Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_0781
Help
Entry
SAR11_0781 CDS
T00257
Symbol
ccdA
Name
(GenBank) probable holocytochrome-c synthase ccdA
KO
K06196
cytochrome c-type biogenesis protein
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pub00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pub02000
]
SAR11_0781 (ccdA)
Transporters [BR:
pub02000
]
Other transporters
Transmembrane electron carriers [TC:
5
]
SAR11_0781 (ccdA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DsbD_TM
DsbD_2
PpoB2
DUF485
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ21599
UniProt:
Q4FMJ0
LinkDB
All DBs
Position
759434..760141
Genome browser
AA seq
235 aa
AA seq
DB search
MIELIIAFGAGLISFLSPCVLPLIPGYVSFITGSTLSEILEKKKIDLLPLIVFSLGFSFV
FIIFGATASFLGQILLQNSQILRIIAGVIIIIFSLQLIGVLNIKFLNIEKKFYTKKSNNI
FFIFIVGMAFGFGWTPCIGPILGSILALASTEETIYKAILLLSFYSLGLAIPFILSGYLM
QKFLLFSKNFKKNINLVTKGGGIILLITGILILTNQLQVLGYYILNYLPFLQNFG
NT seq
708 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaattaattatagcttttggggctggtttaatcagctttttgtctccatgtgtt
ttacctttaatacctggttatgtttcctttattactggcagtacattaagtgaaattcta
gaaaaaaagaaaattgatttattaccgttgatagttttttcattagggttttcttttgta
tttattatctttggtgcaactgcttcttttttggggcaaattcttttacaaaattctcaa
attttaagaattattgctggagttataataatcatattttctcttcaattaattggtgtt
ttaaatattaaatttcttaacattgaaaagaaattttatacaaaaaaatcaaataatatt
ttctttatatttattgtgggaatggcatttggctttggatggacaccatgtattgggcct
attttagggtcgatacttgccttagcctctacagaagaaactatttacaaagcaatttta
cttttaagtttttactcacttgggttagcgataccttttattttatcaggttatttgatg
caaaagtttttattattttcaaaaaacttcaaaaaaaatattaatttagtcacaaaaggt
ggtggtataatacttttaattacaggaattttaattttaacaaatcaattacaagttctt
ggctactatattttaaactatttaccctttttgcaaaacttcggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
