KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00016283001
Entry
GSPATT00016283001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20305  trafficking protein particle complex subunit 8
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00016283001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   TRAPP complex II
    GSPATT00016283001
SSDB
Motif
Pfam: TRAPPC-Trs85 Ig_TPPC8_C KATNA1_MIT
Other DBs
NCBI-GeneID: 5034639
NCBI-ProteinID: XP_001448854
Genoscope: GSPATT00016283001
UniProt: A0DEJ0
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1205 aa
MNITQLELFNQACHQYKGMVISSDFIQTALLSRYQITPAEFLRPFLPRKVQRLKLGLREK
DKELNIKLLDMKEYDQIGNVKLDKYSRLLLEDTQFLEQVQISRNCSKQLLDQICDQNKMA
GFQQLQQVVGDCLGFQYHYNFLDHPIVLFYVVSGQEKNLIQEIHKIRSDSNSLIKMIFKN
NLSDLEMVSKVIIILNDAQEVVQYESLDLIFKEFSKFRAYTLKYNLPNPIEQTHWSRFAY
QRYNYEGEVPKHPLGILDEQWTKIYRQVIEEVILQQALIILESQINKQTQLYQEMKQKTF
DTFLTSIFNTRTGQSTEIEYKMSQKEQLLRFLGDNHFLMNDYESAVTYYKGLITELKNNK
TNTTIATLYATEYYLYSRLLASQKIDNLKNIFDEIEVGYHKFIQFPYMLRVMFFYIITIH
MFGKYSKEQIYFLQRFHRYFKDLGSTTKKDYFVVYQILVYEQIAFIHLRLDPPEFRKFAH
NLTLVANKYESENFKKHALRCFKIVEQLYQQSKWVPLLFWLEGHIGANCLENHKVQEAID
SFKLAFNQLNERQTLELHNQLVVDWKKAYQSIEQLQDFRRKYFTQTNTNLKIPIVKGPVD
MLTHGQDVLDSIVLTNIKQKFKNLWNTVSKNESFFEDASIRSFDSIYLEERIACFNKTPC
ILNADKISDVIDKINKFGRQCFAEDIITLRFFINLPVKVPSYINSLQVMYQFYTLKENLL
DLEAGNEKDYVLTKINTLEIKDIPFQRAVQEYLEVSITPPSAGYLIITGLQWNFINIPAQ
ILINYDAKDQSKKKSVNFYNKFKVFPKFIPIDIEYYTKPVIAYGEIRPILFKFTNKNPEE
IVIHITPIIPYHFGFEEKKIILSAFQVLEYQFYLRCSFQEEFVGQLLFKYQQGQSGGIRI
QKLEIPMKVDPSFKISLQTDLIVDYWKFTLQVQDYFGGKGNLRFDRILCLNENWKYFDIP
YQSSGDPFLLTTFKLKKIQTKDYRYEEYQNRLKERFYREGDNFNEIILGDQDIPADVALD
FVNLDIQHYFSVFYQKLQNQKMEEFPLFIIARWTYRYEDEIVYGLHELPVLQQNYLHRDV
KEFPMSFSIIAPFEVEHQGMITMVPIKISFKNTKYVESISFTVTLFNGDEPLKSINDIQQ
PFFLWEGILQHQITLKPQEMKVLTLEGVFTEKGVYDLSRFRLTMNNKQQSEYYSIDHETV
IIKII
NT seq 3618 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatattacatagctagaactctttaatcaagcctgtcattaatataagggtatggtg
atttcttctgatttcatacagacagctctactaagtagatatcaaataactcctgctgaa
tttttgagaccatttctacctagaaaagtgcagagattgaaattgggtttgagagagaag
gataaggagcttaacataaaattgttagatatgaaggaatatgatcagattggaaatgta
aagttggataagtattcgcgtcttctattggaggatactcaatttttggaacaagtttaa
atctcaagaaattgcagtaaacagcttttagatcaaatttgtgattaaaataagatggct
gggttctagtaattgtaataagtagtgggagactgtttaggattctaatatcattataat
ttcctagatcatccaattgtattattctatgtagtaagtggataagagaaaaatttgata
taggagatccataaaataaggagcgattcaaatagtttgattaagatgatttttaagaat
aaccttagtgatttggagatggtgagcaaggttatcataatattgaatgatgcacaggag
gtagtgtaatatgaatctcttgatttgatctttaaggaatttagcaagtttcgagcatac
acactcaaatacaacttgcctaatccaattgaataaactcactggtctcgatttgcatat
cagagatacaattatgaaggcgaggttcccaagcatcctttaggaatattggatgaataa
tggactaagatttatagataggtgattgaggaagtcatattataacaagcactgatcata
ttggagagtcaaatcaataagtagactcaactctattaagaaatgaagtagaaaacattt
gatacttttttgacaagcattttcaatacgagaacaggttaatcaactgaaattgagtat
aagatgagtcaaaaagaataattattgagattcttgggtgataatcattttttgatgaat
gattatgaaagtgctgtcacttattataaaggacttataactgaacttaagaataataaa
actaatacgactattgccactttgtatgcaacagagtattatttatactctcgcttattg
gcatcatagaaaatagataatttaaagaatatttttgatgaaattgaggttggttatcat
aagtttattcaattcccatacatgttaagagtgatgtttttttatataataacaattcac
atgtttggaaaatatagtaaagaatagatttatttccttcaaagatttcatcgttatttt
aaggatttagggagtactacaaaaaaggattattttgtagtttatcaaattttagtctat
gaataaatagcattcattcatctaagattagatcctccagagttcaggaagtttgctcat
aatctgacattagttgctaataaatacgaatctgaaaatttcaagaagcatgcattgaga
tgctttaaaatagttgaataattatattaataatcgaaatgggtgccattattattttgg
ttggaaggacatataggggccaattgtttggagaatcacaaagtgcaagaagccattgat
tcatttaagttggcattcaattaactaaatgaaagatagacattggaattgcataatcaa
ttagttgtagattggaaaaaagcatactaatcaattgaacaactttaagatttcagacga
aagtatttcacttaaactaatactaacctgaaaattccaattgtcaaaggacctgtagat
atgttaacgcatggttaagatgtattagattccattgttcttactaatatcaagtagaaa
tttaagaatttatggaatacagtctcaaagaatgaatccttttttgaagatgcatccatt
agaagttttgattccatctatttggaagaaagaattgcatgcttcaataaaaccccttgt
attttaaatgctgataaaatttcagacgttattgacaagattaacaagttcggaaggcaa
tgctttgctgaggacattatcactttaaggttttttattaatttgccagttaaagtgccc
agttatatcaatagcttataagtaatgtatcaattttacacactcaaagagaatctttta
gatttagaggctggtaatgaaaaagattatgtactcacaaaaataaatactttagagata
aaggacattcctttttaaagggcagtataagaatacttagaagtgtccataactcctcca
tcagctggatatttgataattacaggtttgcaatggaatttcattaatattcctgcataa
atattaattaattatgatgctaaggatcaatcaaagaagaagagtgtaaatttttacaac
aagtttaaagtttttcctaaattcatcccaattgatattgaatattatactaaaccagtt
attgcttatggggaaataaggcctattctttttaagtttacaaacaagaatcccgaagaa
atagtaattcatataactccaataataccttatcattttgggtttgaagagaaaaagata
atattaagcgccttctaagttttggaatattaattttacttgagatgcagcttctaagag
gaatttgttggtcaattattatttaagtattaataaggatagagtggaggaattagaatt
tagaaattggaaattccgatgaaagtggaccccagtttcaagatatcattataaacagat
ttgattgtggattattggaaatttacattataggttcaagactattttggagggaaaggc
aatttaagattcgacagaattctatgtttgaatgagaattggaaatattttgatattcct
tatcaatccagtggtgatccatttcttctgactacctttaagttgaagaagatccaaaca
aaggattatcgatatgaggaatatcaaaatagactaaaggagagattctatagggagggt
gacaatttcaatgagataatattaggtgattaagacattcctgcagatgttgctttggat
tttgtaaatctggatatataacattacttcagtgttttctatcagaaattgtagaattaa
aaaatggaggaattccctctattcatcatagcaagatggacatacagatatgaagatgaa
atagtatatgggttgcatgaattgcccgttttgcaataaaattatttacatagggatgtg
aaagaattccctatgtcattttccattatagctccatttgaagtagaacaccaaggcatg
attacaatggttcccataaaaattagtttcaaaaatacaaagtatgtagagtctataagt
tttacagtgaccttatttaatggggatgaacctttgaagtcaattaatgacatctagtag
ccattctttttgtgggaaggcattttgcaacaccaaattactttgaagccataggagatg
aaagtgttgacgttagaaggggtttttacagagaagggagtatatgatttaagcagattt
agattgacaatgaataataaacagtaaagcgagtattactcaattgatcatgaaacagtt
ataataaaaattatatga

DBGET integrated database retrieval system