Patella vulgata (common limpet): 126819203
Help
Entry
126819203 CDS
T09576
Name
(RefSeq) phospholipid-transporting ATPase ABCA1 isoform X1
KO
K05641
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 1
Organism
pvul
Patella vulgata (common limpet)
Pathway
pvul02010
ABC transporters
pvul04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvul00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
126819203
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
126819203
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pvul02000
]
126819203
Transporters [BR:
pvul02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
126819203
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
R1_ABCA1
AAA_21
DUF4162
AAA_23
ABC2_membrane_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126819203
NCBI-ProteinID:
XP_050403064
LinkDB
All DBs
Position
4:41686073..41813084
Genome browser
AA seq
2370 aa
AA seq
DB search
MAFWKQLGLLLWKNFTLRIRQPLRLLIELVWPLCLFLILVAVKTRPDLQVFKPECHYDGK
AMPSAGLLPFIQTYACTFDNKCHQTVTEDELRGQVDSFNRSLISILIGDIEKVLANNTQR
TEIFNIIEDFENLQIIYNKIMNGTSQGEIKLGNLLVNPNKLREQIANQSINLSEESLDLL
LNGSISFQKIIKNYNLSTGFFDTVARLNESALRESICQEKLLTRWFDFSDPNTANVLDEQ
LCNLTAVQFQELYNDFMEEYNSSYVNNELQNFYAQNIGKDPNFDLTTIETVQRLSQDITN
LESFQFILDDVQRIQTDLRSGNNTNTSMSENIGLLLCGRKSFNFSSGGGNGNRNSSSPLL
NTKPLEPEEKAKSEREYKDSTPFCRNLYMSFESNPVWKFLKPFILGVIPYSPDTPRVREI
IKLANRTFLDVSLLINLADDWAGFSPSLYRFLNNDINGLRWFFNSSLCKGFEEGSFPPTS
FRFFEGLLANLMGQNRIPKGSCARIGQFVSNDADNSAYDWRDALNNTDELMKGIKQYMQC
FRLNKFVPYKDESALEDDSVEFTANNTLLAALVFDDIDEKSTHIRYKIRMNSDNVDSTKR
IEDRYWRPRARDSPTFDLKYLTFGFAFLQDMVDHAIIGLQTGQEGQIGVMLQQFPYPCYI
NDRFVYTISRMMPLFMILSWIYTVAMIVKGVVHEKEQRLKEVMKMMGLGNAVHWIAWFIN
AFVMMFLTILLLLLILKGGKVLEHSDPSVIFVFLLAFTVATIMLCFFISVLFSKANLAAV
CGGFIYFILYLPYTLVTRFEETMTTSEKAFASLSSCVSFGFGCSYIARYEEQGIGIQWSN
MADSPLTDDGFSMQYAIGMMIIDAIIYGLLTIYVEAVFPGQYGLPRKWYFPIQRSYWCGK
QYNVDAESPMETLDMGCDKEKIEREPADRNIGVGIRGLRKVYSQGKKVAVDRLSLNFYEG
QITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTEGTAYIYGKDIRTDMDEIRHSLGMCPQHNVLFD
KLTVEDHIWFYARLKGQTDSQVRAEMPKMIEDVGLVNKAKERSENLSGGMKRKLSVAVAF
VGGSKTVILDEPTAGVDPYARRSIWDLLLKFRSGRTIILSTHHMDEADVLGDRIAIISHG
KLCCAGSSLFLKNKFGSGYYLTLVKGGIIGTKDDEYEDNYDKDDLSLGRPSTAGSIRSTV
AVKPIFVEDDEGFDDMKGASSTGSTGSSKSDSPTPLDDKGMIPGLSVGRITAFIQKYVST
AELVEDNSTELCFKLPHTSVKAEFHHLFQELEKYHHELGIDSFGLSDTSLEEVFLAVAEE
TGVDELNDETTRNTLESAYDNGKYPRPVTRLSFRNKKKFNFLRNRSSNKIEHTELQEDID
DTASVASGTIGNKSVFADSGKAKIIGWSLILHQFYALFLKRFHHVRRSKKGFVCEIVLPA
GFVCLAMVFSLILPPFEEEPPLELQPWMYTPKTGEPHLYMFYANDNPSNPLTQSLEKTLF
SKPWVGNRCMKPDVYSVSGYSCQSDSETLKWTARPSLTGNLSIDSPDCDCSTGFQQCPPG
AGGPTPSMTLLPTSDYLYNLTGRNISDWLVKTTNSYIKKRYAGITFGDINMMAELNSTQI
VNVLDRLATAANNGQSTNISNIQFWSDLEEFTKGLLTQNVAKVWFNNKGWTASVSYMNVL
NNLILRSYLPSDKDPSVYGITTINHPMTYNKEQLNEESLFSSFVDVVVAICVIFAMSFIP
ASFVLYLIEERVSDSKHMQFVSGINPTVYWISTFAWDLLNYLVPAFLCILIFLAFNEEAY
VSAHNAPCLIALLVLYGWAIIPMMYPFARLFSIPSSAFVALSCCNVFLGTISTLATFILE
LLGQSDQDLEDINSILKQVFLLLPHYCLGRGLIDMAAYQLRYEVMLRFSPNAKQTNILQW
DIVGRNLFCLTMLGIIFFTLNWLIEYHFFIKPKMSNDKDGSTDGIEDIDVKRERQRVLSG
DADDEALVIKNISKTYTTGRKKMKAVNNLCVGVPKGQCFGLLGVNGAGKTTTFKMLTVDV
PITSGSAFVCQKSVLKEKDKVRQVMGYCPQFDALDSLISGREHLEFYARVRGIEEKDVKQ
VADWAIKKLGLLHYADKLAGTYSGGNKRKLSTAISLIGNPQIVFLDEPTTGMDPKARRFL
WNCISEIVKDGRTVILTSHSMEECEALCGRLVIMVNGKFKCIGSSQHLKNRFGDGYTIVI
RISGENPDMKPIKQLIGENFSAAKLQEEHSNMVQYQLGTANLSLSRLFDILESARHEYYI
EDYSVSQTTLDQVFINFAKGQTDTMDADVDDIEQSYPGGKIIYSLIEQSYPYEILQQLDE
DEQSVTGSTFELIRPDTGRRSTGFPDVSIA
NT seq
7113 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttctggaaacagttaggcttactgctgtggaagaattttactttaagaataaga
caaccgctacgtttacttattgagttagtatggcccttgtgtctctttctcatcttggtg
gcagtaaaaacacgacctgatctacaggtgtttaaaccagaatgtcactatgatggaaaa
gctatgccctcagctgggttattgccatttattcagacctatgcctgtacctttgataac
aaatgtcatcaaacagtaacagaggacgaactaagaggacaggttgattcatttaacaga
tctttaataagcatacttataggtgatatagaaaaggttttagctaataatactcagagg
acagagatttttaacattattgaagattttgaaaatctacaaataatttataataagatt
atgaatggaacatcacaaggtgagataaagctaggaaatttattggtcaatcctaacaaa
ttacgagagcaaatagccaatcagagcatcaatttatcagaagaatctttagacctattg
ctaaatggatcaatctcctttcaaaagataataaaaaattacaacttatccactgggttt
tttgatacagtggcaagattgaacgagtcagcattacgtgagtctatttgtcaagagaag
ctactcacacgatggtttgacttcagtgatccaaacacagctaatgttttagatgaacaa
ctttgtaatttgaccgctgttcagtttcaggaactatataatgattttatggaagaatat
aattcatcatatgttaacaatgagttacaaaatttctatgctcaaaatattggtaaagat
ccaaattttgatttaacaacaatagaaacagttcaaagattaagtcaagatattacaaat
ctagagagttttcagtttatcttagatgatgtacaacgaatacagacggatttaagatct
ggtaacaatacaaatacatctatgtctgagaatattggtcttttgctttgtggtagaaaa
agttttaatttttctagtggtggtgggaatgggaatagaaactcatcatccccactactt
aatacgaaaccacttgaacctgaagaaaaagctaagtcagaaagagaatacaaagattca
acaccattttgtagaaatttgtacatgtcatttgaaagcaatccagtttggaagtttctg
aagccatttattttaggagtaattccatactcccctgatactccacgtgtacgagaaatc
atcaaattagcaaatcgaaccttccttgacgtttcattgctgataaacttggctgatgat
tgggctggcttttcaccaagcctttatcgttttcttaataatgatataaatggtttgaga
tggtttttcaactcgagtttgtgtaaggggtttgaagaaggaagtttcccgcctacctca
tttcgtttctttgaaggccttttagctaacttaatgggccagaatagaataccaaagggt
tcatgtgctagaattggtcaatttgtttctaatgatgctgataatagtgcttatgattgg
agagatgcattaaataatacagatgaattgatgaaagggataaaacaatacatgcagtgt
ttccgtttgaataaatttgtaccttataaagatgaatcagcattagaggatgactcagtt
gaatttacagcaaataacacattgttagcagctcttgtatttgatgatatagatgaaaaa
tctacccacattagatataaaatacgtatgaactctgataatgttgatagtaccaagagg
attgaagacagatattggagaccaagggcaagagatagcccaacgtttgatttgaagtat
ttaacatttggttttgcatttttacaagacatggttgatcatgctataataggactacaa
acaggtcaagagggtcaaataggtgtaatgttacaacagtttccatatccatgttatatt
aatgacagattcgtgtatacaatctctagaatgatgcctctctttatgatattaagttgg
atttatacagtagctatgattgtcaagggtgttgtacatgaaaaggaacagagactaaaa
gaagtaatgaagatgatgggactgggtaatgctgtacattggatagcttggtttattaat
gcatttgttatgatgtttttgaccatattactgttacttctgatattaaagggaggaaaa
gtactggaacattcagatccatctgtaatatttgtgtttttgttggcgtttacggtagca
accatcatgctgtgtttttttataagtgtgttattttctaaagctaatttagctgctgtg
tgtggtggatttatatattttatattgtatttaccttacacattggtaacaagatttgaa
gaaactatgacaacatcagaaaaagcttttgcttctctatcatcatgtgtatcatttggt
tttggttgtagttatatagctagatatgaagaacagggcataggcatacaatggtctaat
atggcggatagtccattaacagatgatgggtttagtatgcagtatgcaataggaatgatg
attatagatgctattatatatggtttattaacaatatatgtagaggctgtattcccaggt
caatacggtttaccacgtaaatggtattttcctatacagaggtcatattggtgtggaaaa
cagtataatgttgatgctgaatcacctatggaaacactagacatgggatgtgataaagaa
aagatagagagggaaccagcagatagaaatataggcgtaggaatacggggattaagaaaa
gtttattcccagggtaaaaaagtagcagtcgatagattgtctctcaacttttacgaaggt
caaattacatctttccttggacataatggagctggaaaaacaacaacaatgtcaattttg
acaggattgtttccacctactgaaggtacagcctatatttatggtaaagatataagaaca
gatatggatgaaataagacatagtttaggaatgtgtcctcagcacaatgttctttttgac
aaattaacagtagaagaccatatatggttctatgcaaggttaaaaggtcaaactgacagt
caggttcgagcagaaatgccaaaaatgattgaagatgttggtctggtaaataaagcaaaa
gaacgctctgaaaatctatctggtggaatgaagaggaagttatcagtagctgtagcattt
gttggtggtagtaaaacagttatattagatgaacctacagctggtgttgatccgtatgct
agaaggtcaatctgggatctattacttaaattcagaagtggtcgtaccataattctatca
acacatcatatggatgaagcagacgtactaggtgatagaatagctattatatcacatggc
aaactgtgttgtgctggttcgagtttatttttaaagaataaatttggtagtggttattat
ttaacccttgttaaaggtggtatcattggtactaaagatgatgagtatgaggacaattat
gataaagatgatttaagtttaggtcgaccatccacggctggtagtatcagaagtacagta
gctgtgaaacctatatttgtggaagatgatgaaggttttgatgatatgaagggagctagt
agtactggtagtactggtagtagtaagagtgattcacctacaccattagatgacaagggt
atgataccaggtttgtcagttggtcggattacagcttttatacagaaatatgtatctaca
gcagaattagtagaagataactctacagaactgtgtttcaaattaccacatacttctgtt
aaagcagagtttcatcatttatttcaagaattagaaaaatatcatcatgaacttggtatt
gatagttttggtttatcagacaccagtttagaagaggtattcctggcagtagcagaagaa
actggtgttgatgaactcaatgatgaaactaccagaaatactttagaaagtgcttacgat
aatggtaaatatccccgcccagtaacgaggttgagctttagaaataagaagaaatttaac
tttcttcgtaatcgtagtagcaacaaaattgaacatacagaactacaagaagacatagat
gatactgcttcggtagcatcaggtacaataggcaataaatctgtatttgctgattctgga
aaagctaaaataattggctggtcacttattctacatcagttctacgccttgtttttgaag
agattccatcatgttagacgtagtaaaaaaggatttgtttgtgagattgtattgccagct
ggttttgtgtgtttggcaatggtctttagtcttattttacctccatttgaggaagagcca
ccattagaactacaaccatggatgtatacacctaaaactggtgaaccccatctgtatatg
ttttatgcaaacgacaatccttcaaatccactaacacaaagtttagaaaaaacattattc
tcaaaaccttgggttggtaatagatgtatgaaacctgatgtttattctgtaagtggttat
tcatgtcagtctgattcggaaaccttgaaatggacagctagaccaagtttaaccggaaac
ctgtctatagattctccagactgtgattgttcaacaggctttcaacaatgtcctccagga
gctggaggaccaacaccatctatgactctactaccaacatctgactatttgtataatctg
actggtcgtaatatcagtgattggttggttaaaactacaaattcttatatcaaaaaaaga
tatgctggtataacatttggagatatcaatatgatggctgaattaaactcgacacaaata
gtaaatgttctggatagactagctacagctgcaaataatggacaatctaccaatatatca
aatatacagttctggagtgatttagaagaattcaccaaaggtttattaacacaaaatgtt
gccaaggtgtggttcaataacaagggctggacggcatctgtatcatatatgaatgtatta
aataacttaatattaaggagttatctgccctcggataaagatccatctgtatatggtata
acaactattaatcatcccatgacttacaataaagaacaacttaatgaagaatcattattt
tctagttttgtggatgtagttgtggctatatgtgttatatttgccatgtcatttatacca
gctagttttgtgttgtatttgatagaagagcgagttagtgatagtaaacacatgcaattt
gttagtggtattaatcctactgtatactggatttcaacatttgcatgggacttgttaaat
tatctggtaccagcattcctgtgtattttgatatttttggcgtttaatgaagaagcctat
gtatcagctcacaatgcaccatgtcttatagctttattagttctatatgggtgggctatt
atacccatgatgtatccatttgcaagactgttttctataccaagttcagcattcgtggcc
ttgtcatgctgtaatgtatttttaggaactatttctacattagcaacatttatactggaa
ttacttggacaatctgatcaggatctagaagatatcaatagtatattaaaacaagtattt
ttacttctacctcactattgtctgggtcgtggtttaattgatatggctgcctatcaactg
agatatgaagttatgctgagatttagtcctaatgctaaacaaactaacatattacagtgg
gatatagtaggtcgtaatttgttttgtttaacgatgttgggtataattttcttcacattg
aattggttaattgaatatcacttcttcatcaaaccaaaaatgagtaatgataaagatgga
agtacagatggtatagaagatattgatgtcaaacgagaaagacagagagttttatcaggt
gatgctgatgatgaggcgctagttatcaaaaatatatcaaagacatatacaactggacgt
aagaagatgaaagcagttaataatttatgtgttggtgtacctaaaggacagtgttttgga
ctacttggtgttaatggtgctggaaagacgaccacatttaaaatgttaacagtcgacgta
cctattaccagtggatcagcttttgtctgccaaaaaagtgttttaaaagaaaaagataaa
gtacgacaagtaatgggatattgtcctcaatttgatgctttagatagtttaattagtgga
agagaacatctagaattttatgctagagtacggggaatagaagagaaagatgttaaacag
gtagcagattgggctataaagaagctaggcttattacattatgctgataaactggctggt
acatattctggtggaaataaacgtaaattatcaacagctatatcacttataggaaaccca
cagatagtattccttgatgaacctacaactggaatggatcctaaagctagaagattttta
tggaactgtattagtgaaatagttaaagatggtcgaactgtaatactgacatctcatagt
atggaagaatgtgaagctttatgtggtcgactggttataatggtaaatggtaaatttaag
tgtattggaagttctcaacatcttaaaaacaggtttggtgatggatatactatagttata
agaatctctggagaaaatcctgacatgaagccaatcaaacaattgattggagaaaatttc
tcagctgccaaattacaagaagaacatagtaatatggtacaatatcaacttggtacagct
aatttatctttatctagattatttgatattctagaatcagctagacatgaatattatata
gaagattactctgtatctcaaacaactctagatcaggtgtttatcaactttgctaaagga
cagaccgatactatggatgcggatgttgatgatatagaacaatcatatcctggtggtaag
attatatattcacttatagaacaatcatatccttatgagatattacaacagttagatgaa
gatgaacaaagtgtaacaggaagtacatttgagttaattcgtcctgatacaggacgtaga
tctacaggctttcctgatgtttctatagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system