Paramecium tetraurelia: GSPATT00028431001 Help Entry GSPATT00028431001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K10597   ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:2.3.2.27] Organism ptm  Paramecium tetraurelia Pathway ptm04120   Ubiquitin mediated proteolysis ptm04141   Protein processing in endoplasmic reticulum Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    04141 Protein processing in endoplasmic reticulum     GSPATT00028431001    04120 Ubiquitin mediated proteolysis     GSPATT00028431001  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04121 Ubiquitin system [BR:ptm04121]     GSPATT00028431001 Enzymes [BR:ptm01000]  2. Transferases   2.3  Acyltransferases    2.3.2  Aminoacyltransferases     2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase      GSPATT00028431001 Ubiquitin system [BR:ptm04121]  Ubiquitin ligases (E3)   U-box type E3    GSPATT00028431001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Ufd2P_core U-box PH_2 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5010578 NCBI-ProteinID:  XP_001424794 Genoscope:  GSPATT00028431001 UniProt:  A0BFS9 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 1175 aa AA seqDB search MGNNKSKPIQQQDAYQAHWSKNQAQELRNLQKQEESIQNAKKQQLDKMKVETDQKLIQIK QQEQQIQKFEKGQQTTQQLSFSPQQINLKIQVSFKKPQLLEESSQVDLSQKEEKNKESKA VLTSNVSSNNNKCIIQNNQQEIQLQQVQKDSQQQDEYIGLKQGQNIIQFDIDQQVEQNTK LSDEQQIQQEVQQQSSQKMQQETQQQITQHNNSQGHVDTNANEEAILKRCFMINMKELKI SNLYAKFLEKFSTITSDIILCDIINCVLSSEQYIQTQKVTWLVFVIINLSECKVFDDNVI FNEGSISKQVWTKLINAVLDKLVSAVAKPEKLEWLGSREDVNSYTNQENTNASQVYDMLF GQQKSKNFEFSFENLDHPAIYQLLTYLDTKSQQKDTQRFLELITKRELSKCQQVNLSDCV NQQRALKLLDKLSFYPRITELLFEDSWAYGKFQQYKNGRDLQKYSIFGSILCLSTFPRDF PEVNKIFCSDQGLPILIECYRRPIYEIINQMADIFLRIIRRGKKSQLELFTYLVKLIEIN LDIEKVTEKEKFDKCCYQGMMFNLQQVLLEIFNPFIYNTNQANAKLSKINKDLLAQIKNQ PLLAKIYSNVKQMAPLKTELIQLDKTPEIDPMTFLYLLIQKINSLQQHMIIDYVISYVIL QYDKRHFGSSSKLTQQSEIDKAKYDVLLLNPRSVQNTIQFLSFQSKVAQSLLDENYKPKY PYGLLSNQFMNDIFHYCFIYNSNNLALDYLDEVISICEFTIITMKYQELIEDTHLRVLGM HLFYIFNDYVIQQQHGKASDKAFKIFSENKVIKEFLIEGLIKAYVDQDKVKVTNIIPTFR FKQAVSQLFSYILTTHSNIYNKKFVDYVQSNTDTYSNFALAYINDIKELLDQCLSTTQKL KQEEDSAQTVQVRNPTLQERKEKILKQLFLEIAEKKCLGDWKGFEELFKNIVLFTKIEPK AFLIEESRQTFTENLNYVVVKLNGPENNNCLTSKFFTKYDVKIEPRHLSNYIVDIFINIK NQQEFWDELAMNNSTLQLEILHQLVNQMGYLKLKTQYQLQEFLQIINSLQQLKIDYDQFF RELQQDPNRQRRFIDSLTQNLMTDPVMLPNSKQIVDRVTIKRLLLQKKQDPFDRSYLSVE MLIEQKELKQEIKSFINVKIQELRSIRHGSKQHLK NT seq 3528 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggggaataataaatcaaaaccaatttaataataagatgcttatcaagcacactggagt aaaaattaggcataagaattaaggaacttgcaaaaataggaagaatcaatctaaaatgct aaaaaataacaacttgataaaatgaaagttgaaacagattaaaaactaatctaaattaag taataagagtaataaatccaaaaatttgaaaaaggataacaaacaacataataactaagt ttttctccttaacaaatcaatttaaagattcaagtatcttttaaaaagccacaattatta gaggaatcatcttaagtcgatcttagttaaaaggaggagaaaaataaagagagtaaagct gtattaacttcaaatgtatcttctaataataataaatgtataatataaaataatcaataa gaaatttaattataataagtttagaaagactctcaatagcaagatgaatatattgggtta aaatagggttaaaacattatttaatttgacattgattagtaggttgaataaaatacaaaa ttgtcggatgaataacaaatatagtaagaagtttaatagtaaagttcataaaagatgtaa taagaaacctagcaataaataacttaacataataatagttaaggtcacgtagacacaaat gctaatgaagaagctattttgaaaaggtgttttatgatcaacatgaaagagttgaaaatt agcaacctctatgcaaaatttttagaaaaattttcaacaatcactagtgatatcatttta tgtgatataataaactgtgtcctatcttcagaataatacatttagacttagaaagtgact tggcttgtcttcgttatcataaatttatcagaatgtaaagtttttgatgacaatgttatc tttaatgaaggttcaatatcaaaacaagtttggaccaaattaataaatgctgttcttgat aaacttgtatctgctgtagcgaaaccagaaaaattagaatggctgggaagtagagaggat gtaaacagttatacaaattaagaaaatacgaatgcatcttaagtttatgacatgctgttt ggataatagaaatccaaaaattttgaattttcatttgaaaacttagatcatccagctata tattaattactaacatatcttgataccaaatctcaacagaaagatacttaaagatttttg gaattaattactaaaagagaactcagcaaatgttaataagttaatttatctgattgtgta aatcaataaagagctttgaaattattagacaaattatcattttatccaagaattacagaa ctcttatttgaagatagttgggcttatggaaaattccaataatacaaaaatggtagggat ctataaaaatattcaatttttggttcaattttatgtttgagtacatttccaagagatttt ccagaagtaaataagattttctgttcagattaaggtttaccaattcttatagaatgctat agaagaccaatttatgaaataattaattagatggctgatatattcctaagaattattaga agaggaaaaaaatcttaattagaattattcacttatttggttaaattaattgaaatcaat ttggacattgaaaaagtgactgaaaaagaaaaatttgataaatgttgttattagggcatg atgtttaatttataacaggtattattggagatctttaatccttttatctacaatactaat taagcaaatgcgaaattatctaaaattaacaaagatcttcttgcttaaattaagaattag ccactcctagctaaaatttattcaaatgtcaaataaatggccccattaaaaactgaattg atacaattagataaaactcctgaaattgatcctatgacatttctctacttgctaatttaa aagattaattctctccaacaacatatgataatcgattatgtcatatcatatgtaatcttg tagtatgataaaagacatttcggatcatcttcaaaattaacttaataaagcgaaatagac aaggctaaatatgatgtattattgctgaatcctagaagtgtatagaatacaattcaattt ttatccttttaaagcaaagtagcttaaagcttgcttgatgaaaattataaaccaaaatat ccttatggtttattatctaattaattcatgaatgatatattccattactgtttcatatac aattctaataacttagctttggattacttagatgaagtaatttcgatttgtgaattcaca attattacaatgaaatatcaagaattgatagaagacactcacttgagagttttaggaatg cacttattttatattttcaatgattatgttatttaatagtaacatggtaaagcatcagat aaggcatttaaaatattttcagaaaataaagtcattaaagaatttctcatagagggtctt attaaagcatacgttgattaagataaagttaaagtcaccaatatcatcccaacctttaga tttaaataagcagtttctcaattattttcttacatcttgacaacacacagcaatatatat aacaaaaaattcgtagactacgtctaatctaacactgacacttattcaaattttgcttta gcttatattaatgatataaaagaattgcttgaccaatgtctctctactacctaaaaacta aagtaagaggaagatagtgcataaactgtccaagttcgtaacccgactttgtaggaacgc aaggaaaaaatcctgaagtaactatttctagaaattgcagaaaagaaatgtcttggagat tggaagggttttgaagaattatttaaaaacattgttctgtttactaagattgaaccaaaa gcattcctaatagaagaatcacgataaacttttacagaaaacctgaattatgttgtagta aagcttaatggtccagaaaacaataactgtttgacctcgaaattttttactaagtacgat gtaaagattgagccaagacatctatcaaactacatagtagatatatttataaatatcaaa aatcaataggagttttgggatgaactagctatgaataattctaccttataacttgagatt ttacattagttggtgaattaaatgggctatttaaaattgaaaactcaatattaactctaa gaattcttataaattataaatagcctatagtaattgaagatcgattatgatcaatttttc agagaactctaataggatcccaatagataaagaagatttattgacagtctgactcaaaat ttaatgactgatccagtaatgttaccaaattctaaataaatagtagatagagtaacaatt aaaagactcctattataaaaaaaataagatccttttgatagatcctatcttagtgtagag atgcttatagagcagaaagaattaaaataagaaatcaaatctttcataaatgttaaaata taagaattaaggtcaattagacatggttctaaatagcatctcaaatga

DBGET integrated database retrieval system