KEGG   Plasmodium vinckei vinckei: PVVCY_1000830
Entry
PVVCY_1000830     CDS       T08061                                 
Name
(RefSeq) cleavage and polyadenylation specificity factor, putative
  KO
K13148  integrator complex subunit 11 [EC:3.1.27.-]
Organism
pvv  Plasmodium vinckei vinckei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pvv00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:pvv03041]
    PVVCY_1000830
Spliceosome [BR:pvv03041]
 Other splicing related proteins
  Proteins involved in snRNP biogenesis
   Integrator complex
    PVVCY_1000830
SSDB
Motif
Pfam: Beta-Casp Lactamase_B_6 RMMBL Lactamase_B Lactamase_B_2 Lactamase_B_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 19960074
NCBI-ProteinID: XP_008623758
UniProt: A0A449BTD1
LinkDB
Position
PVVCY_10:334263..337022
AA seq 919 aa
MANYYNQTTVYIKVLGAGQTVGRSCVIVELENRRIMFDCGSHVGYKDERKYPNFNLLVGN
NNMEGGPKIDEENNLNVEVNISIVNSNIADKEKLINNLKRINEIIDCVIISHFHMDHIGA
LPFFTETLQYKGTIIMSYPTKALSPVLLLDGCKISDMKWEKKNLEKQIKMLNEKSDDLLN
YSINRLKKDPWNITEENIYNCINKVVGLQVNETYELGDISITPYYAGHVLGACMYRLEVN
NISVIYTGDYNTIPDKHLGSTKIPVLTPEIFISESTYASYVRPTRKSSELELCNLVNECV
HKGGKVLIPVFAIGRAQELSILLEEYWEKMKINCPIYFGCGLTENANKYYKIYSSWINND
CVSTELKNLFDFSNITQFSNNYLNENRPMVLFATPGMLHTGLALKAFKAWAGNPNNLIIL
PGYCVQGTIGHKLIMGEKKILLDGNTHIYVNCKIIYLSFSAHADSNGIQQLIKHVMPKNV
IFVHGDKNGMEKLSKHISNQYHINSICPYMGQNCQFNFCKYNINYVYLDRKIYNNIIQKV
KLNKQKTSKGLYKNARQIKGGQANILSSNGNVKIPFIAYILYRSINEKPLFFFLSESFLF
KYLTKKHVPMIICRDGKQFDFDYMFDTKKKKKLNKMHEKKEKIKNGTDITIEHYNEAEEG
DDSPKNNNPNDIGDNNILLKNKSIMFNNYIQSDISITENDKNNANDLSSSIEARKRKFNE
ISETNNLSEEQREHLSINSSKMLKIAGDEEKCNNNINQKNGENDQNITGGLKGYLKSETN
INDPNNNGFNIENIYNDKDKKKRHIYIKDKENINLPLINLRFKEEINIAYQSFYNFVITF
FQEIVKDENKNNMGFLGKNIIVKNVKIDQNCFFFLSFHSLRAIHDGNNSLLMQWSYVDDA
KSSVVKKFINCVINYAQEE
NT seq 2760 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaactattacaatcaaaccactgtttacataaaagttcttggggcgggacaaaca
gtgggaaggtcatgcgtaatagtagagctcgaaaacagacgaattatgtttgattgcggt
tcgcatgtaggatataaagatgaaagaaaataccctaactttaacttattggttgggaat
aataatatggaaggaggtcccaaaattgacgaagaaaacaatttgaatgttgaagtaaat
ataagtatagttaatagcaacatagctgataaagaaaaattaataaataacttgaaaaga
attaatgaaataattgattgcgtaataataagtcattttcatatggatcatataggagct
ttaccatttttcacagaaacattacaatataaagggacgataattatgagctatccaaca
aaagctcttagtccagttttattattagatggttgtaaaataagtgatatgaaatgggaa
aaaaaaaacttagaaaagcaaataaaaatgcttaatgaaaaatcggatgatttattaaat
tatagtattaatcgtttaaaaaaagatccttggaatattactgaagaaaatatatataat
tgcataaataaagtagttggtttgcaagttaatgaaacatatgaattaggtgatatatct
attacaccatattatgcggggcatgttttaggggcttgtatgtacagattagaagtaaac
aatattagtgttatatatacaggtgactataatactattcctgacaaacacttaggcagt
actaaaatccctgtattaacacctgaaatatttatatctgaatctacatatgcttcttat
gttagaccaactagaaaatcgtctgagttagaattatgcaacttagtaaatgaatgtgta
cataaaggtggtaaagttttaattcctgtatttgctattggtagagcacaagaattatct
atattattagaagaatattgggaaaaaatgaaaataaattgccctatatattttggatgc
ggtttaacagaaaatgcaaataaatattacaaaatttactcttcatggattaataatgat
tgtgtatcgactgaactaaaaaatttatttgatttttcaaatattacacaattttcaaat
aactatttaaatgaaaatagacctatggttttatttgctacacccgggatgttacataca
ggattagcattaaaagctttcaaagcatgggctggcaatcccaacaatttaataattttg
cctggttattgtgtgcaaggtactattgggcataaattaattatgggagagaaaaaaata
ttattagatggaaacacacatatatatgttaattgtaaaataatttatttatccttttct
gcgcatgcagattctaatggcatacaacagttaataaagcatgttatgccaaaaaatgtt
atatttgtacatggagataaaaatggaatggaaaaattatcaaaacatatatctaatcaa
tatcatattaattctatatgtccatatatgggacaaaattgtcaattcaatttttgtaaa
tataatatcaattatgtatatttggatagaaaaatatataataatattattcaaaaagtt
aaattaaataagcaaaaaacatcaaaaggtttatataaaaatgctagacaaattaaaggt
ggtcaagctaatattttatcatccaatggaaatgtaaaaattccctttattgcttacata
ttatatcgttccattaatgaaaaaccattatttttttttctctccgaatcatttttattc
aaatatttgacgaaaaaacatgttccaatgattatctgccgcgatggcaaacaatttgac
tttgattatatgtttgatacaaaaaaaaaaaagaaattgaacaaaatgcatgaaaaaaaa
gaaaagataaaaaatggtaccgatattacaattgagcactataacgaagcggaagaaggg
gatgatagcccaaaaaacaataatcctaacgacattggtgataataatattttattgaaa
aacaaatctattatgtttaataattatatacaatctgatattagtattacagaaaatgat
aaaaataacgctaacgatttatcatcgtcaattgaagcacgaaaaagaaaatttaatgaa
attagtgaaacaaataatttatcggaagaacagcgtgagcatctttctataaattcttca
aaaatgttaaaaatcgcaggggacgaagaaaaatgtaataataatataaatcagaaaaat
ggtgaaaatgatcagaatattacagggggattaaaaggatatttaaaaagtgaaactaac
ataaatgatccgaataataacggttttaatatagaaaatatttataatgataaggacaaa
aaaaagaggcatatatatataaaggataaagaaaatataaatttgcctctaataaactta
agatttaaagaagaaattaatatagcttatcaatccttctacaatttcgttattacattt
tttcaagaaattgtaaaagatgaaaataaaaataatatgggttttttaggaaaaaacatt
attgttaaaaatgttaaaattgatcaaaattgttttttctttttgtcctttcattcatta
agagcaattcatgatggaaataattccctattaatgcaatggtcatatgttgatgatgcc
aaatcttcagtggttaagaaattcataaattgtgttataaactatgctcaagaagaataa

DBGET integrated database retrieval system