Paramecium tetraurelia: GSPATT00035790001 Help Entry GSPATT00035790001 CDS       T01055                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K19525   vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C Organism ptm  Paramecium tetraurelia Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]     GSPATT00035790001 Membrane trafficking [BR:ptm04131]  Endosome - Golgi transport   Rab GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     GSPATT00035790001 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  VPS13_N VPS13_VAB VPS13_C PH PH-GRAM_MTMR6-like Motif Other DBs NCBI-GeneID:  5019842 NCBI-ProteinID:  XP_001434057 Genoscope:  GSPATT00035790001 UniProt:  A0C793 LinkDB All DBs Position undetermined AA seq 3345 aa AA seqDB search MFEKQLEKILNWVLGKFIDGFDAQNLHIGIWSGEVTIQNVALKPDIIKMLELPIKLCFSH VGKLKLNVPWKSLTSSPVEVVLSDLYLIISLDHPDHWQFMDYSGFIKKMEILEKFKEQIV KSISENSKQQNDKDDGYFMKVVFKIIDNIQLSVTNIHIRFEDTIRNEFAWGISLKSVETF TCNSEWKKQYFDRTKEENKKVPLQKLLTLINIGVYWNQQEKELFNSLEKDEILKKMAELV ISQQDPKDHPKFAQFMLLLNASGRYYQNTSGKFDSPEYSFTLELNTIDLAIENSQLQQLI KMAELFSLYQNRLNKQKKQKLLLTKQQIEDQILIFQNLYEKILRSSEQTNKALTKNENDL FEQSVSNLSIDILCESAREIIKVVEKERAIKEAEDKKKKKGGWFSWGSKKDNTLIDEQEK DELFKFIDKLADFPDVKDLKRPPEYVKFAAKFSLKSGTIHVLKQFEAKREGVQLKYFGFE GQLEIKESGMILNLGLNNIGIDLVTEPIINNVVMYSQQTRKVFVEQVNKQKFIDFTFETN PVHHKGVDKYIKLETGSLKLVFNPIILVRIQQFIDFQIKDETLKNAAWDQVEYAQDLAVN QMAKTQLSSSILFVDVKVKSTIVLVPIPDTNENWLLNLGDISIVTPNMNEINYDKFEITL QDFTFKHYKSFQECQKSITNGAYLNNIDDSFSVIQNIKVSIIAKLLRGSSKPPKELAQIS VDGVLPQLNVFVNPLIYNRIIKVGDCFIAPITEPEEAMLRQSRLTIEKAQTERTALVETA TKVGKIWKRGQQLKWSQYTGVLSGGYIYLFAKPKDEQAESFFWVRNSDFEDVPQEEAGMS NAFYIKNKYGDTLVAFDKQKMANDWKEAIEEMRTQLKAEKNIEHVHTHSNTSMSKESRPL NLKFELSGFCLHLQDEKLSDWLQVVISGLSAGTSILDGSIDLDLKLRDLYVIDSVQNYLN PLFKYIVKSDPDPESNELININVQQINKKDKRYNKKNLIVQVTFGTLCLIAKPLVIARLL LFVTPADQQNQMKGYEEMDQAKRKIEQTKKELEGAAQTVKLDKMQDVILMDVNVKIRIHR FTILPLAEIKIENTEIGLIKYVDELQLNGTLGNLQLFDLTNYPNTLSQESEYDQIQPKQM VGVKLQQQSLLKMNLTLFSDGSSKIFNNVNIIIDVEMSQLIIHVMMQPVLRLLDYTLQQL LYALQNPKQTISPNSNLIQLEEESIEQYQYQRTQYARQTIKLSEEEASVLQKLLKNPPGM KLNVKIHNPQVILKPNQNSNSAMIIDLGTIFVSNKRIQETNRVIGQGSEPVWVEQFILNM KDIQIYQQNEQTKREFSLPFDFNINVEIFTLAEKYALNYPKLKFDEQLKINCFVAPMILQ MTHSDYMFLMKCLFHNIAYDDGFDNMIRINNPEYFKAFFAQQDLQQIKLKEMLRQQNENP QINFQLDIENFTIFLLKDIQPKPTPFQRMTLILMRITFQKCNNGSMKVNLLIRDMEGSMF QGDQSLQEFHELPFIGNMNFHQKYTYEQVTNLNGLVRGKQGAQSNADQSMILASTGQLSQ RTKRDQIFRFEDAFEQQNDGNIQYKLMFSLIMNLNGDKLINVELSDFKLQLHAGPLFEVL QLIAMDDPDLNAKPGKFVNIQLQQQLQQQQQQYGVLQIKVNLRNVITCVPSQVESNVLAI RGIFEITLKMYPQRTQKQVQAEIMEKNIPEKDWNKLNIVMSINAKLQRIEIFLCKSYDLG KKDDFKQVKKREILQPADIEVTIIKAAVYYANSTEFGDDIDIVCRITPINLKVSFKDLLT IQTGLTYQLSQMPKQIPAANNEQMKNNELSKLDTSHLDKISMNSMRIDLEIEKTKVVVLN DMGNTFAPLFDLQVDLIKILLQKKPILTEISILIPFEFKNFNPLTSKWEPIIEKIEFQII YLSSLLGETKNLITIEQLKEDASFNLNISSICIQTVLKVLKIMNKIFKKSNAREQRSMSK SSLTSENEASEVLIQESPYAIRNLTGRALQVEYIDKNNQSPLNVPVNQQLNLVYDEEMEQ MNSNKIRRVNVNIKLDKTTFPLKYIDLDKTRGKLYEHQNLQVYGIVKLDQVTSQKILIVS SPIIIVNKTSKSIVIQISDDKNQQIFKLQPLINELDLTNVVPVPVGFDNSKFCLKVDNCP QFSEEIKIDALIRNSAVGQPQAIHTRDGIYIQLKVYLDKEYKDKVKIEFQAPYRITNSLP KEIYVQMLNQRKETTYIKKIQPKETMEDYMHSLSSIENKNNTYIRVLLQGFYWSSEYQLS SPLIEEGQKNKNDYLGKLQLVDGIDNQLSLLIFEPWRQSDYNKATREFVIHSTGYIINKS GMDLQYYTSEKKKNLAPIAGQNPINSGDSIDRNIIFIGQECGNILQLSHSSAPQKISQFP IQISSSIGEPFIDVIRVDEEDSSRFLQTYLGAKLDLKVCNNKYTLFSKVITIEPRFILVN NTDKELIIHDLDGTYHQIIQPNQRAISQVKYNVKQKDPFDFQYITMNLNEYTYHPSGRIN ICCVGIVNFQLRKTQNSQEKLYFSCDIRKEGCSLYVIFSQLSLDQAPYKIELEAEALELV IQELKVTLRQDNQVAYFASDDPQQTSRILNVELRVADDPYNDFTPFKYKLNPDIIGVFKI YTFKPKKGSMANPISVALTIMPQGNQKHVKVAIATQEQITLYQSKPKQDFLKQVKEKENL GIEMNEDSIRQSYSLQQSRQSQQQDGDKILTRINLKINAFSLSVIHNSQMKKRPAEYFHF LCKNIEFVVISTDISQVVQLRVQYINFDHNAQFFVQFPVILTPQKYSIYQPTQIQQQQQQ QQQQQQQQQEAVKQFQQSEKYFFNFLIMKDNRVTSINLFQNVTLEIDPFEVKIEQLFINN CLDFIWAITSYQGLINDYNKTQSEILMKQKQSDTQSLQEKQQSSNSQAQIESVYLVNEEW KTKQLPKAQLPTYISEIIISPIAINVTFQMTGKGDLKLKQSALFSSIAQALGVALTDVSD APIVISGWQLENCFDTIPGILKKMQEFYLAAGLKQLGKLIGSLSIIGFKDFIDKPAAGLT QGPLEAGLGLAQGAGSLVSHTILGAINSVNKIAGSVSGGLANLAMDENYLRKREKMKMQK PKHIGEGLGQGAQSIMTGITDGIAGVFLKPIQETKEKGLKGVFTGTAKGFAGLIIKPITG VLDGFSQTAAGIQNTVQYFEDKPNNNRSRNIRPVYGYEGYITDFVSLDAEAYATLQFIRR GQLINNRFVASYFLNSEQDGYCMLVLTIEHFIYMSVKTKKKVWILASNEITHLEIVPSGL KIQVNKPQKQLKNKYITQLVLGEDLKYDIFQTMQSIWDSVKVNKN NT seq 10038 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtttgaaaaataactcgaaaaaatattgaattgggttttgggaaaatttatcgatgga tttgacgcataaaaccttcatattggaatatggagtggagaagttaccatataaaatgtt gcattgaaacctgatatcattaaaatgcttgaattacctatcaaactgtgttttagccat gtaggaaaattgaagctaaatgtaccatggaaatctttaactagttcgccagttgaagtt gttttatctgatttatatctgataatttctttagatcatccagatcactggtaatttatg gattactcaggtttcataaagaaaatggagattcttgaaaaatttaaggaataaatagtt aaaagcatttcagaaaattcaaagtagtaaaatgataaggatgatgggtatttcatgaag gtagtgtttaaaataattgataatatataattaagcgtaacgaatatacatataagattt gaggatacaataaggaatgaatttgcatggggaatatcactaaaatcagtagagaccttc acctgcaattcagaatggaaaaaacaatacttcgatagaacaaaagaagagaataaaaaa gtgcctctataaaaattgttaacattaattaatattggagtatactggaattaataagaa aaagagttattcaattccttagagaaggatgaaatattaaaaaagatggcagaattagta atatctcaataagatccaaaagatcatccaaagtttgcttaatttatgttattacttaat gcttcaggtagatattattagaatacatctggcaaatttgattctcctgaatactcattt acccttgaattgaatacaattgatttggcaatagaaaattcataactctaatagttgata aaaatggcagaactattctcattatattaaaatagattaaataaatagaagaaatagaag ttattgttgacaaagcaataaattgaagattaaatattaatcttttaaaatttatatgaa aaaatattaagaagttctgagcaaacaaataaggccttgacaaagaatgaaaatgatctt tttgaacaatctgttagtaatttaagtattgatattctgtgtgaatctgcaagagagata ataaaagtagttgaaaaagaaagagcaataaaggaagctgaggataaaaagaaaaagaaa ggaggttggtttagttggggttcaaaaaaggataataccttaatagatgaataagaaaag gatgaactatttaagtttattgataaattagctgatttcccagacgtaaaggatttgaaa agaccaccagagtatgttaaatttgcagctaaattctctttaaagtctggaacaattcat gtgttgaaatagtttgaagcaaaaagagaaggagtacaattaaaatattttggatttgaa ggttagttagaaattaaagaaagtggaatgattctaaatttaggattaaataatattgga attgatcttgtaactgagccgattataaataatgtagtgatgtactctcaacaaactaga aaagtattcgtcgagtaagtgaacaaatagaaatttatagattttacttttgaaaccaat ccagtacatcataaaggagtagataaatatatcaaattagaaacaggatctcttaaattg gtatttaatccaatcattttggttcgaattcaataatttattgatttttaaataaaggat gaaacattgaaaaatgcagcttgggattaagtagagtatgcttaagatttagcagtcaat taaatggctaaaacacaattatcatcatctattttatttgtggatgtgaaggtaaaatcc acgatagttttggttccaatccctgatacaaatgaaaattggttattgaatttaggagat atttcgattgttactccaaatatgaatgaaattaattatgataagtttgagattacatta caagatttcacatttaagcattataaatcattttaagagtgctagaaatctatcactaat ggagcatacttaaataatattgatgattcttttagtgtaatttaaaatatcaaagtgtct attattgccaaacttttgagaggcagttcaaaacctcccaaggaattggcataaatttca gtggatggtgtgcttccttaattgaatgtctttgtcaatccattaatatataatcgaatc atcaaggtgggtgattgttttattgcaccaattacagaacctgaagaggcaatgcttaga taatctagattgactattgagaaggcctaaactgaaagaactgctttggttgagacagct actaaagttggtaagatttggaaaagggggtaatagttgaaatggtcttaatatactgga gtattaagtgggggttacatctatctatttgctaagcctaaggacgaataggcagaatcc ttcttttgggttaggaatagtgatttcgaagatgtgccctaagaggaagcagggatgagt aatgcattctatataaagaataaatatggagacacattagtagcatttgataaacaaaag atggccaatgattggaaggaggccattgaagaaatgagaacataattgaaggctgagaaa aatattgaacatgtacatacacatagtaatacaagtatgagtaaagagagtcgaccatta aatttgaaatttgaattatctggattctgtttacatttacaagacgaaaaattaagtgat tggttataagtagtaattagtggtttgagtgctggtacatcaatactagatggatcgatc gatttggatttgaaattaagagatctttacgtaatagatagtgtgtaaaattatttgaat ccattatttaagtatattgtgaaatcggatccagatccagaatcaaacgaattaataaac attaatgttcaatagattaataaaaaggataagagatacaataaaaagaatctgatcgtc taagttacttttggtactttatgtttaattgccaaacctttagtaattgcgagactactc ttatttgttactccagcagattaatagaattagatgaaaggttatgaagaaatggatcaa gcaaagaggaagatagagtagaccaaaaaggaattagaaggtgcagcatagactgtgaaa ttagataaaatgtaagacgtaattttgatggatgtcaatgttaaaataagaatacacaga ttcactattttaccattggctgaaatcaagatagagaacactgaaataggactcattaaa tatgttgatgaattacaattgaatggcacattggggaatctacaactttttgatctaacc aattatccaaacactcttagttaggaatctgaatatgatcaaatctaacctaaataaatg gttggagtcaaactacaataatagtcattattaaaaatgaatttaaccttgttctcagat ggctcatccaagatatttaataatgttaatatcatcatcgatgtagaaatgagttaatta attatacatgtaatgatgtaaccagtcttgagattattagattacactctctaataattg ctttacgctctacaaaatccaaagtaaaccatatctcccaattcaaatttaatctaatta gaagaagaatctatcgaataatattaatattaaagaacccaatatgctagataaactatc aaattgtcagaggaagaagcatctgtcctataaaaattattaaaaaatccaccaggaatg aaattaaatgttaaaattcacaatccttaagtgatacttaaaccaaactaaaattcaaat tccgctatgatcattgatttgggaaccatatttgtatcaaataaaagaatctaagaaaca aacagagtaattggttaaggatccgaacctgtttgggtagaataatttatattaaatatg aaggatatctaaatttattaataaaacgaataaactaaaagggaattcagtttaccattt gattttaatataaacgttgaaatatttacacttgctgagaaatatgctttgaattatcct aaattgaaatttgatgaataattaaagatcaattgttttgttgctccaatgattttgtaa atgacccattctgactacatgttcttaatgaaatgtctatttcacaatattgcatatgat gatggatttgataacatgataagaattaacaatccggaatattttaaagccttctttgca taataggatttgtaatagattaaattaaaagaaatgcttagatagtaaaatgagaatcca taaatcaatttctaattagatatcgagaactttactatatttttactaaaagatatttaa ccaaaaccaactcccttttaaagaatgactttgattttaatgagaataacattttaaaag tgtaataatggatcaatgaaagtcaatctattgataagagatatggagggcagcatgttt taaggggattaatccttacaagaatttcatgaattgccttttattggtaatatgaatttt cattaaaaatatacttatgaacaagtaaccaatttaaatggtttagtaagaggaaaacaa ggagcataaagtaatgcagatcaatcaatgattttggcaagtactggttaacttagttaa aggacgaagagagattaaatttttaggtttgaggatgcctttgaataatagaatgatggc aatattcaatacaaattgatgttttcattaataatgaatcttaacggagataaattaatt aatgttgaattgtctgattttaagttgtaattacatgctggccctctatttgaagtactt taattaatagctatggatgatccagacttaaatgcaaaaccaggaaaatttgttaatatt taattataataataactataatagtaataataatagtatggggtattgtaaataaaagta aacttaaggaatgtaatcacttgtgtcccatcgtaagttgaatctaatgtcttagctatt cgtgggatatttgagattactttgaaaatgtatccataaagaacttagaaataagtttaa gcagaaattatggaaaagaatatcccagaaaaagattggaacaaattgaatattgttatg tcaataaatgctaaattataaaggatagaaatcttcctatgtaaaagctatgatttagga aagaaggatgattttaagtaagttaaaaaaagagaaattttgtaacctgctgacattgaa gtaacgataatcaaggccgctgtgtactatgcaaattcaacagagtttggagatgatatt gatattgtttgtagaatcactccaatcaatttaaaagtttcctttaaagacttactcact atccaaactggtttaacatattaactgagctagatgccaaaataaatccctgccgctaat aatgagcaaatgaaaaataatgaattgtctaaattggacacttctcatcttgataaaata tcaatgaattcaatgagaatagatttggaaattgaaaaaacaaaagtagtagtattaaat gatatgggcaacacctttgctccattattcgatttataagtagatctaatcaaaattcta ttacaaaagaaacctattcttactgaaattagtattttaatcccctttgagtttaagaat tttaatcctcttacctctaaatgggaaccaatcattgagaaaatagaatttcaaataatt tacttatctagtttgttgggtgaaactaaaaacctaatcacaatagaacaattaaaggag gatgcatcttttaatcttaatatatcttcaatctgtatttagactgttctcaaggtgctg aaaattatgaataagatctttaagaagtcaaatgctagagaatagagaagcatgtcaaaa tcatcgttaacgtctgagaatgaggcgagtgaagtactcatttaagaatcaccatatgca ataagaaatttaacagggagagctcttcaagttgagtatattgataaaaataattaatca cctttgaatgtacctgtaaatcaataattaaatttggtgtatgacgaagaaatggaatag atgaatagtaataaaataagaagagtaaatgtaaacattaaattggataagacgacattt ccattgaaatatattgatttagacaagactagaggaaagctttacgagcatcaaaatcta caagtctatggtatagtcaaattagactaagtaacaagttagaagatactaatagtttca tctccaattataattgtaaataaaacaagcaaatctatagtcatacaaattagtgatgat aaaaactaataaatatttaaattatagccattgatcaatgaattagatttaacaaatgtt gtacctgtgccagttggatttgataattctaaattttgtttaaaggttgataattgtcca caattttcagaagaaataaaaattgatgctttaattagaaattcagctgtaggatagcca taagcaatacatacaagagatggaatttatattcaactgaaagtatatttagataaggaa tacaaagataaagttaaaatagaatttcaagcaccttatagaataacaaactcattgcca aaagaaatttacgttcaaatgttaaatcaaagaaaagaaacaacatatatcaagaaaata taaccaaaggaaaccatggaagattatatgcatagtctatctagtattgaaaacaaaaac aacacttacattagagtattattgtaaggcttttattggtcaagtgagtatcaactatca tcaccattaattgaggaaggataaaagaacaaaaatgattatttgggaaaattataatta gttgatggaatagataatcaattatcattattaatctttgagccttggcgataatcagac tataataaagcaacaagagagtttgtaattcatagtactggctatataataaataaaagt ggaatggatttgtaatattatacatctgaaaaaaagaagaacttagcaccaattgcagga tagaatccaatcaattcaggagattcaatagatagaaatataatcttcattggataagag tgtggaaacatattgcagttgtctcattcatctgctcctcaaaaaatatcataattccca atttaaatatcatctagtattggtgaaccattcattgatgtcattagggtagatgaagag gattctagtagatttctttaaacatatctaggagctaaactggatttgaaggtttgtaat aacaaatacactcttttttcaaaggtgataacaatagagcctagatttatattggtaaat aacactgataaagaattgataatacacgatctcgatggaacttatcattaaattatttaa cctaatcaaagagccatttcctaagttaaatataatgtcaagcagaaagatccatttgat ttccaatatataacaatgaatctaaatgaatatacctatcatccaagtggcagaatcaat atatgctgcgttggtatagtaaattttcaattgagaaaaactcaaaactcttaagagaaa ttatattttagttgtgacattagaaaagaaggatgcagtttatatgtcatctttagttaa ctctctctcgattaagcaccatataaaatagaacttgaagctgaagcattagaattagta atttaagagttgaaagtcactctcagataagataattaagttgcctactttgcttctgat gatccttaataaaccagtaggattttgaatgtagaattgagagttgcagatgatccttat aatgattttaccccctttaaatataaacttaatccagatatcattggtgtatttaagatc tacacttttaaacctaaaaaaggatctatggctaatcctatttctgttgctttgactatc atgccttaaggtaatcagaaacatgttaaagtggccatagccacataggaataaataaca ctctatcaatcaaaaccaaaataggacttcttaaagtaagtcaaagagaaggaaaatctt ggaatagaaatgaatgaagactccataagataatcgtattcgctatagtaatcacgtcaa tctcaataataagatggtgataaaatcttgacgagaataaatcttaagattaatgcattt tcattatctgttattcataattctcaaatgaaaaagagaccagcagaatactttcacttt ttatgtaaaaatatagaatttgttgttatctcaacagatattagttaagttgtttaattg agagtacaatatataaattttgatcataacgcataattttttgttcaatttcctgttatt ttaacaccttaaaaatattcaatatattaaccaacttaaatctaataataataataacaa taataataatagtaatagtaataataggaagctgtcaaataattttaatagagcgaaaaa tactttttcaacttcttgatcatgaaggataatagagttacatcaatcaacttattttaa aatgtcactttggaaatagatccatttgaagttaaaatagaatagctattcattaataat tgcttagattttatttgggctataacatcgtattaaggattaataaatgattataataaa acctaatcagaaattttaatgaaataaaaataatcagatactcaatcattataagaaaag taatagagtagcaatagtcaagcataaattgaatcagtttacttagtgaatgaagagtgg aaaactaagtaattaccaaaagcataattaccaacttatatcagtgaaatcatcatatcc ccaatagccataaatgtcactttctaaatgacaggcaaaggagatctaaaactaaaatag tctgccttattttcatccatagcctaagctttgggagttgcattaacagatgtaagtgat gcaccaattgttatttcaggatggcaactcgagaattgtttcgatacaattccaggaata cttaagaaaatgtaggaattttatcttgctgcaggtttgaagtaactaggcaaattaatt ggaagcttatcaattataggctttaaagatttcattgataagccagctgcaggattaact taaggtcctttagaagctggtttgggattagcctaaggagctggatcattagtatctcat actatattaggagcaataaactcagttaacaaaatagctgggagtgtaagtggaggtttg gcaaatttggctatggatgaaaattatttaagaaagagagaaaagatgaagatgtagaaa ccaaagcatattggcgaaggtctaggataaggagcccaatcaataatgacaggaataaca gatggaattgctggagtattcttgaaacccatataagaaaccaaagaaaagggtttgaaa ggagtctttactggaacagctaaaggatttgctggactcatcataaaaccaataactggg gttttagatggattctcgtaaacagcagctggaattcaaaatacagttcaatattttgaa gataaacctaataataatagatctagaaatatcagacctgtttatggatatgagggatat attactgatttcgtttcacttgatgccgaagcctatgctactctttagttcatacgtagg ggctaattaataaacaatagatttgtagcatcctactttttgaattccgaacaggatggt tattgcatgctagtcttgactattgagcattttatatacatgtcagtaaagactaagaag aaagtttggatattggcctcaaatgaaattactcatttagagatcgttccttcaggactc aagatttaagtgaacaaaccttaaaaacaattgaaaaacaaatacattacttaattagtc ttaggagaagacttgaaatatgatatcttttagactatgtagagcatatgggattcggta aaggtaaataaaaattga

DBGET integrated database retrieval system