Paramecium tetraurelia: GSPATT00038568001
Help
Entry
GSPATT00038568001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K03348
anaphase-promoting complex subunit 1
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
GSPATT00038568001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
GSPATT00038568001
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
GSPATT00038568001
Ubiquitin system [BR:
ptm04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
APC/C
Other subunits
GSPATT00038568001
Chromosome and associated proteins [BR:
ptm03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid separation proteins
APC/C complex
GSPATT00038568001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PC_rep
DUF4853
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5023646
NCBI-ProteinID:
XP_001437861
Genoscope:
GSPATT00038568001
UniProt:
A0CI47
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1594 aa
AA seq
DB search
MSQQSCFFNEITSIEKIQEESIYQQSQSNTQYYVNQSDKSINFLSKGGNQFFLPLDVEIN
QVFPLSEGLLLGWGRDEFNYSIVLNHPLASITTLGTYNSTLGTIEPWIHMQEEIIYAHKI
LPILITYNSQLMRHCVYILKVDDKQEVQNYNLTEKTDCQIISELYYEENIKEEKAKQCEI
IRSNVDGELLICLLSDHTIRILEMNFQEENKSKNIFNSLKVVQTIQKVSQIQVFNMIDSI
CAETISIKKEKLKYQNNQFEYVAYQIINHNNIPSNLLILHTNSTFTLLSGSKILLNYQIN
EQINDISQFNCAPVITEPLIQTILHSLKIALDTQQYICLFKDVIINCLQNQNLKLEMSKN
NIDNEFMRFTYLMLCYLKLSSNKKDCEDQIQKKIKSNTPSVQQSPMKESSKAFQQLLKSN
YHKENSSYDSNSQYCHQQQQQQQSLSFIYHMTMEMFNEIQDKILYVLHLLYQELLLSDEK
QANKLLVLLYYYSLNMDNEVAINYSDYYLRINPSLQSMYQNDNFISLLPTIRSLTLLGQP
QQQNKQKILPQNPIDLNKWLSSLLMNNPISFPILFKRTKQLCIIMQSILKKQLIHISSIL
QCEVQDFQILYQVQKTQLFFQKVLNQKLQIKYIQQKKNKLEMLTKLRGPSLMLYLCSEKR
WNRDIINKLPLQFKIVILEIITLLRNNFPNDLMGQITKDSYLLIDRMDIYLNCKLYIQNP
VECEFKKYVNSILSGQIKSLQNEDDHDIQYDQHLMQQVKRQFDFTRDIRIKTKMTEHIPE
ERLDQDAPSVLLKLLNRKLAMFVGLGSLTYGTSDHFITDQIKFPSLNLSGILQQNSLKLT
IDSTREDYTQMTQWPEFHLGVTLSLQLSKKLKGLSQESLRTWIFYQKPQNPSNIHGGFML
GLGLLGYLNSFNQIDLYQLLTQNHEATSVGVLLGIGASRIGTCDEPTQKSLTVHIPSLIP
SVYDLELPSNVSTSALCSLGFLFMASGNRNFTEVALGLIGRKPHNDKVIDREGYSLAAGI
ALGLINLGKGSVWRRELQIVDRLIRFVQGGKVLPPPQSSLSTNFMQNESVSSSIREGNMV
NVHVTCPAALMALSLMFMQMNQQNIVDQLNIPNSFSSLESCNPNHIILKSLTRNIIMWDS
IPTTQADLHSQIPELISFLFEQPLKKIHQKFYLVYNVEVIDFMSVSMIYTGMISGALLAM
GIKYAGTHDQQVKQLMIKQIEFLIKLRISQNEFANDPDNKCAIDQYTYYTNIVNALQGLS
LLMAGSFDQEVLTIAKSLIQKMENSQIWHFGFHQGIKMAIGFVFMGKGGYSFKKSKKAIS
MLLLSLYPYYPTNPGDNKQYLQALRWSYVLSIRPKIFKIIDVKTHKTANLQIKNEIFSDP
NYCQSNFSFTNKAIQTIYVQSKVLSQNNQDLLNPNNTLNHIDTLLLIGDMQTIDSKLDGL
YEYKFIKNLKEKQYFLKLLQHDQSNFIQILASLFNTNKYAHIPILGLFYKLYQNKLVLSQ
EVIDQLTPTISVTNQELNKYINQDFKNMQFSLVSHKVYSFLSIYNLPYLHDIKQIVKVAK
QIPLQMLEFYLYKSFEDIQQQKLKQLAHSILLNQ
NT seq
4785 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttaataaagctgtttcttcaacgaaatcacgtccattgaaaagatttaggaagaa
tccatttattagcaaagccaatctaatacccaatattatgtaaatcaatcagacaaatca
attaattttttatcgaaaggagggaattaattctttttacctttggatgttgaaataaac
taagtatttccattatctgaaggtctcttgctaggttggggtagggatgaatttaattac
tctatagtattaaatcatcctctagcctctattacaacattaggaacttataatagcaca
ttagggactattgagccttggatacatatgcaagaagaaattatttatgcccataaaatt
ctgccaatattgataacctataattcttaattgatgaggcattgtgtttatattttaaaa
gttgacgataaacaagaagtgcaaaattacaatcttactgaaaaaacagattgccaaatc
attagcgaattatattatgaagaaaatattaaagaagaaaaggcaaaataatgtgaaata
attagaagtaatgttgatggagaattattaatttgtttattatcagatcatacaataaga
attttagaaatgaatttctaagaagaaaacaaaagcaaaaatatttttaatagtttaaaa
gtagtttaaactatataaaaagttagttaaatataagtattcaacatgattgattcaata
tgtgctgaaactatatctattaaaaaagagaaactgaaatactaaaataatcaatttgaa
tatgtggcttatcaaattattaatcacaataatattccatcaaatttattgatcttacat
acgaattctacatttactttattaagtggtagcaaaatccttttaaattatcaaattaac
gaataaattaatgatatctcttaatttaattgcgctcctgttataactgaacccttaata
caaacaatcttacattctttgaagattgctttagatactcaataatacatttgcctattt
aaagatgtcattattaattgcttataaaatcagaaccttaaattagaaatgtcaaaaaat
aatatagataatgaattcatgagatttacttacctaatgttatgttacttaaagttaagc
agcaataaaaaagattgcgaagatcaaatctaaaaaaagattaaaagtaacactccatcg
gtttagtagtctcctatgaaagaaagttcaaaagcattttaataattattaaaatctaat
tatcacaaagaaaattctagttatgatagcaattcttaatattgtcattaataacaataa
tagtaatagagtttaagttttatttatcacatgactatggagatgtttaatgaaatttaa
gacaagattttatatgttttacatttattgtattaagaattattgttatcagatgaaaag
taggctaataagttgctggttttactatattattattccctcaatatggataatgaagtt
gctattaattatagtgattattacctcagaataaatccatcattataatctatgtattaa
aatgataattttatatcccttttgccaactattagatctttgactttgcttgggtaacca
tagtaataaaacaaatagaaaattctgcctcaaaatccaatagacttgaataaatggttg
agcagcttattaatgaataatccaatatcatttccgatattatttaagaggactaaataa
ttgtgcatcataatgtaatcaattctaaagaaacaattaatccatatttcttcaatatta
tagtgtgaagtttaagacttttaaattttatattaggtacaaaagacttaactatttttc
taaaaagttttaaatcaaaaattgcaaatcaaatatatttaataaaagaaaaataaacta
gaaatgctcacaaaattaagagggccttctttgatgttatatttatgcagtgaaaaacgt
tggaatagagatattattaataaacttcctttataatttaaaattgttattttagaaata
atcactttattaagaaataattttccaaatgacttaatgggataaattactaaagattca
tatttattaatagatagaatggatatttatttaaattgcaaattatatattcaaaatcct
gtagaatgtgaatttaaaaaatatgttaattcaattttaagtgggcaaataaaaagttta
tagaatgaagatgatcatgatatctaatatgattaacatttgatgtagcaagttaagaga
caatttgactttacaagagacattcgaataaaaacaaaaatgactgaacatattcctgaa
gaaagattggattaagatgctccttcagtattattaaagttattgaatcgaaaattagct
atgtttgttgggttaggatcattaacatatggtacaagcgaccattttattactgattaa
ataaaatttccttcattaaacttatctggaatccttcaataaaatagcttgaaattaaca
atagattcaacaagagaagattatacataaatgacataatggccagaatttcatttagga
gttaccttgtcgctatagttatccaaaaaattgaaaggcttaagtcaagaatccttaaga
acttggatattttattagaaaccataaaatccttctaatatccatggaggatttatgtta
ggattaggattattaggatatctaaattcatttaattagatagatttatattaacttctt
acataaaaccatgaagcaacaagtgtgggagtattattaggtattggagcatcaagaatt
ggaacttgtgatgagcctacttaaaaatctttaactgtccatattccaagtttgatacct
agtgtttatgatttggagctaccaagtaatgtttctacgagtgcattatgttcactcgga
ttcttatttatggctagcggcaatagaaattttactgaagttgctttgggtttaataggt
agaaaaccccataatgataaagtgattgatagagagggatattctcttgcagctggaata
gcattaggattaattaatttaggaaaaggaagtgtgtggagaagagaactttaaattgta
gatcgattaatcagatttgttcaaggaggaaaagtactccctccgccttaatcctcatta
tctactaattttatgtaaaatgaaagtgtcagcagttcaatacgagaaggtaacatggtt
aatgtacatgttacttgccctgctgctctaatggcattaagtttaatgtttatgtaaatg
aactaatagaatattgtagattaattaaatattcctaattcttttagtagtttagagagt
tgcaacccaaatcatatcatattaaaatctttaactagaaatattatcatgtgggatagt
ataccaacaacttaagcagatttacattcataaattccagaattaatttcatttttgttc
gagcaacctttaaaaaaaatccattaaaagttctatttagtatataatgtagaagtgatc
gattttatgtctgtaagtatgatatatacaggtatgatatctggagcattattagccatg
ggtataaaatatgctggaactcatgattaataagtcaaataacttatgataaaataaata
gagttcttaataaaattaagaatatcttaaaatgaatttgccaatgacccagataataag
tgcgctattgattaatacacttattatactaatattgttaatgctttataagggttatct
cttttgatggctggcagttttgattaagaagtattgacaatagctaaatctttaatataa
aaaatggaaaattcataaatttggcatttcggtttccattaaggaataaaaatggctatt
ggttttgtatttatgggaaaaggagggtattcattcaaaaaatcaaaaaaagcaatcagt
atgctattattatctttgtacccatattacccaactaaccctggagataataaataatat
ttataagccttaagatggagttacgttttatcaataagacctaaaatatttaaaattatt
gacgtgaagactcataaaactgcaaatttatagattaaaaatgagatattttctgatcct
aattactgctaatcaaacttttcatttacaaataaggcaatataaacaatttatgtacaa
tcaaaagtcttaagctaaaataattaagatttattaaatccaaataacactcttaatcat
attgatactttattattgattggcgatatgtagacgattgactcaaagctagatgggctt
tatgagtataagtttatcaaaaatttaaaagagaaataatattttttaaaattgttgcag
catgattaaagcaattttatttaaatcttagcttctttatttaatactaataaatatgcc
cacataccaattcttggattattttataaattgtaccaaaataaattagtactatcctag
gaagttattgattaattaactcctacaattagtgttactaaccaagaactaaataaatac
ataaattaagattttaaaaatatgtagtttagtttagtatcacacaaagtctacagcttt
ttatcaatatataacttgccttatctacatgacataaaataaatagttaaagttgctaaa
tagattcccctctaaatgttagaattttatttatacaaatcctttgaagacatctaacaa
caaaaattaaagcaattagctcattcaatattattaaattaatga
DBGET
integrated database retrieval system