Paramecium tetraurelia: GSPATT00018248001 Help Entry GSPATT00018248001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K10597   ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:2.3.2.27] Organism ptm  Paramecium tetraurelia Pathway ptm04120   Ubiquitin mediated proteolysis ptm04141   Protein processing in endoplasmic reticulum Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    04141 Protein processing in endoplasmic reticulum     GSPATT00018248001    04120 Ubiquitin mediated proteolysis     GSPATT00018248001  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04121 Ubiquitin system [BR:ptm04121]     GSPATT00018248001 Enzymes [BR:ptm01000]  2. Transferases   2.3  Acyltransferases    2.3.2  Aminoacyltransferases     2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase      GSPATT00018248001 Ubiquitin system [BR:ptm04121]  Ubiquitin ligases (E3)   U-box type E3    GSPATT00018248001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Ufd2P_core U-box Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5037112 NCBI-ProteinID:  XP_001451327 Genoscope:  GSPATT00018248001 UniProt:  A0DLL3 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 1005 aa AA seqDB search MGQAQPAQMNSQQEEQSNAKLTQYPAQKNEKNVESQELNSNQPNQYQFTQNLNSHQNDKA DLQNIDEEIQSAQDIENIWLTRTFGIFTNTQQIYGKEVDFIPKNQILTVDFLIEQVYYQF LTSSQFTEQEKLDFLIKSLSSLSNSQVTNEIVNLAEGKIKKERYFDLLNHIQGQLLTCTL YPDAFEWQNIDEDPNVFEDAKNFRANIIFNEIFCSNNFGISQNTLINLLDYLETQASEDD SFKFLELMLKRELKLYTRLAFDDIRLQQHSLALLHILAQYKKLMEKLLSNSWAYCNFDLI NTGINFQQRSLVGILLSLSSFPTDGHLWKSHFSDDRKQMMEQMSSLRTRMFTIIDDLCML FEKILNSNEILRYKFFEFLSNIIKLNLNLEKQLNIQLQKLSSSPGLVNHLFYILTYLFNK FADSQTTINLFIKKIDLNLLSYCKKHPLFQPLYQNVDLLASELTPFVEPKEFKTIIDPMT ALYLLTQRLSHIVATCLQQFYISTIMREMKDLPQEAFQTQVFDILLKRKISFDLQILHPK GIKYITQFLSFANQLALSLIDTDLKPIYPYGLLSATFLIDTQTFVSIYAYNDEIINYVIE LQKCCEFAAISMNKKLLPNPHLRIRSINIFQIIDETKGSFLQKYTRQNWRQSQELNILFD SKFLRTCLVDGLIQSFIDTEKVAEGNQYFQKLNIRVKICLIIRYLLQVHKSLYQESLFHG FKNDQEQQLHFSNYFLNDFIYVIEECLLSLKNIKKLQVEQQSFFQNHQLHKLQKELTIKS QFFYEYLRSLEVITSIQPEIFLIDEIREKLAIHLNYILEQINGKSSEDIAQNIDVQNFDK MFVVEILINVYTNLRKNQQFILEVVKDERSFSVELFKKTQNETKQYINYEKYSLQFEEFI NQVEELSQKQKVLFQNQEDIPEEFLDPLCFSFMNDPVKLPHSNVIVDRLTIKKHLLNNSI DPFDRSPLTLDMVIEQKELKQKIDEYIAKNLEKLINKQTLNQEQK NT seq 3018 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgggttaggcttagcctgcttaaatgaattctcagcaagaggaataatctaatgcaaaa ttaactcaatatcctgcataaaaaaatgaaaaaaacgttgaaagttaagaattaaattct aatcaaccaaattaatattagtttacccaaaatctcaatagccactaaaatgataaagca gatttataaaatattgatgaggaaatatagagcgcttaggatattgaaaatatttggttg actagaacttttggaatatttacaaatacctaatagatttatggtaaggaagtcgatttt atacccaagaattaaatattgacagttgattttttaatagaacaagtttattaccaattt ttaacatcctcctagtttactgaataagaaaaactagatttccttattaaatcattgtct tctctatctaattcctaagttacaaatgaaatagtgaatttggctgaaggcaaaatcaaa aaagaaagatattttgacctcttaaatcatatttaaggtcaactacttacttgtacatta tatcctgacgcttttgagtggtaaaacattgatgaagaccctaatgtctttgaggatgct aaaaactttagagccaacattatctttaatgaaatattctgctcaaataattttggcata tcctaaaatacacttataaacttattagattatttagaaacataagcgagtgaagatgat tcatttaaatttttagaacttatgttgaagagagaactcaaattatatacgcggttagct tttgacgatattcgattataatagcattcacttgctctattgcatattttggcataatac aaaaagctgatggagaaactattatcaaacagctgggcgtattgcaatttcgatttgatt aatactggaattaatttttaataaagaagcttagttgggattttgttatccttaagctcc tttccaacagatggacatctatggaaaagccatttctcggatgataggaaatagatgatg gagcaaatgagtagtttgagaacaagaatgtttacaatcatagatgatttatgcatgcta tttgaaaagattttgaattcaaacgaaatacttagatataaattttttgaatttttatct aatatcattaaattgaatttaaatttagaaaaataattgaacatttagttgtaaaaattg tcatcaagtccaggattagtgaatcatttattttatattcttacctatctattcaacaaa tttgcagattcataaactacaattaacttgttcataaagaaaatcgatttaaatttatta agttattgtaagaaacatcctctcttttaacctttgtattagaatgttgacttgttggct tcagaattaacaccatttgttgaacctaaagagtttaaaactattatcgatccaatgaca gctttatatctattgacttaaagattaagtcatattgtggctacctgtttacaataattt tacatctcaacaattatgagagagatgaaagatttaccgcaagaggccttttaaacttaa gtgtttgatatactgttaaaaaggaaaatctctttcgacctataaattttacaccctaag ggtataaaatacatcactcaatttttaagttttgctaattaattagctttaagtctaata gatacagatctaaaacctatttatccttatggattattgtcggccacctttttaattgat acctaaacatttgtatcaatttatgcttataacgatgaaattataaactatgtcatagaa ttacaaaaatgttgtgagtttgcagcaatatcaatgaacaaaaaattacttccaaatcct cacttaagaataagatcgataaatatattttaaatcattgatgagacaaaaggttcattt ttgtaaaagtatacacggtaaaattggaggcaatcttaagaacttaatattttgtttgac tccaaattccttagaacatgcctggttgatggattaatataatcttttatcgatacagag aaagtggcagaaggaaatcaatatttctagaagttaaacattagagttaaaatttgttta ataataagatacctcctttaagtacataaaagtttatatcaagagagtttgtttcacgga tttaagaatgattaagaacagtaattgcacttttctaattactttttgaacgacttcata tatgtaatagaggaatgcttattatccttaaaaaatataaagaaattataagttgaataa cagtcctttttctaaaatcatcaacttcataagttgcaaaaagaactaactattaaatca taatttttttatgaatatttacgatcattagaggtgataacttctatttaacctgaaata tttttgattgatgaaattagagaaaaattagcaattcatttaaattatattttagagcaa attaatggtaaatcatctgaagatattgcttagaatattgatgtataaaatttcgataaa atgtttgttgttgaaattttaataaatgtctacactaatttgagaaaaaactagtagttc attcttgaagtagttaaggatgaaagatcattttcagttgaattattcaagaaaacataa aatgaaacaaaataatacatcaattatgaaaaatatagcttataatttgaagaattcata aactaagttgaagaattaagttagaaataaaaagtccttttttaaaattaggaagatata ccagaagagttcttagatccattatgtttttcgttcatgaatgatccagttaaacttcct cattcaaatgtaattgtggataggctcaccattaaaaagcatcttctgaataattcaatt gatccttttgataggagtccattaactttggatatggtgattgagtagaaagaattaaag cagaagatagatgaatacattgcaaaaaatctagaaaaattaataaacaaatagacttta aactaagaatagaaatga

DBGET integrated database retrieval system