacccattttaatcgttattatactttata gttttgggtaaaaagagtgtaataacaacgcttttcaaaaaggaagttaattctggcaaa gaatacaaatcgacatatgaatttttgcaataagatttcacttaacccagatggaaatca gctgcttcaaagaatgcatatgccttagtatctaaaaaaagatactaagatgcagctgcc tttttcttaataggaggacatttgaatgatgcagtgaatgtcatggctagatatatggag gatatttaattagcttacttaacaacaaagatccatgaacctcaaggtggacctgttggt gaataactaatctaagactattttatcaaaagtggtgaggagatgaatgatatttggtta ttgcatataggtttttatctattgggaagatatgttgatagtgttaatgttttattaaga gaacctgaacatcatatattagaatatgataattcaggaaaggctgtctgcattagttgg ccatctacattcacaccttagttatcgtattatcatccgtcagctattctgttggttgaa aaactcaaggaaaatataaatgtgaaaagagaaatccaataaagcattgatgctaataaa aagaagagcaagaaggcagaggatgatatcttttctcaattttatgaaagtgaagaatca gaagaggaagaagttgtagaataagttccaattaagaagataaatgataattaggaattc attaagtaataagcagtagaatattattacaacatctaaatgccataattaggaatgata tttgcttaagagttaaattaacaaacagaataatcagagtagttaatcgaattatagatt gaaatgtacatagtttaagctattgaggattaagagcatttcacaaattatgtgtaacta atgtagaaacttgatgatttagccaattttacaaatcataacaaaactaaactatatgat attgcattgaagaaattaagatagttaaagtctccttctcgttttcttacatttgctatc cattatgattagactgggctagatgagttcatttctttttgtcaagaaacttagagttta ttgtatagaatatgtttcgattatcccttatccgaaaagagttaagagtattatttaaca tttgttcagagtctctatgaaattgatgttggattgaaactattttaataatcctaatat tatcaaaagaaatttgataacaaattgaaattgaacatcattaagttattggcattgttc atgactttgattttggcattagaattacacctatgggagaacgcgtttgaacaattaaga aagttggagacattttgtaatactgtatacaaataacatgtataagattgtggatacgag aatttgagagatgatttctgtgagttggtgaaatcagcaatcaaaaataaaagactctat gcaaataaagggtttaaagcatatcgaaatttagatgtgttgtaagatgcttatcctgaa gatttatataatgttagtgaataggattatttgcaaaagcataaaccagctgcaccagaa taggagtaatagaaatcagatagtcttgaagatttataataatcggatcttagttaagaa aagacaacagaggaggagaatatatagaactcatttatatattttactttgcaatctttg attgtgaaatacttcttgtctatatctaagagttactttaaattagaaatattcaatatt gcaataactagttatagtaatatctttacaatggctgaataatacgtgaccactagaaat gatatggttatcactttattaaagaatctctctgatttctcctaagaatagaattttatt gaagatctaagaatggttttgaaggagacttcatttgctaaaagtcaatactttaagtag cttgaaaggattttcaatttgaatcatttcttttaaatttgctaaaaggttggattagat caatatttggaggaaatctcaataaatagaactaaataagcattcaaatatccaataagt aattttgacgagtaatcaataatcacattcaaaaataaaatctttaagtaaggagttgaa gtatttaaaataaagtccgattaaattaagagcatatgtattaataataccaatccaatt gaagggtttgtattatatggcaaattcttaaagcatatgaaattttataacactctctaa cacaaaaatagatcattggatggttataatttggtagaagaagaaactatcgatgaggct ataagaacagaagcatcttaaacaaataaaccatacattgtaaaactatgctcctcagct ttaggaatctaggttggattggataaggagaaaaaatcatatttaaaatcaagagcacat ccttatgaagaatacaaagacttcactgaaaaggattttatggaaaaattctagaactgt tctagtaaattgattccagaggaggatttgtaatgtttggcttctcatcctcatctaccc ttatttttacaagggggaaaaggaatgatcaatgtaatgacttttaaatcatccacataa gtagttgctgaattcaattctcaataaagagattctattgattttcttaaatttaataac tcaggtgaattatttattggacatgatataaataatagtgcttatatttggaaacttaat cgagtcaacaaactcaatacaccactcttctaacttaatagtaaagttagaccaaccact gatctgacctttattaacgagggaacagtttttgcttctatttatagttctactaataag cctcattttggtttgtatgatatgttattaccttctaatcgtaatattgtagcataagag aactttaatggtacagacatcttattttctactcccttgaattctattttgattggcaat caaaaaaaagggactgtcaatttcttagatatcagaaagaattaaatctacaaaacatta gaattacctttcacagaaatcaaatttatgaaactgaatcagtatcaaacttcactaatt tgtgcctgcaatgatggataaattaaaatcatcaatttagaaactctgtctactattgtt gattataaaccatttagataagataaaaagcagtaaattatggctttgacataaactgag aatgctacatatgcagcatcatctgatggagttatatcattagtatatttgaatgcatga

DBGET integrated database retrieval system