Paramecium tetraurelia: GSPATT00022421001
Help
Entry
GSPATT00022421001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K23288
syndetin
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00022421001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
GSPATT00022421001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Syndetin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5042432
NCBI-ProteinID:
XP_001456647
Genoscope:
GSPATT00022421001
UniProt:
A0E1T3
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
978 aa
AA seq
DB search
MNVKNYILRKLVGDSSNTLTVESVQRILESQKDEDRIFRAIINSSLSNQKLQTTNSDFLI
NSQTEFGNLLLNQLQSSLQSIKSKNQLLSIDQYPIDINQFNVDISQTDLIKQQLQHIYRL
YKATIRQNGDGLKETSNYLANLNQTEQIIESQYAQQCILKAPQFIQGIDQINVWCDKSTT
LHQTVTQTRQLLQQSRTSSLKQQLQIVEKYKSIQRIKYTLEKLMILKQTFGQLAQAMNKY
DDNAYEIIPIMKETQVNINKYKLNELKLSCISDNFFENKIESLKERIKQGILANFMKFDE
KKYCSLLKSYYFIEKHYQMQSYLTQIWGLAKKSISLTFKNAIKLFEQSYIPNKIYQNCQD
EDLLQFYKLLYSELVEQMLNFHYCNRFHQENDFTIEEEQSNSKFEEYTEQIRQSYLEMRQ
LIWQQIQKKLAKIITAHLINIKSLVIEQLIYFLGYNCLLIKRAEDFSHSDSQNLTKCIID
IYTSFVQQFHKANLKSISTYLQNELYQRLPLTKDSKLNAQLEQLKILNQVNKKLFEYLIE
KREENYQQEAKKTVDFQDLINNDKEMQLFYLFEYQNPFVLQQEEFDLIIKAIWIKKYTTQ
STGVLNQIESVLSSSSIRILELLPQYALLSFYHPSCQQQIVSNFLQLLELYMFVSYNQLV
GIHQQKQLLENFAQIIKFDESKETEFFVQTYDSFSDCLVLQERFCYFKRFVQRFSKEGID
SKELDIFQSKEKRQFVDIAERAIASESLAYLLSQTKTVFSLIGITSQNFDIFKEVYNQYK
EFIYRNFVQTYIKIDGIVQYVPQQRWDLKDLHNENNSIYLDRLIQFIIDQKERLKSIGGG
VIPPNAQKDIFSFLAEHCLNILLETYGKIKKLNSIGRDQMVFEYTTCCQSIESSQKNSKE
VVLNPKITIMQLEYLKVFNSQQYEEIDQYIQKSKTLIPLRLLYNLMSSSSSYNKLSKQQK
KDISVKFFKDYYDTFKLF
NT seq
2937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtaaaaaattatatattacgcaaacttgttggtgattcttcaaatacattgaca
gttgaatctgtgcagagaattctggaatcccaaaaggatgaagatagaatatttagagca
attattaattcatcattatccaattaaaaactacagacaaccaattcagatttcctcatc
aattcttaaaccgaatttggcaatcttttgttgaactaactgcaatccagcttataatcc
ataaaatcaaagaattaacttttatcaatagactagtatcctatagacatcaattagttt
aacgttgacatatcataaactgatttaatcaaataataactttagcacatctaccgatta
tacaaagctactattcgttaaaatggtgatggattaaaggaaacttcaaactaccttgcc
aatctaaactaaacagagtaaattattgaatcccaatatgcgtaataatgtattctaaaa
gctcctcagtttattcaaggcatagattaaattaatgtatggtgtgataaaagtacaact
ctacattagacagtaacctaaactagatagttattgtaataaagtagaacttcatcatta
aaacaataattgtaaattgtcgaaaaatacaaatccatctaaagaattaagtatacatta
gaaaaactgatgatactaaaatagacctttggttaattggcttaagcaatgaataaatac
gatgataatgcatatgaaatcataccaattatgaaagagacacaagttaatattaataaa
tataaattgaatgaattgaaattatcctgcattagcgataatttttttgaaaataaaata
gaatccttaaaagaaagaattaaataaggcattctagctaattttatgaagtttgatgaa
aagaaatattgttctcttttgaaaagttattatttcattgaaaaacattatcaaatgcaa
tcctacttaacttaaatttggggtttggcaaaaaagagtattagcttaaccttcaaaaat
gccataaagttatttgaataatcctatattcctaacaagatctatcaaaattgttaagat
gaagacttactctaattctacaaattgttatatagtgaattagtagaataaatgctaaat
ttccactattgcaatagattccattaagaaaacgattttacaatagaagaagagtaaagc
aatagtaaattcgaagagtatactgaatagattagacaatcatatttagaaatgagatag
ctaatttggcaataaatttaaaagaaacttgcgaaaatcatcactgctcatttaatcaat
attaaatcgcttgttattgaacaattaatctacttcttaggctataattgcttattaatt
aaaagagccgaagactttagtcattctgattcccaaaatttgactaaatgcataatcgat
atctatacgagctttgtttaatagtttcataaagcaaatctaaaatctataagtacgtac
ttacagaatgaattgtaccaaagattgcctttaacaaaagattcaaaattaaatgcataa
ttagaatagctaaaaattttgaattaagttaataaaaagctgtttgaatatttgattgaa
aaaagagaagaaaactaccaacaagaagcaaagaaaacagttgatttttaagatttaata
aataatgataaggagatgcaattgttttatttatttgaatatcaaaatccttttgtactg
taataggaagagttcgatctaattatcaaagcaatttggattaagaagtataccacttaa
tccacaggagttttgaattaaattgaatcagttttatcatcatccagcataagaatcttg
gaattgttaccataatatgcattgctctccttctatcacccttcatgccaataacaaatc
gtaagtaacttccttcaattgcttgaactctatatgtttgtttcgtataattaattggtg
gggatacattagtaaaaataattgttagaaaattttgcacaaataataaagtttgatgaa
agcaaagaaactgaattctttgtttaaacttatgattcatttagtgattgtttagttcta
taagagcgattttgttatttcaaaagatttgtatagaggtttagcaaagaaggaattgat
tctaaagagctagatatattttaatccaaagagaaaagataatttgttgatattgcagaa
agagcaatagcttcggaatccttagcatatctactttcttaaactaaaactgtattctct
ctgattggaataacatcataaaactttgatatttttaaagaagtctataatcaatataaa
gaattcatttatagaaattttgtgtaaacctatataaagatcgatggaattgtataatat
gtgccataataaaggtgggatctcaaagatctacacaatgaaaataatagtatttatttg
gatagattgatataatttattattgattaaaaagaaagattgaaaagcataggaggaggt
gtaataccaccaaatgctcaaaaggatattttttcgtttttagcagaacactgtttgaat
atattattggaaacctacggaaaaattaaaaaattaaattcaataggtagagatcaaatg
gttttcgaatatactacatgttgttaatcaatagaatcgagttagaagaatagtaaggaa
gtcgtgcttaatccaaagatcactattatgtaattagaatacttgaaagtcttcaattcc
taataatatgaggagattgattaatatatctaaaaatcgaaaactttgatcccattacga
ttgttgtataatttgatgagttcaagttcaagttataataaattatcaaaataatagaaa
aaagatatttcagtaaagtttttcaaagattattatgatacatttaagttattttga
DBGET
integrated database retrieval system