Patella vulgata (common limpet): 126829318
Help
Entry
126829318 CDS
T09576
Name
(RefSeq) phospholipid-transporting ATPase ABCA3
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
pvul
Patella vulgata (common limpet)
Pathway
pvul02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvul00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
126829318
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pvul02000
]
126829318
Transporters [BR:
pvul02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
126829318
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC2_membrane_3
ABC_tran
R1_ABCA1
AAA_21
AAA_23
SbcC_Walker_B
AAA_15
AAA_22
Zeta_toxin
Rad17
MukB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126829318
NCBI-ProteinID:
XP_050415060
LinkDB
All DBs
Position
8:1267578..1290559
Genome browser
AA seq
1700 aa
AA seq
DB search
MMKFFRQVGILLWKNSLIQRRKICASVVEVLSPLLLVTILVLIRLTVPDNKIYPPKVYEA
VDLTIHENWFGGLLFYYAPKTPIVDDIMHNFITTLTNDDVKGSRKYNATGFISEADLLKY
ATNNSDYLEMAFVFDNITTETKTLPRNVQYALRPKSNNDWNTGSNFPVFGMQDGSYSTND
EYIRERFVHYQRYLDAEIIKYWVPTSNLTDYDYSIQQMPYPAYENDQTISSVQFMFPLIL
CFSFIVSVFITAKNIIYEKENNLKESMKMMGLTSSANWTAWFLTVFIYLFVAVVFYTMVM
LIPIEGKSRVLAHSDMSVIFVFLLCYVTSIISFCFLVSVFFDRANLGASVTGILYFLSFV
PFFVIFVKYKSMSRSEKLGASILSNTAMGIGGYIIGFYEQIGEGVQWSNIASPAYFQDNY
CMLDAMLMLLGDSAIYLTIMWYIENVHPGKHGVPRPLYFPFTRSYWCGTSPVYYNKNKQT
PKDSKFFEKEPTGCQAGIVISDLTKEFKSRGGKKNIAVDNMNLNVYQGQITVLLGHNGAG
KTTTMSMLTGFIPPTSGKATVNGHDITTDIDGVRESLGLCPQHNILFDTLTVDEHLEFFL
LLKGGNRTMVKQEIQTTIQEIGLEPKRNTRSQNLSGGQKRKLSLGIALIGGSQTVILDEP
TSGMDPAARRQTWDILQRNRSSRTILLTTHFMDEADLLGDRIAIMADGRVHCCGGSHFLK
QLYGSGYHLIMVKSETCDVSVVTQLVQSHIPSATLESEISAEISYLLPNEASPKFSPLFK
DIEIKKDELGINSFGTTATTMEEVFLKVGNEVDDVADNDEDDNARLYRFQNLRYTNNELP
ETSSSNNIDVEEDILAFNQGLRKVTGIQLELHRFYGMFIKKAIHTWRNKLVTVFQFLIPV
LFTILALAVSIDTPNYYTEQGQQPSLTLDLKPFSSSITAYGESASSNVTDELSNKYSGLF
SAGEATEHVTHQQAQNFTKYFLDMAKQLKTDVYTSRMVIGADFVSVNTKTTSIRGFYNGK
PYHSPGIAVSFMMNALAKVVSSDDTVSITTRNHPLPQPTSNNYDYGSDSVTNGFLIGFCM
MFGMCFLASSLSVFLIKERQVGAKHLQKVSGVGPVVYWLANITWDFINYMMPSLLIIIAF
ASYGNVEFNSGSNLSYVFLVLFMYGLAVIPFIYTLQFMFKTPPGGMAAIIIFSIFSGALS
IMTVYILSLRPDQRETAQTLDVLFSMLLPHHNLGLSLLNIVTNYNNLDYCSENPCDKTQM
YSSCCPEGCHDFCKKYESNYLSLNRPGIGLYILMMAVQSVLYFSITLCIEGRIPQRIWYY
IRPNQQHAESIVNPAYTYYGGQQTDSDVTSEANRVQNMDMDRPTDSFILNDLYKRYGNFV
AVDHISVGIPDKECFGLLGQNGAGKTTTFKMLTGDVMVTSGNAYLNSNDIKSSIQKVQEN
MGYCPQFDALIDQMTGVETLYMYGRLKGIPENQLKGVVYSLIDILMLKKYANKLTQVYSG
GNKRKLSTAIALIGDPGFILLDEPSTGVDPKARRQLWNVLSKVRASGKTLILTSHSMEEC
DALCTRVAIMVNGSFKCLGSPQHLKNKFGQGYTLICRMKTNEDDGVTSPIEPLVQFIKSN
FPSAIVFDDHQGYAHFQIPDNNTPLAGVFDVMEESKSEYSVEDYSVHQTTLEQVFLAFAG
KQIPPHEDKISICKRICCCC
NT seq
5103 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagtttttcagacaagttggtattttgttatggaagaattctttaatacaaaga
aggaaaatctgtgcgtcggttgtggaggtgttatctccccttcttcttgtcaccatactg
gttctaatccgtctgacggtaccggataataaaatatatcctcctaaagtatacgaagct
gttgatcttacaatacatgaaaattggtttggtggattgctattctattacgcaccaaaa
accccaatagtcgatgatattatgcacaattttattacaacccttactaacgatgatgta
aaaggttccagaaaatacaatgctactggatttattagtgaggctgacttattgaaatat
gccacaaataactcggactatttagaaatggcgttcgtgtttgacaacataactacagaa
actaagactctacccagaaacgtacaatatgctttaaggcctaaatctaataacgattgg
aatacaggttctaattttcctgtttttggaatgcaggatggatcttatagtacgaatgat
gaatatatcagagaaagatttgtgcattatcaaagatatttggatgccgagattatcaaa
tactgggtaccaacatctaatttaacagattatgactattccatccaacagatgccttat
ccggcatatgaaaacgatcaaaccatatcgtctgttcagttcatgtttcctctaatactg
tgttttagttttatcgttagtgtcttcatcacagctaaaaatatcatctatgaaaaggag
aataatttgaaggaatcgatgaaaatgatgggcctgacaagttcagcgaattggacggcg
tggtttttgacagtgtttatatacctatttgtagctgtggtattttatacgatggttatg
ttaataccaatagagggaaagagtcgtgttctagcccattcagatatgtcggtcatcttt
gtgtttctgttgtgttatgttacttctattatatcattttgttttctagtcagcgttttc
tttgatagagcaaatcttggagcttctgttactggaattttatacttcttgtcctttgtg
ccattttttgttatctttgtaaagtacaagagtatgagccgaagtgaaaaacttggtgca
agtattttgtcgaacacagctatggggattggaggatatatcattggattttacgaacag
ataggtgaaggtgttcagtggagcaacatagcttctccagcatatttccaggacaattat
tgcatgttagacgccatgttgatgttgctaggtgacagtgctatttacctcacaataatg
tggtatattgaaaatgttcatcctggaaaacatggagtcccaaggccattgtattttcct
tttacgagaagttactggtgtggaacaagccctgtatactacaataaaaataagcaaacg
ccgaaagactcaaaattctttgagaaagaaccaactggatgtcaggctgggatagtgata
tccgaccttacaaaggagtttaaatctagaggtggaaagaagaatatagctgttgataat
atgaatctgaacgtgtatcaagggcagataactgtgttattaggtcataatggcgctggt
aaaactacaaccatgtcaatgttaactggatttattccaccgacatcaggtaaagcgact
gtaaacggtcatgatataacaactgatatagatggtgttagagaaagcctgggattatgt
ccacaacataatatactctttgataccctaacagtagatgaacatctagaattcttccta
ttgctaaagggaggtaatcgaactatggtaaaacaagagatacagactacaattcaagaa
attggattagaaccgaaacgaaatactcgatcccagaacctgtctggtggacagaagaga
aaattatcacttggcattgctttaattggtggatcacagactgttattttggacgaacct
acatcaggaatggacccggcagcaagaagacaaacttgggacattctacaaagaaaccga
tcttcaagaacgattctgcttacaactcattttatggacgaggctgatctgctaggagac
agaatcgccataatggcggatggaagagttcattgctgtggaggatcccatttcctgaaa
cagctttacggaagtggttatcatttaatcatggtgaaatcagaaacatgtgatgttagt
gtggtgacgcaacttgtccagagtcacatcccatcagctaccctggagagtgagattagt
gctgagatatcctaccttttacccaatgaagcttctcctaaattctctcctctctttaaa
gacatcgagataaagaaagacgagttgggtattaatagttttggcaccactgccaccact
atggaggaagtttttctcaaggtaggaaatgaggttgatgatgtggctgacaatgatgaa
gatgataatgctagactctacaggtttcaaaatctaagatacaccaacaatgaattacca
gaaacatcgtcatcaaataatattgacgttgaagaagatattcttgcttttaatcagggt
ttaagaaaagttacaggaatacaacttgagctgcacaggttttatggcatgtttataaag
aaagctatccatacctggagaaacaaactagtcactgtattccagttcctgattcccgtt
ttatttaccattctagcgctagctgtatcaattgataccccgaattattatacagaacag
ggtcaacaaccatctttaacattggacttaaaaccatttagtagttctattactgcttat
ggcgagtcggccagttcaaatgtaaccgatgaattgagtaacaaatattcgggactgttt
tcagcaggggaggcaaccgaacatgtaacacatcaacaagcccaaaacttcacaaagtat
ttcctggatatggccaaacagttaaaaacagacgtgtatacgagtaggatggtaatagga
gccgattttgtttcagttaatacaaaaacaacatcaattagaggtttttataatgggaaa
ccatatcattcgcctgggattgctgtttcatttatgatgaatgccttagctaaagtggtg
tcttcagacgatactgtttccataacaactcggaatcaccccttgcctcaaccaacttcc
aataattatgattatggtagtgattctgttactaacgggtttctcattggattctgtatg
atgtttgggatgtgttttctagccagtagtttatcagtattccttattaaagaaagacaa
gttggcgctaaacatctacagaaagtcagtggtgtgggaccagtcgtttattggttggct
aacatcacgtgggattttattaattacatgatgccatctctgcttattattatagctttt
gccagttatggaaacgttgaatttaattctggatcaaatctatcctacgtatttctggtt
ctgttcatgtatggcctggctgtgataccatttatatacacgttacaatttatgtttaaa
acgccacctggtggaatggcagccattattatattcagcattttttctggggcactgtca
ataatgaccgtatatattttaagtttacgacctgatcaacgagagacggcacagactctt
gatgttctattttcaatgttgttaccccaccacaatctcggattatcattgttaaacatc
gtcacgaattacaacaatttagattattgctctgaaaatccatgtgataaaacacagatg
tatagctcctgttgtccagagggttgccacgacttttgtaaaaaatacgaaagtaattac
ctgtccctaaatcgacccggtattggattatatattctcatgatggccgttcaatctgta
ttatatttctccattactttgtgtatcgaaggtcgtatacctcaaaggatttggtactat
attagacccaatcaacagcacgcagaatctattgtaaatccagcctacacatattatggt
ggacaacaaactgacagtgacgtaacaagcgaggctaatcgtgttcaaaatatggacatg
gatcgacctacggattccttcatattgaatgatctgtataaaagatatgggaattttgtg
gccgtggatcatattagtgttggtataccggataaagaatgctttggtctcctgggacaa
aatggcgctggtaaaacaacaacttttaaaatgttgactggtgatgtaatggttaccagt
ggcaacgcgtatttgaactcaaacgacataaaatccagtattcaaaaggtacaagagaat
atgggctactgtccacaatttgatgctctgatagatcagatgactggagtagagacatta
tatatgtatggaagactaaaagggataccagaaaaccaactaaagggcgtggtttatagt
ttaattgatatattgatgttaaagaaatatgccaataaattaacacaagtatacagtggt
ggtaataaacgtaaactaagtacagctatagctttaattggtgatccggggtttatttta
ctggatgaaccttcaactggtgttgatcccaaggccagacggcaactgtggaatgtttta
tctaaggttcgagctagtgggaaaacattgatactcacttcacacagcatggaggaatgt
gatgctctgtgtacaagagtagccatcatggttaatggaagtttcaaatgtttaggaagt
ccacaacatttaaagaataaattcggtcagggctacaccttgatctgtagaatgaaaacc
aatgaagatgatggagtgacgtcaccaattgagccattggtgcagttcattaaaagtaat
ttcccatcagccattgtgtttgatgatcaccaaggttacgctcatttccagattccggat
aataacacacctttagcaggtgtatttgatgtgatggaagaatcaaagagtgaatattcc
gtagaggattattctgttcatcagacaactttagaacaagtatttctggcttttgctgga
aaacaaattccaccacatgaagataaaatttctatttgtaaacgtatatgttgttgttgc
tag
DBGET
integrated database retrieval system