Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_1066
Help
Entry
SAR11_1066 CDS
T00257
Symbol
soxA
Name
(GenBank) sarcosine oxidase alpha chain
KO
K00302
sarcosine oxidase, subunit alpha [EC:
1.5.3.24
1.5.3.1
]
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
Pathway
pub00260
Glycine, serine and threonine metabolism
pub01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pub00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00260 Glycine, serine and threonine metabolism
SAR11_1066 (soxA)
Enzymes [BR:
pub01000
]
1. Oxidoreductases
1.5 Acting on the CH-NH group of donors
1.5.3 With oxygen as acceptor
1.5.3.1 sarcosine oxidase (formaldehyde-forming)
SAR11_1066 (soxA)
1.5.3.24 sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming)
SAR11_1066 (soxA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GCV_T
SO_alpha_A3
Fer2_4
GCV_T_C
Pyr_redox_2
FAD_oxidored
Pyr_redox_3
NAD_binding_8
FAD_binding_2
HI0933_like
DAO
Thi4
GIDA
AlaDh_PNT_C
Fer2_BFD
FMO-like
SCAF11-like_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ21871
UniProt:
Q4FLR7
LinkDB
All DBs
Position
1033446..1036454
Genome browser
AA seq
1002 aa
AA seq
DB search
MLKNLRVTTSKYIDETSRVSFKFNGKSYFGYKGDTLASALLANGIHLVGRSFKYHRPRGI
MTSGSEEPNAIVQVNNNTALTEPNVRATELEIYHGLEANSQNCWPSVNFDIGGINNFLSP
LLPAGFYYKTFMWPANFWEKYEYVIRHSAGLGKSPTVPDPDIYDHKYIHCDVLVIGAGIS
GIIAAKTAAKNNLKTLLLDEKNEIGGSTIFQNSDHIKINDQNSSVWLENEINELRNIENL
EIKTRTSVAAYHGYNYLLARENLTDHLPKNEKNKKVRQRLLKIRAKKVIVATGSLERPLV
FNNNDRPGIMLSSAVKKYADYYGVATGQKNIFLTNNDTAYESAISLQKKGIKVEAIIDIR
KQSKTAFTKEADDLGIKVYRSHTVVNTEGYKRINKITIMELSEDGQSFANPEKIELDCDC
LAIAGGWTPAVHLFTQSGGKLKFREKDQVFIPDIYSSAQISIGSCNGDFDLDDVIKNSTK
SLKEFLNINETEFDNLEINCPKDNKIRNIWLLPSDKVLGKTKPFVDYQNDATAKDIKLAL
REGFRSIEHVKRYTTTGMGTDQGKLGNMHALGIIAETAGVKMGELGTTTFRPPYTPLTFG
TIVGRNVGEYFDTFRRTPMNDWHIENKAEFENVGQWKRAWYYPKNNETMHEAVQRESKAA
RNSAGILDASTLGKIDIQGTDASEFLNRVYTNAWSKLAIGKCRYGLMLNEDGMVYDDGVT
TRLDENHYIMTTTTGGAANVLGKLEDYLQTEWPELDVYLSSVTDHYATASICGPNSKKIL
NKLIPDLDLSDESFPHMSFKNTKIGNIKCRIMRISFTGEHSYEINIQANYGEDLWKKCME
AGKEFNITPYGTETMHLLRAEKGFIIVGQDTDATMTPIDLQMDWIVSKKKYDFIGKRSLY
RSDTMKEDRKQLVGLLTDNPSEVLEEGAQIVADTSLKPVEMLGHVTSSYYSPNLNKSIAL
AVVRGGKNMLGQKLFIPMENKNINVTIVDPVFFDKENLRLNA
NT seq
3009 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaaaatttaagagttacaactagtaaatatattgatgaaacttccagagtttct
tttaaattcaatggaaaatcttattttggatacaaaggtgatacccttgcctcagctttg
ctagctaatggtattcatttagtaggaagaagttttaaatatcataggccacgaggaata
atgacttcaggatctgaagagcctaatgcaattgtacaggttaataacaacacagcacta
acagaacccaatgttagagcaaccgaactagaaatctatcatgggcttgaggcaaacagt
caaaattgttggcctagtgttaactttgatattggaggtataaataatttcttatcccca
cttctgcctgctggtttttattataaaacatttatgtggcctgctaatttttgggaaaag
tatgaatatgttataagacattcagcaggactaggaaaatctccaacagtgcctgatcct
gacatatatgatcataaatacattcactgtgatgttttggttatcggagctggcattagt
ggaattatagctgcaaaaactgcagcaaaaaataatcttaaaacattattacttgatgaa
aaaaatgaaatcggaggatctacaattttccaaaattcagatcatataaaaataaacgat
caaaattcttctgtttggttagaaaatgaaattaatgaattaagaaatattgaaaaccta
gaaattaaaacaagaactagtgttgctgcttatcatggatataactatttattagctaga
gaaaatttaactgatcaccttcctaaaaatgaaaaaaataaaaaagtaagacaaagatta
ttaaaaattagagctaaaaaagttattgttgctactggttctttagagcgacctctggta
tttaataataacgatagacctggtattatgctttcatctgcagttaaaaagtatgcagat
tattatggtgttgcaactggtcaaaaaaatatatttcttactaataatgacacagcttat
gaaagtgcaatttcattacaaaaaaaaggtattaaagttgaagcaatcatagatattaga
aagcaatctaaaactgcatttactaaagaagctgacgatttagggattaaagtttataga
tcacacacagttgtaaatactgagggttataaaagaattaataaaattacaataatggaa
ttgtcagaagatggtcaatcttttgcaaatccagaaaaaatagaacttgattgtgattgc
ctagcaattgcaggtggatggacgccagccgttcatttgtttactcaatcaggaggtaaa
ttaaaatttagagaaaaagatcaagtatttattcctgatatatattcatcagctcaaatt
agcattggttcttgtaatggtgattttgatttagatgatgttataaaaaattctacaaaa
tctttaaaagaatttttaaatataaatgaaactgaatttgacaatttagaaataaattgt
cctaaagataataagattagaaatatttggctacttccatccgataaagttttaggaaaa
acaaaacctttcgtagattatcaaaatgatgcaactgcaaaagatattaaacttgctcta
agagaaggttttagatcgattgaacatgtaaaaagatatacaacaactggaatgggtacc
gatcaaggaaagcttggtaatatgcatgcccttggtattattgcagaaactgctggtgtt
aagatgggtgagcttggaactacaacgtttagacctccttacactccattaacatttgga
acaattgttggacgaaatgttggtgaatattttgatacatttagaagaacgccaatgaat
gactggcacatagaaaataaagctgaatttgaaaatgttggtcagtggaaaagagcttgg
tactatccaaaaaataatgaaacaatgcatgaggccgttcaaagggaaagtaaagctgca
agaaatagcgctggtatattagatgcttcaactcttggtaaaattgatattcaaggaacg
gatgcttcagaatttttaaacagagtttatacaaatgcttggtcaaaacttgccattgga
aaatgtcgttatggtttaatgcttaatgaagatggtatggtttacgatgatggggtcaca
actagacttgatgaaaatcattatattatgaccacaacaacaggtggtgctgcaaacgta
ttaggaaaactagaagattacctacaaactgaatggcctgaactagatgtgtatttgtca
tctgtaacggatcattatgcaacagctagcatctgtgggcctaatagtaaaaaaattctt
aataaattaatacctgatcttgatctttcagatgaaagctttccacacatgtcattcaaa
aatacaaaaattggcaatattaaatgtagaattatgcgtattagttttactggtgaacat
agttatgaaattaatatccaagctaactatggtgaagacttatggaaaaaatgcatggaa
gcaggtaaagaatttaacatcactccttatggcactgagacaatgcacttattaagagca
gaaaaaggatttattattgttggccaagatacggatgcaacgatgacacctatagattta
cagatggattggattgttagtaaaaagaaatatgactttattggtaaaagatctctttat
agatctgacaccatgaaagaagatagaaaacaattagtaggtttactgacagataatcca
agtgaagttttagaagaaggagctcaaatagttgctgacactagtttaaaaccagttgaa
atgctaggtcatgtaacttcaagttactatagccctaatttaaataaatcaattgcccta
gcagtagttagaggtggaaaaaatatgctaggtcaaaaattatttatcccaatggaaaat
aaaaatattaatgtgacgattgttgatcctgttttttttgacaaagaaaatttgaggtta
aatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system