Paramecium tetraurelia: GSPATT00016283001
Help
Entry
GSPATT00016283001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20305
trafficking protein particle complex subunit 8
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00016283001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
GSPATT00016283001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TRAPPC-Trs85
Ig_TPPC8_C
KATNA1_MIT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5034639
NCBI-ProteinID:
XP_001448854
Genoscope:
GSPATT00016283001
UniProt:
A0DEJ0
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1205 aa
AA seq
DB search
MNITQLELFNQACHQYKGMVISSDFIQTALLSRYQITPAEFLRPFLPRKVQRLKLGLREK
DKELNIKLLDMKEYDQIGNVKLDKYSRLLLEDTQFLEQVQISRNCSKQLLDQICDQNKMA
GFQQLQQVVGDCLGFQYHYNFLDHPIVLFYVVSGQEKNLIQEIHKIRSDSNSLIKMIFKN
NLSDLEMVSKVIIILNDAQEVVQYESLDLIFKEFSKFRAYTLKYNLPNPIEQTHWSRFAY
QRYNYEGEVPKHPLGILDEQWTKIYRQVIEEVILQQALIILESQINKQTQLYQEMKQKTF
DTFLTSIFNTRTGQSTEIEYKMSQKEQLLRFLGDNHFLMNDYESAVTYYKGLITELKNNK
TNTTIATLYATEYYLYSRLLASQKIDNLKNIFDEIEVGYHKFIQFPYMLRVMFFYIITIH
MFGKYSKEQIYFLQRFHRYFKDLGSTTKKDYFVVYQILVYEQIAFIHLRLDPPEFRKFAH
NLTLVANKYESENFKKHALRCFKIVEQLYQQSKWVPLLFWLEGHIGANCLENHKVQEAID
SFKLAFNQLNERQTLELHNQLVVDWKKAYQSIEQLQDFRRKYFTQTNTNLKIPIVKGPVD
MLTHGQDVLDSIVLTNIKQKFKNLWNTVSKNESFFEDASIRSFDSIYLEERIACFNKTPC
ILNADKISDVIDKINKFGRQCFAEDIITLRFFINLPVKVPSYINSLQVMYQFYTLKENLL
DLEAGNEKDYVLTKINTLEIKDIPFQRAVQEYLEVSITPPSAGYLIITGLQWNFINIPAQ
ILINYDAKDQSKKKSVNFYNKFKVFPKFIPIDIEYYTKPVIAYGEIRPILFKFTNKNPEE
IVIHITPIIPYHFGFEEKKIILSAFQVLEYQFYLRCSFQEEFVGQLLFKYQQGQSGGIRI
QKLEIPMKVDPSFKISLQTDLIVDYWKFTLQVQDYFGGKGNLRFDRILCLNENWKYFDIP
YQSSGDPFLLTTFKLKKIQTKDYRYEEYQNRLKERFYREGDNFNEIILGDQDIPADVALD
FVNLDIQHYFSVFYQKLQNQKMEEFPLFIIARWTYRYEDEIVYGLHELPVLQQNYLHRDV
KEFPMSFSIIAPFEVEHQGMITMVPIKISFKNTKYVESISFTVTLFNGDEPLKSINDIQQ
PFFLWEGILQHQITLKPQEMKVLTLEGVFTEKGVYDLSRFRLTMNNKQQSEYYSIDHETV
IIKII
NT seq
3618 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattacatagctagaactctttaatcaagcctgtcattaatataagggtatggtg
atttcttctgatttcatacagacagctctactaagtagatatcaaataactcctgctgaa
tttttgagaccatttctacctagaaaagtgcagagattgaaattgggtttgagagagaag
gataaggagcttaacataaaattgttagatatgaaggaatatgatcagattggaaatgta
aagttggataagtattcgcgtcttctattggaggatactcaatttttggaacaagtttaa
atctcaagaaattgcagtaaacagcttttagatcaaatttgtgattaaaataagatggct
gggttctagtaattgtaataagtagtgggagactgtttaggattctaatatcattataat
ttcctagatcatccaattgtattattctatgtagtaagtggataagagaaaaatttgata
taggagatccataaaataaggagcgattcaaatagtttgattaagatgatttttaagaat
aaccttagtgatttggagatggtgagcaaggttatcataatattgaatgatgcacaggag
gtagtgtaatatgaatctcttgatttgatctttaaggaatttagcaagtttcgagcatac
acactcaaatacaacttgcctaatccaattgaataaactcactggtctcgatttgcatat
cagagatacaattatgaaggcgaggttcccaagcatcctttaggaatattggatgaataa
tggactaagatttatagataggtgattgaggaagtcatattataacaagcactgatcata
ttggagagtcaaatcaataagtagactcaactctattaagaaatgaagtagaaaacattt
gatacttttttgacaagcattttcaatacgagaacaggttaatcaactgaaattgagtat
aagatgagtcaaaaagaataattattgagattcttgggtgataatcattttttgatgaat
gattatgaaagtgctgtcacttattataaaggacttataactgaacttaagaataataaa
actaatacgactattgccactttgtatgcaacagagtattatttatactctcgcttattg
gcatcatagaaaatagataatttaaagaatatttttgatgaaattgaggttggttatcat
aagtttattcaattcccatacatgttaagagtgatgtttttttatataataacaattcac
atgtttggaaaatatagtaaagaatagatttatttccttcaaagatttcatcgttatttt
aaggatttagggagtactacaaaaaaggattattttgtagtttatcaaattttagtctat
gaataaatagcattcattcatctaagattagatcctccagagttcaggaagtttgctcat
aatctgacattagttgctaataaatacgaatctgaaaatttcaagaagcatgcattgaga
tgctttaaaatagttgaataattatattaataatcgaaatgggtgccattattattttgg
ttggaaggacatataggggccaattgtttggagaatcacaaagtgcaagaagccattgat
tcatttaagttggcattcaattaactaaatgaaagatagacattggaattgcataatcaa
ttagttgtagattggaaaaaagcatactaatcaattgaacaactttaagatttcagacga
aagtatttcacttaaactaatactaacctgaaaattccaattgtcaaaggacctgtagat
atgttaacgcatggttaagatgtattagattccattgttcttactaatatcaagtagaaa
tttaagaatttatggaatacagtctcaaagaatgaatccttttttgaagatgcatccatt
agaagttttgattccatctatttggaagaaagaattgcatgcttcaataaaaccccttgt
attttaaatgctgataaaatttcagacgttattgacaagattaacaagttcggaaggcaa
tgctttgctgaggacattatcactttaaggttttttattaatttgccagttaaagtgccc
agttatatcaatagcttataagtaatgtatcaattttacacactcaaagagaatctttta
gatttagaggctggtaatgaaaaagattatgtactcacaaaaataaatactttagagata
aaggacattcctttttaaagggcagtataagaatacttagaagtgtccataactcctcca
tcagctggatatttgataattacaggtttgcaatggaatttcattaatattcctgcataa
atattaattaattatgatgctaaggatcaatcaaagaagaagagtgtaaatttttacaac
aagtttaaagtttttcctaaattcatcccaattgatattgaatattatactaaaccagtt
attgcttatggggaaataaggcctattctttttaagtttacaaacaagaatcccgaagaa
atagtaattcatataactccaataataccttatcattttgggtttgaagagaaaaagata
atattaagcgccttctaagttttggaatattaattttacttgagatgcagcttctaagag
gaatttgttggtcaattattatttaagtattaataaggatagagtggaggaattagaatt
tagaaattggaaattccgatgaaagtggaccccagtttcaagatatcattataaacagat
ttgattgtggattattggaaatttacattataggttcaagactattttggagggaaaggc
aatttaagattcgacagaattctatgtttgaatgagaattggaaatattttgatattcct
tatcaatccagtggtgatccatttcttctgactacctttaagttgaagaagatccaaaca
aaggattatcgatatgaggaatatcaaaatagactaaaggagagattctatagggagggt
gacaatttcaatgagataatattaggtgattaagacattcctgcagatgttgctttggat
tttgtaaatctggatatataacattacttcagtgttttctatcagaaattgtagaattaa
aaaatggaggaattccctctattcatcatagcaagatggacatacagatatgaagatgaa
atagtatatgggttgcatgaattgcccgttttgcaataaaattatttacatagggatgtg
aaagaattccctatgtcattttccattatagctccatttgaagtagaacaccaaggcatg
attacaatggttcccataaaaattagtttcaaaaatacaaagtatgtagagtctataagt
tttacagtgaccttatttaatggggatgaacctttgaagtcaattaatgacatctagtag
ccattctttttgtgggaaggcattttgcaacaccaaattactttgaagccataggagatg
aaagtgttgacgttagaaggggtttttacagagaagggagtatatgatttaagcagattt
agattgacaatgaataataaacagtaaagcgagtattactcaattgatcatgaaacagtt
ataataaaaattatatga
DBGET
integrated database retrieval system