Pyrenophora tritici-repentis: 6342380
Help
Entry
6342380 CDS
T10215
Symbol
PtrM4_091110
Name
(RefSeq) RTX toxins and related Ca2+-binding protein
Organism
ptrr Pyrenophora tritici-repentis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
6342380
NCBI-ProteinID:
XP_065962613
UniProt:
A0A5M9L9A2
LinkDB
All DBs
Position
4:914602..917153
Genome browser
AA seq
747 aa
AA seq
DB search
MMKLTVAFLAALAAADAAEARNHRMARRQYGGYGSGYGAELPSSSSAPGTSPTPTPDLPA
GAVSTPPAGGYGGGYGGDMPSSSSAPGTSPTPTPDIPAGEVSTPPAGGYGGGYGGDKPPS
SSSAPGTSPTPTPDIPAGAVSTPPAGAVSTPPAGGYGGGYGGDVPGVSMSSAVPSGAVSS
PPAGGYGAGGYGGGYGGNVPGVSMSSVVPSGASSTPAIPAATTSTPAGAVSTSSAGGYGG
GYGGNVPGVSMSSVVPSGASSGSPSASTPAGAVSTPPAGGYGGGYGGNVPGVSMSSVVPS
GASSTPAIPAATTSTPAGGNGGYGSPSSTPGKPVTPDAATSTGMSGTGYAPKPTGTGSYP
GSSTPVSDMVTSTIYSTQIFTVSACPPSVTNCPAQATSMITSVVPVGTTVCTAETGKPTT
TPGVVTESVPVSEIVKTSTQTLTYTVGIGSTAHPVTTEITSTQTSTQYSTVVVTMSKPKP
TGSVPNQTTGGSGYPTGPAGEHPPSPDVTSTIKSTSTSTKFVTVKPTPTGPSGSYPPGPP
AGEKGHPSPSSPAGSYPPGPPAGEQGHPTPSSPAGSYPPGPPAGEQGHPTPSSPAGSYPP
GPPAGEQGHPTPSSPAGSYPPGPPANEQGHPPAGEDTASPTPAVPTGMYPVPGNGTMSHP
GATGFKTSTKPSLPVSTGTSSLPTFSVVTPGAASSTPAVPAASTSAPANGGGYGSPSSSS
TPAVPAASASTPANGGGYGVSVRLRRL
NT seq
2244 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagcttactgttgcctttttggccgctctcgctgccgcggatgccgccgaggcc
cgcaaccaccgcatggctcgccgccaatacggaggctacggttcaggctacggcgctgag
ctcccctcttcctcttccgcccccggtacttcacctacccccacccccgacctccctgcc
ggtgcagtctctacaccccccgctggtggctacggaggtggatacggtggtgacatgccc
tcttcctcttccgcccctggcacttcacccacacctacccccgacatccctgccggtgaa
gtctctactcctccagctggcggatacggaggtggctacggtggtgacaagccgcccagc
agctcttccgcccccggtacttcgccgacacccactcccgacatccctgccggtgctgta
tctacacctcccgctggcgccgtctctactcccccagctggtggatatggtggcggatac
ggcggtgacgttcctggtgtcagcatgagctccgctgtcccctccggcgctgtctcttct
cctcctgctggtggatacggcgctggcggatatggtggcggatacggcggtaacgtccct
ggtgtcagcatgagctccgttgttccttctggagcttcatctactcccgctattcccgct
gccaccacctccacccccgctggtgctgtctccacttcttcagctggcggatacggtggc
ggatacggcggtaacgtccctggtgtcagcatgagctccgttgttccttccggagcttcc
tctggcagcccgtctgcctccactcccgctggcgctgtctccactcctccagctggcgga
tatggtggcggatacggcggtaacgtccctggtgtcagcatgagctccgttgttccttcc
ggagcttcgtccactcccgctattcccgctgccaccacctccacccctgctggtggtaac
ggcggctacggcagcccctccagcacccccggcaagcctgttacccccgacgccgctacc
tctactggcatgtccggcactggctacgctcccaagcccactggaactggctcttacccc
ggttcttccaccccagtcagcgacatggtcaccagcaccatctacagcacccagatcttc
actgtttctgcttgccctcccagtgtcactaactgcccggctcaagccacttccatgatc
accagcgttgttcccgttggcaccaccgtctgcaccgccgagactggcaagcccaccact
acccctggtgtcgtcactgagtcagtccccgtcagtgagatcgtcaagaccagcactcag
actctcacctacaccgttggtattggctccactgctcacccagtgaccaccgagatcacg
tccactcagacctcgacccagtactccactgtagttgtcaccatgagcaagcccaagccc
actggctctgtccccaaccagaccactggcggaagcggctaccccactggccctgctggc
gagcaccctcccagcccagatgtcaccagcaccatcaagtctacctcgacctccaccaag
ttcgtcaccgtcaagcctacccccaccggtccttcaggcagctacccccctggtccccca
gctggcgagaagggacatccatctccttcttccccagccggcagctaccctcctggtccc
ccagctggcgagcagggacacccaactccctcttccccagccggcagctaccctcctggt
cccccagctggcgagcagggacacccaactccctcttccccggccggcagctaccctcct
ggccccccagctggcgagcagggacacccaactccttcttccccggccggcagctaccct
cctggtcctcctgccaatgagcagggccacccccctgctggtgaggacactgcttcccct
actcctgctgtccccactggcatgtaccccgtccccggtaacggcaccatgagccacccc
ggcgccactggcttcaagacctccaccaagccttccctgcccgtcagcactggcacttct
tctctccccaccttcagcgtagtcacccccggcgctgcctcttccacccctgctgtcccc
gctgcttcgacctctgctcctgctaacggtggtggatacggctctccatcctcctcctcc
acccccgctgtccccgctgcttctgcctctacccccgctaacggcggtggatacggtgta
agcgttcggcttcgtcgcctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
