Paramecium tetraurelia: GSPATT00030674001
Help
Entry
GSPATT00030674001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K10742
DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease Dna2 [EC:
5.6.2.3
3.1.-.-]
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
GSPATT00030674001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ptm03032
]
GSPATT00030674001
Enzymes [BR:
ptm01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.3 DNA 5'-3' helicase
GSPATT00030674001
DNA replication proteins [BR:
ptm03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Other elongation factors
GSPATT00030674001
Prokaryotic type
Elongation factors (archaeal)
Other elongation factors
GSPATT00030674001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Dna2
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5013218
NCBI-ProteinID:
XP_001427434
Genoscope:
GSPATT00030674001
UniProt:
A0BNB9
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
896 aa
AA seq
DB search
MFQKISNFDAELEEFLREDNRPTKKLQQQEKPQVVNRENLINNENCMSNANYNLIVKDVL
NSNQVEIDSYILSIFKRIQKQPTSHFLLILACEKFNFGDNQKTIEIFLFDHYNNLKQIRK
GMQIRVNGEFIDSRAIIFTQKIQNKNSFTLEPETLVAPSILNGLDFCRRKQFTREFFQNQ
CFGTTLEMLSGKILHDFFQNIIMDVKSYDSLFENIEQLDEHQKDLQQLVVENLPQSFLQP
ISQLYSKYIQEFYHLEKKTVREMLINIIPKCVNTLRWIQQFVIKQQPISLKQQKSSDVFK
IKILKWVSNEQLISSSVYGLKGFIDVVVQVEFRKNSKECQICYIPIELKTGSKKQSYHLQ
VQTYLLLMNNFYKQQSQFGLLLYLNKLELEVVTCDQMDINDLFFYRNLYISETYMFEKPK
DCYSKLPDLKDELRSERDLNFKCEKCDDKSVCYGLHILTEQSELTVQNPYYDNINQQLQS
KSKEYLNEMLKNIRQEEQTILIPQATYYIQATKSCQTGIQVTLQSKNYYLKQQANEILKQ
CFQDKTKINLFCIRTQKNVKYNFQNAWLVQGTQIINLIENQTDVEEIEVDEQNFDYAIGL
EIFLEYEQIDQLGDHLQINDELIHKLYQKNPFKHFKFIIFELATNKEIYQRKKEILIFGM
EPKFRLVTEMDDNQKVANAILMEKFQKNLNEFQIKAIQLCLLAEDFALISGSYGKRKMLS
HLLFLLGYTNKKVLYCAADQEVVDDQIKDFVDTFPNEGQWVLRLQGEKDKIPEHYQKYSF
SFKNCKDIPEVEKKLEDKQFYFSSCQYCTDILQSQSFDYCIVDQSTKIIEPQCISCILKS
KVFILLDDKEFEQPLIKSQKAKQLRISLFQRLLQQFQNVGCQQQLEFSIQDIDDLI
NT seq
2691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttaaaaaatttctaattttgatgcagagttggaagagtttttaagagaggataat
aggccaacaaaaaaattataataataggaaaaaccgtaggttgttaatcgagaaaactta
attaataatgaaaattgtatgtcgaatgcaaattacaatttaattgtaaaggatgtctta
aactcgaattaagttgagatagattcctacatattatcaatatttaaaagaatttagaaa
taaccaacttcccattttttattaattttggcgtgcgaaaaatttaactttggggacaat
caaaaaactatagagatatttctatttgaccattacaataatctaaagcaaattagaaag
ggaatgtaaattagagtaaatggtgaatttatagattcacgagcaataatcttcacataa
aaaattcaaaataaaaattcatttactttagaacctgaaacattagtagctccatcaatt
ttgaatggtctagacttttgcagaaggaaatagtttactagagaattttttcaaaaccaa
tgctttggaactactctagaaatgcttagtggtaagattcttcatgattttttttaaaac
attattatggatgtcaaaagctatgattcattatttgaaaatattgaataacttgatgaa
cattaaaaagacttataatagttagtagtggagaatttaccttaatcatttttgcaacca
ataagtcagttatattctaaatatatataagaattttaccatttagagaaaaaaacagta
agagaaatgttaattaatatcattccaaagtgtgttaatacacttagatggatacaataa
tttgtaattaagtagtagccaataagtttaaaataataaaaaagttcggatgtattcaaa
attaaaatcttgaaatgggttagtaacgaataattaatatcatcttcggtttatggatta
aaaggatttatagatgttgtagtgtaagtcgaatttcgtaagaattctaaggaatgttaa
atttgctatattcctatagaattgaaaactggctcaaagaaatagtcatatcatttgtag
gtccaaacttatctactattaatgaataacttttataaatagtagagttagtttggatta
ttattgtacttaaacaagttggaacttgaagttgttacatgtgattaaatggatataaac
gatttattcttttataggaatttatatatatcagaaacttacatgtttgaaaaacctaag
gattgttattctaaacttcctgatttaaaagatgaacttagaagtgaacgggatcttaat
tttaaatgtgagaaatgcgatgataaatctgtttgttatggattacatattttaactgag
taatcagagttaactgtttagaatccatattacgataatattaattaataattgcaatca
aaatcaaaggagtatttaaatgagatgttgaagaatattaggtaagaggaataaaccata
ctcatcccttaagctacatattatatttaagcaacaaagagttgctaaactggaattcaa
gtaacattgtaatccaaaaattattatctcaaataataagctaatgaaattttgaaatag
tgtttttaagataaaacaaagataaatcttttttgtattagaacataaaaaaatgttaag
tacaactttcagaatgcatggctagtttaggggacttagataattaatttaattgaaaat
taaacagatgtggaagaaattgaagtggatgaacaaaattttgattacgccattggtttg
gagattttcttggaatatgaacaaatagactaattaggagatcatttacaaatcaatgat
gaattgattcataaattatactagaagaatccttttaagcattttaaatttatcattttt
gaattggcaactaataaggaaatttattaaaggaaaaaggagatacttatttttggcatg
gaacctaaattcagactggttactgaaatggacgataattaaaaagttgctaatgcaatt
ctcatggaaaagttttagaaaaacttaaatgaattttaaataaaagctattcaattatgt
ttattggctgaagattttgctttgatatcaggtagttatggcaagagaaaaatgttgagt
catttgttgtttttattaggatacacaaataaaaaagtattgtattgtgctgctgatcaa
gaggtcgtagatgattaaattaaagattttgttgatacttttcctaatgaaggttaatgg
gttttgagattgcaaggagaaaaagataaaattccagaacattattagaaatattctttt
tcgtttaaaaattgtaaggatataccagaagttgaaaagaaattagaagataaacaattt
tatttctcatcttgttaatattgtactgatattttgtaatcctaatccttcgattattgc
attgttgattaatcaactaagattatagaaccttaatgcatctcttgcattctcaaaagc
aaagtctttatcttgttagacgataaggaatttgagtagccattaataaaatcataaaaa
gctaagcaattaagaattagtctgttctaaagattattataataatttcaaaatgtgggt
tgctaataacaattagaattttcaatacaagatattgatgacttaatttga
DBGET
integrated database retrieval system
