Paramecium tetraurelia: GSPATT00018499001
Help
Entry
GSPATT00018499001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14572
midasin
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
GSPATT00018499001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
GSPATT00018499001
Ribosome biogenesis [BR:
ptm03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
GSPATT00018499001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_5
AAA_3
AAA_22
AAA_7
AAA
AAA_16
bpMoxR
AAA_18
Dynein_heavy
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5037463
NCBI-ProteinID:
XP_001451678
Genoscope:
GSPATT00018499001
UniProt:
A0DML4
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
3256 aa
AA seq
DB search
MSIIFQASNAQQLSLRNTKVTILSKNKSDSEILIFDSDCLIFREYQLTNVNIQSVVCDPN
LQFLLMFEEQEQDKLTNLYSAQLEKSFTPVTKIQIPTTQLRLVDWCNSRICALIFKNDLV
LYDIFLNKVIKKIQSDFNQIEQFTISKKFDQILCEFQQNNHNSICLVLAVENQTEVQKFN
NCVSCKIIEEQEKDSFLLIQNKSSQLVIILAKFEDGFQIEKEIQQNLSDPPQNIIKVGYR
KKKKEILLLDSSQTLHIYSINSNFQMQQKIKSIPNIIQFNVSLLDENLMFLDNKNQLLLE
NLPPDISIRPPYPTQCLTIASQVKKRALQGILTDVNKTKSTELLMQQYQQDFENLNPKFT
TLVNLNVQFRFLPLVDYRVLNLNYQANSKLKELIPNMDTYAETQSVKKHLLQLETAINGD
NPILCEGSAACGKTSIIQYLAYKNKQPLIIMNLSSFTQISDFIGKVEILPGFKFEFQPGP
FAQAVQEGSWILLDEANLASDSILRVIEDVLELGYITLYGNGTLTIKKHQNFKLFLTQNP
ATDSKFAASRNIFSPSLMSQFIPIKFESMSMNDLNFIVDQILVSKLQEMKKQPEQKISIQ
QLSFLIMMIYEEIKLKNMDDGLFTLRDIVQIIDFIFVSFEQDKDKIFELLPLKDCMKLIS
TQFIYLKKNRDLINYQIDQNKFIADTNDAFDQTKSKRDTEIMNWNNTNELKVLSFHETLF
SMLTLCYKTKRAALVVGQQFCGKLSSILLWLKFQKIEKYEILELSSSTNAEDLFGKYQPT
QNGFEFIIGPVTRCFHQGKVLILTNFEAPDCALTESLNGILEKKFLQLLVQNEKYQRHQD
FAVIAVSSDFHELDKKITPALKSRFLSFFLEFQVNQDDIIQLFQSANIPSDINFVRDITT
KLMAGNNGKTSSNLETQIEQISLNKIIRFLKPIKEIQKFAEAQFKMNLQQKVIQCIDFFI
ALSLQDNKSLLSEQIQVPLHYQQLQSKDSKKNNFVVTPSRKIVSDIIAVAVAAKIPLVLQ
GTAGVGKTKVISTFQQTCKLFESTTFHYINLNQNTDVNDLMGQYISSCNQDKKEFILKKG
PLYLGMEQGGIVLIDEANLSDASLLNFLASVAKYPSEFQDPISNKVIKVHENFRIFFAQN
PPSYNSRTELPQTLASKVIVVEVPNYPYEEVIKICTESQLSMKKDSQDCIKKGMEYFLTK
LIPYPKDGNENLLNFNGTQFTLRQFIRFRNRLEKTNFSTKQPNWENQLQLHQIILFPKNA
SEEQDLECKIEYKQQTIKFSIKNQQAEISIPFKLGKNYNIHKSAEQNLNPIQRLVLCKIA
FSCYFRENILIVGKTSSKTYLSQLFAQLVEFQNPYPFELMYINSQTEITDLIGSMESHNQ
ESYEKYCQNLIKKLDKDEQNINQNEINIESRFKQLNDKYQQPSFFDQVFKNIGNQFPFIE
RGLTFNARFGGVVCLKNISMADQSVIEGLNALLEIEPHFIVNGQEIKLHNEFFVIALLNT
NFGGQLSDALQSRLTKIKIQVPQLINSTKILDISYQKFIQSKIKNQVESDQIIKFVQDVL
IRTKEVKEVYYENISDRKFYQWMSFLNLDIDATHLQKLALGFQFTILDKYRITFEEEHYK
QALNKIQEKLKDKQFFNSPKIIMNPSTIKILQRIYSAITTNYIPCLIGPPGVGKSAIASE
FASIIKKEHCRVCCSDSLSVEDLFGSYAPKIDNDQIAFTFQEGYLAQALSQKSLILFDEV
NLASPEVLSTLQALFNTDEKEIRIKDSRLNKDKCVFLCSMNPTSYEGRKDLPLCISNLLC
DVYIEAFSIDQRYKNEIKHLQNNGVNFQLMLDLHKELALLAQQKMKSNYDFNIRFLENLL
QLFSQQILEQRQKLNDEKLQLELIIVCLDMIYVQHFYKTEFTKQVIKIILDKFGLSEEEW
INRRVFLEQNANIIRISRQIEKDFKPLFNFILSNQVPPQISNNSLVINLQNSAIFEKLFI
AIHSKKVILCQGDVSSGKTSCIIKLANLLNQRFILLPIHCDLETDDLLGNFALVDPNYDE
IQQELERISLKQKQKFIYNKKQKQGMNMKYIEGVLKVCCKFGYWLILDNINLARAEIVER
LNSLGEDSPRLFNNEFGDSNSCIIPHKNFRLICVQNPSREDQHILSPAFYNRCIKINFSI
DIADNYIDVIEILTRSGLGQQLQLEDTVILASNILNQIIFIQEQSKCLINLRSIIKAFRM
IQENGLKYYDQTMEILFGSDFKECKNHPDFPIFDFNHQLQVDQILEKYNDTILNKLVSNS
FQIVNHDQTKRWLDLKNLSQFLKKQLSNNDIQNYQSFIEGISRQILLVNFQTENQYDLGC
YEIQVNGELNIQLCQETLKIEPTFLSLYIKGKELLKFIMKSKCQFQQYTFLAEARLNPGG
QLQIQYQQSNDLSLVPLIKSLIGPSQEQFFKTFKHLLSKSDMECLLLLNQDLEIILNFSL
NDYTFPNINLKLKDISGKFASNKENIITQFQLSCDLHLELNYYFIKQGYFGRINDLISNR
GEICIPQQNIVNIFLESGCFSLISNINLTFCENFVPYIDFEERRVEIQLRCEKPIQIYKL
PFWIKINKIDTNIELKQPIALNGSIEFAFQFLDQDIGNLVGIIQKNTMIFKLTEQLPQGQ
HQIYSDKIIKKFFQNYFENNNIFISQLSKSKATSIKKLDIITDAIYWNFQIIIEFDWNIQ
IFEKINFQIKSMQIYSHIDSKIAQFTIGFTVEILKLTIEVELEFDFLRFFCQDLEKCLTM
KLKKGMNSPKLKHIIAAFSSDLEKQLSQVKGFDEIETIQFEQENSKSFLNLDQFEKLGEE
LQQFFQMQEHKMQSQGYDFEEAKSKQQKFQTGLDEKIAQKLKQMQDEKIAQELKQKQEAK
DQEKQNQEQTYESMIIWDNSVWLKFSVGLLNRRKISEFINLCDCYLTIFGSDKCFGLILK
GLIALKGFPLNTFELQLNPTGSLNLEIEDKSLQMSIDPFKLGFGLLGRQFEGIDIFPRVN
HIVYFNYNIISQEFEGELNVVKENIITKYTGLTFEKIQLTFQQSEKRSEGYADLKVKLLF
FQQEVDFLLKFQDSLSQESNPNYQLKFNSFIIEKFSLNQFIKNSVGIDIIEKDAKFEVQD
FSFSLLLEKHQVWEYIVKLFIANSQCKIFNLINIKELNGYLVYRKKDWEETCLSGICRIN
QFLLGSIDLKFSQLKQEFYCDFQLDSKFSMKQFFLAVFNKEIDIVLPGKGGMMMGGDRVM
GKGNLIGRSDEDRRGR
NT seq
9771 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatcatattctaggcatctaatgcttaacaactatcactacgtaacaccaaggtg
actattttatcgaagaataaatcagactcagaaatattaatatttgattctgattgtctt
atttttagagagtactaattaactaatgtcaacattcaaagtgtagtctgtgatccaaac
ttataatttctacttatgtttgaagaataagaacaggataaattaactaatctttattct
gcataattagaaaaatcttttactcctgtgacaaagatacaaattccaactactcagtta
aggttggtagattggtgcaatagtagaatttgcgcactcatttttaaaaatgatctagtg
ctatatgatatttttttaaacaaagtcatcaagaaaatataatcagattttaattaaatc
gaacaatttacaatatctaagaaatttgattaaattctttgtgaatttcaatagaacaat
cataattccatttgtttagtgctagctgtagaaaattaaactgaggtctaaaagtttaat
aattgtgtctcctgcaaaataatagaagaataagagaaagattcctttttattgattcaa
aacaaatcaagttagttagtcattattcttgcaaaatttgaagatggattttaaatagaa
aaagagattcagcaaaatttgtcagatcctccttaaaatataataaaggtaggatacaga
aaaaagaaaaaggagatacttttacttgactcatcctaaaccttgcatatttattcaatt
aactcaaacttctaaatgtagtaaaaaatcaaaagcattcctaatataatttaatttaat
gtttctctcttggacgaaaacttaatgtttttggacaataaaaatcaattattacttgaa
aatttgcctcctgatatatcaataagacccccatatccaacgtaatgcttgacaatagcc
tctcaagtgaaaaagagagccttgtaaggaattttaactgatgtaaacaaaacaaaatca
actgaactcttgatgtagtaataccagtaagattttgagaacttaaatccaaaatttaca
actttagtaaacctaaatgtgtagtttcggtttttacctttagtagattatagagtttta
aaccttaattatcaggcgaattcaaaattaaaggaattgattccaaatatggacacttac
gctgaaactcaaagtgtaaagaaacatttactttaattggaaactgctataaatggagat
aacccaatcttatgtgaaggcagtgctgcatgtggaaagacgtcgataatttaatatttg
gcttataaaaataagtagccattaataataatgaatttgagttcatttacttagatttct
gattttattggcaaagttgaaattctaccaggatttaagtttgaattctaaccaggccct
tttgcttaagctgtataagagggttcatggatccttttagacgaggcaaatttagcgagt
gattcaatactaagagttattgaagatgttcttgagcttggatatatcactttatatggc
aacggaactttaacaataaagaaacattaaaattttaaactctttttaacctaaaatcca
gcaactgattcaaagtttgcagcatctagaaatatcttttctccatctttgatgagccaa
ttcattcccataaagtttgagtccatgagtatgaatgatttaaatttcattgttgattaa
attttagtctcaaagttacaagaaatgaagaaatagccagagcaaaagatatctatttaa
taattatcctttctgattatgatgatttatgaagaaattaaattgaaaaatatggatgat
ggactttttaccttaagagatatagtttaaattattgatttcatttttgtttcatttgaa
taagacaaggacaaaatatttgaattattgcctctaaaagattgtatgaaattaatctca
acataattcatttatttaaaaaagaatcgtgatcttataaattatcaaatagatcaaaac
aaatttattgctgatacaaatgatgcatttgattaaacaaaatcaaagagggatactgaa
attatgaattggaacaatacaaatgagttaaaggttctctcatttcatgaaacattattt
tcaatgttgaccttatgttacaaaactaagagagcagcattagtagtgggataataattt
tgtggaaaattatcaagcattcttctttggttaaaatttcagaagatagaaaaatatgaa
atactggaattatcctctagtacaaatgcggaagatttatttggaaagtatcaacctact
tagaatggatttgaattcattataggaccagttaccagatgttttcatcaagggaaggtg
ttaatcctcactaattttgaagccccagattgtgccttaacagaatcgttaaatggaatt
ttggaaaagaaatttctttaattattggtgtagaatgaaaaataccaaagacactaagat
tttgctgtgattgcagtttcatctgattttcatgaattagataaaaaaatcactccagcc
ttaaaaagcagattcttaagctttttcttagaatttcaagtaaattaagatgatataatt
taattattttaatcagcaaatataccatctgatataaactttgtaagagatattactacc
aaattaatggcagggaataatgggaagacttcatccaatttagaaacctaaattgaataa
atatcattgaacaaaataatcagattcttaaagccaatcaaggaaatctagaaattcgct
gaagctcaatttaagatgaatttgtaataaaaagtaatacaatgtatagatttcttcatt
gctttaagtttacaagataataagtctcttttaagtgaataaatataagtacctcttcat
tattagtaattataatcaaaagatagtaagaaaaacaattttgttgtaactccatcaagg
aaaattgtctctgatataattgcagtagctgtagctgctaaaatacctttggttttataa
ggaacagcaggagttggaaaaacaaaagtaatatctacattttaataaacatgcaaatta
tttgaatcaactacttttcattatattaatttgaattaaaatacagacgttaatgatcta
atgggataatatatatcatcatgcaactaagataagaaggagtttatactaaaaaaaggc
ccattgtatttaggaatggagtaaggtggaatagtgttaatagatgaggctaacctttca
gatgcaagtttacttaacttcttagcatctgtagccaagtatccttcagaatttcaagat
cctatttcaaataaagttataaaggttcatgaaaattttagaatctttttcgcatagaat
cctccatcttataatagcaggactgagctcccacaaacattagcttctaaagttatagtt
gttgaagttcctaattatccttatgaggaagtaattaaaatttgcacagagtcacaacta
agtatgaagaaagatagttaagattgcatcaaaaaaggtatggaatattttctaaccaaa
ctaataccgtatccaaaagacggcaatgaaaatctattaaatttcaatgggacctaattt
actttaagacaattcataagatttagaaatcgtttggagaaaacaaatttttccactaaa
taacctaattgggaaaatcaattacaattacattagataattctttttcctaaaaatgcc
tctgaagaataagatttagaatgtaaaattgaatataaacaataaaccattaagttttca
ataaaaaatcaacaggctgagatatcgataccatttaaacttggcaaaaattacaacatt
cataaatcggcagaataaaatctaaaccctatttaaagattagtcttatgtaaaatagca
tttagctgttattttagagaaaatattttaattgtggggaaaacatcatcaaaaacatac
ttatcctaactatttgcctaactagtagagttttagaatccttatccattcgaattaatg
tacatcaattcataaactgagataacggacttaattgggagtatggaatctcataaccaa
gaatcttatgaaaaatattgttaaaatttaattaagaaactcgataaagatgaatagaat
ataaattaaaatgaaataaatatcgaaagcagatttaaataattgaatgataaatatcaa
taaccttcgttctttgatcaagttttcaaaaatattggtaactaattcccttttattgaa
agaggattaacatttaatgctagatttggaggtgttgtctgtttaaaaaacatatccatg
gcagattaatcagttatagagggattaaatgcattattggaaatagaaccacactttatt
gtaaatggataagagattaaattacataatgaattttttgtaatagcattattaaatact
aattttggaggttaattaagcgatgcattgtaatcaagactgacaaaaatcaaaatataa
gttccataactcattaattctacaaaaatactagacatttcttattagaaatttatataa
agtaaaattaaaaattaggttgagagtgatcaaataattaagtttgtttaggatgtttta
ataaggactaaagaagttaaagaagtctactatgaaaatatatctgatcgaaaattctat
taatggatgagctttttgaatttggatatagatgctactcacttataaaaattagcatta
ggattttaatttactattctggacaaatatagaataacttttgaagaagaacattacaaa
caagctttaaacaaaatttaagaaaaattaaaagataaatagtttttcaattctccaaaa
atcatcatgaatccgtctacaataaaaatattacaaagaatatactcagcaattactaca
aattatataccttgccttattggaccaccaggagttggaaaatctgcaattgcatcagaa
tttgcctctataattaaaaaggaacactgtagagtttgttgttcggattctttgagtgtt
gaagatctatttgggtcttatgctccaaagattgacaatgatcaaatagcatttacattt
caagaaggatatctagcttaagcattatcacagaagagcttaatattattcgatgaagtt
aatttagcatctcctgaagttttaagtacactttaggctttatttaacacagatgaaaag
gagattagaataaaagatagtagattaaataaagataaatgcgtattcttatgctcaatg
aatcccacttcatatgaagggagaaaagacttacctttatgtatttcgaatctattgtgt
gatgtttatattgaagcattcagcatagattaaagatataaaaatgaaattaaacattta
taaaataatggagttaatttttaattgatgttggatttacacaaagagcttgctttattg
gcataataaaaaatgaaatcaaattatgactttaatattagatttttggagaatctattg
taacttttcagctaacaaattttggagtagagataaaaattaaatgatgaaaaactttaa
ttagaattgataattgtttgtttagatatgatatatgtatagcacttttataaaacggag
tttacaaaataagtgataaaaataatcttagataagtttggtttaagtgaggaagaatgg
atcaatagaagagtctttttagagcaaaatgcaaacattatcagaataagcagataaatt
gaaaaagattttaaaccgttattcaattttattttatcaaattaggtacctccttaaatt
tccaataattcattagttataaacttataaaattcagccatttttgaaaagctgtttata
gctattcattcaaagaaagtaatactatgttaaggagatgtctcatcaggaaaaacttcc
tgcatcatcaaattggctaatcttttaaaccaaagatttattctactgccaatccattgc
gatttagaaactgatgatttacttgggaattttgctttagttgaccctaattacgatgaa
atttaataagaattagagaggatttctttgaaataaaaatagaaatttatatataataaa
aaataaaaataggggatgaatatgaaatatatcgaaggagtattaaaggtttgttgtaaa
tttggatattggttaattttagacaatattaatttagcaagagctgaaatagttgaacga
ttgaattctttgggagaagattcacctcgcttattcaataatgagtttggagactcgaat
tcctgtatcattcctcataagaattttcgtttaatatgtgtataaaatccctccagggaa
gactaacatatattatctcctgccttttataatcgatgtattaaaattaacttttcaatt
gatattgctgataattatatagatgttatagaaattttgactagaagtggtttgggatag
tagctttaattagaagatactgttattttggcaagtaatatattgaactaaataatcttt
atttaggaataatctaagtgcttaattaatctaaggagtattatcaaagcttttaggatg
atttaagaaaacggattaaaatattatgattaaacaatggagatcctttttggatcagat
tttaaggaatgtaaaaatcatcctgattttccaatttttgatttcaatcatcaacttcaa
gttgattaaattctagaaaaatataatgatacaatcttaaataaattagtgtctaattcc
ttttaaattgttaaccacgactaaactaaaagatggttggatttaaaaaacttaagttaa
tttttaaaaaaataattatcaaataatgatattcaaaattattagagttttattgagggc
atcagtagataaatattgctggtaaatttttaaacagaaaactaatatgacttaggttgt
tatgaaattcaagtaaatggagagttaaatatttaattatgttaggaaactctgaagatt
gaacctactttcttgtctttatacattaaaggcaaagaattgttaaaatttataatgaag
tcaaaatgttaattttagtaatatacgtttttagctgaagcaagattgaatcctggaggt
taattgtaaatttaatattaataatctaatgatttatctttggttcctttgattaaatcc
cttattgggccatcttaagaataattttttaagacttttaaacaccttttatcaaaatca
gacatggaatgtttattgctcctaaatcaagatttagaaatcattttaaatttcagttta
aatgactacacatttcctaatatcaatttgaaattaaaagatatatctggaaaatttgcc
tcaaacaaggaaaatatcattacttaattttaactaagttgtgatctgcatcttgaatta
aattattattttatcaaacaaggatattttggtagaataaatgatttaatttcaaataga
ggagaaatatgtattccataataaaatatagttaatatttttttggaatctggatgtttt
agtttaatttctaatattaatcttactttttgtgaaaattttgtaccatatattgatttt
gaagaaagaagggtagaaatacaacttagatgtgaaaaaccaatttaaatttataagtta
ccattttggattaaaattaataaaatagatacaaatatagaactaaaataaccaattgct
ttaaatggaagtattgaatttgcatttcagtttctagattaagatattggtaatttagtt
ggaataattcaaaaaaacacaatgatattcaaattaactgaataattacctcaaggataa
cactaaatttattctgataaaataattaaaaaatttttctagaattattttgaaaacaac
aatatttttatatcttagttatcaaaaagtaaagctacttcaataaagaagcttgatatt
atcactgatgcaatttattggaatttttaaataattattgagtttgattggaatattcaa
atttttgagaaaataaatttctaaataaaaagtatgcaaatatattcccatattgattca
aaaattgcataatttacaataggtttcactgttgaaattcttaagcttacaattgaagtt
gaattagagtttgattttttgagatttttttgctaagatttagaaaagtgtctaactatg
aaattaaaaaaagggatgaactccccaaaattaaaacatattattgctgctttctcaagt
gatttggaaaagcaattatcataagtaaaagggtttgatgaaattgaaacaatataattt
gaataagagaattctaaatcatttttaaatttggattaatttgaaaaattaggagaagaa
ctttaatagtttttttaaatgcaagaacataaaatgcaatctcaaggttatgattttgaa
gaggcaaaatcaaaataataaaaattttaaactggtttagatgaaaaaatagcttaaaag
ctaaaataaatgtaagatgaaaaaatagcttaagaattaaaataaaagtaagaagcaaag
gattaagaaaaatagaattaagagcaaacttacgaatcaatgataatttgggataattca
gtttggttgaaatttagcgtaggtctattgaatcgaaggaaaatatctgaatttataaat
ctttgtgactgctatttaacaatttttggatctgataaatgttttgggcttattttgaaa
ggattaatagcattaaaaggatttcctctaaatacctttgaactttagttaaatcctaca
ggatcgctaaatttagaaatagaagataaatctttacaaatgtcaatcgatcctttcaaa
ttgggttttggtttgcttggacgttaatttgaaggaatagatatatttccaagagtaaat
catattgtatactttaattacaatattatatcttaagaatttgaaggtgaattaaatgtt
gtgaaagaaaatattataaccaagtacactggcttaacttttgaaaaaatacaattaaca
ttttaataatccgaaaaacgaagtgaaggttatgctgatttaaaagtaaaattactgttt
tttcagcaggaagttgattttcttttaaaattttaagactctctaagttaggaatcaaat
ccaaattattagctaaaatttaattcttttataatcgagaagtttagtctgaattaattc
ataaaaaatagtgtaggaatagatattattgaaaaggatgcaaagtttgaggttcaggat
ttttctttttctttattattagaaaagcattaagtgtgggaatatatagtaaaattattt
atagcaaatagttaatgtaaaatttttaatttaataaacatcaaagaattgaatggatat
ctagtttataggaaaaaagattgggaagaaacttgcttatcaggaatatgtagaataaat
taattccttttaggttctatagacctcaagttcagttaattaaaataagaattctattgt
gatttctaattagattcaaaatttagtatgaaataattttttttggctgtttttaataaa
gaaatagatattgtattgccagggaagggggggatgatgatggggggggatcgggtaatg
gggaagggaaacctcattgggcggtcagatgaggatcgacgtgggcgttga
DBGET
integrated database retrieval system