Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_0848
Help
Entry
SAR11_0848 CDS
T00257
Name
(GenBank) Predicted ABC-type transport system protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pub00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pub02000
]
SAR11_0848
Transporters [BR:
pub02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SAR11_0848
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MacB_PCD
FtsX
DNA_pack_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ21665
UniProt:
Q4FMC4
LinkDB
All DBs
Position
complement(817687..820215)
Genome browser
AA seq
842 aa
AA seq
DB search
MSKLSEYKLTLIYALRDLSRNYKKISSIILTLFISLFILSSIFTIEDSLNKELNNNSRAL
LGGDIEIDYNRNVGNLELINQVKEFATVSQMVEFSTMISTTNQSKNKSIFSRIKTVDQNY
PLFGKVGYEPSGAFEKLQTIENTILVNENIFKNLNLKINDKIKVQDQLFTVIGIVKSVPD
IGGAFVFGDFALAGKQTLELLKLNNLGSFLNYEYKVKFNEGDNPNTLSKKIEQLFKNEKK
VRIRYHEKSDGPLKRIIDNFSQFLSLVSISAMLIAGIGIANTLLSFINQNNMSIAVKKSL
GFFSKDIKIVYYLQLLILLFIISTAAYSFSFFLVPIVDVYLSAGLGLNIEGSFSILNYFK
VFLVGLLVLIIFSIPTINAIDQVKASNLFRNVFQNLQFYYSKKSILLSLLLLSILISLFT
IGSARPVYSLGYFGAFFVCLLVFYLLSNLIIKLFKGLKEHPNISIKVSVKNITQTKSITP
ITIMSLGLGVTLLLTLAFVGSNFKREIAKSIPELAPDYFFIGIQSDERQIFEDLIFDMDK
EANLEIVPMVSTGIVKINGIDPNTYIDSSNDSHWVIRNDRRSSWADKVLKDNPIVEGKWW
DLDRPDKLQISLDSKIAKDFDIKIGDIFTLNIYGREIEGEIVNFRLVDYRDFSINFAMLL
NPQFAKNIPHEYLATSKFKSLENFNETALLDKMPSLSIIKITDYLEKVTDLLNKVFIAVT
VISAITIVIGLIVISSAIIVQGKIKEFQNLIFKILGFSKVEVILSSIIEFFIIFTSIILI
ALFFAIIGSQFIIENIFQITWKFDLAIFLQVTIGIGLATLILIMITNFKYLSPKVYPLIR
NQ
NT seq
2529 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtctaagctttcagagtacaagttaactttgatatatgccttaagagacttgagtaga
aattataaaaaaatttctagtattattctaacactttttatcagcctatttattttaagt
tcaattttcaccattgaagatagtttgaataaagaattaaataataattcaagagcactt
ttaggtggagatattgaaattgactataatcgtaatgttggcaacttagaattaattaac
caagttaaagaatttgctactgtttcacaaatggttgagtttagcaccatgatctcaact
accaaccaatctaaaaataaatcaatattttctagaattaaaacagtagatcaaaattac
ccattatttggcaaggtaggttatgaaccaagtggtgcatttgaaaaattacaaactata
gagaatacaatccttgttaatgaaaacattttcaaaaatctcaatttaaaaattaatgat
aaaatcaaagttcaagatcagttatttactgtaattggtatcgtaaaatcagtacctgat
attgggggtgcttttgtatttggtgattttgctttagctggcaaacaaacattagaatta
ttaaaacttaataatctagggagctttttaaattatgagtataaagtaaaatttaatgag
ggagataatccaaatactttatctaaaaaaattgagcagttattcaaaaatgaaaagaag
gttagaattagatatcacgaaaaatctgacggtcctttaaagagaataattgataatttc
tctcaattcttatctcttgtatcaatcagtgcaatgttaattgcaggaattggaattgct
aacactctactttcattcattaatcagaataatatgtctattgcagttaagaagtcttta
ggctttttctcaaaggatataaagatagtctactatttacaattgctcattctactattc
ataatatcaactgccgcctactcttttagtttctttctagtccctattgttgatgtttat
ctgtcagctggtcttggattaaatattgaaggtagtttttctattcttaattatttcaaa
gtttttttagtagggttattagtattaatcatattttctataccaaccattaatgcaatt
gatcaagttaaggcatcaaacttatttagaaatgtatttcaaaaccttcaattttattat
tcaaaaaaatcaattcttttaagtctgttactattatcaattttaatttctttatttacc
atcggttctgctcgacctgtttatagtttgggttattttggagctttctttgtttgttta
ttagtcttctacttattatcaaacttaatcattaaattgtttaaaggacttaaagagcat
ccaaatatttcaattaaagtatcagttaaaaatattactcaaactaaaagtattacccct
ataactattatgtctttaggtttgggggtcactttactattaactttagcttttgtaggt
tcaaattttaaaagagaaattgctaaatctataccagaacttgcgcctgattattttttc
attggtattcaaagtgatgaaagacaaatatttgaagatttaatttttgacatggataaa
gaagctaaccttgaaattgttccaatggtttcaacaggtattgtaaaaataaatggaata
gatccaaatacttatatcgattcaagtaatgatagccactgggtgatcagaaatgacaga
aggtcttcttgggctgataaagttttaaaagataacccaattgtagaaggcaaatggtgg
gatctagatagacctgataaacttcaaatttcacttgatagtaaaattgctaaagatttt
gatattaaaattggtgatatttttactcttaatatttatggacgtgaaattgaaggtgaa
atagtaaattttagattagtagactacagagatttttctattaactttgcaatgttatta
aatcctcaatttgcaaaaaatatacctcacgaatatttggctacttcaaagtttaaaagt
ttagagaattttaacgaaactgctttactagataaaatgcctagtctttctattataaaa
attactgattacttggagaaagtaacagatcttttaaacaaagtgtttattgctgtaacc
gttatctctgcaataactatagtcattggtttaattgtcatttcaagtgcaattatagtt
cagggtaaaattaaagaatttcaaaatttaatattcaaaattttaggtttttccaaagtt
gaggttatactttcttcaattattgagttttttataatattcacatccataattctaata
gctctcttttttgcgatcataggttcacaatttatcattgaaaatatttttcaaatcact
tggaagtttgatttagcaatatttttacaggtaactattggaattgggcttgcaacatta
atcttaattatgattactaattttaagtatttaagccctaaagtttatccacttataaga
aatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
