Patella vulgata (common limpet): 126830020
Help
Entry
126830020 CDS
T09576
Name
(RefSeq) phospholipid-transporting ATPase ABCA3 isoform X1
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
pvul
Patella vulgata (common limpet)
Pathway
pvul02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvul00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
126830020
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pvul02000
]
126830020
Transporters [BR:
pvul02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
126830020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC2_membrane_3
ABC_tran
R1_ABCA1
AAA_21
AAA_23
SbcC_Walker_B
AAA_15
AAA_24
AAA_22
Zeta_toxin
AAA_30
MukB
Lig_chan
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126830020
NCBI-ProteinID:
XP_050416182
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(40135248..40164316)
Genome browser
AA seq
1702 aa
AA seq
DB search
MATFFRQVGILLWKNFLIQRRKICASVFEVLCPLLLVALLMVIRASLPANRKYPAKVHLD
GQLNRHKYYDRNYVKTFIYTPNNSLIDDIMNSVVNSVNYDISPTKYEANGFKSETDLLKF
YRNNTRSVEIAIVFDDITNETTALPKHVQYALRPNSQYSALWNTGSTSPFIDSGGQGSRS
TPYIGDDFVYYQRYVDEEIIKSWTPTANLTDYKYSVKQMPYPASEFDYMIDVLQIMLPSI
LCFSFIISVFITAKNIIYEKERNLKESMKMMGLKSSANWTAWFLTAFIYLLVAVILYTVA
MAIPLGENGPVLGHTDMSVIFVFLLCYVISIISFCFLVSVFFDKANVGAAVTGILFFLTY
VPVFTLTGLYETMGRSAKLGSCILSNTAMGLGAYIIGYYEQTGEGVQWSNMASPAVLRDN
FCMLDAMLMLLGDSAIYLIIMWYVENVRPGKNGVPKPFYFPFMKSYWCGTNPAKYRDNEQ
TTNNPKYFEKDPSGCGAGIVINGLSKEFKSGGGKKNLAVDNMNLSMYQGQITVLLGHNGA
GKTTTMSMLTGFIPPTSGKATVNGHDIRTDMDGVRESLGLCPQHNILFDTLTVDEHLEFF
LLLKGGNRATVTQEIQTMAQEIGLETKRNTRSENLSGGQKRKLSVGIALIGGSQTVILDE
PTSGMDPAARRQTWDILQRNRSTRTILLTTHFMDEADLLGDRIAIMADGKVRCCGGSHFL
KQLYGSGYHLVMVKSETCNVGAVTELVQTHIPLATLESEISAEISYLLPNEASSKFSTLF
KDIETQKNQLGIKSFGTTATTMEEVFLKVGEQVDDDDSNGSMDIVKPYMFQNSVFNNGQQ
TENTSLINIQVQDEDILAFNKGFSKVEGLKLELCRFYGMFIKKAIHTWRNKLVTVFQFLI
PVLLTILALAISNITPSYSSEQDTEPSLTLDLKPFANPITVYGESNSSTRTTDLSNKYVG
LFSTGETTIHLTDQQAQNFSRYFLDTAMELKPHIYKERVVIGVDFSSVSGTSTLIKGFYN
GHPYHAAGITVSFMMNALARLVSGDDTVKITTRNHPLPPVTSTDNNFNEYDIRGSTGSNG
FLIGFCMMFGMCFLASSLSVFLIKERQVGAKHLQKVSGVGSFIYWLANITWDFINYMMPC
LLIIIAFAGFRNIEFRSGSNLAYVFLVLVMYGLAVIPFVYMLQFMFKTPPGGMAAILILS
LFSGIISVMVVYYLSMIPEKKTMALTLDVIFSVFFPHHNLGLSIINIVNNYHSIEYCSDQ
ACDREKNYNPCCLDTCGEFCKQYQSNYLSMNRPGIGMYILFMAIQSVLFSTITLCIEGRV
PQRIWYSIRPKQEGTEPGFVIHGGQQTDSDVASEAERVQNMDMNRPTDSFILNNLYKRYG
NFVAVDHISVGIPDKECFGLLGQNGAGKTTTFKMLTGDVMVTSGNAYLKSNDIKSSIQKV
QENMGYCPQFDALIDQMTGVETLYMYGRLKGIPETQLKGVVNSLIDILMLTQHANKLTRA
YSGGNKRKLSTAIALIGDPGFILLDEPSTGVDPKARRQLWNVLSKVRASGKTLILTSHSM
EECDALCTRVAIMVNGSFKCLGSPQHLKNQFGQGYTLICRMKTHEDDGLTAPIGPLVQFI
QQNFPSAIVFDDHQGYAHFQIPDNNIPLAGVFDVMEESKGVYSVEDYSVHQTTLEQVFLA
FAGKQIPPREDKTSVCNRICCC
NT seq
5109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacatttttcagacaagttggtattttgttatggaagaattttttaatacaaaga
aggaaaatctgtgcgtcggtgttcgaggttttatgtcctcttcttcttgttgcgttacta
atggttatccgtgcaagtttacctgctaacagaaagtaccctgctaaagtgcacttagat
ggtcaactcaatagacataaatattacgacagaaattatgttaaaactttcatttacaca
ccaaataactccttaattgatgatattatgaacagtgtcgtgaactccgttaattatgac
atatccccaacgaaatatgaagccaacggatttaaaagtgagactgacttattgaagttc
tacagaaacaacacaaggtctgtagaaatagctatagttttcgacgacataacaaatgaa
actacagctttaccaaaacatgtacaatatgcgttaaggccaaattctcaatatagcgca
ttatggaatacaggatccacatctccctttatagattcagggggacaaggcagcagatcc
acaccttatattggtgatgactttgtgtactatcaaagatatgtggatgaggaaattatc
aaatcctggacgcctacagcgaatttaactgattataaatattctgttaagcagatgcct
tatcctgcaagcgaattcgattatatgatagacgttttgcaaatcatgctccctagtata
ctatgttttagcttcattatcagtgtctttatcaccgcaaaaaatatcatctatgaaaag
gagagaaatttaaaggaatcaatgaaaatgatgggtttgaaaagctcagcaaattggaca
gcgtggtttttaactgcatttatatatcttctagtagctgtgatattatatacagttgcc
atggcaataccactgggggaaaatgggcctgtactagggcacaccgatatgtctgtaatc
tttgtgtttctgttgtgctacgttatttctattatatcattctgttttctagtcagtgtc
ttctttgataaagccaatgttggtgctgcagttactggaattctctttttcctgacctat
gtgccagttttcactttgactgggctatatgagactatgggaagaagtgccaaacttggt
tcatgtattttgtcaaacacagctatgggactaggagcttatattattggatattacgaa
caaacaggcgagggcgttcagtggagcaatatggcctctccagcagtactgcgagataat
ttttgcatgttggatgccatgttgatgttgctaggtgacagtgctatttacctcataata
atgtggtatgtcgaaaatgttcgtcctggaaaaaatggagttccaaaaccgttctatttt
ccttttatgaaaagttactggtgtggaacaaaccctgcaaaatatcgtgataatgaacaa
acaacaaataacccgaaatacttcgaaaaagatccgtctggttgcggggcaggaattgtg
ataaatggtcttagtaaggaatttaaatctggtggtggaaagaagaatttggctgttgat
aatatgaacctgagcatgtatcaggggcagataactgtattattaggtcataatggtgct
ggcaaaactactaccatgtccatgttaactggttttattccaccgacatcaggtaaagct
acagttaacggtcatgatataagaactgatatggatggtgttagagaaagtctgggatta
tgtccacaacataatatactctttgatactctaacagtagatgaacatctagaattcttc
ctgttgttaaagggtggtaatcgagcaacagtaacccaagaaatacagactatggctcaa
gaaattggtttagaaacaaaacgaaatacacgatccgagaacctgtctggtggacagaag
agaaaattatcagttggcatcgctctaattggcggatcacagactgtgattttagatgaa
cctacatcaggaatggatccagcagcaaggagacaaacttgggatattctacaaagaaac
agatctactagaaccattctgcttacaactcattttatggacgaagctgatcttctagga
gacagaattgctataatggcggatggaaaagtccgatgctgtgggggatcccatttctta
aaacagctttatggaagtggttaccatttagtaatggtgaaatcagaaacgtgtaatgtt
ggtgcggtaacagagcttgtccagactcacatcccattagccaccctggagagtgagatc
agtgctgagatatcctacctgttacccaatgaagcttcatccaaattctcaactctcttc
aaagacatagaaacacagaaaaaccagttgggtataaagagttttggaaccacggccacc
actatggaggaggtctttctcaaggttggcgagcaggtcgatgacgacgatagcaatggg
agcatggatatagttaaaccatacatgtttcaaaactctgttttcaacaatggtcaacaa
accgaaaacacttcattaatcaatattcaagttcaggatgaagatatacttgcattcaat
aaaggtttcagtaaagttgaaggactaaagctggagttgtgcaggttttatggaatgttt
ataaagaaagctatccatacctggagaaacaagctagtcactgttttccagttcctgatc
cctgttctgttaactatcctagctttagccatatcaaatataaccccatcttattctagt
gaacaggatacggagccgtcgttaaccttggacctaaagccatttgctaaccctattact
gtttacggtgagtcaaacagctcgacaagaacgaccgacttgagcaataaatatgtgggt
ctgttttcaacaggggagactaccatacacctaacagatcaacaagcacagaatttctca
cggtactttctggatacggcaatggagttaaaaccacacatttacaaagagagagtggtg
ataggagtcgatttttcttcagtttccggaacgagtacattaattaaaggtttttataac
ggacacccgtatcacgctgctggtattacggtctcatttatgatgaatgctttagctagg
cttgtttctggagatgataccgtaaagataacaactcgtaatcatccattaccgccagta
acttcaacagataataattttaatgaatatgatattaggggtagcactggaagtaatggg
tttcttataggattttgtatgatgttcggcatgtgttttctggccagtagtttatctgtg
tttcttatcaaggaaagacaagttggcgccaaacatttacagaaagtcagcggtgttgga
tctttcatttattggttggcaaacatcacgtgggattttatcaattacatgatgccatgt
ctgcttattattatagcctttgcgggttttagaaatattgaatttcgttctggatcaaat
ttagcctacgtgtttctggttctcgtcatgtatggactggctgtaataccatttgtatac
atgttacaatttatgtttaaaacaccacctggtggaatggcggccattctcatacttagt
cttttttctggtataatatctgtaatggtcgtatattatttaagtatgataccagagaaa
aaaaccatggcattaactctggacgtgatattttcagtattttttccccaccataatctc
gggttgtcgatcataaacatagttaataattaccacagtattgaatattgttcagaccaa
gcttgtgatagagaaaaaaattacaatccatgctgtctagacacatgcggagagttttgt
aaacaataccaaagtaattatctttccatgaatcgcccaggtattggaatgtacattctc
ttcatggcaattcaatctgtattattttctaccatcacattatgcatagaaggtcgggta
ccacagaggatttggtactctattagacccaaacaagaaggcactgaaccaggcttcgtc
attcatggtggacaacaaaccgacagtgacgtagccagcgaggctgagcgtgttcaaaat
atggacatgaatcgacccaccgattctttcatattaaataatctttataaaagatatgga
aattttgtggctgtggatcacattagtgttggcataccagataaagaatgtttcggtctt
cttgggcaaaatggtgcaggaaaaacaacaacttttaaaatgttgacgggcgatgtaatg
gttaccagtggtaatgcctatttgaaatcaaacgacattaaatcaagtattcaaaaggta
caggaaaatatgggctactgtccacaatttgatgctttgatagatcagatgactggagta
gaaacattatatatgtatggaagactaaaagggatacctgaaacccaactaaagggcgtg
gttaatagtttgattgacatattgatgttgacgcaacatgcaaataaattaacacgagca
tatagtggtggtaataaacgtaaactcagtacagctattgctttaattggtgacccagga
tttattttactggacgaaccttcaactggtgttgatcccaaggccagacgtcaactctgg
aatgttttatctaaagtcagagccagtgggaaaacactgatactcacgtcacacagcatg
gaagagtgtgatgctctgtgtacaagagtagccatcatggttaatggaagtttcaagtgt
ttaggaagtccacaacatttaaagaatcaattcggtcagggctacactttgatatgcaga
atgaaaacccacgaagatgatggattgacggcacccattggtccgttggtacagtttatc
caacagaatttcccatcagccattgtgtttgacgatcaccaaggttacgctcatttccag
attccagataataacatacctttagcaggtgtatttgatgtaatggaagaatcgaagggt
gtttattcagtggaggattattctgttcatcagacaactttagaacaagttttcctggct
ttcgctgggaaacaaattccaccacgtgaagataaaacttctgtttgtaatcgcatatgt
tgttgttag
DBGET
integrated database retrieval system
