KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00038568001
Entry
GSPATT00038568001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K03348  anaphase-promoting complex subunit 1
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04120  Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    GSPATT00038568001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system [BR:ptm04121]
    GSPATT00038568001
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
    GSPATT00038568001
Ubiquitin system [BR:ptm04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Multi subunit type E3
   APC/C
    Other subunits
     GSPATT00038568001
Chromosome and associated proteins [BR:ptm03036]
 Eukaryotic type
  Sister chromatid separation proteins
   APC/C complex
    GSPATT00038568001
SSDB
Motif
Pfam: PC_rep DUF4853
Other DBs
NCBI-GeneID: 5023646
NCBI-ProteinID: XP_001437861
Genoscope: GSPATT00038568001
UniProt: A0CI47
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1594 aa
MSQQSCFFNEITSIEKIQEESIYQQSQSNTQYYVNQSDKSINFLSKGGNQFFLPLDVEIN
QVFPLSEGLLLGWGRDEFNYSIVLNHPLASITTLGTYNSTLGTIEPWIHMQEEIIYAHKI
LPILITYNSQLMRHCVYILKVDDKQEVQNYNLTEKTDCQIISELYYEENIKEEKAKQCEI
IRSNVDGELLICLLSDHTIRILEMNFQEENKSKNIFNSLKVVQTIQKVSQIQVFNMIDSI
CAETISIKKEKLKYQNNQFEYVAYQIINHNNIPSNLLILHTNSTFTLLSGSKILLNYQIN
EQINDISQFNCAPVITEPLIQTILHSLKIALDTQQYICLFKDVIINCLQNQNLKLEMSKN
NIDNEFMRFTYLMLCYLKLSSNKKDCEDQIQKKIKSNTPSVQQSPMKESSKAFQQLLKSN
YHKENSSYDSNSQYCHQQQQQQQSLSFIYHMTMEMFNEIQDKILYVLHLLYQELLLSDEK
QANKLLVLLYYYSLNMDNEVAINYSDYYLRINPSLQSMYQNDNFISLLPTIRSLTLLGQP
QQQNKQKILPQNPIDLNKWLSSLLMNNPISFPILFKRTKQLCIIMQSILKKQLIHISSIL
QCEVQDFQILYQVQKTQLFFQKVLNQKLQIKYIQQKKNKLEMLTKLRGPSLMLYLCSEKR
WNRDIINKLPLQFKIVILEIITLLRNNFPNDLMGQITKDSYLLIDRMDIYLNCKLYIQNP
VECEFKKYVNSILSGQIKSLQNEDDHDIQYDQHLMQQVKRQFDFTRDIRIKTKMTEHIPE
ERLDQDAPSVLLKLLNRKLAMFVGLGSLTYGTSDHFITDQIKFPSLNLSGILQQNSLKLT
IDSTREDYTQMTQWPEFHLGVTLSLQLSKKLKGLSQESLRTWIFYQKPQNPSNIHGGFML
GLGLLGYLNSFNQIDLYQLLTQNHEATSVGVLLGIGASRIGTCDEPTQKSLTVHIPSLIP
SVYDLELPSNVSTSALCSLGFLFMASGNRNFTEVALGLIGRKPHNDKVIDREGYSLAAGI
ALGLINLGKGSVWRRELQIVDRLIRFVQGGKVLPPPQSSLSTNFMQNESVSSSIREGNMV
NVHVTCPAALMALSLMFMQMNQQNIVDQLNIPNSFSSLESCNPNHIILKSLTRNIIMWDS
IPTTQADLHSQIPELISFLFEQPLKKIHQKFYLVYNVEVIDFMSVSMIYTGMISGALLAM
GIKYAGTHDQQVKQLMIKQIEFLIKLRISQNEFANDPDNKCAIDQYTYYTNIVNALQGLS
LLMAGSFDQEVLTIAKSLIQKMENSQIWHFGFHQGIKMAIGFVFMGKGGYSFKKSKKAIS
MLLLSLYPYYPTNPGDNKQYLQALRWSYVLSIRPKIFKIIDVKTHKTANLQIKNEIFSDP
NYCQSNFSFTNKAIQTIYVQSKVLSQNNQDLLNPNNTLNHIDTLLLIGDMQTIDSKLDGL
YEYKFIKNLKEKQYFLKLLQHDQSNFIQILASLFNTNKYAHIPILGLFYKLYQNKLVLSQ
EVIDQLTPTISVTNQELNKYINQDFKNMQFSLVSHKVYSFLSIYNLPYLHDIKQIVKVAK
QIPLQMLEFYLYKSFEDIQQQKLKQLAHSILLNQ
NT seq 4785 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagttaataaagctgtttcttcaacgaaatcacgtccattgaaaagatttaggaagaa
tccatttattagcaaagccaatctaatacccaatattatgtaaatcaatcagacaaatca
attaattttttatcgaaaggagggaattaattctttttacctttggatgttgaaataaac
taagtatttccattatctgaaggtctcttgctaggttggggtagggatgaatttaattac
tctatagtattaaatcatcctctagcctctattacaacattaggaacttataatagcaca
ttagggactattgagccttggatacatatgcaagaagaaattatttatgcccataaaatt
ctgccaatattgataacctataattcttaattgatgaggcattgtgtttatattttaaaa
gttgacgataaacaagaagtgcaaaattacaatcttactgaaaaaacagattgccaaatc
attagcgaattatattatgaagaaaatattaaagaagaaaaggcaaaataatgtgaaata
attagaagtaatgttgatggagaattattaatttgtttattatcagatcatacaataaga
attttagaaatgaatttctaagaagaaaacaaaagcaaaaatatttttaatagtttaaaa
gtagtttaaactatataaaaagttagttaaatataagtattcaacatgattgattcaata
tgtgctgaaactatatctattaaaaaagagaaactgaaatactaaaataatcaatttgaa
tatgtggcttatcaaattattaatcacaataatattccatcaaatttattgatcttacat
acgaattctacatttactttattaagtggtagcaaaatccttttaaattatcaaattaac
gaataaattaatgatatctcttaatttaattgcgctcctgttataactgaacccttaata
caaacaatcttacattctttgaagattgctttagatactcaataatacatttgcctattt
aaagatgtcattattaattgcttataaaatcagaaccttaaattagaaatgtcaaaaaat
aatatagataatgaattcatgagatttacttacctaatgttatgttacttaaagttaagc
agcaataaaaaagattgcgaagatcaaatctaaaaaaagattaaaagtaacactccatcg
gtttagtagtctcctatgaaagaaagttcaaaagcattttaataattattaaaatctaat
tatcacaaagaaaattctagttatgatagcaattcttaatattgtcattaataacaataa
tagtaatagagtttaagttttatttatcacatgactatggagatgtttaatgaaatttaa
gacaagattttatatgttttacatttattgtattaagaattattgttatcagatgaaaag
taggctaataagttgctggttttactatattattattccctcaatatggataatgaagtt
gctattaattatagtgattattacctcagaataaatccatcattataatctatgtattaa
aatgataattttatatcccttttgccaactattagatctttgactttgcttgggtaacca
tagtaataaaacaaatagaaaattctgcctcaaaatccaatagacttgaataaatggttg
agcagcttattaatgaataatccaatatcatttccgatattatttaagaggactaaataa
ttgtgcatcataatgtaatcaattctaaagaaacaattaatccatatttcttcaatatta
tagtgtgaagtttaagacttttaaattttatattaggtacaaaagacttaactatttttc
taaaaagttttaaatcaaaaattgcaaatcaaatatatttaataaaagaaaaataaacta
gaaatgctcacaaaattaagagggccttctttgatgttatatttatgcagtgaaaaacgt
tggaatagagatattattaataaacttcctttataatttaaaattgttattttagaaata
atcactttattaagaaataattttccaaatgacttaatgggataaattactaaagattca
tatttattaatagatagaatggatatttatttaaattgcaaattatatattcaaaatcct
gtagaatgtgaatttaaaaaatatgttaattcaattttaagtgggcaaataaaaagttta
tagaatgaagatgatcatgatatctaatatgattaacatttgatgtagcaagttaagaga
caatttgactttacaagagacattcgaataaaaacaaaaatgactgaacatattcctgaa
gaaagattggattaagatgctccttcagtattattaaagttattgaatcgaaaattagct
atgtttgttgggttaggatcattaacatatggtacaagcgaccattttattactgattaa
ataaaatttccttcattaaacttatctggaatccttcaataaaatagcttgaaattaaca
atagattcaacaagagaagattatacataaatgacataatggccagaatttcatttagga
gttaccttgtcgctatagttatccaaaaaattgaaaggcttaagtcaagaatccttaaga
acttggatattttattagaaaccataaaatccttctaatatccatggaggatttatgtta
ggattaggattattaggatatctaaattcatttaattagatagatttatattaacttctt
acataaaaccatgaagcaacaagtgtgggagtattattaggtattggagcatcaagaatt
ggaacttgtgatgagcctacttaaaaatctttaactgtccatattccaagtttgatacct
agtgtttatgatttggagctaccaagtaatgtttctacgagtgcattatgttcactcgga
ttcttatttatggctagcggcaatagaaattttactgaagttgctttgggtttaataggt
agaaaaccccataatgataaagtgattgatagagagggatattctcttgcagctggaata
gcattaggattaattaatttaggaaaaggaagtgtgtggagaagagaactttaaattgta
gatcgattaatcagatttgttcaaggaggaaaagtactccctccgccttaatcctcatta
tctactaattttatgtaaaatgaaagtgtcagcagttcaatacgagaaggtaacatggtt
aatgtacatgttacttgccctgctgctctaatggcattaagtttaatgtttatgtaaatg
aactaatagaatattgtagattaattaaatattcctaattcttttagtagtttagagagt
tgcaacccaaatcatatcatattaaaatctttaactagaaatattatcatgtgggatagt
ataccaacaacttaagcagatttacattcataaattccagaattaatttcatttttgttc
gagcaacctttaaaaaaaatccattaaaagttctatttagtatataatgtagaagtgatc
gattttatgtctgtaagtatgatatatacaggtatgatatctggagcattattagccatg
ggtataaaatatgctggaactcatgattaataagtcaaataacttatgataaaataaata
gagttcttaataaaattaagaatatcttaaaatgaatttgccaatgacccagataataag
tgcgctattgattaatacacttattatactaatattgttaatgctttataagggttatct
cttttgatggctggcagttttgattaagaagtattgacaatagctaaatctttaatataa
aaaatggaaaattcataaatttggcatttcggtttccattaaggaataaaaatggctatt
ggttttgtatttatgggaaaaggagggtattcattcaaaaaatcaaaaaaagcaatcagt
atgctattattatctttgtacccatattacccaactaaccctggagataataaataatat
ttataagccttaagatggagttacgttttatcaataagacctaaaatatttaaaattatt
gacgtgaagactcataaaactgcaaatttatagattaaaaatgagatattttctgatcct
aattactgctaatcaaacttttcatttacaaataaggcaatataaacaatttatgtacaa
tcaaaagtcttaagctaaaataattaagatttattaaatccaaataacactcttaatcat
attgatactttattattgattggcgatatgtagacgattgactcaaagctagatgggctt
tatgagtataagtttatcaaaaatttaaaagagaaataatattttttaaaattgttgcag
catgattaaagcaattttatttaaatcttagcttctttatttaatactaataaatatgcc
cacataccaattcttggattattttataaattgtaccaaaataaattagtactatcctag
gaagttattgattaattaactcctacaattagtgttactaaccaagaactaaataaatac
ataaattaagattttaaaaatatgtagtttagtttagtatcacacaaagtctacagcttt
ttatcaatatataacttgccttatctacatgacataaaataaatagttaaagttgctaaa
tagattcccctctaaatgttagaattttatttatacaaatcctttgaagacatctaacaa
caaaaattaaagcaattagctcattcaatattattaaattaatga

DBGET integrated database retrieval system