Polaribacter sejongensis: NQP51_03015
Help
Entry
NQP51_03015 CDS
T08505
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug domain-containing protein
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
pun
Polaribacter sejongensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pun00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pun02000
]
NQP51_03015
Transporters [BR:
pun02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NQP51_03015
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWD32651
LinkDB
All DBs
Position
complement(780612..782549)
Genome browser
AA seq
645 aa
AA seq
DB search
MKKQLLIVGVLACSFASTNLFAQQKEKVEALDEVVVTATKFNLKKENTGKVIQKITQKEL
QQNAGKNVIEILNNVVGIDVRGVNSNASEPRSINIRGGRNRQVLVLIDGVPVTDQSAINQ
QFDLRLLAVSQIESIEILKGASSTLYGSGAATAVINVVLKKASEDKISGSFETSVGTNNT
ANVKGSGLSDNNQNVSLNGTLGKLNFLGSFSITGTDGMSAAKSKTNAVYENDSFYSKNAL
LKLGYAVNDKFSIETFLNYDDFDYDFDAGAFSDSDVNTGDQEQFRVGVKPKYTYNKGEVY
LLASANVVERNLEQFNSFAGTLDNYEFVGRSVNLDLVNRYDFKDGKIQLITGLNYQIHSN
NTVTPFAEIEKGIANFNTVDPYASVVYITDFGLSANVGGRLNIHNVYGNHAVYDGNLAYS
VLKNENASIKLLTSYSTAFITPSLYQLYDGFSGNLDLKPESNETFEAGFDVNYKDWLQFD
VVYFNRKEEDAIIYDNATYKYGNGSSDANGLEINTNITPLKFLTVNASYTYVDKDNTEDF
NDYIPANKFVAGLDVNAFTNTFFNITYKNVGDRSIFDRYGSFGAAGEDVTLESYQVLDFA
ANYKLLEDTVTLFGGVTNILNEDYDDILGFSTRGRNFKLGVRLQF
NT seq
1938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacaattattaattgttggtgttttggcatgtagttttgctagcacaaatctt
tttgcacaacaaaaagaaaaagtagaggctttagatgaagttgttgttacagcaacaaaa
ttcaatctaaaaaaagagaataccggtaaggtaattcagaaaattactcaaaaagaattg
caacaaaatgctggtaaaaatgttattgaaattctaaataatgttgttggtattgatgtt
agaggtgtaaattctaatgcatcagaaccaagaagtattaatattagaggaggaagaaat
aggcaagttttagttttaattgatggtgtgccggttacagatcaatctgcaattaatcaa
caattcgatttacgtttattagccgttagtcaaatagagtctattgaaattttaaaaggt
gcatcatctacattatacggttctggagcagctactgcagttattaatgttgttttaaag
aaagcatcagaagataaaatttctggttcttttgaaacaagtgttggtacaaataatacc
gcaaatgttaaaggaagcggattgtctgataacaaccaaaacgtaagtttaaacggtact
ttagggaaacttaatttcttaggttcttttagtattactggaacagacggaatgtctgct
gcaaaaagtaaaacaaatgctgtttatgaaaatgatagtttttacagtaaaaatgcattg
ttaaaattaggttatgcagtaaatgataagttttctatagagactttcttaaattatgat
gattttgattatgattttgacgcaggggctttttctgatagtgatgtaaatacaggagat
caagagcagtttagagttggtgtaaaaccaaaatacacttataataaaggagaagtttac
ttattagcttctgcaaatgtggtagaaagaaatttagagcaattcaattcttttgctggt
actttagacaactacgaatttgttggtagaagtgtaaatttagatttagtaaatagatat
gattttaaggatggtaaaattcaattaattacaggtttaaattatcaaattcacagtaat
aatacagttactccttttgcagaaattgaaaaaggaattgcaaattttaatactgtagat
ccttatgcaagtgtagtgtatataacagattttggtttaagtgccaatgtaggtggacga
ttaaatattcataatgtatatggtaatcatgcagtttatgacgggaatcttgcgtactca
gttttaaagaatgaaaatgcttctattaaattattaacttcttatagtacagcttttatt
acaccaagtttgtatcaattatatgatggtttttctggtaatttagatttaaaaccagaa
tctaatgaaacttttgaagcaggctttgatgtaaattataaagattggcttcagtttgat
gtggtttattttaatagaaaagaagaagatgcaattatttatgataatgctacctacaaa
tatggtaatggttcttctgatgcaaatggtttggaaataaataccaatattacgcctctt
aaatttttaactgttaacgcttcttatacatatgtagataaagataatacagaagatttt
aacgattatattcctgcaaataaatttgtagctggtttagatgtaaatgcttttacaaat
acattctttaatattacttataaaaatgtaggtgatagaagtatttttgataggtatggt
tcttttggagctgctggagaagatgttactttagaaagttaccaagtattagattttgct
gctaattataaattattagaagatactgtaactttatttggtggagttacaaatatttta
aatgaagattacgatgatattttagggttttctacacgtggtagaaactttaaattagga
gtaagacttcagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
