Plasmodium vinckei vinckei: PVVCY_1303220
Help
Entry
PVVCY_1303220 CDS
T08061
Name
(RefSeq) 26S proteasome regulatory subunit RPN2, putative
KO
K03032
26S proteasome regulatory subunit N2
Organism
pvv
Plasmodium vinckei vinckei
Pathway
pvv03050
Proteasome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pvv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03050 Proteasome
PVVCY_1303220
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03051 Proteasome [BR:
pvv03051
]
PVVCY_1303220
Proteasome [BR:
pvv03051
]
Eukaryotic proteasome
Regulatory particles
PA700 (19S proteasome)
non-ATPase subunits
PVVCY_1303220
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RPN2_N
PC_rep
RPN2_C
HEAT_2
HEAT
HEAT_EZ
Vac14_Fab1_bd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
19958514
NCBI-ProteinID:
XP_008622218
UniProt:
A0A449BY26
LinkDB
All DBs
Position
PVVCY_13:join(1219678..1223112,1223204..1223331,1223798..1223897)
Genome browser
AA seq
1220 aa
AA seq
DB search
MDVEKMIHKNDIVTSASGVIALLNEEDASLKIFGLEKLNSVVDIYWPELADYIFKIEELC
EDDEFSGKELANLVASKVYYHLEKYPEALKYALCAGKLFNINEKSQYIETMLAKCIEKYV
EIREKNYEGVDPDPSNTGRNNGINYSTNENSFSSSYTLNTNYNNIDPEYKKGKNGLNTQN
NIDDNNRNIYDSYDYNGKGINLNGSTKNSNTLLSRDNENYKIKEENNIFKYDLNNDINKK
MEIFVDDMLEICIKNNSIKEALGVALDARRLDKVEYIILNAPNKLEILQHSISNERHINT
TKKFRDDFFKLLVKIYLSMNEEEIKYEYVNLCECLFYINDYKTVAEILLKLIENYHLMVY
QISFDLVDLENINFLKNILKEIKEIIIKNKSYYYGEENYKHLNTDLLKKNSSNSAISEGT
NEAVKSENTSEKDEQKENNQDSSNAENDQDNVENAQDNSEGTDPANPTSTSVNDENKNSK
ENEEKDKIPEDVLMYVNEEHHLYEKIKKLIFILTGKITTSLYIEFLHRNNHADLILLDSY
KNVIDSRSSITHHGIVIAHGLMQAGTTCDVFLRSNIEWLSKAVNWAKFSSTASLGVVYKG
HVNESFMVLSSHLPYNDISRQITNNINANISQSDVYSESGSLYALGLIHATYNTNYKKVR
DFLLSQLKASNNNEVLQHGCCLGLGLVCLEQNDDEQVYDELKSVMYSDSAVAGESAAYAI
GLLKLGSGDEKCVDELLAYAHDTQHEKITRACSISLGFVMFQKEREADNLIEELINDKDA
IIRYGGMFTIALAYCGLSSYNKHAIKKLLHFSVSDVSDDVRRAAVIALGFVLCNAPAQVP
MFLNLLIESYNPHVRYGAALALGIACAATGNEEAVNMLMPLLTDTTDFVRQSAFISLGLI
FQQSNENVSPNFKKFKDEIMKILSDKHEDIIAKFGATVGLGLLDICGRNAISTFFTRRAN
IIRPQSAVGFCLFCQLWYWFPLIHMISLTFLPTCLIGLTEDFKVPKNFTILSTKNQAFDY
PSFLSKEKVQEKKETVTAILSTTDKRKTLKLKKQKNENKLTKEKNPQDDSSSVLSDGKSM
KNLEILSTAATIGQSSHVSHAESVEGSANDENSNDNQNDANQFSQLQRIKKSDKGKSSSL
SQATTVDMKNPCRVIKTQEKYIEYPPSNRFKPIISIRKSGFVMLSDTTPTEPFDFIEPKL
ESGTKKELPPFEPFSWKDEN
NT seq
3663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgttgaaaaaatgattcacaaaaatgatattgttacatcagcttcaggtgtaata
gcattactaaatgaggaagacgctagcttgaaaatttttggattagaaaaattaaattca
gtagtagatatatattggcctgaattagctgattatatttttaaaattgaagaattatgt
gaagacgatgaatttagtggtaaagagctagcaaatttagttgcaagtaaagtttattat
catttagaaaaatatccagaagctttaaaatatgctttatgtgcaggtaaactatttaat
attaatgaaaaatctcaatatattgaaacaatgcttgcaaaatgcattgaaaaatatgta
gaaataagagaaaaaaattatgaaggtgtagatccagatccaagtaacactggtcgaaat
aatggtattaattattctactaatgaaaacagttttagtagttcatatactttaaataca
aattataataacatcgatcctgaatataagaaaggaaaaaatggattaaacacacaaaat
aatattgacgataacaataggaacatatatgacagttatgattataatggtaaaggcata
aatcttaacggttccacaaaaaatagtaatactttattaagtagagataatgaaaattat
aaaataaaagaggagaataatatatttaaatatgatctaaataatgatataaataaaaaa
atggaaatttttgttgatgatatgctagaaatatgtataaaaaataatagtattaaggaa
gcattaggagttgctcttgatgctagacgtttagataaagtagaatatataatattaaat
gcaccaaataaattagaaatattacagcattctatatctaatgaaagacatattaataca
acaaaaaaattccgtgatgatttttttaaattacttgtaaaaatatatctatcaatgaat
gaagaagaaataaaatatgaatatgtaaatttatgtgaatgtttattttatattaatgat
tataaaacagttgctgaaattttattaaaactaatagaaaattatcatttaatggtatat
caaatttcatttgatttagtagatttagaaaatattaattttttaaaaaatattttaaaa
gaaatcaaagagattataattaaaaataagtcttactattatggtgaagaaaattataaa
catctaaatacagacttattaaaaaaaaatagcagtaatagtgccatcagtgaaggaaca
aatgaagccgtaaaaagtgaaaatacatctgaaaaagatgaacaaaaagaaaataatcaa
gactcaagtaatgcagaaaacgatcaagataatgtagaaaatgctcaagataattcagaa
ggtactgatccagcaaaccccacttctacttctgtaaatgatgaaaataaaaattctaaa
gaaaacgaagaaaaagataaaatccctgaagatgtacttatgtatgtaaatgaagaacat
catttatatgaaaaaattaaaaaattaatttttatattaacaggaaaaataacaacaagt
ttatatatcgaatttttacatcgtaataatcatgctgatttaattttactagatagttat
aaaaatgtaatagattcaagaagcagtataacacatcatggtattgttatagcacatgga
ttaatgcaagcaggaacaacatgtgatgtctttttacgatcaaatattgaatggttatct
aaagcagtaaattgggctaaattttcatcaactgcttcattaggagttgtatataaaggc
catgtcaatgaatcgtttatggtattatcatcccatttaccatataatgatatatcacga
caaattacaaataatataaatgcaaacatatcacaaagtgatgtatattcagaaagtggc
tctttatatgcattgggtctaatacatgctacttataatacaaattataaaaaagttcga
gattttttattatcgcaattaaaagcaagtaacaataatgaagtattacaacatggttgt
tgtttagggttaggtttagtatgtttagaacaaaatgatgatgaacaagtatatgatgaa
ttaaagtctgttatgtattccgattctgcagtagctggtgaaagtgccgcatacgcaatt
ggtttattaaaattaggtagtggagatgaaaaatgtgttgatgaattattagcatatgca
catgatacacagcatgaaaaaataacaagagcatgtagtataagtttaggttttgttatg
tttcaaaaagaaagagaagcagataatttaatagaagaattaattaatgataaagatgca
ataattagatatggtggtatgtttacaattgcattagcatattgtggtttatcaagctat
aataaacatgctattaaaaaattattacatttttcagtttcagatgtaagtgatgatgtt
agaagagcagctgttattgcattaggttttgttttatgtaatgctcctgcacaagttcca
atgtttttaaatttattaatagaaagttataatccgcatgtacgatatggtgctgcttta
gctttgggtattgcatgtgcagccacaggtaatgaagaagctgttaatatgttaatgcca
cttttaacagatactacagattttgttaggcaaagtgcttttatatcattaggcttaatc
ttccaacaatctaatgaaaatgttagtccaaattttaaaaaatttaaagatgaaataatg
aaaattttatcagataaacatgaagatattattgctaaatttggtgctactgtaggactt
ggattattagatatatgtggacgaaatgccatttcaacattttttacaagacgagctaat
attataagacctcaatcagcagttggtttttgtttattctgtcaattatggtattggttt
ccattaattcatatgattagtttaactttcttaccaacttgtttaattggattaacagaa
gattttaaagtacctaaaaattttactatcttatcaacaaaaaatcaagcatttgattat
ccttcctttttaagtaaagaaaaagttcaagaaaaaaaagaaactgttactgctatttta
tcaacaactgataaaagaaaaacattaaaattaaaaaaacaaaaaaatgaaaataaatta
acaaaggaaaaaaatccacaagatgatagtagttcagttttatctgatggaaagtctatg
aaaaatttagaaattttaagtactgctgcaactataggacaatcaagtcatgtctctcat
gcagaaagtgttgaaggaagtgcaaatgatgaaaattccaacgacaatcaaaatgatgca
aatcaattttcacagctacaacgaattaaaaaatcagacaagggaaaatcttcatctctt
tctcaagccactacggttgatatgaaaaacccatgcagagtcataaaaacgcaagagaaa
tatatagaataccctccaagcaacagattcaagcctatcattagcatcaggaaatccgga
ttcgttatgctttcagatacgacaccaaccgaaccttttgattttattgagcctaagtta
gaaagtggaactaagaaagagctcccaccatttgagcctttttcttggaaagatgaaaat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
