KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00027386001
Entry
GSPATT00027386001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K00784  ribonuclease Z [EC:3.1.26.11]
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:ptm03016]
    GSPATT00027386001
Enzymes [BR:ptm01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.26  Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.26.11  tRNase Z
     GSPATT00027386001
Transfer RNA biogenesis [BR:ptm03016]
 Eukaryotic type
  3'processing and CCA adding factors
   3'processing factors
    GSPATT00027386001
 Prokaryotic type
    GSPATT00027386001
SSDB
Motif
Pfam: Lactamase_B_2 Lactamase_B_4 Motile_Sperm Lactamase_B
Other DBs
NCBI-GeneID: 5048215
NCBI-ProteinID: XP_001462430
Genoscope: GSPATT00027386001
UniProt: A0EIB6
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 712 aa
MVRFSFQVIKNQETPNIVCSFDNIRYIFNLPDGFQRFTKDNQVKINQGPRIFFTRLSTQT
TTGCFGYLSTLLAQNCGVNTKIYGPKGLYIMKQEVLKHYLIRCKNLMETAYWEQKIQSQQ
KNYCSRTIEHIIDPKESNDASIYMKNSTLFKDQNIQIQAIEINDTIQYVISSFPQPGNYN
KDKLQQFKVPANKMQDLSKNGKVILEDGQIVTIEQVKEPDIIPQVAIILDIGNEEQMQKL
MGHIEFKKTLEQFQAKQVNLVAVFHLSHQIQEEYYIDFIKKYSYFNHIFCNYYKESDDKI
CQTHMKIQPLSELLSNFLHKQYPFNFPHIECLKLRPIPIDFKDVNQIFGYIPLFEYLILP
TKQQGYKPVQNFSPKIMSEMFTNIQFKNYQQQFQQKGIDHIRLIFLGTCSMKPGQLRNVS
GIILVNEKLKSNIILDCGEGTFKQISDENIVLDNKPLIIWISHAHSDHHLGLLQIVHNLC
KCHNEIYLIVPAIVVPWLMFFKEILGEQCNWKIIVSQQFDQDFKEDINQLIKDCFHQCRI
RQGELVQIQDNQNFIKNYEDLISCLKDQFELDSIKVTPVEHCPQSYGVRLNLCDGRSLSY
SGDTRPCDRFIKLSQNVDILIHESTFTDDLQENALQNMHSTISEAVKVGMLADAKVITLT
HYSQRYSRQIEINQENLENDRIIFCCDHFGGYLNEYSKLSQMSKEIIQLFNE
NT seq 2139 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtgagattttccttttaagttattaaaaattaagaaactccaaatattgtttgctcc
tttgataatattaggtatatttttaatcttccggatggattttaaaggttcacaaaagac
aattaagtaaaaatcaatcaagggcctcgaatattttttaccagattgagcacacaaaca
acaactggttgttttggatatttatcaacattattggcataaaattgtggagttaataca
aaaatttatgggccaaaaggactttatataatgaaataggaggttttaaaacattacctt
attcggtgtaagaatttaatggaaactgcttattgggaacaaaagatacaaagctaatag
aagaactattgcagcagaacgattgagcatattattgatccaaaagaatctaatgatgct
tctatctatatgaaaaattcaactttgtttaaggatcaaaatatataaatataagctatt
gaaataaatgatacaattcaatatgtcatttcatcattcccctaaccaggtaactacaat
aaagataaattacaataatttaaagttcctgctaataaaatgcaagatttgtcaaagaat
ggcaaagttattctagaagatggataaatagttacaattgaataagtaaaagaacctgac
attataccttaagttgcaattattttggatattggaaatgaagaataaatgtagaaattg
atgggtcatatagaattcaagaagactctggaataatttcaagcaaaataggtaaattta
gttgctgtttttcatttatctcaccaaatttaggaagaatactatattgactttattaaa
aaatattcctactttaatcatattttctgtaactattataaggaaagtgatgataagatt
tgttaaacacatatgaagatccaacctttatcagaacttttatcaaattttttacataaa
caatatccatttaattttcctcatattgaatgcttaaaattaagacccatacctattgat
tttaaagatgtaaactaaatatttggctacattcctctttttgaatatttaattctccca
acgaaataataggggtataaaccagtttagaatttttccccaaaaataatgtctgagatg
tttactaacatttaattcaaaaactattaataataattttaataaaaaggaatcgatcat
ataagattaatatttttaggtacttgttctatgaaaccaggatagttaagaaatgtttca
gggattattttagtgaatgaaaaattgaaatctaacattattttagattgtggagaagga
acttttaaatagatcagcgatgaaaatatagttcttgataataagccactaattatttgg
ataagccatgctcatagcgatcatcatttaggtttattataaattgttcataatttatgt
aaatgccataatgaaatatatttaattgtgcctgcaatagtagttccttggctgatgttt
ttcaaggaaatcttaggagagtaatgtaattggaaaattattgtgtcgtaataatttgat
taggattttaaagaagatattaatcaattaataaaggattgttttcattaatgtcgaatt
agataaggtgaattagtataaatttaagataattaaaatttcattaaaaactatgaagac
cttataagttgtttgaaggattaatttgaattagattctataaaagttacgcctgttgag
cattgcccataatcttatggagtaagattaaatttatgtgatggaagatctttatcttat
tctggagatacaagaccatgtgatagatttataaaattatcataaaatgttgatattcta
attcatgaatccacttttacagatgatttgtaagagaatgcactttaaaatatgcactct
acaatttctgaggctgttaaagtaggcatgcttgctgacgcaaaagttattacattaact
cattattctcagagatactcaagatagatagaaattaattaagaaaatttggagaatgat
agaattatattttgttgcgaccattttggaggatatttaaatgagtattcaaaattaagt
caaatgagtaaagagattatataattatttaatgaatga

DBGET integrated database retrieval system