Paramecium tetraurelia: GSPATT00018323001
Help
Entry
GSPATT00018323001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K18460
exportin-7
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
GSPATT00018323001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ptm03019
]
GSPATT00018323001
Messenger RNA biogenesis [BR:
ptm03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Ran-mediated transport factors
GSPATT00018323001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5455
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5037287
NCBI-ProteinID:
XP_001451502
Genoscope:
GSPATT00018323001
UniProt:
A0DM38
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1087 aa
AA seq
DB search
MQTIMTLIEQKNQQVLELLRNFVLDYSNIELFKSLILEDCNPDTTFALYSIIQKGLINGD
HFTNLPHQKVSTEYFYNEYDHRMNITEICTKHIEIALIYLQSTHNHPNYVQNQVIFTIAL
LMRKNWVDILKIEDLISQIINSTIQANKIVFFKIFENLISCIRQYSYANGYIEFRKILNN
FQMLSLSKIISAIHQQIQQLQGSSLLQLYTQNKTMAESFINILYQLMNLNFNLSYYEIDM
DNDGKDTSQLTNFPDYYLDLIIDPIFLRELFQDTIGFINVDQNLSLQCITMLQRIACVRL
SIFHNKKCKGGFRRAMWEGLLYLYQNQDQFINYVEFSSEIHSLAVRVINNLTLRKIAKFQ
FQFDNFFQLIQQVYQKTIQIYGVKVILNSPIIKLQELWNQISYQGSLHQPLHEEFNVKIS
MVMQNQLILVLKAFFQQNQFTEIPQECSVKKFKKLLELTFMPFHCLFKSHIQDNINLIQQ
MIEQLRGDNEYQCAAVISLTIVFLLHTSNTEILNMGFDSYNFGQKEEPKPNLDGQSYILK
FIVELIMNQQVQKNTRILKIAILSFIESFIATTIDSFCYDQETKNFKNLSQIYSQLIRID
QRYQNYVLVLETMLDECFQVFTYGDPQLIEFSLKLIEFIYQKVKKYIPRKVFKACTITDM
LKQFFLQLNITCLNTPQYIKKRAMVFKIITIVWVDDCSDDYLNALVDIYNQIKKSIQIEM
NKLNILKYVWDLIGIASEIDVDNIYRAFLRIIYPDLAGLLTQENIELFAKDYDSSIAIIT
LFKAIFYNKNTRLSTENIQLILYQIYGKAMKFFIILIQQQIQTAKTQQKLSDLQLKQVSK
LFALMSQISGQKKINQGFFIIYNDQSFLELFTLQIQLILIYRPLLQHIPKYKKLLYECFD
CICQDHSETLAYKCNLNLYLDIFLICKESLKDIIYDNQGEDTINENSATLILIGTLLSNI
STFLVQEASVGDINDLQMIKNKINGIIVQGKQILFDIFNLSCQITLIYPKNSKLIFAIPE
ILYAVSIFSPQDFETLLITMITNQIGITKNPIIDQISLAFKNLQGELQISNKEDFTRKIK
VVLEMYK
NT seq
3264 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaacaataatgaccttgatagaatagaaaaattaacaagttttagaattactcaga
aactttgttctagattattcaaatattgaattgtttaaaagtctaatacttgaagattgt
aatcctgataccacgtttgctctttattcaattatctaaaaaggtcttataaatggggat
cattttacaaatttgcctcattaaaaagtaagcactgagtacttttataatgaatatgat
catcgaatgaatattacagaaatttgcacaaaacatattgaaattgctctaatttatttg
caatcaactcataatcatccaaattatgtacaaaattaagtaatctttacaattgcactt
ctaatgagaaagaattgggttgacattttaaaaattgaagatctcataagttaaattatc
aacagcactatttaagcaaataaaatagtgttttttaaaatatttgaaaatttaataagt
tgtattcgataatactcctatgctaatgggtatattgaatttagaaaaatcctcaataac
ttttaaatgttatccttatcgaaaataatatcagctattcattaacaaatttaacaatta
taaggatcttccttgttgtaattatatacataaaataaaacaatggcagaatcctttatt
aacatattatatcagttgatgaacttgaattttaacttaagttattatgagattgatatg
gacaatgatggaaaggacacttcctaattgaccaattttccagattattatttagacttg
ataatcgaccctatatttttgagagaactgttccaagatacaattgggttcataaacgtt
gaccaaaatctatctctatagtgtataaccatgctttaaaggattgcttgtgtgagatta
tctatatttcataataagaaatgtaaaggaggatttagaagagcaatgtgggaaggactg
ctctatttatattagaaccaagattaatttattaattacgtagaattctcatctgaaata
cattccttagcagttagggttattaataatcttacattgagaaaaatagcaaaattttaa
tttcaatttgataattttttttagttgatataataagtctactaaaaaaccatttagata
tatggagtcaaagtcattttgaatagtccaataattaaattataagaactatggaattaa
attagttattagggatcattacatcagcctttgcatgaggaatttaatgtaaaaataagc
atggttatgtaaaatcaattaattttggtattgaaagcttttttttaataaaatcaattt
acagaaatcccttaagaatgcagtgttaaaaagtttaaaaaattattggaattaaccttt
atgccttttcattgtctttttaaatcgcatatctaagataatatcaatcttatttaacag
atgatcgaacaattaagaggggataatgaatattaatgtgctgctgtcataagtctcaca
atagtatttttgttgcatacatcaaacactgagatcttaaatatggggtttgattcctat
aactttggatagaaggaagaaccaaaacctaatcttgatggctaatcgtatatcctaaaa
tttatagtggaactgatcatgaattaacaagtgcaaaaaaatacaagaattttaaaaatt
gcaatcttatcgttcatagaaagctttattgcaacaacaattgactctttttgttatgat
taagaaactaaaaatttcaagaatctttctcaaatatattcacaattgattcgtatagat
caaagataccaaaattacgtcttagttttagagactatgcttgatgaatgtttctaagta
tttacctatggtgatcctcaattaatagaattcagtcttaaattaattgaatttatttat
tagaaagtcaaaaagtacattcccagaaaagtattcaaggcttgcactatcacagacatg
ttgaagcagttcttcttataattaaatatcacttgtctgaatacaccttaatatataaag
aagagagctatggtctttaaaattatcactattgtttgggtggatgattgctctgatgat
tatcttaatgcacttgttgacatttacaaccaaataaagaaaagcatttagattgagatg
aataagcttaatattctaaaatacgtttgggatcttattggtattgcatccgaaatagat
gtcgataatatttatagagcattcttaagaataatatatcctgatcttgcaggactattg
acacaggaaaatattgagctttttgctaaagattacgattcttccattgccatcatcaca
ttgttcaaagccatattttataataaaaacacgagattgtcaactgaaaacatttaacta
atattatatcaaatttatggtaaagccatgaaattcttcatcatactaatttaatagtaa
atttaaacagcaaaaacccagtaaaagctatcagatttgtaattgaagtaagtatccaaa
cttttcgcactaatgagtcaaatatcaggatagaagaaaattaattaaggatttttcatt
atttataatgattaatcttttctggaactttttaccttatagatacaactcatcttaatt
tatcgaccattgctttaacatatcccaaaatacaaaaaattgctatatgaatgttttgat
tgcatatgttaggaccattcagaaacattggcttacaagtgtaacttgaatttgtatctt
gatatattccttatttgtaaggagtcattaaaagacattatttatgataattaaggtgaa
gatacaataaatgagaatagtgccacactaatactaattggaactctattgagcaatata
tcaacatttttagtttaagaagcttcggttggagacatcaatgatttacaaatgataaaa
aataaaataaatggaataattgtatagggaaaacaaatactatttgacatttttaatttg
agctgctaaatcactttaatttatcccaaaaattcgaaactaatatttgccattccagaa
atcttatatgcagtttcaatatttagcccataagattttgagactcttctcatcacaatg
ataaccaattaaataggaataacaaaaaatcctatcattgattaaatcagtttagctttc
aaaaacctttagggagagttataaatttcaaataaagaagattttacaagaaaaattaaa
gtagttttagaaatgtataaatga
DBGET
integrated database retrieval system