Polaromonas vacuolata: HC248_01837
Help
Entry
HC248_01837 CDS
T06542
Symbol
tycA
Name
(GenBank) Tyrocidine synthase 1
Organism
pvac
Polaromonas vacuolata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
PP-binding
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJC56531
UniProt:
A0A6H2H9H7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1992985..1996989)
Genome browser
AA seq
1334 aa
AA seq
DB search
MRNEVLVDSFLQGQHRPELIRDESLADLFEATAERTPAQTALLFGSYSLSYLELNNRADL
AASHLIASGIVPGQIIGLWLPRGIELLVMQLAISKAGAAWLAFDADTPVERILVCLLDAN
AAGVVSCEIFKPRLDECSCPVWTAEVLSEQSQLDLRRRVDLLPSHPAYVIYTSGSTGKPK
GIVINHGSICHFLRSENALLGVTASDRVYQGFSLAFDMSFEEIWISYLVGASVWIAPSQI
ASDPEAIPLALSDNAITVLHAVPTLLALFNRDVSSLRLINLGGEICPQPLVKRWWREGRQ
LFNTYGPTETTVSASLAELYPDTPVTIGRPLPNYGMLVINATAEGPLQIMPMGEVGELCI
TGPGLSQGYLGRADLTADKFLLNPWAPSAEPGRLYRTGDLARILPDGLVECLGRTDDQVK
IRGFRVELGEIEAVLSQQAGVGAAAVVLRSENGIDQLLAFLVPQSIDQPPAVAWLRSALA
SALPNYMVPSVFELLTEMPRLTSGKIDRKALKARPLTQFVGDVTASDQPDTDTEKALFSA
LAKLFPGQPIRRNADFFTDLGGHSLFAARLASALRADARFAHVTVRDIYQNRIIGRIAQV
LALDHDALPPVNTQWTPPSALKRWRCGLAQAAVIPLLVTLHMAQWLAPFFTYHFYTGDAD
QSITFAIAASTGAFLLATLLTFVLAIAAKWMVAGRLKAGRYPLWGLTYYRWWLADRMIEA
APTYMLNGSSLYTWWLRALGAKIGRDVMIGSGTLRVADLLEIGDGASIGNAVNFENARVE
HGVLHLGTIKIGIDANVSSYAVLEGNTEIGALGHLEGQSALSDGMQVGAGRVFSGSPALD
IGAFDPASNQPRPVVSKLRHVLEAIFFLCGALVITTLFFLPVFPSFILIDLIDGSDGLAP
IPQGAVTEQLVKYFLLAFPATALLIVCTVLLSAGVRWLVLPRMKPGSWPVHSNLYCAKWL
VNQIQESSLSVLHGVYATVYAPFWYRLLGAKVGRGAEISTALGLVPDMLTLGDESFIADA
VMLGDEKIDAGWMTLRPTVISRRSFVGNGAYIPDGTLLPENVLIGVHSSAPANAVMRDGD
TWLGSPPINLPAREAVQCFDEHLTFNPSLLRRLGRGTVEAFRIITPHAFVIAVGFTVVLG
VMPLASDGLWIRVVYYLAIAGLAYGIGTFFFVAMLKWLLVFRYKKRSVPMWTPFVWFSEA
VTNLYEGIAVPNFLRYLRGTPWLPLVLNLLGAKIGRGVYLDTTDITEFDCVKIGDYSELN
ALACPQTHLFEDRVMKVDHVTIGSRVYMGPRSCVLYSAVVVDNAKLGALTLVMKGEVIPA
ASAWRGCPAAPAQF
NT seq
4005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaatgaagttttagtcgacagttttctacaaggtcaacaccgtcctgagttaatt
cgtgacgagtccttagccgatttgtttgaagcgacagctgagcgcacgccagcacagacg
gcgttgttatttggctcctacagcttgagttatttagaactcaacaatagggccgacctg
gcagcttcacacctgatagcttcggggattgtgccgggtcaaattatcggcctgtggttg
ccgcgcggtattgagcttttggtcatgcaactggccattagcaaggccggtgcagcttgg
ttagcctttgacgccgatacgcctgttgagcggattttggtctgtctgttggatgctaat
gcggctggagttgtgagctgcgaaatttttaagccccgacttgacgaatgcagttgtccg
gtctggactgcagaagttttgagcgagcagtctcaactggacttgcgcagacgcgtagat
ttattgcccagtcatcccgcttatgtcatctacacctcagggtctaccggcaaacccaaa
ggcatagtcattaaccacggcagtatttgccactttttacgcagtgaaaatgccttgctt
ggtgtgaccgcaagcgatcgtgtctaccaaggtttttcattggcctttgacatgtctttt
gaagagatatggattagttacttggtcggcgccagcgtctggatcgcgcctagtcaaatt
gcgtctgatcctgaagcaataccgctggccttgtcagacaatgcaattactgtgctgcat
gcagttccgacgctgctggctttgtttaatcgcgatgtcagcagcctgcgcttgattaat
ttgggcggcgaaatttgtcctcagccgctggttaaacgctggtggcgtgaaggccggcaa
ctttttaatacctatggccctacggaaaccaccgtatcggcaagcttggctgagctttat
ccggacacccctgtcacgattggccggccactgcccaattacggcatgctggtgattaac
gccactgctgaagggccgctgcaaatcatgcctatgggcgaggtcggtgagctgtgtatt
accgggcctggcttgtctcagggttatctcggtcgggcggatttaactgccgacaagttt
ctgctcaatccttgggctccgagtgctgagccgggccgactttaccgaaccggtgactta
gcgcgcatattgcccgatggacttgtggagtgtttgggtcgcactgacgaccaggtcaag
attcgcggctttcgggttgagctaggtgagatcgaggccgtgctgtctcagcaagccggt
gttggtgcggctgccgttgtgctgcgctctgaaaatggtattgatcaattgctggctttt
ctcgtgccgcaaagcattgatcaaccacccgccgtggcctggttgcgcagcgctttagcc
tctgccttacccaactacatggtgccgagtgtgtttgagttactcactgaaatgccgcgc
ctgacttcaggaaagattgaccgcaaggctttgaaagcgcgtccgctgacgcaatttgtt
ggtgatgtgacggcctcggatcagcccgatacggatactgaaaaagccttgttttccgct
ttggcgaagctttttcctgggcaaccgatacgccgcaatgcagatttcttcactgatctt
ggcggccattctttatttgcagcaaggctagcgtcggccttgcgagccgatgcgcgtttt
gcacatgtcacggtgcgtgacatctatcaaaatcgcatcattggccggattgctcaagtg
ctggcgctggatcatgatgcgctgccgcccgtcaatacccaatggacgccgccgtcagct
ttaaagcgctggcgttgcggcttagcccaggcagcagtcataccgctgttggtgacgttg
cacatggcccagtggttagcaccgtttttcacctatcacttttataccggcgacgcagac
cagtccatcacctttgcgattgccgcatcgactggtgcttttttgctcgcgaccttgttg
acttttgtgctggcgattgcggctaaatggatggttgccggcagattaaaggcgggccgt
tatccactttggggcctgacttattaccgttggtggttggccgaccgcatgattgaggcg
gcgccgacttatatgcttaacggctcatcactctacacctggtggctgcgcgcactgggc
gcgaagattggtcgggatgtgatgattggttctggtactttgcgtgtcgccgatctttta
gagattggcgacggtgccagtattggcaatgcagttaattttgaaaatgcgcgggttgag
cacggtgtgctgcatcttgggactatcaaaattggaattgacgcgaacgtgtcttcttac
gcggtcttagaaggcaatactgagattggcgcactcggccatttagagggtcaatcggcc
ttgagcgacggtatgcaagttggggcagggcgtgtgtttagtggctcaccggcgcttgat
attggggcttttgatcccgcttcgaaccagccgcgcccagtcgtctcaaagctgcgacat
gtgcttgaagcgatattttttctgtgcggtgcgcttgtcatcaccacgttattttttctg
ccggttttccccagtttcatactgatagatttaatcgacggctcggatggtttagcgcca
atcccgcaaggcgctgtgactgagcaactggtgaaatactttttgctggcttttcccgcc
acggctttgttaattgtctgcaccgtgttgctctcggctggtgtgcgttggctagtgttg
ccgcgtatgaaacctgggagctggccggtgcacagcaatttgtattgcgccaaatggctg
gtgaaccagattcaagagtccagccttagcgttttacacggcgtttacgccactgtttac
gcgccattttggtatcgattattgggtgccaaagtcggccgaggcgcagaaatatccacc
gcgctcggcttggtgcccgatatgctcacgcttggtgacgagtcttttattgcggacgcc
gtcatgctgggcgacgagaaaatcgatgcgggctggatgacgctacggccgaccgtgatt
tctcggcgtagctttgttggcaacggtgcttacattcctgatggcactttattgccagaa
aatgtattgattggtgtgcattcctcggcaccagccaacgccgtcatgcgcgatggtgat
acatggttgggctcgccgcctattaatttgccagcgcgcgaagcagtgcaatgtttcgat
gagcacctgacctttaatccatcgttattgcgccgcttaggacgcggcacggtggaggcg
tttcgcatcatcacgccgcacgcctttgtgatcgctgtgggttttactgtggtgctgggc
gtcatgcctttggcctctgatggtttgtggattcgcgtggtttattacttggcaattgct
ggcttggcctacggcataggtacgttcttcttcgttgccatgctcaagtggttactggtg
tttcgctacaaaaaacgcagcgtaccgatgtggacaccgttcgtctggttctcagaagcg
gtgaccaatctttatgaaggaattgccgtgcctaacttcttgcgctatctgcgcggcacg
ccgtggctgccgctagttctaaacttgttgggcgccaagattgggcgcggcgtttatctt
gacaccaccgatatcactgagttcgattgcgtaaaaattggcgactacagcgaattgaat
gcattggcttgcccgcaaacccatttgtttgaagaccgagtcatgaaggtcgatcacgtc
actattggcagccgcgtttatatggggcctcgcagctgcgtgctctacagcgctgtggtc
gtggacaacgcaaaattaggtgcgctgactttggtcatgaagggtgaagtgattcctgcg
gccagtgcttggcgcggttgcccggctgctccggcgcaattttga
DBGET
integrated database retrieval system