Portunus trituberculatus (swimming crab): 123502416
Help
Entry
123502416 CDS
T07853
Name
(RefSeq) extensin-like
Organism
ptru
Portunus trituberculatus (swimming crab)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mucin-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123502416
NCBI-ProteinID:
XP_045107538
LinkDB
All DBs
Position
1:6319215..6329238
Genome browser
AA seq
1053 aa
AA seq
DB search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NT seq
3162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaccaggataccgcggctccaggtggtgtgattgccctacgccaaagatgcgcttg
gacctccattacccagcgccctcctactcgtccagccctgcgcagaagtcctacaaaccc
gctatcgagtacgcaggtcccattgtgtactccgatgaaaaaccaccgataattcacttc
cctcggcctccactgcctaagtcagactcctccccgcccatccacgtggtccacaccccc
gccccggccatcaaagcccccgtcaagccctcctacggtccaccacccaaggccccctcc
cctagctatggtccacccaaggcaccgaccccatcctacagacccccacccaaggccccc
tctcccagctacggtccacctcccaagggtccaccgaaggggtcttatggtccaccccct
aaggcgccacgtcccagctacagaccgcccccgaaggcaccacgtcccagctatggtcca
cctccgaaggcaccacgtcccagctatggtccacctccgaaggcgccgtcacctagctat
ggtccacccccaaaagccccgtcccccagctatggtccacccccaaaggccccgtccccc
agctatggtccacctccaaaggccccgtcccccagctatggtccaccgcccaaggccccc
cctcccacatatggcccgcctaagccctcttcaatagccaaggcgccattaccaaaagcc
ccatctcccaaggccccatcaccttcctatggtccatccaaggccccttcacccacttat
ggtccacctaagccccaaaaacctcccagcccccagtacgggtccccagctaacacgggt
cctattttcatcagcgccccgccgcctcccagccccgtgttggtgtcagccccgcagccc
caatacgcagattcagcggccccgaagccctcatatggcctcccgcccaaacccaagcct
agctaccaccccccagccccgcagaaacccctcatatgcagccccacccaaagccacgcc
ccagaaagccccgaaagcttatgccccgcccccaaaagccccgaaagcttatgccccgcc
cccaaggctccaaaggcatatgcaccccacccaaagccctccagcccccacttatggccc
ccaaggcagccccagttaaggccaccccagccccacacattatctacggccaccccccat
ccacgtgtaccagcaacccccgtgtaccaggtgaccaagccagccccagcccccccaacc
aagggcctccacgtagccccagcagcccccaagccctcctatggccctcctcccaaggcc
aaggcaccgcgaccgactttcaaggcacccagaccctcctatggtccaccgcccaaggcc
ccgtcaccaagctatggaccgcctcctaaagccccatcacccagacccagctatggtcca
cctcccaaggccccttcaccctcttatggcccacctcctaaagccccatcacccagaccc
acctatggtccacccccaaaagccccttcaccctcttatggcccgcctcctaaagcccca
tcacccagctatggtccacccccaaaggccccatcaccctcctatggtccaccacccaag
gcccccccaccaagacccagctacagaccaccacccaaggccccatcacccagctatggt
ccacccccgaaggctccatcaccgagctatggcccgcctccgaaggccccatcaccttcc
tatggcccgcctcccaaagccccgaagccttcttacagaccgccacccaaggccccgtca
ccaagctatggcccgccacccaaggccccatcaccaagctatggcccgccacccaaggcc
ccatcaccaagctatggcccgccacccaaggccccatcaccaagctatggtccaccacct
aaggccccatcaccaagctatggtccaccacccaaggccccgtcaccaagctatggtcca
ccacccaaggccccgtcaccaagctatggtccaccacccaaggccccgtcaccaagctat
ggtccaccacccaaggccccttcacctacatatggccctcccaaagcccacaaggccccg
tcacccagctatggcccgccgcccaaagccccatctcctagctatggtccacccccgaag
gccccgtcccccagctacggtccgccgcccaaggcccagtcagggttcgggcggcccaag
gcaccactatccttgaagggcccgcggccgtccttcagcctaccgcccaagggtccccgc
cccacctacacgccacccaaggccaccaagccagagcccgtgtacctgcccgcgcccaaa
gccttccacaagccgcccatcatcatctaccagggggtgcggccgcccgtgcacgtgtac
cagaagccaggcagcaaggcgcccagcaaagctccctcgcccagctacggcgcacccaag
gcccccgccacaggctacggagtccccaaggcccccgccacaggctacggcgcccccaag
gctgatagcactcccagggaggcctacggcgcccccaaaagtgaagacatcatcgtgaag
agcagcggtggcggtggtggtggtgatggtggttacagcagcggtggtggtggtggtggc
tacagcagcggtggtggtcacaggagcagcggtggtggcggtggtggtggtcacaggagc
agcggtggtggcggtcacaggagcagcggtggtggcggcaaggagatctacacgtcaggc
agcgccctggcccaggtgaaggtggcggcgcccaagacagacacccataccacggccacg
gccacgtccctggccacgtccccagtgtccgtgtcgtcccgccccacgccggtgtccacc
acgttcggcaacaaggagacagtgggcggcaccagcagcagcagcagcagcagcagcggt
gacgggctgggcagcaccaccatcaagccctcgccgcaggacccctcagcggacgcagcc
aagtcctcccagagcgtggacgactgggagccctccgtgggatacgccgcctactccgac
gcctccctctctgtgtccatccctcagtctgccacaaagacctcactcgacgtcagcgag
gcaaaggtctccgcctctgtctccgtcagctcctcctcctga
DBGET
integrated database retrieval system
