Pseudoalteromonas tunicata: PTUN_a3001
Help
Entry
PTUN_a3001 CDS
T05187
Symbol
pilY1
Name
(GenBank) type IV pilus assembly protein PilY1
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
ptu
Pseudoalteromonas tunicata
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
ptu02044
]
PTUN_a3001 (pilY1)
02035 Bacterial motility proteins [BR:
ptu02035
]
PTUN_a3001 (pilY1)
Secretion system [BR:
ptu02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
PTUN_a3001 (pilY1)
Bacterial motility proteins [BR:
ptu02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
PTUN_a3001 (pilY1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
VWA_2
MapZ_EC1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC95397
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2763112..2766204)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MNYLLNGIFEGNKMKYFNLSLKALTLLCLSVQVPAVSASDIELYVNHNVQTTEKPRVMIV
FDTSGSMESSVATGEYCYNRKGNQVYCADSRIKVAQAAMKALVEQNTDIEFGLMRFNGGS
GGYILAGLGSSKEAILTKIESLRAGGSTPLAETLYESYLYLTGGGVNYAKNIADRDKDIE
DNSSYDSPFKPKKDDSGLDILRCDNSINMIIMTDGDPTEDGGQNGNIKSLYNSKYGAYPK
SKSGSYLNSLAKYMLNVDLFPTTSGVTDIARTFTIGFGSGMSDDGLDLLKQTASDGGGEY
LLASTAEQLTEALKKTITKIRQINDTFTSPSVASSQSDRTQTLDAVYFAMFYPNTGPRWD
GNIKKLKLSGEKLVDKNNDAAIDGEGNIKKTASTFWLKEGEAADGNVVGKGGVSARISAM
ASRKVYTDVGTAGSGGSMPVFSFDNVKTTLKASSVFSGYSDQQLANLVNWSAGIDIDDED
LDNSKTDLRPAIFGDPLHSRPVAINYGDGNIRLLVGTNAGFVHMFKDSGTTDDISEEWAF
IPSELFPILPELKNNVIPEVGEGKVYGMDLTPTIYIDDANDNGIIESGDKVWAFLGMRRG
GSSYYALDISVADKPKLLWSNPINPTKSGYSLLGQTWSQPKVTFIDVAGYKNKPLLVFGA
GYDIAKDANASATDTKGLGVFIADAESGELVASFTPGGGTVNFSGLSNSIPADIALLDSD
YDGMTDRMYTADTGGNVWRIDMPSDSPNGSEPWTVIKIAALGGTGVTDRKFFYQPEVART
YFSKVTETTIDDNGSVSKQLSRRQTPYEAILIGSGNRTNPKNTSVDDQLFMIRDEKVLTQ
SFTLSSKPKVVTIDQLMDIKAKSFEDKSVDEFRTLEAEYAKNFVGWRYALGVSEKALAKP
AVIGGVAYYTSFTPASDSNVSQCDINGGSGALYAFHLHYGAKIYDNLKFDVGNKVPSTPQ
LIFDKGEDDNSQFLLIGVGSGQDGSGVIKAKAISNNLVPIDENGDGKIDLSGDFVGLKTH
RTYIYREADF
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattatttattaaatggtatttttgaggggaataaaatgaagtacttcaatttatct
ttaaaggctttgaccttgttgtgcttgtcagtgcaagtgcccgctgtaagcgcaagtgat
atcgaattgtatgttaatcataatgtacaaactaccgaaaaacccagagtgatgattgta
tttgatacatcgggaagtatggagagttccgttgcgacaggtgaatattgttataatcga
aaaggaaatcaagtttactgcgctgactctcgaattaaagttgcacaggcggcaatgaag
gcacttgtagaacaaaatactgatattgaatttggacttatgcgctttaatggtggcagt
gggggttatattttagctgggcttggtagttcaaaagaagcaatattaacaaaaatagaa
agcttaagagctggtggaagtacgccgcttgctgaaactttatatgagtcatacctatat
ctaactggtggtggggtgaattatgcaaaaaacattgccgatagggataaagatatcgag
gataattctagttatgattcaccttttaaaccaaaaaaagatgatagtggtttagatatc
cttcgttgtgataacagtatcaatatgatcattatgaccgatggagatccaaccgaggat
ggtggtcagaatggcaatataaaatctttgtataatagtaagtatggggcatatccgaaa
tctaaatcaggaagttatttaaattctttagcaaagtatatgttgaatgttgatttgttc
cctactacctctggagtgacagatatcgcacgtacattcaccattggttttgggtcaggt
atgagtgatgatggacttgatttattgaaacaaacagcatcagatggtggaggtgagtat
ttattagccagtacggcagagcagctaacagaagcgcttaaaaaaactatcactaaaatc
cgtcaaattaacgatacctttacttcgccttcggttgctagcagtcaaagtgaccgtacc
caaaccctagatgcagtttattttgcaatgttctacccaaataccggaccaagatgggat
ggtaatatcaaaaagctgaaactttcaggtgagaagctagttgataaaaataatgatgcg
gccattgatggtgaaggaaatattaaaaaaacagcttcaacattttggttgaaagaaggt
gaggctgctgatggcaacgtggttggtaaagggggggtttctgctcgtatttcagctatg
gcttcacgaaaagtgtacactgatgtaggtactgctggtagtggcggtagtatgccagta
tttagttttgataatgttaaaaccaccttaaaagcaagctctgtatttagtggttatagc
gaccaacaattggctaatttagtcaattggagtgcgggtatcgatatcgatgatgaagat
ttagataatagtaaaaccgatttaaggcctgcaatttttggtgatcctcttcactctcgc
cctgtggcgataaattatggtgatggtaatattcgcttgctagttggcactaatgctggt
tttgttcatatgtttaaagacagcggtacaacggatgatatcagtgaagagtgggcgttt
attccttctgagttatttcctattttacctgagttaaaaaacaatgtgatccctgaagtt
ggtgaaggcaaagtgtatggtatggatttaacgccaactatttatattgatgatgcaaat
gataatggcattatcgaatccggtgataaagtgtgggcttttttaggaatgcgccgcggc
ggttcatcttattatgcgttagatatcagtgtagctgataaaccgaaattactctggtca
aatccaatcaatccaacaaaatcgggttatagcctgctaggtcaaacgtggtctcaacct
aaggtgacttttattgatgtcgcaggttataaaaataaaccgctattagtctttggtgcg
ggttatgatatcgcaaaagatgcaaatgcctctgcgactgataccaaaggattgggtgta
tttattgcagatgcggaatcgggtgaactagtcgcaagttttacacctggtggtggcacc
gttaattttagtggattaagtaatagtattcctgcagatatagcactacttgattctgat
tacgatggaatgaccgatagaatgtacactgctgataccggcggaaatgtttggcgtatc
gatatgccaagtgattcacctaatgggagtgaaccatggacagttattaaaattgcagca
ctgggtggtacaggagttacagatagaaagtttttttatcagccagaggttgctcgaact
tattttagtaaagtaactgaaacgactatagatgataatggatcagtctcgaaacagcta
tctcgtcgacaaacaccttatgaagcaattttgattggcagtggtaatcgaacaaaccct
aaaaacaccagtgttgacgatcaattatttatgatccgagatgaaaaagtattaacgcaa
tcattcacgttaagctctaaacctaaggttgtaacaattgatcaacttatggatataaaa
gctaaatcatttgaagacaaatcagtcgatgagtttagaacattagaagctgaatatgcg
aaaaattttgttggctggcgctatgcgctaggcgttagtgaaaaagctttggcaaagcca
gcagtaattggaggggttgcttattatacttctttcactcctgcaagtgattcaaatgta
agtcaatgtgatattaacggtggttcaggtgctttatatgcatttcatttacattatggc
gctaaaatttatgataatttaaagtttgatgttggcaacaaagtgccatcaacaccgcag
cttatttttgacaaaggagaggatgataacagtcaattcttgttaattggtgtaggcagt
ggtcaagatggtagtggtgtcattaaagcgaaagccatctcaaataatctggtacctatc
gatgaaaatggtgacggtaaaattgatttaagtggcgattttgttggtttaaaaacgcat
agaacttatatttatcgagaagcagacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system