KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00020199001
Entry
GSPATT00020199001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K23288  syndetin
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00020199001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Protein recycling
  Others
   EARP complex
    GSPATT00020199001
SSDB
Motif
Pfam: Syndetin_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 5039697
NCBI-ProteinID: XP_001453912
Genoscope: GSPATT00020199001
UniProt: A0DTZ8
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 978 aa
MNVKNYILRKLVGDSSNTLTVEQVQRILESQKDDDRIFRAIINSSLSNQKLQAGNSEFHI
NTSTDFGHLLLNQLQSSLQSIKSKNQLLSFDQFPIDINQFNIDISQTDLMKQQLQYIYRL
FKATIRQNGDGLKETQNYLANLNQAEQIIESQYAQQCIMKAPQYIQGIDQINLWCEKSST
LYQTVISTRQLLQESKRTSLKKQLQIVEKYKSIQRIKYTLEKLMILKQTFGQLAQAMNKY
DDNAYEIIPIMKETQNNINKYKLNELKLACISDNFFENKIESLKERIKSGILANFMKFDE
KKYYSLLKSYYFIEKHYQMQSYVTQIWGLAKKSISVTFKNAIKLFEQSYIPHKIYQNCQD
EDLLQFYKLLYSELVEQMLNFHYCNRFHQENDFKIEEEDGNSQFEEYTEQIRQSYLEMRQ
LIWSQIQKKIVKIINAHLINIKSLVLEQLIYFLGYNCLLIKRAEDFSHSDSQQLTKCIID
VYMSFVQQFHKTNLKSISTYLQNELYQRLPLTKDSKLIQQLEQLTNLNQVNTKLFEYLIE
KREENYHQETKKTVDFQDLINNDKEMQLFYLFEYQNPFVLQQEEFDLIIKAIWIKKYATQ
STGVLNQIESVLSSSSIRILELLPQYALLSFYHPSCQQQIIANFLQLLELYMFVSYNQLV
GITQQKQILENFSQIMKFDESKEIEFFVQTYDSFSDCLVLQERFCYFKRFVQKFCKEGID
FKEIDIFASKEKRQFVDIAERAIASESLAYLLSQTKSVFSLIGITSQNFDIFKEVYNQYK
EFIYRNFVQTYIKIDGIVQYVPQQRWDLKDLHNENNNIYLDRLIQFILDQRDRLKSIGGG
VIPPNAQKDIFSFLAEHCLNVLLETYGKIKKLNSIGRDQMVFEYTTCCQSIESSQKNSKE
VVLNPKITLMQLEYLKVFNSQQYEEIDQYIQKSKTLIPLRLLYNLMSSSSSYNKLSKQQK
KDIQVKFFKDYYDTFKLF
NT seq 2937 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgtaaaaaattatatattacgtaaactggttggtgactcttcgaatacattgaca
gttgaataggtttagagaattctagaatcacaaaaggatgatgataggatatttagagca
attattaattcatcattgtccaattaaaaactacaggcaggcaattcagaattccatatt
aatacttcaacagattttggtcatctattgttgaactaattacaatccagtttataatcc
ataaaatcaaagaattaacttttatccttcgactagtttcctatagacatcaattaattc
aacattgacatttcacaaactgatctaatgaaataataactttaatacatttatcgatta
tttaaagctactattcggtaaaatggtgatggtttaaaagaaacataaaattaccttgcc
aatttaaattaagcagagtaaattattgaatcttaatatgcataataatgtattatgaaa
gcgccccaatacatttaaggaatagattaaattaatttatggtgtgaaaaaagcagtacc
ttgtattagactgtaatctcaactagatagttattgcaagaaagtaagcgcacatcttta
aaaaaataattgtaaattgttgaaaagtacaaatccattcaaaggataaaatatactttg
gaaaagttaatgatcctaaaatagacttttggctaattagcttaggcaatgaacaaatat
gatgataatgcttatgaaatcataccaataatgaaggaaactcaaaataatattaataaa
tataaattgaatgaattaaaattagcatgcattagtgataacttttttgaaaataaaata
gaatccttaaaagaaagaataaaatcaggcatcttagcaaattttatgaagtttgatgaa
aaaaaatactattcccttttgaaaagctattattttattgaaaaacattattaaatgtaa
tcttatgtaactcaaatttggggtttggctaagaaaagtatcagtgtaacctttaaaaat
gctataaaattgtttgaataatcttatattccacataaaatctatcaaaattgctaagat
gaagacttattataattctataaattactgtatagtgaattggtagaacaaatgcttaat
ttccattattgcaataggttccatcaagagaatgattttaaaattgaggaagaggatggc
aactcctaattcgaagagtatacagaataaattagacaatcatacttagaaatgagatag
ttaatatggtcataaattcaaaagaaaattgttaaaatcataaatgcccatttaatcaat
ataaaatcattggttcttgaacagttaatctacttcttaggttataattgcttattgata
aaaagggctgaagattttagtcattctgattcacaataattaactaaatgcatcattgat
gtctatatgagttttgtttagtagttccataaaacaaatcttaaatctataagtacatat
ttacaaaatgaattgtactagagattgcccttaacaaaggattctaaattaattcaataa
ttagaataactcacaaatttaaatcaagtcaatactaagctttttgaatacttaattgaa
aaaagggaggagaattatcattaagaaacaaagaaaacagttgacttctaagatttgatt
aacaatgataaagagatgtagttattttatttatttgaataccaaaatccttttgttctt
taataggaggaatttgatctcattattaaggcaatttggataaaaaagtatgctacttaa
tccacaggggttttgaattaaatcgaatcagttttatcatcatcgagtattagaatcttg
gaattgctaccataatatgctctgctttccttttatcatccatcatgtcaacaacaaata
attgccaattttctttaactgctagaactctatatgtttgtttcatataatcaattggta
gggataacataatagaaataaatactagagaatttttcataaataatgaagtttgatgaa
agtaaggaaattgaattctttgtacaaacttatgattcatttagtgactgtttagttctt
taagaacgattttgctatttcaaaagatttgtctaaaagttttgtaaggaaggaatagac
ttcaaagaaattgatatatttgcatccaaagaaaagagacaatttgttgacattgcggaa
agagctatagcatcagaatccttagcgtatttactttcttaaactaaatctgtattttct
ctaattggaataacatcataaaattttgatatttttaaagaagtctataattagtataag
gagttcatttatagaaattttgtgcaaacctatataaagattgatggaatagtacagtat
gtaccataataaaggtgggatcttaaggatctacacaatgaaaataataatatttatttg
gacaggttgatacaatttattcttgattaacgagatagactaaaaagtataggaggcggt
gttataccaccaaatgctcaaaaagatattttttcattcttggcagagcattgcttaaat
gtacttttggagacgtatgggaagattaagaagttaaattcaattggaagagattaaatg
gtgtttgaatatacgacttgctgttaatctatagaatcaagttaaaagaatagtaaagag
gttgtgcttaatccgaagattactttaatgcaattagaatatttgaaggttttcaattcc
taataatatgaggaaattgatcagtacattcaaaaatcaaaaactttgatccctttaaga
ctgctatataatttgatgagttcaagttcaagttataacaaattatcaaaataatagaag
aaggacatataagtcaaattctttaaagattattatgatacatttaaattattttga

DBGET integrated database retrieval system