Paramecium tetraurelia: GSPATT00022837001
Help
Entry
GSPATT00022837001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
WD40_WDHD1_1st
WD40_Prp19
WD40_CDC20-Fz
Beta-prop_EML_2
Beta-prop_TEP1_2nd
Beta-prop_CAF1B_HIR1
WDR55
WD40_MABP1-WDR62_2nd
EIF3I
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
WD40_MABP1-WDR62_1st
ANAPC4_WD40
Beta-prop_EML
Beta-prop_SCAP
Beta-prop_WDR75_1st
Beta-prop_WDR19_1st
Beta-prop_IFT122_1st
Ge1_WD40
WDR90_beta-prop_4th
RMC1_N
NBCH_WD40
Beta-prop_IFT140_1st
Beta-prop_RIG_2nd
WD_LRWD1
Nbas_N
Beta-prop_SPT8
Beta-prop_DCAF4
Beta-prop_NWD2_C
NACHT
AAA_22
Pentapeptide
Viral_helicase1
Pentapeptide_4
AAA_30
AAA_16
NPHP3_N
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5042847
NCBI-ProteinID:
XP_001457062
Genoscope:
GSPATT00022837001
UniProt:
A0E2Z8
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
2818 aa
AA seq
DB search
MSQMEFILRGGGCGTSKIYSLESEISKTDNQDLYNLFNKFNFYVEIICTKAAVAANQLEN
QEISIALQWFNFQEEKIYKLNKNAESVAKTYDLILEGIRKLLKSCLIYIRTDSFKCLYIL
QTTASLSKVIFSFHMLNKERYIKCDLQQEFLDISDELRKHMEIEKNDLIQNQMELYLFLT
KTSFQISPNNNDERKEILKGFLSGIIGSIISMKPNEELLESLFLGACHLYNLYIVDKNRK
QFEVYYSIDMLQWEIIGYFKNDTLQDLDEIILRVEVIHDKIVKNSNEWKYHYLWVQMVGK
ILQYNPLITKHKLSQLIRTFNLGLKLNQIWKEYQRKGLLFQVSNDQAVIQLDQLQNSSLN
ENDRIMLETCFKGWEIFLSLKDFLINENIPFTFGSYLKSKLEIEGKGLQKHEYLLAINNI
KRYLGFQIPNKLLTLIKQNDKKLEETIKICRNFIKDKQYDQGLIIKVSNQQITKIMQKLE
HKIYRLNQIKKKDISQNNNFEKLNNLLWLQESLELYLILLERNEAQNNNGKDSKNELQDW
ITLIKEDLIAKDFQASYLSFLDLPATQQIRKKILQEVEKFVDIYEKEICKLNINELLQYF
QNLVNNLQEEYENQSNEHQKQILEFNLHLKRVMIIKYQMETVTQIVELEKIKKDIADMHL
LKFLENLKYKNLKLKLKLVASKKSFSFILEKTKPEELRKFSEVINLQEFLLSIVEDFLKR
ILKENANFEDSLRIELKNIEITKQEDFDYRLSKQKGIIKFLVFKQGLDENQIEQDEKDLE
LIEKEFGDLYNKETPSSSIVTIKQIFENLQVDETLKQVMDEKLDSSQLKLEKEKYYIFLS
QLKQIEDFRKCLLIKNWNQLILQTETVIQTFENFGCPDKEVIKMLINEELIQLKTLIKIN
QGELQSPKDQIRQEKVDITDIEKCDQIGQIQFHDQQVGKSENGILTNQNSQRTYLSFIMK
IVKLKKIRLKEEMVLLQKFLEEVSFFSDTIKQIEKYEKEIQSNFYQRFQSSIKEFIQKFE
QLQCSQVNLQQKDVENIHLYLEFQETKFVEQVNNKGIIQIPINTFDFLNYNTRSFSNIQV
EQDYLIQQIKKIYLEDEDEEESKEQFGLSDNMTQRFKDFTNNEQWKIKQGLVFTIIQILS
NCFSGSLTSFCQKVLIQLWIQEKDLKVRNLLKNEKLMRIQMQILQKDWQIQHDRIAGEMQ
KMLSRIDDLQEQISHEANLNKRDIQLKELDETTEQLDQQIENISEMGQQLKLITDFVNHI
RKGLIRVEGKINEMKEQLKSMGNNIKFLRGKSVEQLFEIRKWKVLKEAADKNAKSIYLPL
DAKDINHKGEKNEDKLSVLINLEQINDAKGEVNKFLLEEKETVLLIHGVAGSGKSTTAKK
IEEFIWKQNNNNIKIRNQILIPVYISLPSLKNPVFQAVEEALHQDEYGFDELQLKECKEM
LEKKEVRLLLIMDSYDEMKLENISKNLYMNNKVKQNWSDPLVIFTTRSEIFTSSNYAFWF
APNNKENLKEVQIQKFNPQQIMEYLKKFTIQSVKMLIFELYEQSTQISNLVGFDINDFEK
VWEILQGQYMSLTKFNGEALLNQKQIDNILTFLKNNQLFTFKSNEVLRSLIVKLQNLWSV
EKYEKMMKKINLYRLIETPYMMEIIVQVLPKMMVKAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXLHQYYKSNYLIQMYNWQKKQYIKHDNNEKEELDNNEKEYQNNNETEQQVTQTEVEN
LDKINYFEIAVEVWNKMEENSIAIQFFNFQELNEINKNLLFENYVKLFNNSFAQISIQKD
RLIDVVCIALCELNLTSFDFYDEFINQYHYQQIEKQRNLGKSIYIDRFLHDLKKYSINLA
KVMSIKQTTQVQYQIQGFLYKEQNQEEKWQNEFFNDDDLQFGSYKKDLRSCSLIQQKGTH
FQFVHKSIQEFYIAADLYSVLLPFKDLNKQIFNWILEQLSKQKNYEKNCLEYLTNYLMQD
NLIKFEDQILDKQKKANAFKKNIELTLNLLRNMNKHEFFQENYSTDTYAETRKYMIQKIK
NEQQIIEFLKFLVYLTSFDSTFIQGGSNSLNLLVEMQIDLTNHNFEKIRIKNTSLSGGNF
AYCNLNQSELTDVNINGVNLNGAQMFWCKWKDLKINSVYSLYGHESGILSVCFSPDGTIL
ASGSGDKSIRLWDIKTGQQKAKLDGHSREVHSVNFSPDGTTLASGSYDQSIRLWDVKTGL
QKVKLDGYSSADYSVNFSPDGTTLSVAMCGGEQEFLICLWDLKTGQKTEFQFYSKSFSNA
QSICFSPDGTTVAFVKERYSSISIYLLHVKTGKIKDILYVDQSNCNSVCFSPDCTKLAFG
GGGRIGDGDCSLYLWDLNTRQEKAIIERHYGPISLVCFSPEGTTLAFASEEYQKIWLWNV
TTEQQKGILDCHSGKILSICFSSDSTLACGSDDMSIRLWDVRTGQQQHVGHSSKVNTVCF
SPDGTTLASGSSDNSIRLWDVKTGQQKAKLDGHSREVYSVNFSPDGTTLASGSRDNSIRL
WDVKTGLQKAKLDGHSYYVTSFNFSPDGTTLASGSYDNSIRLWDVKTRQQKVKLDGHSNN
VNSICFSPDSTTLASGSDDFSIRLWDVKTGQQKAKLDGHSNNVNSICFSPDSITLASGSD
DYSICLWDVKTGYQKAKLDGHSREVHSVNFSPDGTTLASSSYDTSIRLWDVKTRQQKAKL
DGHSEAVYSVNFSPDGTTLASGSNDNSIRLWDVRTRQQKAKLDGHSVSLLMELHQHLLIV
IRLSVYGMLRQNNKSYLQIIITKIFQRLGFWVWVWGWVLGLGLGLGWGWGWGWVWVWV
NT seq
8454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttaaatggaattcattttgcgtggaggtggttgtggaacttcaaaaatatactca
ctcgaatcagaaatctcaaagacagataattaagatctttataatctctttaataaattc
aatttttatgttgaaatcatctgcacaaaggctgctgttgccgctaattagttagagaat
taagaaatatcgattgctttacaatggtttaatttttaagaagaaaaaatttacaaactt
aacaagaatgctgaaagtgttgcgaaaacatatgatttaattttagagggaatcagaaaa
ttattgaaaagctgcttgatttacattagaacagattcgtttaaatgtttatatatcttg
tagacaacagcgtctctatctaaagtaatatttagcttccatatgctaaataaggagaga
tatataaaatgtgatttataacaggaatttttggacatctctgatgaactaagaaaacat
atggaaatagagaagaatgatttgatttaaaattaaatggaactctatcttttcttaaca
aaaacttctttctagatatcacctaacaataatgatgaaaggaaagaaatcttaaaagga
tttttaagtggtattattggttcgataatttcaatgaaaccaaatgaagaattgcttgaa
tcattgtttttgggagcttgtcatctttataatttatatattgttgataaaaatagaaaa
tagtttgaagtttattattcaatagatatgttacaatgggagataataggttattttaag
aatgatacattgtaagatctagacgaaataattttacgagttgaggttatacatgataaa
attgtgaaaaattcaaatgaatggaaatatcattatctttgggtgtaaatggttgggaaa
atcttataatataatcctctaataacaaaacacaaattatcccagttgataaggacattc
aatttgggtttaaagctaaatcaaatttggaaggaatattaaagaaaaggattactattt
taagtgagtaatgactaggcagtcatctaacttgattaactttagaatagttcattaaat
gaaaatgatagaataatgttagaaacctgtttcaaagggtgggaaatctttttatcactt
aaagattttctcataaatgaaaatatcccttttacatttggatcatatttaaaaagcaaa
ttagaaattgaaggaaaaggactctaaaaacatgaatatctattggcaattaacaatatt
aaaaggtatttagggttttagatacccaataagctgctaactttaattaaataaaatgat
aaaaaattggaagaaacaattaaaatttgtagaaactttataaaggacaagtagtatgat
taaggtttaatcataaaagtttctaattaataaataacaaagattatgcaaaaattagag
cataaaatctataggcttaattagatcaaaaagaaagatataagtcaaaataacaatttt
gagaaacttaataatttgttgtggttgtaagaaagtttagaattatatctaattttactt
gaaaggaatgaagcacaaaataacaatggtaaagatagcaagaatgaacttcaagattgg
ataacattaattaaagaagatttaatagccaaagatttttaagcttcttatttatcattt
cttgacttaccagcaacccaacaaattagaaagaaaattctgtaagaagttgaaaaattt
gttgacatttatgagaaagaaatttgcaaattaaatataaatgaattattgcaatatttt
tagaatttagtcaataatctacaagaagagtacgaaaactagagcaatgaacattaaaaa
caaattttagagttcaatttacacctaaagagagtcatgattataaaatattaaatggag
acagttacttaaattgttgaacttgaaaaaattaaaaaagatatagctgatatgcattta
cttaaatttctagagaacttaaagtacaaaaatctgaagctaaaattaaaattggttgct
tctaagaaatccttttcatttattttagaaaaaaccaaaccagaggaattaagaaagttt
tcagaagttataaatttgtaagagttcctattaagtatagttgaggattttctaaaaaga
attctaaaagaaaatgctaattttgaagactcacttcgaattgaactgaaaaatattgaa
atcacgaaataagaagactttgactacagattatcaaagtaaaaaggaataataaaattc
ctcgtatttaaataaggtttagatgaaaatcagattgaataggatgaaaaagatttagag
ttgattgagaaggaatttggagatttatacaataaagaaactccttcttcttctattgtg
acaataaagtaaatttttgaaaatctacaagttgatgaaactttaaaataggtgatggat
gaaaaattagattcatcgcaattgaaattggaaaaagaaaaatattatatttttttatct
caattaaagcaaattgaagattttagaaaatgtttattaattaaaaattggaatcaatta
atcttataaacagaaactgtgatccaaacatttgaaaattttggatgcccagacaaggaa
gttataaaaatgttaattaatgaagaactaatccagttaaaaactttaataaagataaat
taaggagaattgtaatctccaaaagactagataagataggagaaagttgatataacagac
attgagaaatgtgattaaattggataaatataatttcatgattaataagtaggaaaaagt
gaaaatggcattttaactaattaaaatagttagcgaacttacttatcattcataatgaag
atagtaaagttaaaaaaaataagactaaaagaagagatggtactattgtaaaaatttctt
gaagaagtaagttttttttctgatacgattaaataaattgaaaagtatgaaaaagaaatt
taatccaatttctatcaaagatttcaaagtagtataaaagaatttattcaaaagtttgag
tagttacaatgttcataagttaatttataatagaaagatgttgaaaatattcatttgtat
ttggaattttaagaaaccaagtttgttgaataggtaaataataaaggaattattcaaatc
ccaataaatacctttgattttcttaattataatacaagaagtttttcaaacatctaagtt
gaataggattatctaattcaataaataaaaaaaatatacttagaggatgaagacgaggaa
gaatcaaaagaataattcggtttatcagataatatgactcaaagattcaaagactttaca
aataatgaataatggaaaattaaatagggtctagtttttactataatttagattttatcc
aattgtttttcaggtagccttacttctttttgttagaaagttcttatctaattgtggatt
caagaaaaagatctaaaagtaagaaaccttttaaaaaatgaaaaattgatgagaatataa
atgcagattttgtagaaggattggtagatttaacacgatagaattgcaggtgaaatgtag
aaaatgttgagcagaattgatgatttgtaagaataaatttctcatgaggctaatctcaac
aagcgagatatataactaaaagaacttgatgaaacaacagagcaattagattaataaata
gaaaatatcagtgaaatgggttaataactaaaactgataactgactttgttaatcatatt
agaaaaggcttgatcagagtggaggggaaaatcaatgaaatgaaggaataactcaaaagc
atgggtaacaatatcaaatttttgagaggaaaatctgttgaataattatttgaaattaga
aaatggaaagtattgaaagaagctgcagataagaatgccaaatccatttacttaccatta
gatgccaaagatataaatcataaaggtgaaaaaaatgaagataaattaagtgttctgata
aatttagaacaaattaatgatgcaaaaggagaagtgaataagtttttattagaagagaaa
gaaacagtgttattaattcatggggtagctggatctggcaaaagtactacggctaagaaa
atagaagaatttatttggaaataaaataacaataatataaaaattagaaatcaaattctc
atacctgtttatatctcattaccctctttaaaaaaccctgtgttttaagcagtagaggaa
gcacttcatcaagatgagtacggctttgacgaactttaattaaaagaatgcaaagagatg
ttagagaagaaagaagtcagattattattgatcatggatagctatgatgaaatgaaacta
gagaatatttcaaaaaatttatatatgaataataaagtaaaatagaattggtcagatcca
cttgtcatttttaccacgagaagtgaaatttttacaagtagtaattatgcattttggttt
gcacctaacaacaaagaaaatttaaaggaagttcagatttaaaaatttaatcctcaataa
ataatggaatacctaaaaaaattcacaatttaaagtgttaaaatgttgatttttgaatta
tatgaatagtcaacataaatttcaaatctagtgggatttgatatcaatgattttgaaaag
gtttgggaaatattgtaaggataatatatgagtttaacaaagttcaatggtgaagcactt
ttgaattaaaaataaatagataatattttaacttttttgaagaataattaattatttact
tttaaaagcaatgaggttttaagaagtctaatagtaaaattataaaatctgtggagtgtt
gaaaagtatgaaaagatgatgaagaaaataaatttatatagattgatagaaactccatat
atgatggaaataatagtttaagtgttgcctaaaatgatggtcaaagctcnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnntgcttcatcagtattacaaaagtaactatctgattcaaatgtataattgg
caaaagaaacaatatataaaacatgataataatgaaaaagaagaattggataataatgaa
aaagaatatcagaataataatgaaacagaataataagttacctaaactgaagtggaaaat
ttggataaaattaattattttgaaattgctgttgaggtttggaataaaatggaagaaaat
tcaatcgcaatccaatttttcaactttcaagaattaaatgaaattaacaaaaatctctta
tttgaaaattacgttaaactcttcaataattcatttgcataaattagtattcagaaagat
agactaattgacgttgtttgtattgcattatgtgaactgaatcttacaagttttgacttt
tatgacgaatttataaattaatatcattatcaacaaattgaaaagtagagaaatttggga
aaatcaatttatatcgatcgatttttgcatgatttaaaaaagtattcaatcaatcttgca
aaagtaatgagcataaagtaaacaacataagtttaatattaaatataaggatttctgtat
aaagaataaaattaagaggagaagtggtaaaatgaattttttaacgatgatgatctttaa
tttggttcatacaagaaggatttaaggagttgttcactaatatagtaaaaaggtactcat
ttttaatttgtccataagtcaattcaagagttctacatagcagctgatctatatagtgta
ttattgccattcaaagatcttaataaatagatattcaattggatactagaatagctatct
aaatagaaaaattatgagaaaaattgtttagaatatttaacaaattacttgatgtaggat
aatttgattaaatttgaagattaaattttggataaacaaaagaaagcaaatgcttttaaa
aaaaatattgaattaactcttaatcttttgagaaatatgaataaacatgaatttttttaa
gaaaactattccactgacacttatgcagaaactagaaaatacatgatctaaaaaataaaa
aatgaataataaataattgagtttttaaagtttctggtgtatttaacatcatttgatagc
actttcatatagggaggatccaactcacttaatttattagttgagatgcaaattgattta
actaatcataattttgagaagataagaatcaaaaacacttctctctcaggaggaaatttt
gcttattgtaatttaaactaatctgaattaactgatgtgaacataaatggagtaaatcta
aatggagcataaatgttctggtgcaaatggaaagatttgaagattaatagtgtttattca
ttatatggtcatgagagtggtattttatcagtctgtttctctcctgacggtactatatta
gcatctggtagtggagacaagtctatccgtttatgggatattaaaacaggataataaaaa
gccaaattagatggtcattcaagggaagttcattcagtaaatttttctcctgatggcaca
acattagcatctggtagttatgattagtctatccgtttatgggatgttaagacaggatta
taaaaagtcaaattagatggttattcatcagcagattattcagtcaatttctctcctgat
ggtactactttatcagtggcaatgtgtggtggtgaataagaatttttaatctgcttatgg
gatttaaagacaggataaaaaaccgaattctaattttatagtaaatcctttagtaatgct
caatcaatttgtttctctcctgatgggactacagtagcatttgtcaaagaaaggtattcc
tctatttcgatttatttattgcatgttaaaacaggaaaaataaaagacattttatatgtt
gactaaagtaattgcaattctgtttgtttctctcctgattgtactaaattagcatttggg
ggggggggaagaattggcgatggagattgctctctatatttatgggatttgaatacaaga
taagaaaaagccatcatagaacgtcattatggtccaatttcattggtctgtttctcacct
gaaggcactacattagcgtttgctagtgaagaatattaaaaaatctggttgtggaatgtt
acaacagaataataaaaaggcatattagattgtcattctggtaaaattctatcaatctgt
ttctcttctgatagtacattagcatgtggtagtgatgacatgtctattcgattatgggat
gttaggacaggataataataacatgttggtcattcatcaaaagttaatacagtttgtttt
tctcctgatggtactacattagcatctggtagttcagataactctatccgtttatgggat
gttaagacaggataataaaaagccaaattagatggtcattcaagggaagtttattcagtc
aatttctctcctgatggtactacattagcatctggtagtagagataactctatccgttta
tgggatgttaagacaggattataaaaagccaaattagatggtcattcatattatgttact
tcattcaatttctctcctgatggtactacattagcatctggtagttatgataactctatc
cgtttatgggatgttaaaacaagataataaaaagtcaaattagatggtcattctaataat
gttaattcaatttgtttctctcctgatagtactacattagcatctggtagtgatgatttt
tctatccgtttatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaattagatggtcactct
aataatgttaattcaatttgtttctctcctgatagtattacattagcatctggtagtgat
gattactctatctgtctatgggatgttaagacaggatatcaaaaagccaaattagatggt
cattcaagggaagttcattctgtcaatttttctcctgatggcacaacattagcatctagt
agttatgatacgtctatccgtttatgggatgttaaaacaagatagtaaaaagccaaatta
gatggtcattcagaagcagtgtattctgtcaatttctctcctgatggtactacattagca
tctggtagtaatgataactctatccgtttatgggatgttagaacaagataataaaaagcc
aaattagatggtcattcagtttctctcctgatggaactacattagcatctgttaattgtg
attagactatccgtttatgggatgttaagacagaataataaatcttaccttcagataatc
attacaaagatattctagcggttgggtttttgggtttgggtttggggttgggttttgggt
ttgggtttgggtttgggttggggttggggttggggttgggtttgggtttgggtt
DBGET
integrated database retrieval system