Polaribacter sejongensis: NQP51_06610
Help
Entry
NQP51_06610 CDS
T08505
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
pun
Polaribacter sejongensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Por_Secre_tail
DUF642
LT-IIB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWD33347
LinkDB
All DBs
Position
1594506..1603721
Genome browser
AA seq
3071 aa
AA seq
DB search
MKNKYLFVKGLIICNFLFFFITNTQAQTTPTNAISIKEGVSFQWASDQTKRTDAANIKSF
TVDGTVFDLFAVPSGYQLTQLGPDGQGQNAIKENGKTPISGSGSGPYTNPLLNGYGSDAW
NTAALAAFKDKNLNHYFTSSKNGRNLNYKFDAEITTDAQRQSLLYAPAIPSNEGAIVAIT
ERNANNAYHIEVFGIPSAGEKEQPLGETFVRANSITERGHGGTGSGTGDNIGTEGTVKEP
SENSDYWLSDRVVENNGTIGIALFYLSEIAPIGSKITRVQLTAATRDHGDGKFFILQSYA
TDSQEEIIWNQTFLNGDVTTNNQVPDGSTYSNISTPSNGTLVFNADGTYEYTPNTNFVGV
DTFKYQVCLPVPNTATCDTATVTITVRRDSDGDGVPDYLDLDSDNDGILDTVESGGNDPY
GDEDNDGIFNYQDNEDNGNGGPGGTTDYTDTNNDGIPDVYDFDGDGIPNHLDLDSDNDGI
TDVIEAGGTDNNNDGKADGDVNEDGIPSSAGSGLVPTNSDSDNLPNFLDLDSDNDGIYDL
LEAGGTDTDNNGIVDNLSDLDNDGLADIYDDTCEIPAIPGSTFYATAITDSRHFTNTSNT
IGNPGTTFATGPSTYPGSNPYYIIFDFAETIPNGAEVTFYLGATTTSTKFQVRQTNKPSF
SQDEGSNFKEFTNINTSGPSTYTYTTIGESEYLKIRTYETNEARIYGVKVTITGTDAISC
KGTGLIPRETTPGTPDYINKDSDGDGCSDVKEARFTDADNDGEIDGTGISTSGTVLGSDG
YTGTTSAVTDSSDNATCLDTDGDGVPDYLDLDSDNDGIPDSIEYSDSANCFEGSVSGINE
IALNPYTTGTNLASQLPLKGLSNGSFNIDVTLNGSAFLTDNNGVQINTNDAIGEHIYFQP
KGTAILSTGNYATIIITFPKPVSGLSFKVAGVNGQDYYEMNASYNGLPKTVDNSNFTNFN
PNNFSDSDGWQFVKPNQIVGHQNGGGTDVTENTFTFSVDGLVDTITIRTGKQQSNQDGNG
STVTSAITSMNFCPLTDTDGDGIPDYLDLDSDNDGIPDIVEAGGIDTNGDGLIDYPIAGD
PTSMVDLDGDGLADMYDDTDSAGNTPNWVAGTPIANPDSDGDGIKDYLDLDSDNDGIPDL
VEAGGIDTNGDGRVDNTTDIDQDGLADIHDENASNGPGASGTNGTALIKTDAAGNMISGN
DTSIDTDGDGIPDHLDLDSDNDGIPDLVEAGGVDTNGDGRVDTNLDADKDGLADIYDENA
SDGPRLDGINGTALVETDETGKMIGGDGTSIDTDNDGIPDHLDLDSDNDGIPDLIEAGGI
DTDKDGRVDSILDEDKDGLADIYDENATDGPGAGGTNGIALVETDTTGKMVSGNGESIDT
DSDGIPDHLDLDSDNDGIPDIVEAGGVDTNGDGKVDDINPTTGKLINDLDGDGLDDLYDV
NSGTYTNAITYPDSDKDGIPNTKDLDSDNDGILDVIEAGGIDEDRDGKVDNWVDIDNDGF
NDLVDGDVGQDGIAENKDNALIITGKDTNGDGKPNSYPSKDYDGDGKLNHIDIDSDNDGI
PDNIEAQTTSGYIAPSNPDGAMLDTNKNGVDDNYEDGNIIGLIPVNTDNKDNPDYLDLDS
DNDGIPDIVENGDPANNVILDINADEDGDGLNDIFDDNNDSENSRITVNDGSSAQKTVTT
PSELDIAFGDEDNDFPGNGDLDYRDIKDTDNDGVPDFYDLDDDNDGILDTDEGCGNLIIN
GDFELQDFSNASDFPNGGTDNFGTFIGKTLNTNTLTGWSYTQNLDGWVGGQSPSWLTSNY
AAAYSGNQYIDVLGNNDKSDGNVSNILSQTFSTVPGSEYTLTFYWGEDIGHETGQDVTLN
VKVKDASSSNILNKTLTAIAEGAVNGVVGPKKWYRFTTVFVATTTETSLEFQASPPVPGS
IGIGAALDLVSVFSNNCEDTDNDGIPNSLDLDSDNDSISDLIEAGGIDTNGDGLVDNINA
DGTLINDTNGNGLDDLYDADVAGGNNLENTDTDGDGIPNSIDLDSDNDGILDIIEAGGTD
ANRDGKVDTINADGTLTTDTNNNGFDDAVDGAINSSTPLVITGEDTDGNGKPNTYTKGDE
DKDNIPNFLDIDADNDGIPDNVEAQTTIGYKAPSGIATGITDTNNNGVDDIYEDDNKIGL
IPENTDGTDNPDYLDLDSDNDNIPDIAENGHLLDVASGKDDDNDGLDNAFDDNDDSDIAG
STVNDGSGDGDKVTNTSILDTSLEDAFGDEDNDVNTGGDLDYRDIPEAANVMITQVYHLG
NEKWIEITNISASTILANSVKIHLFKDKIGDQTNIAPNASYILTTPLLAGKSVLFRNSSN
TLTPELVTGRTIVDNDALTDLDDTINDIIILSASNGVYSWDHRYDVVSNVTNNTSVVRID
ESLTTNKDYNANDWVVFIDDAITPFQLVGETDVTGTKRHPQDPLISEITSSNVESNTLLG
LHRIDITTSTNSNNVYTNGYPDRSRSVVIDQNFEHSEDRLSARKLRVNASKKLTVTDQLL
VVTNDITLDGDIRLAGTLAQLVQTHTGTSTITSSVSGTMGNLLVDQNSEIPSLYRYGYMS
SPVNSGVNNYTIEGVLRDGTAPSNPKEITFIDGYDGSFTSTGISLADYWIYTYAPGSDGR
SDWAHQYKSGTINRGEGYIFKGPGRAQNYTFSGTPNDGDFSTTSKIASGESYLIGNPYPS
AMNTKKFIQDNLANTTGTLYFWEHHESVLGEGDGIAGHVFGGYIGGYATINFVTGVAADR
IENLSINNDSGTSGLGDQEYKEPLPYIAMGQGFFIEGDAVIETPQAVNFNNSQRAYVTEG
DESVFFKTSKKSSKTASTTNLLPIIKLGFEYKNTEETLLHHQIAVSFQGTNSFDFDKGYD
SQVYQIGNTDIYWKFPNDDNNYVIAGVQGISNELEVPLELVMDYSGQVNLMVDEIQNISR
DIYITDKLTGTSYDVKNEKITLTLEKGVYTDRFVLNFIENAALSVDYEILSTSTNIYADN
ENHNIIVSKDGDVEINKVEMFDILGKKVSVWEIKEQKNTYQLEIKKQIPTGIYIVKMNTN
KGETNKKVIIE
NT seq
9216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaatacttatttgtaaaagggttaattatatgtaatttccttttctttttt
atcacaaatactcaagcgcaaactacacctacaaacgcaataagcattaaagaaggtgtc
agttttcaatgggctagtgatcaaactaaaagaacagatgccgctaacataaaaagtttt
acggtagatggcacagtgtttgatttattcgcagttccttcaggttatcaattaacccaa
ttagggccagatggtcaaggtcaaaatgccattaaagaaaatggtaaaacacctatatca
ggtagtggaagcggcccttatactaaccctttactaaatggttacggaagtgatgcttgg
aatacagcagccttagcagcttttaaagataaaaatttaaaccactattttacatctagt
aaaaacggaagaaatcttaattataaatttgatgcagaaataactacagatgcacaaaga
caatcattgttatatgctcctgcaattccttctaatgaaggagcaattgtagcaattaca
gagcgaaacgctaacaacgcttaccatattgaagtttttggtataccttctgctggtgaa
aaagaacaacctttaggagaaacttttgtacgtgcaaattctattactgaacgaggtcat
ggtggtacaggtagcggtactggcgataacataggtactgagggaactgtaaaagagcca
agtgaaaattcagattattggttatcagaccgagttgtagagaataatggaacgataggg
attgccttattttatttaagtgaaatagctcctattggctctaaaattactagagttcaa
ttaactgctgctacaagagatcatggtgatggaaaatttttcatacttcaatcttatgct
acggactctcaagaagaaattatttggaaccaaacttttttaaatggtgatgttacaact
aacaatcaagtaccagatggttctacttacagtaatatttcaacccctagtaacggtact
ttagtgtttaatgcagacggtacttatgagtacacaccaaatacaaattttgtaggagta
gacacttttaaataccaagtatgtttaccagttccaaatacagcaacttgtgacactgca
acagttacaattactgttagacgtgattctgatggtgatggcgttccagattacttagat
ttagatagtgataatgatggtattttagatactgtagaaagtggtggaaatgatccttat
ggagatgaagacaatgatggtatatttaattaccaagataatgaagataatggaaatggt
ggaccaggtggtactacagactatacagacacaaataatgacggtatacctgatgtttat
gattttgacggagacggaattcctaaccatttagacttagattctgataacgatggtatt
actgatgttatagaagctggtggaacagataacaacaacgatggtaaagcagatggagat
gtaaatgaagatggtataccaagttcagcaggatcagggttagttcctactaattcagat
tcagataatcttccaaatttcttagacttagattctgataatgatggtatttatgatcta
ttagaagctggtggaacagatacagataacaacggaatagttgacaatttaagtgactta
gacaacgatggcttagcagatatttatgatgacacttgtgaaataccagctattccaggg
agtacattctatgctacagctattacagattcaagacattttacaaacactagtaatacc
ataggtaatcctggtactacttttgctacaggtccttctacatatcccggatcaaatcct
tattatattatttttgattttgcagaaacaatacctaatggtgcagaagtaacattttat
ttaggtgcaactacaacttcaacaaaatttcaagtaaggcagactaacaaacctagtttt
agtcaagatgaaggaagtaattttaaagaattcaccaatattaacacaagtggtcctagt
acttacacttacactacaattggagaatcagaatatctaaaaatacgaacttatgaaact
aacgaagctcgtatatatggagtaaaagttactataacaggtacagacgcaatatcttgt
aaaggtactggcttaataccaagagaaacaactcctggtacaccagattatataaataaa
gattcagatggagatgggtgttctgatgttaaagaagctcgttttacagatgcagataat
gatggagaaatagacggtacaggtatttctacctcaggtacagtccttggtagcgatggt
tatacaggtacaacttctgctgtaacagatagttctgataacgctacttgtttagataca
gatggtgatggtgttccagattacttagatttagattctgataatgatggtatcccagac
tcaatagaatacagtgattctgcaaattgttttgaaggctcagtttcgggtataaacgaa
atagcattaaacccttatacaacaggtacaaacttagcttcacaattaccgctaaaaggt
ctttcaaacggatcctttaatatagatgtcactttaaatggtagtgcgtttttaacagat
aataatggtgttcaaataaatacaaatgatgctattggagaacacatctattttcaacct
aaaggaacagcaattttatcaacaggaaattatgcaacgattataataacatttcctaaa
ccagtttctgggttatcttttaaagtagcaggagtaaatggtcaagattattatgaaatg
aatgcttcttataatggtttgcctaaaactgtagataattctaatttcactaattttaat
ccaaataactttagcgatagtgatggttggcaatttgtaaaaccaaaccaaattgtaggt
caccaaaatggtggtggaactgatgttacagaaaacactttcactttttcagtagatggt
ttagtagatacgattacaataagaacaggtaaacaacaatctaaccaagatggtaatggt
agtacagtaacttctgcaataacctcaatgaatttctgtccacttacagatacagatgga
gatggtattccagattatttagatttagattcagataacgatggtattccagatatcgta
gaagcaggtggtatagatacaaatggtgatggattaatagattatccaattgcaggagac
cctacaagtatggtcgatttggatggtgatggtttagcagatatgtacgatgatacagat
tctgcaggaaacacacctaattgggttgcaggaacaccaattgccaatccagattcagat
ggagatggtattaaagattacttagatttagattcagataacgatggtattccagacctt
gtagaagcaggtggtatagatactaacggtgatggacgtgtagataacactacagatatt
gaccaagatggtttagcagacattcatgacgaaaacgcttctaacggacctggtgctagt
ggtacaaatggtacagctcttattaaaacggatgcagcaggtaacatgataagtggaaat
gatacttctattgatactgatggtgacggaattcctgatcacttagacttagattcagat
aatgatggtattccagacttagtagaagctggtggtgtagatactaatggtgacggacgt
gtagacacaaatttagatgcagacaaagatggacttgcagatatttatgatgaaaatgct
tctgatggaccaagattagatggtataaatggtacagctcttgtagaaacggatgaaaca
ggtaaaatgataggtggagatggtacttctattgatactgataacgacggaatccctgat
catttagacttagattcagacaatgatggtatccccgatttaatagaagcaggtggtatt
gacacagataaagacgggcgtgtagactcaattttagatgaagacaaagatggtttagca
gatatttatgatgaaaatgctacagatggaccaggggcaggtggtacaaacggtattgct
cttgtagaaactgatactacaggtaaaatggtaagtggaaatggtgaatctatcgataca
gatagcgacggaattcctgatcatttagacttagactcagataatgatggtattcctgat
attgtagaagctggaggtgtagatactaatggtgacggtaaagtagatgacataaaccca
acaacaggaaaacttataaatgatttagacggcgatggtttagatgatctttatgatgta
aatagcggtacatataccaatgcaattacatacccagactcagacaaagatggtattcca
aacaccaaagacttagattcagataacgatggtattttagacgttatagaagcaggtggt
atagatgaagatagagatggtaaagtagataattgggttgatattgataacgacggtttt
aacgaccttgttgatggagatgttggtcaagacggcatagcagaaaacaaagacaacgct
ttaataattacaggtaaagacacaaatggagatggtaaaccaaactcatatccaagtaag
gattatgatggagacggtaaattaaaccatatagatatcgattcagataatgatggtata
ccagataatatagaagcacaaacaactagtggttatatagcaccaagcaatcctgatgga
gcaatgttagacactaataaaaatggtgtagacgacaactacgaagatggtaatattatt
ggtttgatccctgtaaacacagacaataaagataatccagattacttagatttagattca
gataatgatgggattcctgatattgtagaaaacggtgatcctgcaaataatgtaatttta
gacatcaatgcagatgaagatggtgatggcttaaatgatatttttgacgataacaatgat
tctgaaaactcaagaattacagtaaatgatggatcaagtgcacagaaaactgtaactaca
ccaagtgaattagatattgcctttggagatgaagataatgacttccctggaaacggagat
ctagattatagagacattaaagacacggacaacgatggtgttccagatttttatgattta
gatgatgataacgatggtattttagatacagatgaaggttgtggtaacttaattataaat
ggagattttgagcttcaagatttttcaaacgcatctgattttccaaacggaggtacagat
aattttggtacgtttataggaaaaactttaaatacaaacactttaacaggttggagttat
acacagaacctagacggatgggttggaggacaatctccaagttggttaactagtaattat
gctgccgcttatagcggaaaccaatacatagatgttcttggtaataacgataaaagtgat
ggaaatgtaagtaatattctctcacaaactttttctacagtaccaggtagtgaatataca
ctaaccttttattggggagaagatattggtcatgaaacaggacaggatgttactttaaat
gtaaaagtaaaagacgcttctagttctaatattttgaataaaacattaaccgcaatagca
gaaggtgctgtaaacggagttgtggggcctaaaaaatggtatcgttttactacagtattt
gtagctactacaacagaaacatcattagagtttcaagcatctcctcctgtaccaggttct
ataggaattggtgcagctttagatttagtaagtgttttttcaaataattgtgaggataca
gataatgatggtattcctaattctttagatttagattcagataatgatagtatttcagac
ttaattgaagctggtggtatagatactaatggagatggattagtagacaatattaatgca
gacggtactcttataaatgatacaaacggtaatggattagacgacctttatgatgctgat
gttgctggaggtaataatctagaaaacacagatacagatggagatggtataccaaatagc
atcgatttagactcagacaacgatggtattctagatattattgaagctggaggaactgat
gctaatagagacggtaaagtagatactattaatgctgatggtacactaaccacagacaca
aacaataatggttttgatgacgctgtagatggggctataaattcaagtacacctttagta
ataacaggtgaagatacagacggaaatggaaaaccaaatacatacacaaaaggtgatgaa
gataaggacaacattcctaactttttagacattgatgcagataatgatggaattccagat
aatgtagaagcacagacaactattggatataaagctccatctggtatagctacaggaata
acagatacaaataataatggtgtagatgatatttacgaagatgataataagattggtttg
attccagaaaatacagatggtacagataatcctgactatttagatttagattcagacaat
gataatattcctgatattgcagaaaacggacacctattagatgttgcttctggtaaagat
gatgataatgatggtttagataatgcattcgacgataatgatgactctgatattgcagga
tctacagtaaatgatggatcaggagatggtgataaggtaaccaacacaagtattttagat
acttctttagaagatgcatttggagatgaagacaatgatgttaatactggtggagattta
gattatagagatattcctgaagctgctaatgttatgataacgcaagtatatcaccttgga
aatgaaaaatggatagaaattactaacataagtgcttctacaattcttgcaaatagtgtg
aaaattcatttatttaaagataaaataggagatcaaacaaatattgctcccaatgcatct
tacattttaacaactcctttacttgctgggaaatcagtattatttagaaactcgagtaat
actcttactccagaattagtaacaggtagaacaattgtagataatgatgcattaacagat
ttagatgatactattaacgatatcattatattatctgcatctaatggagtttattcttgg
gatcatagatatgatgttgtttctaatgttactaacaacacttctgttgttagaatagac
gaaagtttaacaacaaacaaagattataacgcaaatgattgggtagtatttatagatgat
gcaataacaccatttcaattagtaggagaaacagatgttacaggaactaaaaggcaccct
caagatcctttaatctctgaaattacatcttctaatgtagagtctaatactttattagga
ttacatagaattgatattactacttcaacaaatagtaacaatgtttatacaaatggatat
ccagatagatctcgttcagtagtaattgatcaaaatttcgaacattctgaagatagatta
agtgctagaaaattaagagtaaatgcaagtaaaaaactaacagtaacagaccaattatta
gtagtaactaatgatattactttagatggagatattcgtttagcaggtactttagctcaa
ttagtacaaacacatacaggtacaagtacaattacgagctctgtttctggaactatgggg
aaccttttagtagatcaaaactcagaaataccaagtttatatagatatggttacatgagt
tctcctgttaattctggcgtaaacaactacacaatagaaggtgtattaagagacggtact
gccccaagtaatccaaaggaaattacatttattgatggatatgatggttcatttactagc
acaggtatttcactagctgattactggatatacacctatgcacctggatctgatggtaga
tctgattgggcacatcaatataaaagtggtactataaacagaggtgaaggttatattttt
aaaggccctggaagagcacagaattatacattctctggtacgcctaacgatggtgatttt
agcacaacttctaaaatagcttcaggagaaagttatttaattggtaacccttacccttct
gctatgaatactaagaaatttatacaagataatttagctaatactaccggaacactttac
ttctgggaacatcatgaaagcgttcttggagaaggagatggaattgctgggcatgtattt
ggtggttacattggtggatatgcaaccataaacttcgttacaggagtagcagcagatcga
atagaaaaccttagtattaataatgatagcggaacttctggtttaggcgatcaagaatac
aaagagccgttaccttatatagcaatgggtcaaggattctttattgaaggagatgcggta
atagaaacaccacaagcagtaaactttaataatagccaaagagcttatgttacagaagga
gatgaatctgtattctttaaaacaagcaaaaaaagcagcaaaacagcaagtacaactaac
ttgttaccaattattaagctaggttttgaatacaagaacacagaagaaacattacttcac
catcaaatagcagtttcttttcaaggaacaaactcatttgattttgataaaggatatgat
tctcaagtatatcaaattggtaatacagacatctactggaaattccctaatgatgataac
aactatgtaattgcaggtgtacaaggaatatctaatgagttagaagtacctttagaatta
gtaatggattattctggtcaagtaaacttaatggtagatgaaattcaaaatatttctaga
gacatctatattacagataaacttacaggaacttcttatgatgttaaaaacgagaaaata
actttaactttagaaaagggagtttatacagatcgttttgtacttaattttatagaaaat
gctgcacttagtgtagattacgaaattttatcaacatctacaaatatttatgcagacaat
gaaaaccacaatattatagtttctaaagatggtgatgtagaaatcaataaagtagagatg
tttgatattcttggtaaaaaagtaagtgtttgggaaattaaggaacaaaaaaatacgtac
caattagaaatcaagaagcaaataccaactggtatttacattgtaaaaatgaatactaat
aaaggtgaaacaaataaaaaagttattattgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system