Penaeus vannamei (Pacific white shrimp): 113811933
Help
Entry
113811933 CDS
T06111
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: flocculation protein FLO11-like
Organism
pvm
Penaeus vannamei (Pacific white shrimp)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FeoB_associated
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113811933
NCBI-ProteinID:
XP_027219587
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1049 aa
AA seq
DB search
MCRCFSPVAKLLYLCTVRAVLCQAQLWASAPRMPGYPYQRVPAVPTASPSAPAAPVWPST
WNISPARSPYPPYGATGGAPRAPPKTSPGGGATWRPGYNPLKAPSLGGPEAPLRGALSPA
QGWDGLGYRPWRRPSPEAEKRLDSASDSLLIPSSGLAGNPWQSTSIPSLNATASPSASPS
TPTPPTVPSDMPDAFATLSPTTPSPPLTTGPSAQPTETTATAYLTTPSTDIASALPTTTS
STTTSDALSKTSPTTNTPPATSTSTSIAPSSTISTSTAPSSTISTSTAPSSTISTSTAPS
STSTAPSSTISTSTAPSSTISTSTAPSSTISTSTAPSSTISTSTASSPISTSTAPSTIST
STAPSSTISTSTAPSTSMSSTPIGHSSTFTTQSSTTSTSTAPPTAMPSTSTAPSSTASTS
TTPSTTMSSTSIEPSSISTSTTPSSTTSTSTASSTSTSTVSSTSTSTASSSTTSSTIPLT
TMSSTSTVPSSTSTSTAPSSAASTSTAPSTTMSYASTVPSSPSTAPLSTTSTSTTPSTTM
SSTSIEPSSISTSTVPSSTSTTPSSTTSTSSASSTTASSTASSSTTASTIPLTTMSSTST
VPSSTFTSTVSSTSTVSSSSTSTAPSSAASTSTDASTTRSSTSTEPSSTSTSTGAPSTAI
APPSIYLHCSVDNSPTAPSAPSTPSASPPAPTPTPSTTTITSATDDAAGLARSASLLQLL
SVLSRAPLPSRRGSGSRNLPPPLIPSSSFSGGGDALGEEESVVVQSLSAFVAAPIAFRAT
TPRPQGHRDDPMAPAASATTIARPAPTTPSPPARRPHSTPASPAPTGSGAATTPATTSVT
ANTPARSSTSTASSTSSITSSTTPASPTTSATLTVPATTSAATTSFSSAMPATTSDSTSP
STFIATTPATAATSSESADSPNTQAPSPEITSTSSPAPASPATSAAAQSTSSPPTATSST
GSSPAAPPADPSAEASKGTVQIPRFIWVVIYTVVIAMTLIAILTVASLVEHYVKDLKNGP
HERKCSCEECPGGEECGSLRVKENVRDCP
NT seq
3150 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtcgctgtttctccccggtggccaagttactatacctgtgtactgttcgtgctgtg
ttgtgtcaagctcagttatgggcgtctgcgccccgtatgcctggatacccttatcagcgg
gttcctgcagtgcccactgcgtcaccctctgcccctgcggcgcccgtgtggccatctacg
tggaacatttctcctgcgcgctctccttaccctccttacggagctacaggaggagcgccg
agggcacctcctaaaacctcgccaggaggaggagcaacatggagaccaggttataaccct
ctcaaggcgccctcgcttggcggtcctgaagcaccgcttcgaggcgccctttcccctgcg
caaggctgggatggcctcggataccgcccttggagacgtccttctccggaggcagaaaag
aggctcgattctgcgtcggattcactgctgattccttcgtctggcttggcgggcaatcct
tggcagagcacgtcgattccttcgctgaacgccactgcgtcgccgagcgcctctccctcc
acgccgacgccgccgaccgttcccagtgacatgccagatgcttttgctacgctgtctcct
acaactccatcaccgccactcaccacggggccatccgcgcagccaacagagacaaccgca
acggcatatttaactactccatctactgatattgcctccgccttaccaacaaccacatcg
tcaaccacgaccagtgatgccctttcaaaaacctcacccaccacgaacacgccaccagca
acttcaacttcgacttctattgctccttcatctactatatctacctccactgctccttca
tctactatatctacctccactgctccttcatctactatatctacctccactgctccttca
tctacctccactgctccttcatctactatatctacctccactgctccttcatctactata
tctacctccactgctccttcatctactatatctacctccactgctccttcatctactata
tctacctccactgcttcatctcctatatctacctccactgctccatctactatatctacc
tccactgctccttcatctactatatctacctccactgctccttcaacatctatgtcatct
actcccattggacattcatctacctttactacccagtcgtctactacatctacctccact
gcaccgccaacagctatgccatctacctctactgcaccttcatctactgcatctacctct
actacaccctcaacaactatgtcctctacctctattgaaccttcatctatatctacctct
actacaccttcatctactacatctacctcgactgcatcatctacatctacctctactgta
tcatctacatctacctctactgcatcttcatctactacatcttccactataccattaaca
actatgtcatctacctccactgtaccttcatctacatctacctctactgctccttcatct
gctgcatctacttccaccgcaccatcaacaactatgtcttatgcatccactgtcccttca
tctccctctactgcacctttatctactacatctacctctactacaccctcaacaactatg
tcctctacctctattgaaccttcatctatatctacctccactgttccttcatctacctct
actacgccttcatctactacatctacctcgtctgcatcatctactacagcttcctctact
gcatcttcatctactacagcttccactataccattaacaactatgtcatctacctccact
gtaccttcatctacatttacctctactgtatcttcaacctctactgtatcttcatcctct
acctctactgctccctcatctgctgcatctacttccactgacgcctcaacaactaggtca
tctacctccactgaaccttcatctacatctacttccactggagctccatctaccgctatt
gctcccccatctatctacctccactgctccgtcgacaactctcctacagcgccatcagcc
ccatccaccccatcagcgagtccgcccgcgcctacacccacgccctccaccacaaccatt
acatctgcaactgacgacgcagcaggactcgcacggagcgcctctctgctgcagctcctg
agcgtcctgtcccgcgcgccgctgccgtcgcgtcggggatcaggaagcaggaacttgcct
ccgcctctcatcccttcgtcgtccttcagcggtggtggggacgccctcggagaggaggag
tcggtggtcgtgcagtcgctctctgctttcgtggcagcgccgattgcctttagggctacg
actccgcgcccgcaaggccaccgtgacgaccccatggccccggctgcgtcggctaccacc
atcgctcggcctgcccctactactccttctcccccggcgaggaggccccacagtacccct
gcttcacctgccccgaccgggtctggcgccgctacgacacctgccaccacttctgtcact
gccaacaccccggcaaggtcttcaacatccactgcgtcctcaacttcttcaattacctct
tctacaaccccggcatcgcctacaacttctgccacacttacagttcctgccactacctca
gcagcgacaacttcattctcaagtgccatgcctgccaccacttcagactcgacctcaccc
tcgacattcatagccacaacacctgccacagctgcaacttcaagtgagtccgccgactcg
cccaatacccaggccccttctcctgagatcacttcaacttcgtctccagccccagcctcg
cccgcaacctctgccgccgcccaatctacttccagcccgccaacggccacctctagcaca
gggtcgtccccggcagcgcctcccgccgaccccagcgccgaagcctccaaaggaaccgtg
caaatccctcgcttcatctgggtagtgatttacacggtggtcatagcgatgacgctcatc
gctatactgacggtggcgtcgctcgtcgaacattacgtgaaagacctgaaaaatggccca
cacgagcgaaagtgttcctgcgaggagtgtccgggcggcgaggaatgcggctcgttaaga
gtgaaggaaaatgttagagattgtccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
