Candidatus Phytoplasma vitis: M6G77_00520
Help
Entry
M6G77_00520 CDS
T08290
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
pvh
Candidatus Phytoplasma vitis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pvh03032
]
M6G77_00520 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pvh03400
]
M6G77_00520 (gyrA)
Enzymes [BR:
pvh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
M6G77_00520 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
pvh03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
M6G77_00520 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pvh03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
M6G77_00520 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USQ93475
LinkDB
All DBs
Position
131723..134242
Genome browser
AA seq
839 aa
AA seq
DB search
MSNKIKKNNSLNNSNSDISEINNIGFVKEVNISQEMEKSFLDYAMSVIVSRALPEIQDGL
KPVQRRIIYSMKELGVTSQTSYKKAARIVGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQNFNYRYP
LIDGHGNFGSIDGDSAAAMRYTEVRMSKIAMELIKEIDQNTIDFVDNYDGSEKEPVILPT
SFPNLLINGATGIAVGMATNIPSHNLGEVIDALTAYINNKEISISELVTYIKGPDFPTGG
EILEVDKLQEIYEKGRGKIIIRSKINIVTSEKNKSSIIITEIPYQMKKSNLIKNIVSLQK
NKILDGITDLRDESSNRQGIKIVIDLRKDINPKIFLNNLYKRSQVQVSFHFNMIVLINKK
PQLVNLKQILEAFFTFRINIINRQKQFELKNALSKKHLIQSAVIVLNDIDDAIELIKSSS
NVKEAREKLMLKYNFDEIQSKYILEMSLQKITNLEVEKIKTEEQNLIKQISECEIIINSQ
TKKEQILKKELLQLKKVFQDERQTLIRKDVEINISEETLIQEKSILITITNKGYIKRLDL
DTYKKQNKGGTGVSGITMNENDFVKHFVTTSTHDYQLFFTNKGKVYRMKGYEIPDYSRQS
KGIPLINLVPLSEGEFLTSVTSMNPNLKQEHNYLVLITKKGLIKRNNISDYQNIQSKGKI
AFTLKNDDEVLTVLKSSGEQDIIMASSDGKAIRFNEKTIKQTSRMGSGVIGMKLNSDETL
IGATIVESNKQDILVVTELGYGKKNKINEYKNQKRGGKGIKTLKITSKNGKIIALKAVFN
DKELILISDRGKVIRLVNNNTIPTPKSKVTQGNKLVKLKDSDKLFTCVIINDKEKIDIL
NT seq
2520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaataaaattaaaaaaaataattctttaaataattcgaattctgatatttcagaa
ataaataatataggatttgttaaagaagtaaatattagtcaagaaatggaaaaatctttt
ttagattacgccatgagcgttattgtttcaagagctttaccagaaattcaagatggttta
aaacctgttcaaagaagaattatatatagtatgaaagaattaggcgtcacttcacaaact
agttacaaaaaagctgctagaattgtcggtgatgttatgggtaaatatcatcctcatggt
gatagtagtatttatgaagcaatggtaagaatggcacaaaattttaattatcgttatcct
ttaattgatgggcacggtaactttggttctattgatggagattctgctgcggcaatgcgt
tatacagaagtacgtatgtcaaaaatagcaatggaattaattaaagaaatagatcagaac
actattgattttgtagataattatgatggaagcgaaaaagaaccagtaattcttccgaca
agttttcctaatcttttaataaatggagcgacgggtatagctgtaggaatggctactaat
attccttctcataatttaggtgaagttattgatgctttgaccgcttatataaataataaa
gagatttctatttctgaattagttacatatattaaaggtcctgattttcctactggtgga
gaaattttagaagttgataaattgcaagaaatttatgaaaaaggaagaggaaaaattatt
attcgttctaaaattaatattgtgacttctgaaaaaaataaaagttcgataattattaca
gaaattccttatcaaatgaaaaaaagtaatttaattaaaaatattgtttctttacagaaa
aacaaaattttagatggaattacagatttaagagacgagtcttctaatcgccaaggtatt
aaaattgttattgatttaagaaaagacattaatccaaaaatatttttaaataatttgtat
aaacgttctcaagtgcaagtatcttttcattttaatatgattgttttaattaataaaaaa
cctcaacttgttaatttgaaacaaatcttagaagcttttttcacttttagaataaatata
attaatcgtcaaaaacaatttgaattaaaaaatgctttatcaaaaaaacatttaattcaa
tcagcggtaattgttttaaatgatattgatgacgcaattgaattaataaaaagttctagt
aatgttaaagaagcacgtgaaaaattaatgttaaaatataattttgatgaaattcaaagt
aaatatattttagagatgagtttacaaaaaataacaaatttagaagtagaaaaaataaaa
acagaagaacaaaatttaattaaacaaatttcagaatgtgaaattattattaattctcaa
actaaaaaagaacaaattcttaaaaaagaattgctgcaattaaaaaaggtttttcaagac
gaaagacaaactttaataagaaaagatgtagaaattaatatatctgaagaaactttaatt
caagaaaagtctattcttattactattactaataaaggttatatcaaacgtttagattta
gatacttataaaaaacaaaataaaggtggaactggtgttagcggaattactatgaatgaa
aatgatttcgtaaaacattttgttactacttctactcatgattatcaattattttttaca
aacaaagggaaagtttaccgcatgaagggttacgaaatacctgattactctcgacaatca
aaaggtataccacttataaatttagttcctttaagcgaaggagaattcttaacttctgtt
acaagtatgaaccctaatttaaaacaagaacataattatttagttttaataactaaaaaa
ggtttaataaaaagaaataatatttcagattatcaaaatattcaaagtaaaggtaaaata
gctttcactttaaaaaatgatgatgaagttttgacagttttaaaaagttcaggcgaacaa
gatattattatggcgagttctgatggtaaagctattcgttttaacgaaaaaactattaaa
caaactagtagaatgggtagtggagtgattggaatgaaattaaattctgatgaaactttg
ataggagctacaattgttgaatcaaataaacaagatattttagttgttactgaattagga
tatggtaagaaaaataaaattaacgaatataaaaatcaaaaaagaggcggaaaaggaata
aaaactttaaaaattacttctaaaaatggtaaaattatagcattaaaagctgtttttaat
gacaaagaattaattttaatttctgatcgtggtaaagtaattagattagttaacaataac
acaattccaactcctaaatcaaaagtaactcaaggaaataaattagttaaattaaaagat
tctgataaattatttacttgtgttattatcaatgataaagaaaaaatagatattttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
