KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00022421001
Entry
GSPATT00022421001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K23288  syndetin
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00022421001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Protein recycling
  Others
   EARP complex
    GSPATT00022421001
SSDB
Motif
Pfam: Syndetin_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 5042432
NCBI-ProteinID: XP_001456647
Genoscope: GSPATT00022421001
UniProt: A0E1T3
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 978 aa
MNVKNYILRKLVGDSSNTLTVESVQRILESQKDEDRIFRAIINSSLSNQKLQTTNSDFLI
NSQTEFGNLLLNQLQSSLQSIKSKNQLLSIDQYPIDINQFNVDISQTDLIKQQLQHIYRL
YKATIRQNGDGLKETSNYLANLNQTEQIIESQYAQQCILKAPQFIQGIDQINVWCDKSTT
LHQTVTQTRQLLQQSRTSSLKQQLQIVEKYKSIQRIKYTLEKLMILKQTFGQLAQAMNKY
DDNAYEIIPIMKETQVNINKYKLNELKLSCISDNFFENKIESLKERIKQGILANFMKFDE
KKYCSLLKSYYFIEKHYQMQSYLTQIWGLAKKSISLTFKNAIKLFEQSYIPNKIYQNCQD
EDLLQFYKLLYSELVEQMLNFHYCNRFHQENDFTIEEEQSNSKFEEYTEQIRQSYLEMRQ
LIWQQIQKKLAKIITAHLINIKSLVIEQLIYFLGYNCLLIKRAEDFSHSDSQNLTKCIID
IYTSFVQQFHKANLKSISTYLQNELYQRLPLTKDSKLNAQLEQLKILNQVNKKLFEYLIE
KREENYQQEAKKTVDFQDLINNDKEMQLFYLFEYQNPFVLQQEEFDLIIKAIWIKKYTTQ
STGVLNQIESVLSSSSIRILELLPQYALLSFYHPSCQQQIVSNFLQLLELYMFVSYNQLV
GIHQQKQLLENFAQIIKFDESKETEFFVQTYDSFSDCLVLQERFCYFKRFVQRFSKEGID
SKELDIFQSKEKRQFVDIAERAIASESLAYLLSQTKTVFSLIGITSQNFDIFKEVYNQYK
EFIYRNFVQTYIKIDGIVQYVPQQRWDLKDLHNENNSIYLDRLIQFIIDQKERLKSIGGG
VIPPNAQKDIFSFLAEHCLNILLETYGKIKKLNSIGRDQMVFEYTTCCQSIESSQKNSKE
VVLNPKITIMQLEYLKVFNSQQYEEIDQYIQKSKTLIPLRLLYNLMSSSSSYNKLSKQQK
KDISVKFFKDYYDTFKLF
NT seq 2937 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgtaaaaaattatatattacgcaaacttgttggtgattcttcaaatacattgaca
gttgaatctgtgcagagaattctggaatcccaaaaggatgaagatagaatatttagagca
attattaattcatcattatccaattaaaaactacagacaaccaattcagatttcctcatc
aattcttaaaccgaatttggcaatcttttgttgaactaactgcaatccagcttataatcc
ataaaatcaaagaattaacttttatcaatagactagtatcctatagacatcaattagttt
aacgttgacatatcataaactgatttaatcaaataataactttagcacatctaccgatta
tacaaagctactattcgttaaaatggtgatggattaaaggaaacttcaaactaccttgcc
aatctaaactaaacagagtaaattattgaatcccaatatgcgtaataatgtattctaaaa
gctcctcagtttattcaaggcatagattaaattaatgtatggtgtgataaaagtacaact
ctacattagacagtaacctaaactagatagttattgtaataaagtagaacttcatcatta
aaacaataattgtaaattgtcgaaaaatacaaatccatctaaagaattaagtatacatta
gaaaaactgatgatactaaaatagacctttggttaattggcttaagcaatgaataaatac
gatgataatgcatatgaaatcataccaattatgaaagagacacaagttaatattaataaa
tataaattgaatgaattgaaattatcctgcattagcgataatttttttgaaaataaaata
gaatccttaaaagaaagaattaaataaggcattctagctaattttatgaagtttgatgaa
aagaaatattgttctcttttgaaaagttattatttcattgaaaaacattatcaaatgcaa
tcctacttaacttaaatttggggtttggcaaaaaagagtattagcttaaccttcaaaaat
gccataaagttatttgaataatcctatattcctaacaagatctatcaaaattgttaagat
gaagacttactctaattctacaaattgttatatagtgaattagtagaataaatgctaaat
ttccactattgcaatagattccattaagaaaacgattttacaatagaagaagagtaaagc
aatagtaaattcgaagagtatactgaatagattagacaatcatatttagaaatgagatag
ctaatttggcaataaatttaaaagaaacttgcgaaaatcatcactgctcatttaatcaat
attaaatcgcttgttattgaacaattaatctacttcttaggctataattgcttattaatt
aaaagagccgaagactttagtcattctgattcccaaaatttgactaaatgcataatcgat
atctatacgagctttgtttaatagtttcataaagcaaatctaaaatctataagtacgtac
ttacagaatgaattgtaccaaagattgcctttaacaaaagattcaaaattaaatgcataa
ttagaatagctaaaaattttgaattaagttaataaaaagctgtttgaatatttgattgaa
aaaagagaagaaaactaccaacaagaagcaaagaaaacagttgatttttaagatttaata
aataatgataaggagatgcaattgttttatttatttgaatatcaaaatccttttgtactg
taataggaagagttcgatctaattatcaaagcaatttggattaagaagtataccacttaa
tccacaggagttttgaattaaattgaatcagttttatcatcatccagcataagaatcttg
gaattgttaccataatatgcattgctctccttctatcacccttcatgccaataacaaatc
gtaagtaacttccttcaattgcttgaactctatatgtttgtttcgtataattaattggtg
gggatacattagtaaaaataattgttagaaaattttgcacaaataataaagtttgatgaa
agcaaagaaactgaattctttgtttaaacttatgattcatttagtgattgtttagttcta
taagagcgattttgttatttcaaaagatttgtatagaggtttagcaaagaaggaattgat
tctaaagagctagatatattttaatccaaagagaaaagataatttgttgatattgcagaa
agagcaatagcttcggaatccttagcatatctactttcttaaactaaaactgtattctct
ctgattggaataacatcataaaactttgatatttttaaagaagtctataatcaatataaa
gaattcatttatagaaattttgtgtaaacctatataaagatcgatggaattgtataatat
gtgccataataaaggtgggatctcaaagatctacacaatgaaaataatagtatttatttg
gatagattgatataatttattattgattaaaaagaaagattgaaaagcataggaggaggt
gtaataccaccaaatgctcaaaaggatattttttcgtttttagcagaacactgtttgaat
atattattggaaacctacggaaaaattaaaaaattaaattcaataggtagagatcaaatg
gttttcgaatatactacatgttgttaatcaatagaatcgagttagaagaatagtaaggaa
gtcgtgcttaatccaaagatcactattatgtaattagaatacttgaaagtcttcaattcc
taataatatgaggagattgattaatatatctaaaaatcgaaaactttgatcccattacga
ttgttgtataatttgatgagttcaagttcaagttataataaattatcaaaataatagaaa
aaagatatttcagtaaagtttttcaaagattattatgatacatttaagttattttga

DBGET integrated database retrieval system