Paramecium tetraurelia: GSPATT00033210001
Help
Entry
GSPATT00033210001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD_C
UvrD_C_2
AAA_19
TPR_2
AAA_29
TPR_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5016539
NCBI-ProteinID:
XP_001430755
Genoscope:
GSPATT00033210001
UniProt:
A0BXU0
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1451 aa
AA seq
DB search
MKQNQKSQETQTKNYKAKIQNYLNQQKKDSRIKDMTNEKILTQIFLDALSFSDDQQYNST
IFDAIKESVWSYQVKIQILNKIINKNDKILSMVSSMLLILDGYFNFNSKKINLIYVKVPY
VMKYQSFFLLQSNDNFNILFEVGLHKKYNDTKQQICLFDIVQKITFIDIFFYQKGQEITD
AIQEYQINISKDFYRTELDYAECISVPLTGINAKQQSYLFQVQNKSWAESSYLQQSQNLI
QWIPLKFNQLKEKKDDLLFKKGQLIKKSFYEKLSNQFHYEDIGNQNKYKLIQFVDFESVG
QILDLLQKSQAFKIKLSDQEKQIVITKNNALVIGRSGTGKTTSTVLRIFATEMLVKVRSK
FLGQKRIQFLQDYQRKEVEIHSLFSTANRFLVQEVEKYYHKLERQAQEAINKHRDQNTFN
LDESFVSINESVISNYETDLLDFVLQEEQIQNPQIRQNVQSHQNEKQSQTIKFPSFLSSE
QLLILLDKKSNNPFFSIEKINKFRQKHSKKIGFQDFNGINLDEWFPQANNIQSQYQYSSS
SDIQLKQDIIVPEVDFMLFYLYFWPQVCGRGRNNFDNTALPSLIWTQIYSYIKGSQYSYA
YPNRCLPFQLYKERVGNYLSEAQMVEIYDCFLKYEIWKEKEQYIDQLDLINSLLVNIEQN
QLIRFPIHHSYIDEVQDLPQAMIELFCKITEQGIIFCGDSAQSILKGVGFRFSDLQTIFK
TSKKIGANQLEKFQVFQLTKNFRSHNNILQLANCIIIILELLFPNSLDHLQKEISNLKGP
KPLIISQVDPSLILYHLNQQCDAEEQCEIEFGYNQVIIVKNEEAKQTLPQQFKTARVLTT
YQTKGLEFDDVILYNCFSSDPIPEQQWAFLSCIDVEESYVDKQVFEQSITKFDEQNNKYD
VELTEDGQQVVQKKLKLNQRYDKKKMNDYSSLCNELKMLYVCVTRAKKRVIIYDDNPQQR
YPLERILKQYNVCDFTGKQNQIIQIPQKARQVINVPQDNQQEIQQEQRQRQPKIWDDEEI
QIWEQQGQLMFQKKLYDEAKKCFKRCKNERMTVLSKAFLNATKGAQKLANYKSQKIQFKL
NGTLELKKKMDELEQELQKDFRKAAKQFLQIEDVQQAANCYYSGMMYEDSVIQFLNSQLL
PQAAKSAVKLKQFQLAILIYYHLGYYLDALKLLSEINQIKGFQYGFFKYDFLKECLNENI
LQKAEVKYLLLNQFQDLNNNVFYLLVQKYKNKDNTQFDVDKFTETQISQNILDKVPIKDI
FENEINKILNSQIYIDDDLEEMIYEQFKMFWEIYYEIIDSQMIINPHSKQQISAIFQSNQ
QIYQDRQLKSFLIEVFEQLNQHNVLITLYPENRLLYKFFHQQQQIQEFKIDDKEEYNICQ
SLLCNQLSIIQLLFLDDIETLRKTMKHQNQQQKQLYQELNDLIYQRGRIIPDQELLYYKL
LFGNVLQKQQK
NT seq
4356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtaaaaccaaaaaagttaagaaacttaaacaaaaaactacaaagcgaaaatctaa
aattacctaaatcaacaaaaaaaagactcaagaataaaagatatgaccaacgaaaagatc
cttactcaaatattcttggatgctttgagttttagtgatgatcaataatataattccaca
atttttgatgccatcaaagaatctgtttggagttatcaagttaaaatataaattcttaat
aagatcataaataaaaatgataaaatattatccatggtgtcgtctatgttgttgatattg
gatggatactttaatttcaacagtaagaagatcaacttgatctatgtaaaagttccatac
gttatgaaatatcaaagttttttcttacttcaatccaacgataatttcaatatcctattt
gaagttggattacataaaaagtacaacgataccaaacaataaatttgcttatttgatatt
gtccaaaaaataacttttattgacatattcttttatcaaaaaggttaagaaattacagat
gcaatataagaatattaaataaatatttcaaaagatttctatagaactgaattagactat
gcagaatgcataagtgttccattgacaggaatcaatgccaagtagtagagctacttattt
taagtctaaaacaaaagttgggctgaatcatcatatttataataaagttaaaatttaatt
taatggattcctttgaaatttaattagcttaaagagaagaaggatgatcttttatttaaa
aaagggcaactcataaagaaatctttttatgaaaagttatcaaatcaatttcattatgaa
gatattggaaattaaaataaatataagttaatctaatttgtggattttgaatctgttggc
caaatattagatttactttaaaaatcttaagcatttaaaattaaattatcagattaagag
aaataaattgtgattacaaagaataatgctttagttattggtagaagtggaacaggaaaa
actacaagcactgttttaagaatatttgctacagaaatgttggtgaaagtaagaagcaaa
tttcttggttaaaaaagaatataatttttataagattattaaagaaaggaagtggaaatt
cattcattgttttcaacagcaaataggtttctagtttaggaagtagaaaaatattaccat
aaattagaaagataagcttaagaggctataaataaacatagagattaaaacacatttaat
ttagatgaatcatttgtctcaattaatgaaagtgtcatctcaaactatgagactgatctc
ttagattttgttttacaagaggaataaatttaaaatccctagataagataaaatgtctaa
tcacattaaaatgaaaaataatcataaacaatcaagttccctagttttttatcatcagaa
tagcttttaattcttttagataagaaatctaataatccatttttctctattgaaaaaatc
aataaattcagataaaagcatagtaagaaaattggattctaagactttaatggaataaat
ctagatgagtggttcccttaagctaataatatttaatcttagtattaatattcatcttca
agtgatattcaattgaaataagatataattgtgcccgaagttgattttatgttgttttat
ttatatttttggccttaagtctgtggaagaggaagaaataattttgataacactgcactc
ccatcactaatatggacatagatatactcatatattaaaggctcttaatattcatatgca
tatcctaataggtgccttcctttttaattgtataaagaaagagttggaaactatttgagt
gaagcttagatggtagaaatttatgattgctttttaaaatatgagatttggaaagaaaag
gaataatatatcgatcaattagacttaataaattcattattagttaatattgaataaaat
taactaattagatttcctattcaccattcttacatagatgaagtataagatttaccataa
gctatgattgaactattttgtaaaataacagaataagggataatattttgtggtgattca
gcttaaagtattctaaagggagtgggatttagattttccgatttataaactatttttaaa
acttcaaagaagataggggctaaccaattagaaaagttttaagttttctaattaacaaaa
aatttcagatctcataataatatactttaattggcgaattgtataattataatacttgaa
cttttatttcctaatagcttggatcacttataaaaggaaatctcaaatctcaaaggtcca
aagcctctaattatttcataagttgatccctctttaattttatatcatttgaattaacaa
tgcgatgctgaagaacaatgtgaaattgagtttggttataattaagttataatagtaaaa
aatgaagaagccaaacaaactctaccataataatttaaaacagctagagtattaaccact
tactaaacgaaaggattagaatttgatgatgttattctatataactgttttagttctgat
cctattccagaatagcaatgggcctttttatcttgcatagatgtagaagaatcatatgta
gacaagtaagtgtttgaacaatcaatcacaaaattcgatgagcaaaataataaatacgat
gtagaattaacagaagatggacagtaggttgtgtaaaaaaaactaaagctaaattaaaga
tacgataaaaagaaaatgaatgattattcatccctctgtaatgaattgaagatgctatac
gtttgtgttacaagagctaaaaagagagttattatttatgacgataatccataatagaga
tatcctttagaaagaattctaaagcaatacaatgtttgtgattttacaggcaaataaaat
taaattatataaataccataaaaagccaggtaggttattaatgtacctcaagataactaa
taagaaatttaataagaataaagacaaagataaccaaaaatatgggatgatgaagaaata
taaatttgggaataataagggcagttgatgttttaaaaaaaactttatgacgaagctaag
aaatgttttaagagatgtaaaaatgaaagaatgactgtattatcgaaagcgttcctaaat
gcaactaaaggggcttaaaaattagccaattataaatcataaaaaatctaatttaaatta
aatggaaccttagaacttaaaaaaaaaatggatgaattagaataagaattacaaaaagat
tttcgaaaagcagccaaataatttttacaaatagaagatgtttaataagcagctaattgt
tattactcaggtatgatgtatgaagatagtgttatttagtttttaaattcacaattatta
ccataagctgcaaaaagtgcagtcaaattaaaataattttagcttgcaattttaatttat
tatcatctcggctattatttagatgcactaaaattactttcagaaattaactaaataaag
ggtttccaatatggatttttcaaatatgatttccttaaggaatgcttaaacgaaaatatt
ttataaaaagctgaagttaaataccttctcttaaattaattttaggatttaaataacaat
gttttctatttattagtttagaaatataaaaacaaagataatacttagtttgatgtggat
aaatttacagaaacatagatatcataaaacattttggataaggttcctataaaagacatt
tttgagaatgaaataaataagatacttaattcataaatttacatagatgatgatttagaa
gaaatgatttatgaataatttaaaatgttttgggaaatttattatgagataattgattca
taaatgataataaatccacactcaaaataataaatttcagcaatcttttaatcaaattaa
taaatatattaagatagataattgaaatcatttttgattgaagtcttcgaataattgaat
taacataatgtattaattactttatatccagaaaatagattactttataaattttttcat
caacaacaacaaatttaggaatttaaaattgatgataaagaagagtacaatatctgctaa
tcattattatgcaattagttgtcaattatatagctgttatttttagatgatattgaaact
ttaaggaaaactatgaaacactaaaatcaataataaaaacaattatatcaagaacttaat
gatttaatatattaaagaggaagaattattcctgattaggagttactatattataaacta
ttattcggaaatgtactataaaaataataaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
