KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00031221001
Entry
GSPATT00031221001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K10597  ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:2.3.2.27]
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04120  Ubiquitin mediated proteolysis
ptm04141  Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
    GSPATT00031221001
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    GSPATT00031221001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system [BR:ptm04121]
    GSPATT00031221001
Enzymes [BR:ptm01000]
 2. Transferases
  2.3  Acyltransferases
   2.3.2  Aminoacyltransferases
    2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase
     GSPATT00031221001
Ubiquitin system [BR:ptm04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  U-box type E3
   GSPATT00031221001
SSDB
Motif
Pfam: Ufd2P_core U-box
Other DBs
NCBI-GeneID: 5014174
NCBI-ProteinID: XP_001428390
Genoscope: GSPATT00031221001
UniProt: A0BR25
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1066 aa
MGQSQSAQQQQQQQREQPSQPQLSSEERALKYWASKQKEAEKNIQSNVNEEESMNQKETS
SQQQVQQQQHQYQKVNEIEEKEELINHDQSSSQQFIKQEIIQQQVQDEQIEQYFENQVKE
PQNEMIQLTPEEVEHVWLSKIFKIDSNNQVMNDRMVDFIPKDKRITVQYLIDELCYSFLT
CAQFKEQEKFEYIMEVLTNITDVSISDHSDQVNLVWAGNIEKTKYFEILNYVQGQLITCI
LYPEGLEWEKFDEDSNRMDDKRNLRATNFYDRIFNSNQLLFCQQVVSNLLEYLNSKVSAD
DVQKFMDLMFKRELELNANWTLDSLDQPQKTLKLLLIIAEYPNVIEVILLNSWAFGKFKL
IQIGKQFQNYSIIGKILSGSCFYTDSMIVNKFTGDYSSMTILRDRYRTRIFNLNDDVCNL
FTRILKHKSNVLKMNFYNFISTIITLNLNLEKQFNQGLQQQCSSPGMVFNLHYVLLKMFN
PWIDTQDKINSRIKNIQTQMIIVLKEHPLFSTLYQNIDLLAPDLTPLQELQELETRMDPM
TIMFLLSQRINHIVATNIDQFYYNRVLSKLRDIAQQYGQESPQFRDILKLKMSFDAQILH
PKTITNTMQFLSFSSQLALSMVDENDKPKYPYGLLPSSFVYDTHSFFVVYNYNDEILKHS
NELGKCCEFAIFAMNTRNMTNPHLRIKGIELFHIFDQGRMNRRGIVQPQSYDFIFRYNEI
IEKHMIGGILKVFIDCERTGEGNQFYEKFNFRYQFCKLIRFLLEKHRDRYNSLLTQTVEK
EKEMFLAFANYYLNDMIFLLDECLTRMKRMKNLESNQQEFMDNKQEYLKIQQELKTYTIF
LQEYYKNIQVFSEVQPEAFLTDEIRDKLANNLNYTLEQLNGKQAIQYKIQSLESVNFDPK
LIMGNVIELYINFSQNEKFLMQVVKDDRCFSIELFQVTINLLDKHHIIPYERIQQFRDLI
FKLQEYEEKQKIINQLPDDVPDEFLDPLCYSLMTDPVKLPHSNVVLDRLTIKKQLLNQQV
DPFDRTPLTIEMVIEQPELKQRIAKFIENLEKKKNKQQIKIVQEES
NT seq 3201 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggggtaatcttaatctgcctagcaataatagtagtagtagcgagaacaaccatcttaa
ccataacttagctcagaagagagagcgttaaaatattgggctagtaagtagaaggaagct
gagaaaaatatacaatctaatgtaaatgaggaggaatcgatgaatcaaaaggaaacatcc
tcttaataataagtttaacaatagcaacaccaatactagaaagtgaatgaaatcgaggag
aaagaggaattaattaatcacgattaaagtagttcttagcaattcattaaataagaaata
atataataataggtgtaggatgaataaattgaataatatttcgaaaatcaagtgaaagag
ccttaaaatgaaatgattcaattaactcctgaagaagtggagcatgtctggctttcgaaa
atatttaaaattgactcaaataatcaggttatgaatgacagaatggttgactttattcct
aaagataaacgcatcactgtacaatatttgattgacgaattatgctattcatttttgaca
tgcgcctaatttaaagagcaagagaagtttgagtatataatggaagttctcaccaatatt
acagatgtttcaatttcagatcattcagatcaagtcaatttagtttgggctgggaatatt
gagaaaaccaagtatttcgagattctcaattatgtgtaaggacaattaataacttgcatt
ctctatccagaagggttggaatgggagaagtttgacgaggattcaaatagaatggatgat
aaaagaaatttgagagcaactaatttttatgatagaatattcaattcaaaccaattattg
ttttgctaataggttgtgagcaatttactagagtatttgaattcaaaagtcagtgctgat
gatgttcaaaaatttatggatctgatgtttaagagagagctagaacttaatgcgaattgg
actctggattcattggattagccataaaagaccttgaagttattattaataatagcagaa
tatccaaacgtcatcgaagtcattttattgaacagttgggcctttggaaaattcaagtta
atttaaattggtaagcaattctaaaattacagtattattgggaaaatcctaagtggaagt
tgtttctacactgattctatgatagtcaataagtttactggagattacagttcaatgaca
atattgagagataggtacagaacaaggatattcaatttaaatgatgatgtttgcaatcta
ttcactaggatattgaaacacaaatcaaatgtacttaagatgaatttttacaatttcata
tcaactatcattactctgaatctcaacttagagaagtaattcaatcagggattgcaataa
caatgtagctctcctggaatggtgtttaatttacattatgttttacttaaaatgtttaat
ccctggattgatacccaagacaaaataaattcgagaatcaaaaacatctaaacctaaatg
atcattgttctaaaggagcatcccctattttccaccctctactagaatattgatttactt
gccccagacttgacaccactccaagaactttaagaacttgagactagaatggatcccatg
actataatgtttttgctcagttaaagaatcaatcacattgtagccactaacatcgattaa
ttttattacaatagagtcttaagcaaattgagagacattgcccaatagtatggtcaagag
tctccttaatttagagatatcttgaaattaaaaatgtcatttgatgcttaaatcttgcat
cccaagactattacaaatacaatgcaattcctaagtttttcaagccaattggcactgagc
atggtggatgaaaatgataagccaaaatatccttatggtttattaccgtctagttttgtt
tatgatactcactcattctttgtcgtgtacaattataatgatgaaatccttaagcattca
aatgaattagggaaatgttgtgaatttgccatttttgctatgaatactagaaatatgacc
aatccccatctaagaataaaaggcattgaactgttccatattttcgaccaaggcagaatg
aacagaagaggaatagtgcaacctcaatcttatgattttatttttaggtacaatgagatc
attgaaaaacacatgattggtggaatattaaaggtattcattgattgtgaaagaacaggt
gagggtaattagttctatgagaagtttaacttcagataccaattttgtaagttgattaga
tttctactcgagaaacacagggataggtataattcattgttaacttaaactgttgaaaaa
gaaaaggaaatgtttttggcctttgccaattactatttaaatgatatgattttcttattg
gatgagtgtctaacaagaatgaagagaatgaaaaatttagaatcaaattaacaagagttt
atggataataaataagaatacttaaaaatctaataagaattaaaaacctacactattttc
ttataggaatactacaaaaacatttaagttttcagtgaagtccaacctgaggcatttttg
actgatgaaattagagacaaattagctaacaatctaaattacaccttggagcaattgaat
ggtaaataggctattcaatataaaatccaatctttagaatccgtcaattttgatccaaaa
ttaattatgggaaatgtcatagaattgtatatcaatttcagtcaaaatgagaaatttttg
atgcaagttgttaaggatgacaggtgcttttctattgaattgttccaagtgaccatcaat
ttattagacaaacaccatataataccatatgaacgaatttaatagtttagagacttgatt
tttaagctctaagaatatgaagagaaataaaagatcatcaattaattgcctgatgatgtc
cctgatgagtttttagatcctctttgctattccttaatgactgatccagttaaattgcca
cattccaatgtagtccttgataggttaacaataaagaaatagttattaaatcaataggta
gacccattcgatagaactccgttaacaattgagatggttatagagtaacctgaactaaaa
tagagaatcgcaaagtttattgaaaatttggagaagaagaagaacaaataataaataaag
attgtacaagaagaaagttga

DBGET integrated database retrieval system