KEGG   Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_1066
Entry
SAR11_1066        CDS       T00257                                 
Symbol
soxA
Name
(GenBank) sarcosine oxidase alpha chain
  KO
K00302  sarcosine oxidase, subunit alpha [EC:1.5.3.24 1.5.3.1]
Organism
pub  Candidatus Pelagibacter ubique
Pathway
pub00260  Glycine, serine and threonine metabolism
pub01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pub00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    SAR11_1066 (soxA)
Enzymes [BR:pub01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.3  With oxygen as acceptor
    1.5.3.1  sarcosine oxidase (formaldehyde-forming)
     SAR11_1066 (soxA)
    1.5.3.24  sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming)
     SAR11_1066 (soxA)
SSDB
Motif
Pfam: GCV_T SO_alpha_A3 Fer2_4 GCV_T_C Pyr_redox_2 FAD_oxidored Pyr_redox_3 NAD_binding_8 FAD_binding_2 HI0933_like DAO Thi4 GIDA AlaDh_PNT_C Fer2_BFD FMO-like SCAF11-like_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAZ21871
UniProt: Q4FLR7
LinkDB
Position
1033446..1036454
AA seq 1002 aa
MLKNLRVTTSKYIDETSRVSFKFNGKSYFGYKGDTLASALLANGIHLVGRSFKYHRPRGI
MTSGSEEPNAIVQVNNNTALTEPNVRATELEIYHGLEANSQNCWPSVNFDIGGINNFLSP
LLPAGFYYKTFMWPANFWEKYEYVIRHSAGLGKSPTVPDPDIYDHKYIHCDVLVIGAGIS
GIIAAKTAAKNNLKTLLLDEKNEIGGSTIFQNSDHIKINDQNSSVWLENEINELRNIENL
EIKTRTSVAAYHGYNYLLARENLTDHLPKNEKNKKVRQRLLKIRAKKVIVATGSLERPLV
FNNNDRPGIMLSSAVKKYADYYGVATGQKNIFLTNNDTAYESAISLQKKGIKVEAIIDIR
KQSKTAFTKEADDLGIKVYRSHTVVNTEGYKRINKITIMELSEDGQSFANPEKIELDCDC
LAIAGGWTPAVHLFTQSGGKLKFREKDQVFIPDIYSSAQISIGSCNGDFDLDDVIKNSTK
SLKEFLNINETEFDNLEINCPKDNKIRNIWLLPSDKVLGKTKPFVDYQNDATAKDIKLAL
REGFRSIEHVKRYTTTGMGTDQGKLGNMHALGIIAETAGVKMGELGTTTFRPPYTPLTFG
TIVGRNVGEYFDTFRRTPMNDWHIENKAEFENVGQWKRAWYYPKNNETMHEAVQRESKAA
RNSAGILDASTLGKIDIQGTDASEFLNRVYTNAWSKLAIGKCRYGLMLNEDGMVYDDGVT
TRLDENHYIMTTTTGGAANVLGKLEDYLQTEWPELDVYLSSVTDHYATASICGPNSKKIL
NKLIPDLDLSDESFPHMSFKNTKIGNIKCRIMRISFTGEHSYEINIQANYGEDLWKKCME
AGKEFNITPYGTETMHLLRAEKGFIIVGQDTDATMTPIDLQMDWIVSKKKYDFIGKRSLY
RSDTMKEDRKQLVGLLTDNPSEVLEEGAQIVADTSLKPVEMLGHVTSSYYSPNLNKSIAL
AVVRGGKNMLGQKLFIPMENKNINVTIVDPVFFDKENLRLNA
NT seq 3009 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctaaaaaatttaagagttacaactagtaaatatattgatgaaacttccagagtttct
tttaaattcaatggaaaatcttattttggatacaaaggtgatacccttgcctcagctttg
ctagctaatggtattcatttagtaggaagaagttttaaatatcataggccacgaggaata
atgacttcaggatctgaagagcctaatgcaattgtacaggttaataacaacacagcacta
acagaacccaatgttagagcaaccgaactagaaatctatcatgggcttgaggcaaacagt
caaaattgttggcctagtgttaactttgatattggaggtataaataatttcttatcccca
cttctgcctgctggtttttattataaaacatttatgtggcctgctaatttttgggaaaag
tatgaatatgttataagacattcagcaggactaggaaaatctccaacagtgcctgatcct
gacatatatgatcataaatacattcactgtgatgttttggttatcggagctggcattagt
ggaattatagctgcaaaaactgcagcaaaaaataatcttaaaacattattacttgatgaa
aaaaatgaaatcggaggatctacaattttccaaaattcagatcatataaaaataaacgat
caaaattcttctgtttggttagaaaatgaaattaatgaattaagaaatattgaaaaccta
gaaattaaaacaagaactagtgttgctgcttatcatggatataactatttattagctaga
gaaaatttaactgatcaccttcctaaaaatgaaaaaaataaaaaagtaagacaaagatta
ttaaaaattagagctaaaaaagttattgttgctactggttctttagagcgacctctggta
tttaataataacgatagacctggtattatgctttcatctgcagttaaaaagtatgcagat
tattatggtgttgcaactggtcaaaaaaatatatttcttactaataatgacacagcttat
gaaagtgcaatttcattacaaaaaaaaggtattaaagttgaagcaatcatagatattaga
aagcaatctaaaactgcatttactaaagaagctgacgatttagggattaaagtttataga
tcacacacagttgtaaatactgagggttataaaagaattaataaaattacaataatggaa
ttgtcagaagatggtcaatcttttgcaaatccagaaaaaatagaacttgattgtgattgc
ctagcaattgcaggtggatggacgccagccgttcatttgtttactcaatcaggaggtaaa
ttaaaatttagagaaaaagatcaagtatttattcctgatatatattcatcagctcaaatt
agcattggttcttgtaatggtgattttgatttagatgatgttataaaaaattctacaaaa
tctttaaaagaatttttaaatataaatgaaactgaatttgacaatttagaaataaattgt
cctaaagataataagattagaaatatttggctacttccatccgataaagttttaggaaaa
acaaaacctttcgtagattatcaaaatgatgcaactgcaaaagatattaaacttgctcta
agagaaggttttagatcgattgaacatgtaaaaagatatacaacaactggaatgggtacc
gatcaaggaaagcttggtaatatgcatgcccttggtattattgcagaaactgctggtgtt
aagatgggtgagcttggaactacaacgtttagacctccttacactccattaacatttgga
acaattgttggacgaaatgttggtgaatattttgatacatttagaagaacgccaatgaat
gactggcacatagaaaataaagctgaatttgaaaatgttggtcagtggaaaagagcttgg
tactatccaaaaaataatgaaacaatgcatgaggccgttcaaagggaaagtaaagctgca
agaaatagcgctggtatattagatgcttcaactcttggtaaaattgatattcaaggaacg
gatgcttcagaatttttaaacagagtttatacaaatgcttggtcaaaacttgccattgga
aaatgtcgttatggtttaatgcttaatgaagatggtatggtttacgatgatggggtcaca
actagacttgatgaaaatcattatattatgaccacaacaacaggtggtgctgcaaacgta
ttaggaaaactagaagattacctacaaactgaatggcctgaactagatgtgtatttgtca
tctgtaacggatcattatgcaacagctagcatctgtgggcctaatagtaaaaaaattctt
aataaattaatacctgatcttgatctttcagatgaaagctttccacacatgtcattcaaa
aatacaaaaattggcaatattaaatgtagaattatgcgtattagttttactggtgaacat
agttatgaaattaatatccaagctaactatggtgaagacttatggaaaaaatgcatggaa
gcaggtaaagaatttaacatcactccttatggcactgagacaatgcacttattaagagca
gaaaaaggatttattattgttggccaagatacggatgcaacgatgacacctatagattta
cagatggattggattgttagtaaaaagaaatatgactttattggtaaaagatctctttat
agatctgacaccatgaaagaagatagaaaacaattagtaggtttactgacagataatcca
agtgaagttttagaagaaggagctcaaatagttgctgacactagtttaaaaccagttgaa
atgctaggtcatgtaacttcaagttactatagccctaatttaaataaatcaattgcccta
gcagtagttagaggtggaaaaaatatgctaggtcaaaaattatttatcccaatggaaaat
aaaaatattaatgtgacgattgttgatcctgttttttttgacaaagaaaatttgaggtta
aatgcttaa

DBGET integrated database retrieval system