Pseudoalteromonas tunicata: PTUN_a0251
Help
Entry
PTUN_a0251 CDS
T05187
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel
KO
K16053
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
ptu
Pseudoalteromonas tunicata
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ptu02000
]
PTUN_a0251 (mscM)
Transporters [BR:
ptu02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PTUN_a0251 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC93069
LinkDB
All DBs
Position
I:237402..238598
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MSQLTTILLEWFTPLKQALLFAQISATSIGIVSLLMLYLFAKQLFLPSIQKLVIYFSPTT
AGRLSKLLDKFNGRLAIMLCCIVFIGTLELIYPFNNLILSVLRTFGQCAMLIYGGLIFSS
IISISGGIYNQLSFAKDVPIQGLIQLVKLVTFIVICVLLVSLMLDKSPAYILSGFGALAA
VLLLVFKDTILGFVASIQIAANRLVTHGDWIQMDQYGADGEVEDLGLNIVKVRNWDKTIT
SIPTYALIAQSFKNWRGMQESGGRRIKRALNIDMHSVRLLEAETVQSLQQHPVLKSYFDK
NTEDLSSFTNISVFRRYAEFYLKVHPQLNHGMTLMVRELQPTATGLPIEFYCFSEDQRWI
PYEHLQADITDHFLAVLPLFKLYPYQHISGALSTQSGQ
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccagttaacaaccatactacttgaatggtttacaccgttaaagcaggctctgttg
tttgctcaaattagcgcgacttcaattggcattgtgtctttattgatgctgtatttgttt
gcaaagcagttatttttaccttcaatccaaaaattagttatttatttctctccaaccaca
gctggtcgattaagtaagttgctagataaatttaacggcagacttgcaatcatgctctgt
tgtattgtgtttatcggcactctagagctcatttacccttttaataatttaatattgagt
gtgctaagaacctttggtcaatgtgctatgttgatttatggcgggttgatttttagctca
atcattagtatttctggtggtatatacaatcaactttcttttgctaaagatgtgccaatt
caagggcttattcaattagttaagctggtcacttttatagttatctgcgtattgctggtt
agcttaatgcttgataagtcgccagcttacattttgtcgggttttggtgcgttggctgct
gtgctgttattagtgtttaaagacactattttaggatttgtggccagtattcaaatcgcc
gctaatcgattggtcacccatggtgattggatccaaatggatcaatatggtgctgatggt
gaggttgaagatttaggcttaaacatagttaaagtccgcaattgggataaaacgattact
agcattccaacttacgcgttaattgcacagtcgtttaaaaactggcgaggaatgcaagag
tcaggtgggcgtcgcataaaaagagcgctaaatattgatatgcacagtgtacggttactc
gaggctgaaaccgtacagagcttacagcaacatcctgtgctaaaaagctatttcgataaa
aataccgaagacttaagtagtttcaccaatattagtgtatttcgtcgttatgcggagttt
tatctgaaagtgcatccccagttaaatcatggcatgacgcttatggtgcgtgagctacaa
ccgacagctacgggattgccaatagagttttactgttttagtgaagatcagcgctggatc
ccttatgagcatttacaagcggatattacggaccattttttagcggtattgccgttattt
aaactatatccgtatcagcatattagtggggctttgagtacgcaatcggggcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system