Patella vulgata (common limpet): 126809533
Help
Entry
126809533 CDS
T09576
Name
(RefSeq) TATA-binding protein-associated factor 172
KO
K15192
TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-]
Organism
pvul
Patella vulgata (common limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvul00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pvul03021
]
126809533
Transcription machinery [BR:
pvul03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Others
126809533
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3535
SNF2-rel_dom
HEAT
TOR1L1_N
HEAT_EZ
HEAT_2
HEAT_EF3_N
Vac14_Fab1_bd
TPR_Trm732_C
HEAT_Maestro
UTP20
NtrY_N
CCD97-like_C
HEAT_ECM29
Sdh5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126809533
NCBI-ProteinID:
XP_050390117
LinkDB
All DBs
Position
2:40556018..40584547
Genome browser
AA seq
1464 aa
AA seq
DB search
MTTRLDRLFLLLDTGSTPLIRKSAAEQLGEVQKLHPYELNNLLSKVHVYLRSSNWDTRIA
AGQAVEAIAKNVPQWEPRGAPKSEAGTAAAQCAGKILFTQFDVNKVLAFGASLLGSEGGQ
YDVVQSAIALDDKERLSQQRQLLNKRLGLDLAGNLGIESDNLFNDEDLHIENFNGQVSGQ
PAFNKPVADLVKQQLMDVTRGLSARERNRAKRKAKHLAKQISKDGSSESSAADLDPPAKK
TKQDPENNGTSSDKTLIDTGDNTLNLEEMDEWPFETFCEVLMNDLFNSSWEIRHGAATGL
REVIKQHGRGASKSSDTPSDQMTAVNQIWLSDLSLRLLCVLVLDRFGDFVSDEVVAPVRE
TCSQNLGVALKFLDVEGVQGVTSVLLQLLSQSQWEVRHGGLLGIKYLLAVRQDLTDALLP
IVLPAVFRGLQDPDDDVRAVAAAALIPVSDKLVLLMPQQTPVVIDCLWQTLLDLDDLTAS
TNSIMILLSTLLSKPSTTTTSTSQALSELTPRLWPFFRHNILSVRKAALETFYTLLNIPD
QQQPVSQWLTPILSDALRHIYQRSLLENDVDVLNLVQKVWSVLLEKAQLDYLIVASVPWL
GVWLCLLMQPSRTPFEPTYLLEAKHKVREQTVGKRCPSDSGPILDKDNREYIGGAQSLNK
TIVERDIDVMRSRIAGTKLLGLLAGYITKPVPNYPKDAEKPVDSLRKLFIFHLNTKSALQ
RYVIGQVLYQWALLNKNCDCPEDVKTKLLECLSEAIYFDEIALAFTRMQSDCRDFIASLK
QQGVEMDSLFPPASILSLDQAGQLTSTVFDQVKISLKPKVLQMLDDRRKQLQITVTQTTL
EQQTLTVRVLSSLAMAAVVLSVFPEKLNPVVRPLMDCIKKEDNRNIQAEAAKSLARMIEF
VLEKNPNPISKIIKNLCNFLCCDSSYTPLVHQPIAVKTTENQPHEVTCDINTGILTLSNL
QKAPEKNRKWLRRSLSIKSADVDVPSELLQEDSEVQQMLKIQRRGADVALSTICAYFSDK
MQTKVPVLWECCINQLLTVQDTNKNSDDENLSQELVNSLQVLETVSSSFHSTVLAQVIAK
LPLLSVCLQHKYTAVRHIAARCIATLCQLQTHHTMHFIIETIIPMLASTDSEIKRQGASE
ALANIIELLGIDILPYIVLLVVPILGCMCDQNEAVRLMATHCFANMIRLLPLEAGIPDPP
EMNAEMIERKEKQREFLEQLLDGSKIECYKITVDIKAELRKYQQDGVNWLGFLNKYKLHG
ILCDDMGLGKTLQSICILATDHYHRDTKHKVSSIYFYSVSSQMDQLQKKLSRAVKQLTCN
HRLILSGTPIQNNVLDLWSLFDFLMPGFLGTEKQFQARYGKPIIQSRDAKSTTKDQEAGA
LAMEALHRQVLPFVLRRLKEDVLQDLPPKIIQDYYCDLSPLQVELYEDFARSRARNDIDE
TVTSQDGKEKKSQAPTHIFQTIIK
NT seq
4395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaccagacttgaccgactgttcctgcttttggatactggatctactccattgatc
cggaaatcagcagctgaacagcttggagaagttcaaaaacttcatccttatgaactcaat
aatttattatcaaaggtgcatgtataccttcgtagttctaattgggatacaagaattgct
gctggacaggcagtggaagccattgctaagaatgttccacaatgggaaccaagaggtgct
ccaaaatcagaagcaggaactgcagcagcacaatgtgctggaaaaatcctgtttacccag
tttgatgttaataaagttttagcttttggtgccagtttactgggctcagagggtggacaa
tatgatgtggtacagtctgccatagctctagatgataaagaacgtttatctcaacaaagg
cagttattaaataaacgtttaggattagatttagctggtaatttaggtatagaatcagat
aacttatttaatgatgaagatcttcatattgagaacttcaatggtcaagtttctggtcaa
cctgctttcaacaagcctgtggctgatttggttaaacaacagttaatggatgtaactaga
ggattaagtgccagagagagaaatcgagctaaaagaaaggctaaacatcttgctaaacag
atctctaaagatggatcaagtgagagttcagctgcagatttagatccccctgccaaaaaa
acaaaacaagaccctgaaaataatggtacatcgagtgataaaacattaatagatactggt
gataatactcttaatctagaagagatggatgaatggccgtttgagacattttgtgaagta
ctgatgaatgatttgtttaatagttcatgggagattaggcatggtgctgctacaggactt
agagaagttataaaacaacatggtcgaggagctagtaagtcaagtgatacaccatcagat
cagatgacggctgtcaatcagatatggttatctgatttgtctctgcgtctgctgtgtgtt
ttggtattagacagatttggtgattttgtttcagatgaggttgttgctcctgtaagagaa
acgtgttcacagaatctaggtgttgcgttaaagtttttagatgtagaaggggtacagggt
gttacaagtgttttattacaactgttatcacagagtcagtgggaggtacgacatggtggt
ctattaggtatcaaatatcttctagccgttagacaggatttaacagatgcattattacct
attgtattaccagctgtatttcgaggtctacaggatccagatgatgatgtccgagctgta
gcagcagcagctttgattcctgtcagcgacaaattagtgttgttaatgccacaacagacc
cctgtagtaatagattgtttatggcagacattgttagatttagatgatttaacagcatca
actaatagtattatgatattattatctactctgttatctaaaccatcaacaaccacaacc
agtacatctcaagccttatccgaactaacaccaagattgtggccattttttcgacacaat
atcctgtcagtacgtaaagcagctctagaaacattttatacgttgttaaatataccagat
caacagcaacccgtgtctcagtggttaacacccattttatcagatgctttgcgccacata
tatcaacgtagtttattggaaaatgatgtggatgtattaaacctagttcagaaagtttgg
tcagtgttactagaaaaagcacaactagactacctcattgttgcttcagtgccttggtta
ggagtatggctctgccttcttatgcaaccatcgagaaccccatttgaaccaacttatttg
ttagaagctaaacataaagtgagggagcagactgtaggaaagcgttgtccatcagattct
ggacctatattagataaagataatcgtgaatatataggtggtgcacagtcattgaataaa
actatagttgaacgagatattgatgtgatgagatctagaatagctggtacaaaattgttg
ggtttattagcaggttacattacaaagcctgtaccaaattatcctaaagatgccgaaaaa
ccggttgattcactgagaaaactgtttatatttcatttaaatactaaatcggctttacaa
cgatatgttattggccaggttttatatcagtgggcattgctcaataaaaattgtgattgt
ccagaagatgttaaaactaagttattggaatgtttaagtgaggctatatattttgatgaa
atagctttagcttttaccagaatgcaatctgattgtcgagattttatagcctcattaaag
caacaaggtgtagaaatggattcactttttcctcctgcatctatcttaagtcttgatcaa
gcaggacaactgacgtcaactgtatttgatcaggtaaaaatttcattgaaacccaaggtg
ctgcagatgctggatgacagacgaaaacaattacagataactgtcactcaaacaacatta
gaacaacagacattaactgttcgagtgttaagtagtctggctatggcagcagtagtactg
tctgtttttcctgagaaattaaatcctgttgtacggccattgatggactgtatcaagaag
gaagacaatcgaaatatccaggcagaagcagccaagtctttagccagaatgattgagttt
gttcttgagaagaatcctaaccctatttctaaaataattaaaaatctatgtaatttctta
tgctgtgattcatcttatactccattagtacaccaacctatagcagtcaagacaacagaa
aatcagccacatgaagtaacctgtgatataaatactggtattttaacattaagtaattta
cagaaggctcccgaaaagaatagaaaatggttacgtagaagtttaagtattaaatcagca
gacgttgatgtacctagtgaattattacaagaagattctgaggttcaacagatgttaaag
atacagcgacggggtgctgatgtagcattatctactatatgtgcttattttagtgataaa
atgcagactaaagtaccagtattgtgggaatgttgtataaatcaactattaactgtacag
gataccaataaaaattcagatgatgaaaatttgtctcaagaactagtaaactcattgcaa
gttttagaaactgttagttcttcttttcattccacagtattagctcaggttatagcaaaa
cttccattgttatcagtttgtttacaacataaatatacagctgtacgacatattgcagct
agatgtatagctacattatgtcaactccaaacacatcatactatgcattttattatagaa
actattatacccatgttagcatctacagacagtgaaataaaacgccagggtgcctccgaa
gctctagcaaatataatagagttattaggtatagatatattaccatatatagtattacta
gttgtacctatattaggttgtatgtgtgatcaaaatgaagccgttagattaatggctact
cattgtttcgctaatatgatacgtctcctgccattagaggctggtataccagatccacct
gaaatgaatgctgaaatgatagaaagaaaagagaaacagagagagtttttagagcaatta
ttagatggttctaagattgagtgttataaaataacagttgatattaaagctgaattacgt
aaatatcaacaagatggtgttaattggttaggttttctaaataaatataaattacatggt
atattatgtgatgatatgggtttaggcaaaacactacaatctatatgtatactagctaca
gatcattatcaccgtgacacaaaacataaggttagttccatttatttttattctgtgtct
tctcaaatggatcagttacagaagaaattatcgagagctgtgaaacagttgacctgtaat
catagattaatattatcaggaactcccatacagaacaatgtcttagatctgtggtctcta
tttgacttcttgatgccaggatttcttggcactgagaaacaattccaagctcgttatggt
aaacctatcatacagagtcgagatgctaaaagtacaacaaaagatcaggaagctggtgcc
ttagctatggaagctttacatagacaagttttaccatttgtgctgcgtaggttaaaagaa
gatgttttacaagatttaccacccaaaattatacaagattattattgtgatctaagtcca
ctacaggttgaactgtatgaagattttgcaagatctcgtgctagaaatgatatagatgaa
acagttacttctcaagatggaaaagagaagaaaagtcaggcacctactcacatattccag
acaattattaaatga
DBGET
integrated database retrieval system