Candidatus Paraimprobicoccus trichonymphae: RsTaC01_0855
Help
Entry
RsTaC01_0855 CDS
T09783
Name
(GenBank) helix-rich protein
Organism
ptrh
Candidatus Paraimprobicoccus trichonymphae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
KASH_CCD
Cnn_1N
INO80F
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED92932
UniProt:
A0AA48I4U7
LinkDB
All DBs
Position
959592..961904
Genome browser
AA seq
770 aa
AA seq
DB search
MKSKKNKLQYVGLIGTSVLGFVAGYTVKFNENNKLKQDLELSEEKVKSVNSRLLINGNKN
ELNDDKLQKLEEENFKLKSEVITLEEKNQNLERKFEIYNDKNLRGLDAKKSHIENLLHKS
QKKTFIENSDFKNSLKQSRENNDLKVKLLLSETEIERMKTINVDSSNNKKLNNMGFPVKY
AMICGRLKSKVDSQDKIIKSLEDKIESNLLLKNQDNFEEIENKNLKSRNQKLESELEKKE
KIINLSSYKELSFRKELMNENNDLKSKIKNLKDKNQKLKDELKLKEQNSILGSNRELLFK
KKLTNENENLKSRIENLENKNRELENELKLREQSTNSNSKNIEILKKQIEVLSENLTSDD
LKLTVQELQDENTNLKLKIKVLENKNSYLEIEIKDKNKDIQNLSNYEKLQFQIDSQNEFI
KYMKNQFEVFSKNVDSQKNSDLKLLNKRIQEIEDENTNLKLKIEFLGDENIKLEKEKIQN
LSNNMDGKLQNENFNLKTRIECLENEIKDKNEVVKNLSNYEKLQSQIDSQNEFIKYLKNQ
FEVFSKNVDSQKNNDSEILNKKIQDLENKNDNFKLKIEFLKNENEKLETELSNKNQDIIL
DNKHDEIAELLKSQIKELSEKLSLQNQKSSKKLEEFKENDKILREENQKLKEKLQINDDL
DKYLEENQNLLKELKILDQEVLNKSTEVEEFKNRIQDLENIIKEMKKNIKLYSEKFKILS
EQFGYFSGEEIDEKSAKAYCDKQIKILRDVYQSRYELFKEKIKIEREQNK
NT seq
2313 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagtcaaaaaaaaataaactacaatatgtaggtttaataggaacatcagttttaggc
tttgtggcaggttatactgttaaattcaatgaaaataataaattaaaacaagatttggag
ttatcagaagaaaaggttaaaagtgttaattctcgactgttgataaacggcaataaaaat
gaactgaacgatgataaattgcaaaaacttgaagaagaaaattttaaattaaaatctgaa
gtaataactttagaagagaaaaatcaaaatttggagcgtaaatttgagatatataatgat
aaaaatcttcgaggtcttgatgcaaaaaaatcacatatagaaaatttattacataaatca
caaaaaaagacttttatagaaaacagtgattttaaaaattcgttaaaacaatcaagagaa
aacaatgatttgaaagtaaaattattactttcagaaactgaaatcgaaagaatgaaaaca
ataaatgttgatagttctaacaataaaaaattgaataatatgggttttccagtaaaatat
gcgatgatttgtggtagactgaaatcaaaagttgattcccaagataagattattaaatct
ctggaagataaaattgaaagcaatttattactaaaaaatcaagataattttgaagaaata
gaaaataaaaacctgaagtctaggaatcaaaagcttgagagtgaattagaaaaaaaagaa
aaaattataaatttaagttcttataaagaattatcattcagaaaagaactaatgaatgaa
aataatgatttaaaatctaaaataaaaaatttgaaagacaagaatcagaaacttaaagat
gaattaaaattgaaagaacagaattcaattttaggatctaatagggaattgttatttaaa
aaaaaattaacaaatgaaaacgaaaatttgaagtctagaatagagaatttagagaataaa
aatcgagagcttgaaaatgaattaaaattaagggaacaaagtactaattcaaatagcaaa
aatattgaaattttgaaaaaacaaattgaagttttgtcagaaaatttgacttcagatgat
ttgaaattaacagttcaagaattacaggatgaaaatactaatttaaaattaaagataaaa
gttttagaaaataaaaatagttatttagaaattgaaattaaagataaaaacaaagatata
caaaatttatcaaattatgagaaattgcaatttcaaattgattctcaaaatgagtttatt
aagtatatgaaaaaccaatttgaggttttttcaaaaaatgtggattctcaaaaaaatagc
gatttgaaattattaaataaaagaatacaagaaattgaagatgaaaatactaatttaaaa
ttaaaaatagaatttttaggagatgaaaatataaaacttgaaaaagaaaaaattcaaaat
ttatcgaataatatggacggaaaattacaaaatgagaattttaacttgaaaacaagaata
gagtgcttagaaaatgaaattaaagataaaaatgaagtcgtgaaaaatttatctaactat
gaaaaattacaatctcaaattgattctcaaaatgaatttattaaatatttgaaaaaccaa
tttgaggttttttcaaaaaatgtggattctcaaaaaaataacgattcagaaattttaaac
aagaaaatacaagatcttgaaaataagaatgataattttaaactgaaaatagaattttta
aaaaatgagaacgaaaaattagaaacagaattaagtaataaaaaccaagatataatatta
gataataaacatgatgaaattgccgaattattaaaaagccaaattaaggaattatctgag
aaattgtcacttcaaaatcaaaaaagttctaaaaaattagaagagtttaaagaaaacgat
aaaattttaagggaagaaaatcaaaaattaaaggagaaattacaaataaatgatgattta
gataaatatttggaagaaaaccagaatttattaaaagagttaaaaattttggatcaagaa
gtactaaataaaagtactgaagtagaagaatttaaaaatagaattcaagacttagaaaat
ataataaaagaaatgaaaaaaaatataaaattatatagtgagaaatttaaaattttatct
gaacaatttggatatttttcaggggaagagatagatgagaaaagtgcaaaagcctattgt
gataaacaaattaagattttaagagacgtttatcaatcaagatatgaactatttaaagaa
aaaattaaaatagaaagagaacaaaataaatga
DBGET
integrated database retrieval system
