Pseudoalteromonas tunicata: PTUN_a3273
Help
Entry
PTUN_a3273 CDS
T05187
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ptu
Pseudoalteromonas tunicata
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ptu02000
]
PTUN_a3273
Transporters [BR:
ptu02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PTUN_a3273
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC95634
LinkDB
All DBs
Position
I:3017274..3020240
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MRNSKLSQSIRLAILCSLSAPVALISNSVLAEEAAQKDKNIEVIAITGSRIRQVGAESVS
PIISIGEKELGFLQEPEVEQILRSLPATIPGDGSNVNNGSAGAATIDLRGLGSQRSLILM
DGRRMIPFNYNGSVDASTIPSALIKSIDIVTGGASATYGSDAIAGAVNVLLKNDFEGVDL
DLKHSRTGDNDGDKSSIALTIGSSLANGKGNAAISIGWMQRDQVLLGDRSLGLLGIETAN
GANYQQFLNGEAPAPAPSECSAPNSVASGGSTTAIPTRFAIVGAGASAAGQFRNDGTLVN
KECSVFNFNPYNFYQTPTERYTATALAHYDITEEQQIYTNFSYANNSVDTQVAPSGTFGA
AFNLPLRNPLIGNQAREFMIGAANTALSNGLLDSTNWQDLNNNGVVDADDYLKVQLRRRT
LELGARTERFDSEQFQFVVGSRGQLFGDWEYDAYYQYGESNRTTVRAGYTNLTNIQNALD
SFDGVTCNNGDSTCVPINLFGGYGTITDEMAGYAQAVALQQQKYSQEIATVIVNGPVDMI
QLPTADAPLALSFGYETRTEKGLFEPDECLKLAPASCQGGAGGNQLPVKGGFKVDELFFE
GALPILADLPAAQSLDLSFGYRWADYDTVGNNETWKLGFNWRPVDSVLFRVMQQQATRAP
NVGEIASPVVTSLDNSKLDPCSVANAENIDARLRQLCISTGMSDAQVGNVQDVVSGQVNV
IQGTDPNNQPGAEQADTLTAGIVWTPEFDFAQNLTLSVDYYDIDIKDTIDKFSAQEITDA
CYIYGDVNACAKIKRVGGDLTVDGAGIEQLTTNLKYQRAQGVEIGFNLAFDLTEMGQLEF
SGTVNKYLKQESQSSDTLPVLDCKGHFGTSCDPIPEVQWVQRTTWNYEDTTVSLQWRHSD
GISAEPSERAGVFETFQTIGGYNYFDLFASYNYSDNIKLTFGIDNLFEKEPPVVGNEAGD
TSSNSGNTFPSNYDVLGRKFKMGIKFQF
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtaattctaagctttcgcaatcaatccgactggcgattttatgcagtctttccgct
ccagttgcacttatttcaaactcagtactcgcagaagaagcagcacaaaaagataaaaat
attgaagtaattgctattaccggtagtcgtatcagacaagtcggtgctgaatctgtatca
ccgattatttcgatcggtgaaaaggaactcggttttttacaagaacctgaagtagaacaa
attctaagaagtttacctgctacaattcctggcgatggtagtaacgtaaataatggctca
gctggtgctgccacaatcgacttaagaggactgggttcacaacgttcactcatcctgatg
gatggtcgccgcatgatcccatttaactacaatggctcagttgatgcgtctacgatccca
agtgccttaattaaaagcatagacatagttacaggtggggcatcagcaacctacggttct
gacgctattgctggcgcggtaaatgtacttttaaaaaatgattttgaaggtgttgattta
gaccttaaacattctcgcactggcgataatgatggcgataaaagcagtatcgcattaacc
attggttcgagcttagcgaatggcaaaggtaatgctgcgatttcaataggttggatgcag
cgagatcaagtcttgctgggtgaccgttcattggggttattaggcattgaaacagctaac
ggtgccaactaccagcagtttttaaatggtgaagcgccagcacctgcaccaagtgagtgt
agtgctcctaactctgtagcttctggtggttcaacaacagcaataccaactcgttttgct
attgtaggtgctggtgcatctgcagctggacaatttagaaatgatggtactcttgtaaat
aaagaatgtagtgtatttaacttcaacccttataacttctaccaaacaccaaccgagcgt
tataccgctaccgctttggcacattacgacattactgaagagcaacaaatttatactaac
ttcagctatgccaataactctgtagatacccaagttgcgccatcaggtacatttggtgca
gcatttaatttaccccttcgtaacccgctcattggcaatcaagcacgtgaatttatgatt
ggtgcagctaatacagcactaagtaatggcttattagattcgaccaactggcaagatctt
aataacaatggagtggttgatgctgatgattaccttaaagttcaattacgtcgccgtact
ttagagttaggtgcacgtacagaacgctttgattctgaacaattccaatttgtagtcgga
agccgtggtcaactatttggtgattgggaatatgatgcgtattatcaatatggtgaatca
aaccgtaccacggttcgtgctggttataccaatctaacaaatattcagaatgcattagat
agcttcgatggtgttacgtgtaataatggtgactcgacttgtgtcccaattaatttattt
ggtggttatggcacaattactgatgaaatggcaggttatgcacaagctgtcgctttacaa
cagcaaaaatacagccaagaaatcgctacggtaatcgtcaatggccccgttgacatgatc
caattgccaacggctgacgcccctttagccctgagctttggttatgaaacgcgaaccgaa
aaaggtttgtttgaacctgatgaatgtttaaaacttgcacctgcaagctgtcagggtggc
gcaggcggtaatcagctgccagttaaaggcggttttaaagttgatgaactgttttttgaa
ggcgcactacctattttagccgatttacctgctgcgcaatcgcttgatttgagctttggc
tatcgctgggctgattacgatactgttggcaacaatgaaacatggaaacttggttttaac
tggcgtccagttgactctgtgttatttcgtgtgatgcaacaacaagcaactcgagcgccg
aatgttggcgaaatcgcatcgcctgtagtaaccagcttagataactcaaaattagatcct
tgttctgtcgctaatgcagaaaatattgatgcaagattacgtcaattatgtatctcaacg
ggcatgagcgatgcgcaagtcggtaatgtacaagatgtagtctctggccaagtaaatgta
attcaaggtaccgatccaaacaatcaaccaggtgcagaacaagcagatacattaacagct
gggattgtatggactcctgaatttgactttgcacaaaacctaacgctgtctgttgattac
tatgacattgatattaaagatactattgacaagttttctgctcaagaaattactgatgcc
tgctatatctacggtgatgtaaacgcatgtgccaaaattaagcgtgtaggtggtgattta
accgttgatggcgcagggatagaacaactgactaccaacttaaaataccaacgtgctcaa
ggggttgagattggttttaatcttgcttttgacttaactgaaatgggtcaacttgagttt
tcaggtaccgttaataaatacttaaaacaagaaagtcaaagctcagacaccttacctgta
cttgattgtaaaggtcattttggtacatcgtgcgatccaatccctgaagttcagtgggta
caacgtacaacatggaattatgaagacaccacagtatcattgcagtggagacattctgat
ggaatttctgctgagccaagtgagcgtgcaggcgtatttgaaactttccaaaccatcggc
ggttataactacttcgacttatttgccagctacaactacagcgacaatattaagttgacc
tttggtatcgacaacttatttgaaaaagagccgccagtagtcggtaacgaagctggagat
actagctcaaactcaggtaatacctttcctagtaactatgatgtgctaggtcgtaaattt
aaaatgggtattaaatttcaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system