KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00018057001
Entry
GSPATT00018057001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K11293  protein HIRA/HIR1
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
    GSPATT00018057001
Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
 Eukaryotic type
  Nucleosome assembly factors
   Histone chaperones
    Other Histone chaperones and regulators
     GSPATT00018057001
SSDB
Motif
Pfam: WD40_WDHD1_1st Beta-prop_CAF1B_HIR1 WD40_CDC20-Fz WD40 Beta-prop_EML_2 ANAPC4_WD40 WD40_Prp19 Beta-prop_HPS5 WDR55 Beta-prop_IFT140_1st WD40_MABP1-WDR62_2nd Beta-prop_WDR19_1st Beta-prop_WDR35_TULP_N Hira Beta-prop_Vps41 Beta-prop_WDR90_POC16_2nd Beta-prop_EML Beta-prop_RIG_2nd Beta-prop_TEP1_2nd EIF3I MIOS_WD40 F-box_4 Beta-prop_WDR19_2nd NBCH_WD40 DUF5424
Other DBs
NCBI-GeneID: 5036922
NCBI-ProteinID: XP_001451137
Genoscope: GSPATT00018057001
UniProt: A0DL23
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 792 aa
MSVRIKYTSIIEAKTGLKSLGLSKKNILALGSGEEEDWLLLNEVNAQFNLHPIQIGKMEK
RMISQLAWSPSGLYLATSNDKLIVWQFNGGNLSISRTYQGHKLEITALCWSPDDQRIATA
SLDGNIFIYHIKQDGIQHKIDCGQKTVGICWDPFDKYIVSLKFDNTVQIFKYKVNFYKID
NWKQEITVSLQIHGKQCTTKREDRKLDWSVDCRYLAVPNLDDKTIPTVAILDRNQNFQVV
RTIIGPFSSINVVRFSPMLFKNIIAIGDNDGNISLWQINENQVDEQPFLLVKGHKKAGEL
IEDITWNQQGTVLMATTSKKYIIVIDFQLSLGQVLNETEKQQAIKSLYGDLKNTIKQIRF
YQPKINNDNIKFADMQLENIDVQDELKNQIPDSAFQQREILKQTQTQFKQIIVDGKKKLI
PLDVNSSEPVFKKVEQQQPLLIIQQYEILPKSYSFSMNNKSLLLEVQKQQQRIFNQAVYG
TLIRCIENNTPKWIDYVEGQIKNIQYNDDLIVIYTDQALLYIENHKGMRQESPFILPFLS
QIVLSPKNYILCLQNTGEFKVINLNTKTISYEGDIKILMQHVYEWMDQKQLFNEDEKKGK
QSIDPLIKANLKIDTEGYPLVEFLFKDYCVYTYHKQLRQWIKTKQIDVNNQNQDIKNLKK
FNFNQYQTPPYNDAQIYKRIIQKSTIEDAINDIQQISKLEEQLKIYWSDGDIKTYEKALY
TYIKKLCDTWPNNQEKLSNIIETIITNYNSAEYKYLSERVQDMEELKKKIIYILQQFPQT
RDLTLCLFPDHF
NT seq 2379 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctgtaagaatcaaatatactagcataatagaagctaagactggattgaaatcgttg
ggtttatcaaaaaaaaacatattagcattagggagtggtgaagaagaagattggttacta
ttaaacgaagtgaatgcataatttaatttgcatcctatttaaattggcaagatggagaag
agaatgatctctcaattagcatggtctccatcaggactctatttggcaacaagcaatgat
aaattgattgtttggtaattcaatggcggcaatttgtcaatatctcgaacctattaagga
cataaattggagattactgcattatgttggtctccagatgattaaagaatagctactgcc
tctttagatggaaatatctttatttatcatatcaaataagatggaatctaacataaaata
gattgtggttaaaaaacagttggaatatgttgggatccctttgacaaatacatagtatcc
ttgaaatttgataacacagtataaatttttaaatataaggtcaatttttataaaatagat
aattggaaacaagaaatcacggtttccctccaaatacatggcaaataatgtacaaccaaa
agagaggataggaaattagattggagtgtagattgcagatatttggcagtcccaaattta
gatgataaaactatcccaacagtggctatcttagatcgaaaccagaattttcaagttgtt
agaacgataattggtccattctcatcaatcaatgttgttagattttcaccaatgttattt
aagaatatcattgctattggtgataatgatggtaatatcagtttatggtaaataaatgag
aattaagttgatgaacaaccatttctgttggttaagggtcataaaaaggctggagaactt
atagaggatattacatggaatcaataaggaactgttttaatggctacgacgtccaaaaaa
tatattattgttattgattttcaactgagtttgggctaggttttaaatgaaacagagaaa
cagtaagcaataaagagtctttacggagatcttaaaaatacaattaaataaattagattt
tattaaccaaaaattaataatgacaatatcaaatttgcagatatgcaattagaaaatata
gatgtctaagatgaattgaagaatcaaattcctgatagcgcattttaataaagagaaatt
cttaaataaacttaaacataatttaagtagattattgtagatggcaagaaaaagttaatt
cctttagatgtgaattcttctgaacctgttttcaaaaaggttgaataacagtagcctttg
ttgattatttaataatatgaaatattgcctaaaagctactcattttcaatgaataacaaa
tctcttttgttggaagttcaaaaataataataaagaatattcaattaagctgtctatgga
actttaattagatgtattgagaataatacaccaaagtggattgattatgtagaggggtaa
ataaagaatattcaatataatgatgatctaattgtcatatacactgattaggcgttgcta
tacattgaaaatcataaaggaatgaggtaggagtcaccatttatattgccattcttaagt
tagatagttttgagtccgaagaattatatcttatgtctttaaaacactggagaatttaaa
gtcatcaatttaaatacaaaaaccatttcttatgaaggtgatattaaaattctaatgcaa
catgtttacgagtggatggattaaaagcaattatttaatgaagatgaaaagaaaggcaaa
taaagcattgaccctttaataaaggctaatcttaaaattgatactgaaggatatccctta
gttgaatttctatttaaagattattgtgtttacacttatcataagtaattgagacaatgg
attaaaactaaatagattgatgtgaacaatcaaaattaagatatcaagaatttaaagaaa
ttcaactttaattaatactaaacgcctccttataatgatgcttagatatataagaggata
atctaaaaatctacaattgaagatgcaataaatgatattcaataaatatcgaaattggag
gaacaattaaaaatatattggtctgatggtgatattaaaacatatgagaaagcattatat
acctatattaagaaattatgtgacacttggccaaacaatcaagagaaattatcaaatatc
attgaaacaataattactaattacaattctgctgaatataagtatctgagtgaacgtgta
taggatatggaagagctaaaaaaaaaaattatttatattcttcaacaatttccataaaca
agagatctaacattgtgtctttttccagatcatttctga

DBGET integrated database retrieval system