Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_1297
Help
Entry
SAR11_1297 CDS
T00257
Symbol
opuAB
Name
(GenBank) glycine betaine/L-proline transport system permease
KO
K02001
glycine betaine/proline transport system permease protein
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
Pathway
pub02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pub00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SAR11_1297 (opuAB)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pub02000
]
SAR11_1297 (opuAB)
Transporters [BR:
pub02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Glycine betaine/proline transporter
SAR11_1297 (opuAB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ22100
UniProt:
Q4FL38
LinkDB
All DBs
Position
complement(1230571..1232724)
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MELLKKYPKFFQWLFLLIVFFSLCFAIEVPETYNFIRGQAEFIKDPNQSTYTLFGAEVRY
YAFDVFWRLPPLLGWLPIWINDSLFFLMNEWMPMEFWNEDIQEFRTQPLLLQITRNLTSF
MTFLIELIREILLGGVETIVSFSSWDWIDANPWAELPGLPWTIVTAGAVILGYKLSGKGL
ALFAGLVMIYISVFGQWKPSMQTLSFILVAAPLSFLFGLTFGVMAFKSKRVEKFLYPILL
VMQTMPQYAVLVPAIVLFGIGDHAAVIITMVVAVPPMILLTLLGLRGIPSEVIEAGRMSG
CNNWQLMTKVLIPTARRDILIGVNQVIMVCFSMAVISAFIGAKGLGFNLLLALNQLNIGL
ALEAGLCISLIAILLDKMSLAWANKQIDYFGNLTYFQRNKNILFFAAAVILGIIFSYLGS
FYFKDGSNYLFEVPHNKGISTADFWNKGVDWIWDTFFHTLKIFNTWLIVDVLQPMRALYL
RMPAVATLVLVIGAGYIIGGIRSALVVGGLTLFIALSPWWDRALVTLYMATFGVFISTII
GFTVGIISFQNKHTANFMLGVCDIFQTFPSFVYLIPVMMLFGVTDTSVLIAVIVYATIPA
TRYTIEGLRSVPEALHDAATMSGVNKVQRLLKIEFPLAFPHMMLGLNQTIVFALFMVIIG
AFIGTEDLGQYILKALSDKKGAGIGLTLGLCVAFIGLIFDHLIRTWVGKRKKHLGIG
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaattattaaaaaaatatccaaaattttttcaatggttatttttgttaattgtattt
tttagcttatgttttgcaatagaagttcctgaaacttataattttataagaggccaagcc
gaattcattaaagaccctaatcaaagtacttacacattatttggtgctgaggtgagatat
tatgcgtttgatgttttttggagactaccacctttacttggatggttgcctatttggata
aacgattctttattttttttaatgaatgaatggatgccaatggagttttggaatgaagac
attcaagagttcagaactcaacctctacttttacaaattacaagaaatttaacttcattt
atgacgtttcttatagagttaataagagaaattttattaggaggtgttgaaacaattgtt
tcatttagtagttgggattggatagatgcaaatccatgggcagaactgccaggattacct
tggacaatcgttacagcaggtgcggtaatacttggatataaattaagcggtaaaggctta
gctttatttgcaggtttagtcatgatttatatttctgtttttggtcaatggaaaccttcg
atgcaaactctttcttttatattagtagcagcaccactttcttttctttttggtttaact
tttggagttatggcatttaaaagcaaacgtgtagaaaaattcttatatccaatacttttg
gttatgcaaactatgcctcaatacgcagtattagttcctgcaattgttctttttggcatt
ggtgatcatgctgcagttattataactatggttgtagcggttccaccaatgatattatta
accttgttaggtctaagaggaataccctctgaggttattgaggctggtagaatgagtggg
tgtaataattggcaactgatgactaaagtattaattcctactgctagaagagatatttta
attggagttaaccaggtcataatggtgtgtttttctatggcagttatttcagcttttata
ggagcaaaaggtttagggtttaatttattattagcattaaaccagctaaatattggatta
gcattagaggctggtttatgtattagtttgattgcaatacttttggataagatgtcctta
gcttgggcaaataagcaaatagattattttggtaacttgacttattttcagcgtaataaa
aatatattattttttgcagctgctgtaattctaggaattattttttcatatctggggtca
ttttattttaaagatgggtctaattatttatttgaagttcctcacaataaaggaatatca
acagcagatttttggaataaaggtgtggattggatttgggatactttctttcatacttta
aagatttttaatacttggttgatagtagatgtgttgcaacccatgagagctttatattta
agaatgccagcagttgctactttagttttagtcattggagcgggttatataattggagga
attcgttcagctcttgtagtgggcggattaactttatttattgcattgagtccttggtgg
gatagagctttagttacattgtacatggcaacttttggagtttttatatccactataatt
ggatttacagttggaattatatcatttcaaaacaagcatactgcaaattttatgctgggc
gtttgtgatatctttcaaaccttcccttcgtttgtatacttgattcctgtgatgatgctt
tttggagttacagatacttcagtattaattgctgtaatagtttatgcaactatacctgca
acaaggtatactattgaaggtttaagaagtgttccagaagctttacatgacgctgccaca
atgtcaggtgtaaataaagtacaaaggttattaaaaattgaattccctttagcttttcct
cacatgatgcttggtttaaatcaaacaattgtatttgctttgttcatggtaattattggg
gcttttattggaacagaagatttaggacagtacattctaaaagctctatctgataaaaag
ggtgcaggtataggattgacattgggactttgtgttgcttttattggcctaatatttgac
catttaatcagaacgtgggttgggaaaagaaaaaaacaccttggtataggatag
DBGET
integrated database retrieval system