Phaseolus vulgaris (common bean): 137822560
Help
Entry
137822560 CDS
T03093
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g08210
Organism
pvu
Phaseolus vulgaris (common bean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
ChAPs
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
137822560
NCBI-ProteinID:
XP_068483566
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(18631529..18635939)
Genome browser
AA seq
692 aa
AA seq
DB search
MHNGLAMDLNQIQLALRCCGRFQAIKHAKSLHSHIIKLGLFSHVFLLNNIISVYAKCSQF
DDARTLFDDMPHRNIISYTTMVSAFTNSGRPQDALTLYNHMLESKTVQPNQFLYSAVLKA
CGVAGDVELGKLVHRRVYQARLEYDTVLMNALMDMYVKCRRLGDANRVFYDMPCKNSTSW
NTLILGHAKQGLMKDALDLFDQMPEPDLVSWNSIIAGLADTSSFQALQFVSMMHMKGLKL
DAFTFPCALKACSLLGKLTAGRQIHCCIIKSGFECSFYCISALIDMYSNCKLLNDAMNIF
DNKSPLAESLAVWNSMLSGFVANGDWWKALSMIAHMHHSGAQFDPYTFSVALKVCIEFEN
LRLASQVHGLVITGGYELDYVIGSIFIDLYVKQGNINNALKLFERLPYKDVVAWSSLIVG
CARFGLATLAFSLFMDMVHLDLEIDHFVLSIVLKVSSSLASLPTGKQIHSFCLKKGYESE
RVITTALTDMYAKCGEIEDALALFNCLSEVDTLSWTGIIVGCAQNGREDKAINLLHKMIE
SGTKPNELTIIGVLSACRHAGLVEEAWTIFKSTETKHGLTPCPEHYNCMVDIFAQAGRFK
EAINLINDMPYKPDKTIWCSLLGACGNYKNRHLANIVAEHLLATSPEDASVYIMLSNVYA
SLGMWDNVSKVREAVKKVGIKGAGKSWIEIFS
NT seq
2079 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacaatgggttagcaatggatttgaaccaaatccagttagctttacgctgttgtggg
cggtttcaagctatcaaacatgctaaatcacttcattcccatataataaaacttggtctt
ttcagtcacgtttttctcctaaataacattatctctgtctatgcaaaatgctcccaattc
gacgatgcacgaacccttttcgacgatatgcctcacaggaacataatttcttacacaacg
atggtctctgcattcaccaattccgggagaccccaagatgctctcacactctacaaccac
atgctggaatctaaaacagtgcaacccaatcagttcttgtactcagcggttctcaaggca
tgtggagtcgctggtgatgttgaattgggcaagttggttcaccgacgtgtatatcaggct
aggttagagtatgacactgttctgatgaatgccctcatggacatgtacgtcaaatgtaga
aggttgggtgatgcaaatcgagttttctatgacatgccgtgtaaaaattctacttcatgg
aacactctcattctagggcatgccaaacagggtttgatgaaggatgcgttggatctgttt
gatcaaatgccagaaccagaccttgtgtcttggaacagcatcattgctggtcttgcagat
acttctagcttccaggcattgcaatttgtttctatgatgcatatgaagggccttaaactt
gatgcattcacattcccatgtgccctcaaagcgtgtagtctacttggcaagttaaccgcg
gggagacagattcattgttgcattatcaagtcagggtttgagtgtagcttttattgcata
tcagcattgattgatatgtattcgaattgcaagctattgaatgatgcaatgaatatattt
gataacaaatctcctcttgcagaaagcttggcagtatggaattccatgctttcagggttt
gttgccaatggagattggtggaaagctctcagtatgattgctcatatgcatcattctggt
gcacagtttgatccctatacctttagtgttgctttaaaggtctgcatcgagtttgaaaac
ttgaggttggcatctcaagtgcatggattggtcatcactggtggctatgagttagactat
gttattggaagcattttcattgatctatatgtgaaacagggcaatattaacaatgcattg
aaattgtttgaaaggttgccatataaagatgttgtggcttggtctagtttgattgttggt
tgtgctagatttggtctagctacactagctttttccctcttcatggatatggttcatttg
gatcttgagattgatcattttgtcctttcaattgttctgaaagtttcttcaagtttggca
tcgcttccaactggcaaacaaattcattctttttgtcttaagaagggatatgaatcagag
cgagttattacaactgctcttactgatatgtatgcaaaatgtggtgagattgaggatgcc
ttagctttgtttaattgtctttcggaagtagataccttgagttggactggtattattgtg
ggatgtgcacaaaatggaagagaagacaaggcaattaatcttctgcataagatgattgag
tcaggtacaaagccaaatgagctcaccattataggtgttctgtctgcatgtagacatgca
ggcctagtagaagaggcatggactatatttaagtctactgaaacaaagcatggattgaca
ccatgccctgaacattacaattgtatggttgatatatttgctcaagcaggacgttttaaa
gaagcaataaacttgattaatgacatgccatataagcccgacaaaaccatatggtgttcc
ttgcttggtgcttgtggaaattacaagaatcgacatcttgcaaatattgttgctgagcat
cttcttgctacctcacctgaagatgcttctgtgtatataatgctgtcaaatgtttatgca
tcacttggaatgtgggataatgtaagcaaagtacgagaagctgtcaaaaaagtaggtata
aaaggagctggaaaaagctggatcgagatctttagctga
DBGET
integrated database retrieval system
