Paramecium tetraurelia: GSPATT00030065001
Help
Entry
GSPATT00030065001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K06636
structural maintenance of chromosome 1
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
GSPATT00030065001
Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid cohesion proteins
Cohesin complex
GSPATT00030065001
Meiosis-specific proteins
Cohesin complex and associated proteins
GSPATT00030065001
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_21
AAA_29
AAA_15
SbcC_Walker_B
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5012614
NCBI-ProteinID:
XP_001426830
Genoscope:
GSPATT00030065001
UniProt:
A0BLL5
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1256 aa
AA seq
DB search
MSQLIGTLSLDTNAYVDYNISENMSNNALENSDLLKVRLGKIKGMKVCNFKSFENEHFVG
PFTKFTSIIGPNGGGKSNVLDAIQFVLGISIRSMRCHRAEELIYSQSMYYKNYQEEDRTA
YVEIIFEAINYIDTQISLKRTVNKQQQTQVYIGEQQVTEKELSSFLLLSKIILPAKNFIM
LQGDTDTLTTIEPKKLTELFEYVSGSVQYKNTCQQIQSELNKVVIRMRELQFQRGAMRTE
QKKVKELKNTSDKYKKINDEINQLKLKQKLFELKQIDNELEDISKQLTQNKNDESDQNSE
NKRLIEDIQQCDLEIEKLKQELNQIEENEKKIKKDEKSKAYDTTSIDLEIELLKKQVSTY
EGLLGKLKKDINYQQEMIEEVQTDLDGKTQHLQKIKSQSNLKLSKKLMEEFQELQMKFKI
QNQQIQSELEKLQEKQGVAQKIYDQIDDEIKQYTDDRKELVQAIEEQNTQLKYVKDEFDV
LKDRHQNTQKRIDELYRQNQIEENELKSLQQHKIEQERQLRLIEVQETENIDEKQTQLLI
QQLKSMFKDFRGELSSLCNPDQQQFAIPLKVALGQRLLCALVVDSEKTAKEINMHLRSLD
IVKELIILNRVKSNKDESELRENTRAGKAYLAIDIIKYDQSLDKVLKSLLSGIVVCDSYQ
LAVQLQKEKIQDIKQIITLDGITLATSGMIVFNGSQQRLSEMRNFRSNNQRIQQKGPKES
KEQLIKSIDELQNKIKTLKNISVQDDLKYQSALKMKLEEQQAQLSNKQISLQKSIQMYND
KLKQVDKLLDELYIEINKRKVQLKEFDEQNEKLVNQIQNQQKVAYQDFAKRNSISLQELN
QLDFQQNLGKQLEIKQQQLNKLQVQKQSMEQYLEELKKKQEDFQNNIKTKNEAINNYEQK
KIDLQQNHDKKNKDLVQYTQKQQDINQKLKAQQKKLLNLTDLRNQQVRKGVDKKQQINLI
NRKLEQLRFQRGRLIELCEIESIPVRFKRSQGTFQPSLNFDDDQQMDMEAIDYGAIKNDL
KHSNWNKLMEEINVELEIKEQEITKYLSENLQVGLIGAKTDEKFVQLETNIESLGRSIKE
LQNREAELSDQLVQTQQLRKDRFDKLFDRVEKEIKILYQKLTENQNRVGGTVLLYMENKE
EPFEGGLIYTPNPPNKKYIFDNSEQLSGGEKAIASIALLLALNAAIDAPFILLDEVDAHL
DQDNADKLQKIVKLLSNQIQFVLVSHNPDVFAHSDSLVGVTIQHSKTTSEAFSLLL
NT seq
3771 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaacttattggaactttgtccttagataccaatgcctacgtagattacaatata
agtgagaatatgtctaacaacgcactggaaaactctgatttattgaaagtgagattggga
aagattaaagggatgaaagtttgcaattttaagtcatttgaaaatgagcattttgtaggt
ccgtttactaaattcaccagtatcataggaccaaatggaggagggaagtcgaatgttttg
gatgcaatttaatttgtattaggaatctcaatcaggtcaatgagatgtcatagagcagag
gagttaatttatagttaatcgatgtactacaaaaactatcaggaagaggacagaacagct
tatgttgaaataatttttgaggccatcaattacattgacacttaaatttcacttaaaaga
actgtaaataaatagtagcaaacacaagtttatattggcgaataataagttactgagaaa
gagttgagttcatttctcctcttatctaaaatcatattgcctgctaagaatttcattatg
ttgcaaggtgacactgatacattgacaacaattgagcctaagaaattaacagaattattc
gaatatgtcagtggaagtgttcaatataaaaacacatgtcaatagatctaaagtgagtta
aacaaagtggttattaggatgagggaattgtaattttaaagaggagccatgagaacagaa
taaaaaaaagtgaaagaattaaaaaacacttcggacaaatacaaaaaaattaatgatgag
atcaatcaattgaaattaaaatagaaactatttgagcttaaatagatagacaatgaatta
gaagatatctcaaagtaattaacatagaacaaaaatgatgaatctgattaaaatagtgaa
aataagagattgattgaagatattcaataatgtgatttggagattgaaaagttgaagtag
gaactcaattagattgaggaaaatgagaaaaagattaagaaggatgagaaatctaaagca
tatgatacaacctcaattgatttagaaatagaattactaaaaaagtaagtgtcaacatac
gaagggttattgggtaaattgaagaaggatatcaattatcaataggagatgatagaagag
gtgtaaacagatcttgatggtaaaacatagcatttgtaaaaaataaaatcttaaagcaat
ttaaaattatcaaaaaagttaatggaagaattttaagagttgtaaatgaaatttaaaata
tagaattaacaaatacaatctgagttagaaaaattacaagaaaaacagggagtagcatag
aagatctatgattaaattgatgatgagatcaaacagtatacggatgatcgcaaagaatta
gtgtaagcaattgaagaatagaatacttagttgaagtatgttaaagatgaatttgatgta
ttaaaggatagacatcaaaatacttaaaagagaattgatgaattgtatagataaaattaa
attgaggaaaatgaattgaaatcactttaacagcataaaatagaataggagagataatta
agattgattgaggtctaagagactgaaaatattgatgaaaaataaacatagttgctgatt
taatagctaaagtctatgttcaaagatttcagaggagagttgtctagtttgtgtaatcct
gattaataataatttgccatcccattgaaagtggctcttggctaaagattactttgcgca
ttagtagttgattcagagaagacagcaaaggaaattaatatgcatctaagatctcttgat
attgttaaagaactcatcatattgaatagagttaaaagtaataaggatgaatctgaattg
agggagaatacaagagcaggtaaagcatatttagcaattgatataattaaatatgatcaa
agtttagataaagttttaaagtctttattgagtggaatagtggtgtgtgattcatattaa
ttggcagtttaattgtaaaaagagaagattcaagatattaaatagattattacattggat
ggaatcactttggcaacatcaggtatgattgtgtttaacggatcataataaagattgtcg
gaaatgagaaattttagatcaaataattaaagaatttaataaaagggaccaaaggaatca
aaagagtagttaattaagtctattgatgaattgtaaaataaaatcaagactctcaaaaac
ataagtgtttaggatgatcttaaatattaatctgcattaaaaatgaaattagaagaataa
caagctcaattatcaaataaatagatttcattataaaaatcaatacaaatgtataatgac
aaattaaaataagttgataaactattggatgaactttacattgaaataaacaagcgaaaa
gtttaattgaaagaattcgatgaataaaatgaaaaacttgttaattaaatctagaaccaa
taaaaggtggcatattaagattttgctaaaagaaattcaataagtctgcaggaattaaac
taactagactttcaataaaatttaggtaaataattggaaattaaataataataattgaat
aaactttaagtttagaaatagagtatggaataatatttggaagaattgaaaaagaaacaa
gaagacttttagaacaatataaaaactaagaatgaagctattaacaattatgaacaaaag
aaaattgatctacaacagaatcatgataaaaagaataaagatttagtttagtatacccaa
aagcaacaagatattaatcaaaaactaaaagcttaataaaaaaaattgcttaatctcact
gatttgagaaatcaataggttagaaaaggagtagataaaaaacaataaatcaatttaatc
aatagaaaattagagtagttaagattctaaagaggaagattaatagaattatgtgaaatt
gaatctattcctgtcagatttaagagatctcaaggaaccttccaaccttctttaaatttt
gatgatgactaacaaatggatatggaagccatagattatggtgccataaaaaatgatttg
aaacattctaattggaataaattaatggaagaaattaatgtagaattagaaataaaggaa
caagaaattactaagtatttatcagaaaatttacaggttggattgattggagccaaaaca
gatgaaaagtttgtctaattggaaaccaatattgaatcattaggaagatcgattaaggaa
ttataaaatcgagaagcagaattgagtgattaattagtatagacataataattaagaaag
gatagatttgataaattatttgatagagtagaaaaggaaattaaaatattatattaaaaa
ttaactgagaatcaaaatagagttggtggaactgttcttctctatatggaaaataaagaa
gaaccctttgaaggaggattgatatatactccaaatcctccaaacaaaaaatatattttt
gataattctgaatagctttctggaggagaaaaggcaatagcttcaattgctctgttgtta
gcattaaatgcagctattgatgctcctttcattttgcttgatgaagtagatgctcattta
gactaagacaatgcggataaattacaaaagattgtgaaattgttgtcgaattagatctag
tttgtgcttgtaagtcataatccggatgtgtttgctcattcagattcactagtaggggta
acaatccagcattctaaaactaccagtgaagctttttcattattactttga
DBGET
integrated database retrieval system
