Paramecium tetraurelia: GSPATT00038263001
Help
Entry
GSPATT00038263001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K02156
aubergine
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
GSPATT00038263001
Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
GSPATT00038263001
piRNA pathway
GSPATT00038263001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Piwi
PAZ
ArgoN
THF_DHG_CYH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5023000
NCBI-ProteinID:
XP_001437215
Genoscope:
GSPATT00038263001
UniProt:
Q3SD95
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
774 aa
AA seq
DB search
MQQKTNTICQLPLRPQRRANLDKDFRIKTVESNHFELQFLKDVILHIYSFAIQPEPPLDS
EKEIRKQFNEFKDEIQKEGIKRYCITGMNLWSYELRKNAIHLEKVMNKEKKMILDIKYVK
TINLKEMAQFDDQSSINVTKQAINAILKQLYESRNMKELFGKGKFYESKMNEEKNLQKNY
NIGYMKGFRSAFCSGQSSPLLQIDYSVKLINTYPISRIISDMEWNYDKHELQLQIRKKLI
GQSGLAKYSNRFYRIDDIDFSRNPQSMMEDGKTTYRLYYQQRYNITINDISQPLLVHQTK
KGQKIRLIPELMMLTGLSQAQKTNTNIKKFLRPILIVNQNERQQRIMDERGELEYLMKQQ
NIVLKSNSKTQAYEIRKPEIYAEGIINSFPGGCFEIKNKFYQQSKLENWVLIYNDQEEQL
ANYFLRQLISSGNRYGLILSQPLRQKVKSDQSQDWISCLEQNFSEKGRPKLVVSLIDQEK
DKQIYQQLKQYLIAEEGVSHQNVTLQLIENQKFGAIVPKIIQQIHSKLGNQTWNIQKIQE
ISDNIMIVGIDVYHKTVLGLDSCVGFNAQFGQQGYANFTKTIIVRKGKEINKDVAMLLEQ
SLEEYQNYNKKLPDTIIIFRDGVGTSQINRLYQEEVETMKEIINNKYNLKLPEFAFIMVN
KRINDRFFSQSKENFGMIVADRVVSSHFDYFLIAQQVNQGTATPTHYTVLENSTKWNEDL
FWKFTFYQCFNYRNWCGPVKIPACVQNAHTAAYRVGEVIKTNASYYLETKLFFL
NT seq
2325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatagaaaacaaatacaatttgttaattacccttaaggccgtaaagaagagcaaat
ctagacaaagattttaggattaagactgttgagtctaatcattttgaactttaattttta
aaggacgtgatacttcatatttacagttttgcaatctaacctgaacctcctttggattca
gaaaaggaaattagaaaataatttaatgaatttaaagatgaaattcaaaaggaaggaatt
aaaaggtattgtatcacaggaatgaatctttggagctatgaattgagaaagaatgccatt
catttagaaaaagttatgaataaagaaaagaagatgatactcgacatcaaatatgttaaa
acaattaatttaaaagagatggcctagtttgatgattaatcatcaataaatgtaaccaaa
taagctatcaatgctatacttaagtagctttatgaatctagaaacatgaaagagttgttt
ggaaaaggtaaattttatgaatccaaaatgaatgaagaaaaaaacctctaaaaaaattac
aatattggctacatgaaaggtttcaggagtgcattttgcagcggacaatcatctcctcta
ctttaaatagattatagcgtaaagttaatcaatacatatcccatatctagaataatttca
gatatggaatggaactatgataaacatgaattataactacaaataagaaaaaaattaatt
ggataatctgggcttgctaaatattcgaatcgattctatagaattgatgatatagatttt
tctagaaatccataatccatgatggaagatggaaaaactacataccgtttatattattaa
taaagatacaatattactataaatgatatatcctaacctttattggtccatcagactaaa
aagggataaaaaataagattgattcctgaattaatgatgttaactggattatcataagca
caaaaaactaatactaacatcaaaaaattccttaggcctatattaattgtgaattaaaac
gaaagataataaaggattatggatgagagaggtgaattagagtatttgatgaagtaataa
aatatagttctcaaatctaattctaaaacataagcctatgaaataaggaagccagaaata
tatgctgaaggaataataaatagttttcctggtggatgctttgagataaaaaataaattt
tattaataaagtaaattagaaaattgggttttaatatataatgattaagaagaacagttg
gcaaattattttttaagataactaatatcaagtggaaatcgttatggattaatcttatca
caacctcttcgttaaaaggttaaaagtgatcaaagctaagattggatatcatgccttgaa
taaaatttttcagagaaaggaaggccaaaattggtagtttcattaatagatcaagaaaaa
gataaatagatttatcaacaattaaaatagtatttaattgctgaggaaggcgtatctcat
caaaatgtcactctataattgattgaaaattaaaaatttggtgcaatagttcctaaaata
atccaataaatacatagcaaattaggaaattaaacgtggaatatataaaagatataagag
atctcagataatattatgattgttggaattgatgtttatcataaaacagttttaggattg
gattcttgcgttggattcaatgcttaatttggatagtaaggttatgctaatttcactaaa
actataattgtaagaaaaggaaaagaaatcaataaagatgtagctatgttactagaacaa
agtttagaagaatattagaattataataaaaaattacctgatacaattataatttttaga
gatggagtagggacttcatagataaatagattatattaagaggaggtagaaactatgaaa
gagattattaataataaatataatttaaaattaccagaatttgcatttataatggtgaat
aagagaataaatgataggttcttttcataatcaaaagagaattttggaatgattgttgca
gatagagttgtctcttctcattttgattatttcttgattgcataataagttaattaagga
acagcaactcctacacattatacagttttggaaaattcaactaaatggaatgaagattta
ttttggaaattcacattttatcaatgtttcaattacagaaactggtgtggaccagttaaa
ataccagcttgtgttcagaacgcccatactgctgcgtatagagttggcgaggttatcaaa
accaacgcaagttattatttggaaacgaaattatttttcttatga
DBGET
integrated database retrieval system